MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7503	NC_022110	TCA	2	6	386542	386547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353519
7504	NC_022110	CT	3	6	386618	386623	0 %	50 %	0 %	50 %	532353519
7505	NC_022110	T	6	6	386667	386672	0 %	100 %	0 %	0 %	532353519
7506	NC_022110	CTT	3	9	386710	386718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353519
7507	NC_022110	TTA	2	6	386720	386725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353519
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7509	NC_022110	CT	4	8	386771	386778	0 %	50 %	0 %	50 %	532353519
7510	NC_022110	TATTC	2	10	386833	386842	20 %	60 %	0 %	20 %	532353519
7511	NC_022110	T	6	6	386904	386909	0 %	100 %	0 %	0 %	532353519
7512	NC_022110	GCTC	2	8	386910	386917	0 %	25 %	25 %	50 %	532353519
7513	NC_022110	ATC	2	6	386929	386934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353519
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7515	NC_022110	ATTTT	2	10	386972	386981	20 %	80 %	0 %	0 %	532353519
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7518	NC_022110	TGC	2	6	387091	387096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353519
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7522	NC_022110	A	9	9	387446	387454	100 %	0 %	0 %	0 %	532353519
7523	NC_022110	TTG	2	6	387484	387489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353519
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7526	NC_022110	CT	4	8	387649	387656	0 %	50 %	0 %	50 %	532353520
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7530	NC_022110	GAA	2	6	387916	387921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353520
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7532	NC_022110	CGT	2	6	387944	387949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353520
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7534	NC_022110	ACC	2	6	387993	387998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353520
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7537	NC_022110	GCA	2	6	388044	388049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353520
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7544	NC_022110	ACT	2	6	388431	388436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353520
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7546	NC_022110	AGG	2	6	388513	388518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353520
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7558	NC_022110	CAG	2	6	389512	389517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353520
7559	NC_022110	CAG	2	6	389545	389550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353520
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7590	NC_022110	ACA	2	6	391334	391339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353523
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7595	NC_022110	AG	4	8	391560	391567	50 %	0 %	50 %	0 %	532353523
7596	NC_022110	GATT	2	8	391807	391814	25 %	50 %	25 %	0 %	532353523
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7604	NC_022110	A	7	7	392362	392368	100 %	0 %	0 %	0 %	532353524
7605	NC_022110	CG	3	6	392425	392430	0 %	0 %	50 %	50 %	532353524
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7613	NC_022110	ATCA	2	8	392843	392850	50 %	25 %	0 %	25 %	532353524
7614	NC_022110	A	6	6	392850	392855	100 %	0 %	0 %	0 %	532353524
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7621	NC_022110	TAAA	2	8	393168	393175	75 %	25 %	0 %	0 %	532353524
7622	NC_022110	AGA	2	6	393190	393195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353524
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7998	NC_022110	CAC	2	6	411160	411165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353538
7999	NC_022110	CT	3	6	411226	411231	0 %	50 %	0 %	50 %	532354066
8000	NC_022110	T	6	6	411250	411255	0 %	100 %	0 %	0 %	532354066

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