MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022110	GAA	2	6	336612	336617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353481
6502	NC_022110	T	6	6	336633	336638	0 %	100 %	0 %	0 %	532353481
6503	NC_022110	AGAA	2	8	336652	336659	75 %	0 %	25 %	0 %	532353481
6504	NC_022110	CTT	2	6	336660	336665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353481
6505	NC_022110	TAA	2	6	336682	336687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353481
6506	NC_022110	TA	3	6	336709	336714	50 %	50 %	0 %	0 %	532353481
6507	NC_022110	GCA	2	6	336791	336796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353481
6508	NC_022110	AGC	2	6	336827	336832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353481
6509	NC_022110	CGA	2	6	336875	336880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353481
6510	NC_022110	CCT	2	6	336920	336925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353481
6511	NC_022110	CT	4	8	337011	337018	0 %	50 %	0 %	50 %	532353481
6512	NC_022110	T	6	6	337038	337043	0 %	100 %	0 %	0 %	532353481
6513	NC_022110	AC	3	6	337103	337108	50 %	0 %	0 %	50 %	532353482
6514	NC_022110	GAAG	2	8	337177	337184	50 %	0 %	50 %	0 %	532353482
6515	NC_022110	CTAAA	2	10	337217	337226	60 %	20 %	0 %	20 %	532353482
6516	NC_022110	GCT	2	6	337253	337258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353482
6517	NC_022110	CTC	2	6	337271	337276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353482
6518	NC_022110	CA	3	6	337283	337288	50 %	0 %	0 %	50 %	532353482
6519	NC_022110	CCA	2	6	337307	337312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353482
6520	NC_022110	CT	3	6	337353	337358	0 %	50 %	0 %	50 %	532353482
6521	NC_022110	AAG	2	6	337747	337752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353482
6522	NC_022110	AAG	2	6	337763	337768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353482
6523	NC_022110	ATCT	2	8	337829	337836	25 %	50 %	0 %	25 %	532353482
6524	NC_022110	TCCAA	2	10	337852	337861	40 %	20 %	0 %	40 %	532353482
6525	NC_022110	CTT	2	6	337880	337885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353482
6526	NC_022110	TCCAT	2	10	337935	337944	20 %	40 %	0 %	40 %	532353482
6527	NC_022110	TTC	2	6	337968	337973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353482
6528	NC_022110	ATC	2	6	338062	338067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
6529	NC_022110	TCA	2	6	338200	338205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
6530	NC_022110	CTT	2	6	338358	338363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353482
6531	NC_022110	TCA	2	6	338380	338385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
6532	NC_022110	CCAA	2	8	338388	338395	50 %	0 %	0 %	50 %	532353482
6533	NC_022110	GAA	2	6	338419	338424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353482
6534	NC_022110	TAT	2	6	338531	338536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353482
6535	NC_022110	CCA	2	6	338559	338564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353482
6536	NC_022110	CTA	2	6	338572	338577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
6537	NC_022110	ATT	2	6	338595	338600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353482
6538	NC_022110	GGA	2	6	338632	338637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353482
6539	NC_022110	TTC	2	6	338649	338654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353482
6540	NC_022110	GA	3	6	338716	338721	50 %	0 %	50 %	0 %	532353482
6541	NC_022110	ATA	2	6	338818	338823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353482
6542	NC_022110	TC	3	6	338879	338884	0 %	50 %	0 %	50 %	532353482
6543	NC_022110	ATC	2	6	338940	338945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
6544	NC_022110	AAT	2	6	339012	339017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353482
6545	NC_022110	GTA	2	6	339183	339188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353482
6546	NC_022110	TC	4	8	339199	339206	0 %	50 %	0 %	50 %	532353482
6547	NC_022110	TCA	2	6	339220	339225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
6548	NC_022110	ATA	2	6	339267	339272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353482
6549	NC_022110	CTT	2	6	339315	339320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353482
6550	NC_022110	T	6	6	339419	339424	0 %	100 %	0 %	0 %	532353482
6551	NC_022110	TTC	2	6	339453	339458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353482
6552	NC_022110	TCG	2	6	339474	339479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353482
6553	NC_022110	CAA	2	6	339556	339561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353482
6554	NC_022110	TGG	2	6	339654	339659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353482
6555	NC_022110	ACT	2	6	339690	339695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353482
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6557	NC_022110	TGT	2	6	339809	339814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353482
6558	NC_022110	CAAG	2	8	339906	339913	50 %	0 %	25 %	25 %	532353482
6559	NC_022110	TA	3	6	340067	340072	50 %	50 %	0 %	0 %	532353483
6560	NC_022110	CAT	2	6	340097	340102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353483
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6562	NC_022110	GA	3	6	340161	340166	50 %	0 %	50 %	0 %	532353483
6563	NC_022110	GCT	2	6	340205	340210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353483
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6565	NC_022110	CAGAG	2	10	340329	340338	40 %	0 %	40 %	20 %	532353483
6566	NC_022110	CGC	2	6	340341	340346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353483
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6569	NC_022110	AT	3	6	340435	340440	50 %	50 %	0 %	0 %	532353483
6570	NC_022110	ACTG	2	8	340546	340553	25 %	25 %	25 %	25 %	532353483
6571	NC_022110	CAT	2	6	340578	340583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354057
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6573	NC_022110	TGA	2	6	340621	340626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532354057
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6575	NC_022110	AAT	2	6	340645	340650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532354057
6576	NC_022110	ACT	2	6	340763	340768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532354057
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6578	NC_022110	T	7	7	340810	340816	0 %	100 %	0 %	0 %	532354057
6579	NC_022110	A	7	7	340818	340824	100 %	0 %	0 %	0 %	532354057
6580	NC_022110	T	6	6	340875	340880	0 %	100 %	0 %	0 %	532354057
6581	NC_022110	CCA	3	9	340900	340908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532354057
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6583	NC_022110	ATA	2	6	341220	341225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353484
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6587	NC_022110	AGA	2	6	341343	341348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353484
6588	NC_022110	TAC	2	6	341391	341396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353484
6589	NC_022110	AAC	2	6	341448	341453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353484
6590	NC_022110	TA	3	6	341459	341464	50 %	50 %	0 %	0 %	532353484
6591	NC_022110	CTA	2	6	341476	341481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353484
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6593	NC_022110	TCT	2	6	341516	341521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353484
6594	NC_022110	ATA	2	6	341580	341585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353484
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6597	NC_022110	TGT	2	6	341670	341675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353484
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6599	NC_022110	AC	4	8	341688	341695	50 %	0 %	0 %	50 %	532353484
6600	NC_022110	ATG	2	6	341786	341791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353484
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6602	NC_022110	TAA	2	6	341825	341830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353484
6603	NC_022110	A	7	7	341839	341845	100 %	0 %	0 %	0 %	532353484
6604	NC_022110	CTTCA	2	10	342027	342036	20 %	40 %	0 %	40 %	532353484
6605	NC_022110	ATC	2	6	342081	342086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353484
6606	NC_022110	TCT	2	6	342094	342099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353484
6607	NC_022110	CATTG	2	10	342131	342140	20 %	40 %	20 %	20 %	532353484
6608	NC_022110	CTT	2	6	342198	342203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353484
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6610	NC_022110	TCT	2	6	342361	342366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353484
6611	NC_022110	A	7	7	342404	342410	100 %	0 %	0 %	0 %	532353484
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6614	NC_022110	TTAG	2	8	342625	342632	25 %	50 %	25 %	0 %	532353484
6615	NC_022110	TC	3	6	342722	342727	0 %	50 %	0 %	50 %	532353484
6616	NC_022110	CTT	2	6	342750	342755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353484
6617	NC_022110	AATA	2	8	342762	342769	75 %	25 %	0 %	0 %	532353484
6618	NC_022110	ACT	2	6	342799	342804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353484
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6621	NC_022110	T	6	6	342920	342925	0 %	100 %	0 %	0 %	532353485
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6623	NC_022110	AGC	2	6	342975	342980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353485
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6991	NC_022110	TCT	2	6	361445	361450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353499
6992	NC_022110	CTTT	2	8	361464	361471	0 %	75 %	0 %	25 %	532353499
6993	NC_022110	CA	3	6	361579	361584	50 %	0 %	0 %	50 %	532353499
6994	NC_022110	TCA	2	6	361614	361619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353499
6995	NC_022110	TCT	2	6	361668	361673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353500
6996	NC_022110	TTC	2	6	361678	361683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353500
6997	NC_022110	GCT	2	6	361703	361708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353500
6998	NC_022110	T	7	7	361711	361717	0 %	100 %	0 %	0 %	532353500
6999	NC_022110	TTC	2	6	361742	361747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353500
7000	NC_022110	TTC	2	6	361771	361776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353500

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