MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain J/27-97 genome

Total Repeats: 20165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022110	GAA	2	6	238608	238613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353391
4502	NC_022110	T	6	6	238615	238620	0 %	100 %	0 %	0 %	532353391
4503	NC_022110	CTG	2	6	238687	238692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353391
4504	NC_022110	GAC	2	6	238717	238722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353391
4505	NC_022110	TAT	2	6	238724	238729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353391
4506	NC_022110	TTC	2	6	238771	238776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353391
4507	NC_022110	CT	4	8	238836	238843	0 %	50 %	0 %	50 %	532353391
4508	NC_022110	CAG	2	6	238988	238993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353391
4509	NC_022110	CAG	2	6	239127	239132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353391
4510	NC_022110	AC	3	6	239268	239273	50 %	0 %	0 %	50 %	532353391
4511	NC_022110	TCTCCT	2	12	239482	239493	0 %	50 %	0 %	50 %	532353391
4512	NC_022110	TCTTT	2	10	239579	239588	0 %	80 %	0 %	20 %	532353391
4513	NC_022110	TAG	3	9	239593	239601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353391
4514	NC_022110	TTCT	2	8	239667	239674	0 %	75 %	0 %	25 %	532353391
4515	NC_022110	AAT	2	6	239689	239694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353391
4516	NC_022110	GTC	2	6	239793	239798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353392
4517	NC_022110	TCC	2	6	239838	239843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353392
4518	NC_022110	ACGG	2	8	239851	239858	25 %	0 %	50 %	25 %	532353392
4519	NC_022110	AGA	2	6	239871	239876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353392
4520	NC_022110	CAA	2	6	239901	239906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353392
4521	NC_022110	TCA	2	6	239959	239964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353392
4522	NC_022110	TCT	2	6	239986	239991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353392
4523	NC_022110	AAACCA	2	12	240056	240067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353392
4524	NC_022110	A	6	6	240077	240082	100 %	0 %	0 %	0 %	532353392
4525	NC_022110	AATCT	2	10	240172	240181	40 %	40 %	0 %	20 %	532353392
4526	NC_022110	TCA	2	6	240197	240202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353392
4527	NC_022110	CA	3	6	240214	240219	50 %	0 %	0 %	50 %	532353392
4528	NC_022110	ACT	2	6	240362	240367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353393
4529	NC_022110	AGAT	2	8	240376	240383	50 %	25 %	25 %	0 %	532353393
4530	NC_022110	CTT	2	6	240438	240443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353393
4531	NC_022110	CTG	2	6	240444	240449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353393
4532	NC_022110	T	6	6	240463	240468	0 %	100 %	0 %	0 %	532353393
4533	NC_022110	AAT	2	6	240529	240534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353393
4534	NC_022110	ATTA	2	8	240571	240578	50 %	50 %	0 %	0 %	532353393
4535	NC_022110	T	7	7	240629	240635	0 %	100 %	0 %	0 %	532353393
4536	NC_022110	AAT	2	6	240701	240706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353393
4537	NC_022110	TC	3	6	240825	240830	0 %	50 %	0 %	50 %	532353394
4538	NC_022110	AGA	2	6	240872	240877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353394
4539	NC_022110	CTA	2	6	240946	240951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353394
4540	NC_022110	GAA	3	9	240976	240984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353394
4541	NC_022110	T	6	6	240985	240990	0 %	100 %	0 %	0 %	532353394
4542	NC_022110	CTC	2	6	241009	241014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353394
4543	NC_022110	TCCA	2	8	241052	241059	25 %	25 %	0 %	50 %	532353394
4544	NC_022110	CT	3	6	241205	241210	0 %	50 %	0 %	50 %	532353394
4545	NC_022110	CA	4	8	241235	241242	50 %	0 %	0 %	50 %	532353394
4546	NC_022110	CCA	2	6	241252	241257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353394
4547	NC_022110	GAA	2	6	241308	241313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353394
4548	NC_022110	GTT	2	6	241327	241332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353394
4549	NC_022110	N	10	10	241356	241365	0 %	0 %	0 %	0 %	532353394
4550	NC_022110	AAT	2	6	241441	241446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353394
4551	NC_022110	TAA	2	6	241578	241583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353395
4552	NC_022110	AG	3	6	241590	241595	50 %	0 %	50 %	0 %	532353395
4553	NC_022110	T	8	8	241611	241618	0 %	100 %	0 %	0 %	532353395
4554	NC_022110	TGA	2	6	241620	241625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353395
4555	NC_022110	TCT	2	6	241646	241651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353395
4556	NC_022110	AAG	2	6	241670	241675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353395
4557	NC_022110	TAA	2	6	241745	241750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353395
4558	NC_022110	AGA	2	6	241788	241793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353395
4559	NC_022110	CAAT	2	8	241802	241809	50 %	25 %	0 %	25 %	532353395
4560	NC_022110	CAA	2	6	241848	241853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353395
4561	NC_022110	ACA	2	6	241929	241934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353395
4562	NC_022110	ACAA	2	8	241955	241962	75 %	0 %	0 %	25 %	532353395
4563	NC_022110	CTT	2	6	241967	241972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353395
4564	NC_022110	TCT	2	6	241999	242004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353395
4565	NC_022110	ACT	2	6	242055	242060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353395
4566	NC_022110	CAG	2	6	242150	242155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353395
4567	NC_022110	GAAAA	2	10	242200	242209	80 %	0 %	20 %	0 %	532353395
4568	NC_022110	AAG	2	6	242220	242225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353395
4569	NC_022110	AGCT	2	8	242238	242245	25 %	25 %	25 %	25 %	532353395
4570	NC_022110	TCT	2	6	242297	242302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353395
4571	NC_022110	CA	3	6	242354	242359	50 %	0 %	0 %	50 %	532353395
4572	NC_022110	GAG	2	6	242390	242395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353395
4573	NC_022110	TCT	2	6	242405	242410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353395
4574	NC_022110	A	7	7	242464	242470	100 %	0 %	0 %	0 %	532353395
4575	NC_022110	ATT	2	6	242562	242567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353395
4576	NC_022110	TGC	2	6	242581	242586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353395
4577	NC_022110	T	6	6	242592	242597	0 %	100 %	0 %	0 %	532353395
4578	NC_022110	GAA	2	6	242621	242626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353395
4579	NC_022110	T	7	7	242642	242648	0 %	100 %	0 %	0 %	532353395
4580	NC_022110	ATC	2	6	242673	242678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353395
4581	NC_022110	CAC	2	6	242708	242713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353395
4582	NC_022110	ACT	2	6	242769	242774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353395
4583	NC_022110	CAA	2	6	242795	242800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353395
4584	NC_022110	TA	4	8	242814	242821	50 %	50 %	0 %	0 %	532353395
4585	NC_022110	CGAT	2	8	242846	242853	25 %	25 %	25 %	25 %	532353395
4586	NC_022110	ACA	2	6	242872	242877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353395
4587	NC_022110	CAA	2	6	242925	242930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353395
4588	NC_022110	TAA	2	6	242931	242936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353395
4589	NC_022110	TGC	2	6	242937	242942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353395
4590	NC_022110	GCT	2	6	242944	242949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353395
4591	NC_022110	CAG	2	6	242951	242956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353395
4592	NC_022110	CTC	2	6	243032	243037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353395
4593	NC_022110	TAG	2	6	243038	243043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353395
4594	NC_022110	GGA	2	6	243049	243054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353395
4595	NC_022110	AC	3	6	243110	243115	50 %	0 %	0 %	50 %	532353395
4596	NC_022110	CAGA	2	8	243505	243512	50 %	0 %	25 %	25 %	532353396
4597	NC_022110	AAT	2	6	243513	243518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353396
4598	NC_022110	CT	3	6	243579	243584	0 %	50 %	0 %	50 %	532353396
4599	NC_022110	GCTG	2	8	243687	243694	0 %	25 %	50 %	25 %	532353396
4600	NC_022110	CTT	2	6	243706	243711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353396
4601	NC_022110	T	6	6	243761	243766	0 %	100 %	0 %	0 %	532353396
4602	NC_022110	TAAAC	2	10	243770	243779	60 %	20 %	0 %	20 %	532353396
4603	NC_022110	ACA	2	6	243804	243809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532353396
4604	NC_022110	TCT	2	6	243820	243825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353396
4605	NC_022110	TCT	3	9	243897	243905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353396
4606	NC_022110	GAA	2	6	243906	243911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353396
4607	NC_022110	TTG	2	6	243913	243918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353396
4608	NC_022110	AG	3	6	243945	243950	50 %	0 %	50 %	0 %	532353396
4609	NC_022110	CTTGG	2	10	243951	243960	0 %	40 %	40 %	20 %	532353396
4610	NC_022110	TGT	2	6	243998	244003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353396
4611	NC_022110	AAT	2	6	244005	244010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353396
4612	NC_022110	CTG	2	6	244024	244029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353396
4613	NC_022110	AGG	2	6	244109	244114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353396
4614	NC_022110	AATT	2	8	244124	244131	50 %	50 %	0 %	0 %	532353396
4615	NC_022110	TGA	2	6	244142	244147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353396
4616	NC_022110	TCA	2	6	244167	244172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353396
4617	NC_022110	ACC	2	6	244174	244179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532353396
4618	NC_022110	CAG	2	6	244288	244293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353396
4619	NC_022110	TAAT	2	8	244294	244301	50 %	50 %	0 %	0 %	532353396
4620	NC_022110	TGG	2	6	244310	244315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532353396
4621	NC_022110	ATTT	2	8	244395	244402	25 %	75 %	0 %	0 %	532353396
4622	NC_022110	CAT	2	6	244444	244449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353396
4623	NC_022110	TCT	2	6	244456	244461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353396
4624	NC_022110	AGT	2	6	244503	244508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353396
4625	NC_022110	CCTT	2	8	244524	244531	0 %	50 %	0 %	50 %	532353396
4626	NC_022110	GCA	2	6	244612	244617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353397
4627	NC_022110	TTCA	2	8	244626	244633	25 %	50 %	0 %	25 %	532353397
4628	NC_022110	ATA	2	6	244715	244720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353397
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4634	NC_022110	CTA	2	6	245035	245040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353397
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4642	NC_022110	TTTG	2	8	245558	245565	0 %	75 %	25 %	0 %	532353397
4643	NC_022110	TTG	2	6	245636	245641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353397
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4645	NC_022110	TTCT	2	8	245669	245676	0 %	75 %	0 %	25 %	532353397
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4652	NC_022110	AAG	2	6	245870	245875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353397
4653	NC_022110	TTTC	2	8	245880	245887	0 %	75 %	0 %	25 %	532353397
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4656	NC_022110	TC	3	6	246192	246197	0 %	50 %	0 %	50 %	532353398
4657	NC_022110	TCCCC	2	10	246236	246245	0 %	20 %	0 %	80 %	532353398
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4730	NC_022110	GCC	2	6	249621	249626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532353402
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4733	NC_022110	GAT	2	6	249696	249701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353402
4734	NC_022110	TCCGT	2	10	249712	249721	0 %	40 %	20 %	40 %	532353402
4735	NC_022110	CTC	2	6	249728	249733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532353402
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4738	NC_022110	ATA	2	6	249877	249882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353402
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4742	NC_022110	GGAA	2	8	249973	249980	50 %	0 %	50 %	0 %	532353402
4743	NC_022110	GCT	2	6	250000	250005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353402
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4746	NC_022110	GA	3	6	250192	250197	50 %	0 %	50 %	0 %	532353402
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4871	NC_022110	TTG	2	6	257608	257613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353411
4872	NC_022110	GGC	2	6	257837	257842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532353412
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4874	NC_022110	ATT	2	6	257876	257881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353412
4875	NC_022110	CT	3	6	257909	257914	0 %	50 %	0 %	50 %	532353412
4876	NC_022110	AGG	2	6	257986	257991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353412
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4884	NC_022110	TTTA	2	8	258602	258609	25 %	75 %	0 %	0 %	532353412
4885	NC_022110	T	6	6	258659	258664	0 %	100 %	0 %	0 %	532353412
4886	NC_022110	TCT	3	9	258672	258680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353412
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4980	NC_022110	TAT	2	6	263073	263078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532353415
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4988	NC_022110	TTG	2	6	263589	263594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353416
4989	NC_022110	ACCG	2	8	263639	263646	25 %	0 %	25 %	50 %	532353416
4990	NC_022110	TCT	2	6	263745	263750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353417
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4992	NC_022110	CAT	2	6	263818	263823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532353417
4993	NC_022110	TTTCA	2	10	263851	263860	20 %	60 %	0 %	20 %	532353417
4994	NC_022110	A	8	8	263945	263952	100 %	0 %	0 %	0 %	532353417
4995	NC_022110	CTT	2	6	264429	264434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532353418
4996	NC_022110	AAT	2	6	264457	264462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353418
4997	NC_022110	GCT	2	6	264473	264478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353418
4998	NC_022110	TAA	2	6	264531	264536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532353418
4999	NC_022110	CTG	2	6	264573	264578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532353418
5000	NC_022110	TA	3	6	264590	264595	50 %	50 %	0 %	0 %	532353418

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