MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022110	CGG	2	6	361821	361826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353500
7002	NC_022110	AC	3	6	361858	361863	50 %	0 %	0 %	50 %	532353500
7003	NC_022110	AAGGC	2	10	361867	361876	40 %	0 %	40 %	20 %	532353500
7004	NC_022110	TGT	2	6	362083	362088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353501
7005	NC_022110	GAA	3	9	362092	362100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353501
7006	NC_022110	GAA	2	6	362119	362124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353501
7007	NC_022110	GTC	2	6	362133	362138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353501
7008	NC_022110	CTT	3	9	362142	362150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353501
7009	NC_022110	GCAA	2	8	362205	362212	50 %	0 %	25 %	25 %	532353501
7010	NC_022110	GAG	2	6	362254	362259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353501
7011	NC_022110	TC	3	6	362271	362276	0 %	50 %	0 %	50 %	532353501
7012	NC_022110	GACC	2	8	362349	362356	25 %	0 %	25 %	50 %	532353501
7013	NC_022110	TAC	2	6	362407	362412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353501
7014	NC_022110	ATC	2	6	362497	362502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353501
7015	NC_022110	TATG	2	8	362533	362540	25 %	50 %	25 %	0 %	532353501
7016	NC_022110	TGA	2	6	362577	362582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353501
7017	NC_022110	AAG	2	6	362611	362616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353501
7018	NC_022110	TCT	2	6	362657	362662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353501
7019	NC_022110	AAC	2	6	362692	362697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353501
7020	NC_022110	ACT	2	6	362774	362779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353501
7021	NC_022110	TTC	2	6	362923	362928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353501
7022	NC_022110	ACGC	2	8	362985	362992	25 %	0 %	25 %	50 %	532353501
7023	NC_022110	AGC	2	6	362998	363003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353501
7024	NC_022110	TTA	2	6	363062	363067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353501
7025	NC_022110	ATGC	2	8	363594	363601	25 %	25 %	25 %	25 %	532353502
7026	NC_022110	CAA	2	6	363606	363611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353502
7027	NC_022110	TCT	2	6	363643	363648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353502
7028	NC_022110	T	7	7	363648	363654	0 %	100 %	0 %	0 %	532353502
7029	NC_022110	A	7	7	363664	363670	100 %	0 %	0 %	0 %	532353502
7030	NC_022110	A	6	6	363674	363679	100 %	0 %	0 %	0 %	532353502
7031	NC_022110	N	45	45	363710	363754	0 %	0 %	0 %	0 %	532353502
7032	NC_022110	GA	3	6	363768	363773	50 %	0 %	50 %	0 %	532353502
7033	NC_022110	TTC	2	6	363961	363966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354058
7034	NC_022110	GCTTC	2	10	363977	363986	0 %	40 %	20 %	40 %	532354058
7035	NC_022110	TAGT	2	8	364016	364023	25 %	50 %	25 %	0 %	532354058
7036	NC_022110	TA	3	6	364048	364053	50 %	50 %	0 %	0 %	532354058
7037	NC_022110	AGTAG	2	10	364055	364064	40 %	20 %	40 %	0 %	532354058
7038	NC_022110	TTC	2	6	364098	364103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354058
7039	NC_022110	GC	3	6	364112	364117	0 %	0 %	50 %	50 %	532354058
7040	NC_022110	TTC	2	6	364128	364133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354058
7041	NC_022110	CCGC	2	8	364192	364199	0 %	0 %	25 %	75 %	532353503
7042	NC_022110	TAT	2	6	364407	364412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353503
7043	NC_022110	ACA	2	6	364488	364493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353503
7044	NC_022110	TTAT	2	8	364556	364563	25 %	75 %	0 %	0 %	532353503
7045	NC_022110	CTC	2	6	364568	364573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353503
7046	NC_022110	TAT	2	6	364587	364592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353503
7047	NC_022110	T	6	6	364599	364604	0 %	100 %	0 %	0 %	532353503
7048	NC_022110	AT	3	6	364662	364667	50 %	50 %	0 %	0 %	532353503
7049	NC_022110	CAT	2	6	364716	364721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353503
7050	NC_022110	CGC	2	6	364759	364764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353503
7051	NC_022110	AT	3	6	364769	364774	50 %	50 %	0 %	0 %	532353503
7052	NC_022110	GAA	2	6	364852	364857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353503
7053	NC_022110	AGT	2	6	364890	364895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353503
7054	NC_022110	GCTCA	2	10	364921	364930	20 %	20 %	20 %	40 %	532353503
7055	NC_022110	CTCTT	2	10	365041	365050	0 %	60 %	0 %	40 %	532353503
7056	NC_022110	ACAA	2	8	365080	365087	75 %	0 %	0 %	25 %	532353503
7057	NC_022110	T	8	8	365208	365215	0 %	100 %	0 %	0 %	532353504
7058	NC_022110	T	6	6	365316	365321	0 %	100 %	0 %	0 %	532353504
7059	NC_022110	GGA	2	6	365361	365366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353504
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7061	NC_022110	ACT	2	6	365473	365478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353504
7062	NC_022110	CGA	2	6	365488	365493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353504
7063	NC_022110	GAA	2	6	365630	365635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532354059
7064	NC_022110	TAT	2	6	365672	365677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354059
7065	NC_022110	ACG	2	6	365681	365686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354059
7066	NC_022110	TTG	2	6	365731	365736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354059
7067	NC_022110	GCA	2	6	365854	365859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354059
7068	NC_022110	TGT	2	6	365860	365865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354059
7069	NC_022110	TC	3	6	365881	365886	0 %	50 %	0 %	50 %	532354059
7070	NC_022110	ATC	2	6	365889	365894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354059
7071	NC_022110	TCT	2	6	365944	365949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354059
7072	NC_022110	TA	3	6	365951	365956	50 %	50 %	0 %	0 %	532354059
7073	NC_022110	CAA	2	6	365987	365992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354059
7074	NC_022110	AGGC	2	8	366005	366012	25 %	0 %	50 %	25 %	532354059
7075	NC_022110	TCCA	2	8	366061	366068	25 %	25 %	0 %	50 %	532354059
7076	NC_022110	A	7	7	366068	366074	100 %	0 %	0 %	0 %	532354059
7077	NC_022110	AGC	2	6	366112	366117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354059
7078	NC_022110	ACCA	2	8	366138	366145	50 %	0 %	0 %	50 %	532354059
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7083	NC_022110	AGGGA	2	10	366392	366401	40 %	0 %	60 %	0 %	532354060
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7087	NC_022110	TAC	2	6	366482	366487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354060
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7089	NC_022110	GCAT	2	8	366602	366609	25 %	25 %	25 %	25 %	532354060
7090	NC_022110	TGAG	2	8	366635	366642	25 %	25 %	50 %	0 %	532354060
7091	NC_022110	AC	3	6	366663	366668	50 %	0 %	0 %	50 %	532354060
7092	NC_022110	A	6	6	366764	366769	100 %	0 %	0 %	0 %	532354060
7093	NC_022110	CAA	2	6	366784	366789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354060
7094	NC_022110	CT	4	8	366835	366842	0 %	50 %	0 %	50 %	532354060
7095	NC_022110	CAA	2	6	366923	366928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354060
7096	NC_022110	TGA	2	6	366945	366950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354060
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7098	NC_022110	TGA	2	6	367041	367046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354060
7099	NC_022110	CT	3	6	367068	367073	0 %	50 %	0 %	50 %	532354060
7100	NC_022110	CA	3	6	367077	367082	50 %	0 %	0 %	50 %	532354060
7101	NC_022110	CAA	2	6	367123	367128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532354060
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7104	NC_022110	GCA	2	6	367197	367202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532354060
7105	NC_022110	C	8	8	367246	367253	0 %	0 %	0 %	100 %	532354060
7106	NC_022110	TCT	2	6	367324	367329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354060
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7108	NC_022110	TCG	2	6	367369	367374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532354061
7109	NC_022110	TATG	2	8	367376	367383	25 %	50 %	25 %	0 %	532354061
7110	NC_022110	GT	3	6	367394	367399	0 %	50 %	50 %	0 %	532354061
7111	NC_022110	TAT	2	6	367406	367411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532354061
7112	NC_022110	TCT	2	6	367432	367437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532354061
7113	NC_022110	TTG	2	6	367461	367466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532354061
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7115	NC_022110	A	6	6	367520	367525	100 %	0 %	0 %	0 %	532354061
7116	NC_022110	A	8	8	367540	367547	100 %	0 %	0 %	0 %	532354061
7117	NC_022110	CTG	3	9	367739	367747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353505
7118	NC_022110	GT	3	6	367792	367797	0 %	50 %	50 %	0 %	532353505
7119	NC_022110	AT	3	6	367800	367805	50 %	50 %	0 %	0 %	532353505
7120	NC_022110	AAT	2	6	367809	367814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353505
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7122	NC_022110	CAA	2	6	367907	367912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353505
7123	NC_022110	CTT	2	6	368654	368659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353506
7124	NC_022110	CTC	2	6	368678	368683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353506
7125	NC_022110	ATT	2	6	368697	368702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353506
7126	NC_022110	GA	3	6	368714	368719	50 %	0 %	50 %	0 %	532353506
7127	NC_022110	ACA	2	6	368770	368775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353506
7128	NC_022110	TGC	2	6	368802	368807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353506
7129	NC_022110	ACA	2	6	368836	368841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353506
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7154	NC_022110	TTC	2	6	370418	370423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353508
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7160	NC_022110	TCAA	2	8	370751	370758	50 %	25 %	0 %	25 %	532353508
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7222	NC_022110	T	6	6	373392	373397	0 %	100 %	0 %	0 %	532353511
7223	NC_022110	ATG	2	6	373424	373429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353511
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7227	NC_022110	TAT	2	6	373604	373609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353511
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7232	NC_022110	TCT	2	6	373788	373793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353511
7233	NC_022110	CAA	2	6	373808	373813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353511
7234	NC_022110	GTT	2	6	373816	373821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353511
7235	NC_022110	TTA	2	6	373832	373837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353511
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7239	NC_022110	GGC	2	6	373918	373923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353511
7240	NC_022110	ATA	2	6	373958	373963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353511
7241	NC_022110	TC	3	6	373977	373982	0 %	50 %	0 %	50 %	532353511
7242	NC_022110	ATCAC	2	10	374057	374066	40 %	20 %	0 %	40 %	532353511
7243	NC_022110	T	6	6	374119	374124	0 %	100 %	0 %	0 %	532353511
7244	NC_022110	CTT	2	6	374170	374175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353511
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7248	NC_022110	TAT	2	6	374418	374423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353512
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7250	NC_022110	TGA	2	6	374601	374606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353512
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7362	NC_022110	AC	3	6	380148	380153	50 %	0 %	0 %	50 %	532353513
7363	NC_022110	A	6	6	380163	380168	100 %	0 %	0 %	0 %	532353513
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7372	NC_022110	TCTT	2	8	380696	380703	0 %	75 %	0 %	25 %	532353513
7373	NC_022110	A	8	8	380704	380711	100 %	0 %	0 %	0 %	532353513
7374	NC_022110	AC	3	6	380725	380730	50 %	0 %	0 %	50 %	532353513
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7376	NC_022110	A	6	6	380796	380801	100 %	0 %	0 %	0 %	532353513
7377	NC_022110	TTCC	2	8	380828	380835	0 %	50 %	0 %	50 %	532353513
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7475	NC_022110	CCAG	2	8	385191	385198	25 %	0 %	25 %	50 %	532353517
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7481	NC_022110	A	8	8	385518	385525	100 %	0 %	0 %	0 %	532353518
7482	NC_022110	AAC	2	6	385558	385563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353518
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7487	NC_022110	GA	3	6	385869	385874	50 %	0 %	50 %	0 %	532354062
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7490	NC_022110	GGCA	2	8	386041	386048	25 %	0 %	50 %	25 %	532354062
7491	NC_022110	TGCT	2	8	386049	386056	0 %	50 %	25 %	25 %	532354062
7492	NC_022110	CTG	2	6	386071	386076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353519
7493	NC_022110	CTA	2	6	386165	386170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353519
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7495	NC_022110	TTAA	2	8	386261	386268	50 %	50 %	0 %	0 %	532353519
7496	NC_022110	A	9	9	386267	386275	100 %	0 %	0 %	0 %	532353519
7497	NC_022110	CTCA	2	8	386276	386283	25 %	25 %	0 %	50 %	532353519
7498	NC_022110	CAT	2	6	386353	386358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353519
7499	NC_022110	CTA	2	6	386361	386366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353519
7500	NC_022110	TCA	2	6	386441	386446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353519

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