MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain D/14-96 genome

Total Repeats: 20343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022109	TTG	2	6	157832	157837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352417
3002	NC_022109	A	6	6	157861	157866	100 %	0 %	0 %	0 %	532352417
3003	NC_022109	T	6	6	157940	157945	0 %	100 %	0 %	0 %	532352417
3004	NC_022109	ATG	2	6	157990	157995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352417
3005	NC_022109	TG	3	6	158041	158046	0 %	50 %	50 %	0 %	532352417
3006	NC_022109	T	6	6	158060	158065	0 %	100 %	0 %	0 %	532352417
3007	NC_022109	AGA	2	6	158082	158087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352417
3008	NC_022109	TCCTTG	2	12	158310	158321	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532352418
3009	NC_022109	GAA	2	6	158331	158336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352418
3010	NC_022109	GTT	2	6	158348	158353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352418
3011	NC_022109	AAGTTT	2	12	158395	158406	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	532352418
3012	NC_022109	TTA	2	6	158519	158524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352418
3013	NC_022109	CG	3	6	158551	158556	0 %	0 %	50 %	50 %	532352418
3014	NC_022109	AGA	2	6	158577	158582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352418
3015	NC_022109	CAT	2	6	158586	158591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352418
3016	NC_022109	TTC	2	6	158681	158686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352418
3017	NC_022109	AGA	3	9	158691	158699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352418
3018	NC_022109	ATT	2	6	159148	159153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352419
3019	NC_022109	CAT	2	6	159300	159305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352419
3020	NC_022109	TCAA	2	8	159361	159368	50 %	25 %	0 %	25 %	532352419
3021	NC_022109	TGA	2	6	159558	159563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352419
3022	NC_022109	GAA	2	6	159586	159591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352419
3023	NC_022109	TC	3	6	159621	159626	0 %	50 %	0 %	50 %	532352419
3024	NC_022109	GT	3	6	159659	159664	0 %	50 %	50 %	0 %	532352419
3025	NC_022109	AAT	2	6	159703	159708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352419
3026	NC_022109	GGA	2	6	159715	159720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352419
3027	NC_022109	AGGAA	2	10	159744	159753	60 %	0 %	40 %	0 %	532352419
3028	NC_022109	TAG	2	6	159774	159779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352419
3029	NC_022109	AGG	2	6	159780	159785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352419
3030	NC_022109	CTG	2	6	159800	159805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352419
3031	NC_022109	AG	3	6	159831	159836	50 %	0 %	50 %	0 %	532352419
3032	NC_022109	TCT	2	6	159859	159864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352419
3033	NC_022109	AGG	2	6	159978	159983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352419
3034	NC_022109	GAA	2	6	159991	159996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352419
3035	NC_022109	AGA	2	6	160039	160044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352420
3036	NC_022109	ATAC	2	8	160163	160170	50 %	25 %	0 %	25 %	532352420
3037	NC_022109	AGG	2	6	160189	160194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352420
3038	NC_022109	AGG	2	6	160204	160209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352420
3039	NC_022109	CT	3	6	160302	160307	0 %	50 %	0 %	50 %	532352420
3040	NC_022109	GA	3	6	160312	160317	50 %	0 %	50 %	0 %	532352420
3041	NC_022109	ATT	2	6	160332	160337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352420
3042	NC_022109	ATA	2	6	160428	160433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352420
3043	NC_022109	AC	3	6	160452	160457	50 %	0 %	0 %	50 %	532352420
3044	NC_022109	A	8	8	160497	160504	100 %	0 %	0 %	0 %	532352420
3045	NC_022109	ATG	2	6	160578	160583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352420
3046	NC_022109	TCT	2	6	160593	160598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352420
3047	NC_022109	TTC	2	6	160807	160812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352420
3048	NC_022109	AGG	2	6	160818	160823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352420
3049	NC_022109	ATA	3	9	160844	160852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352420
3050	NC_022109	AACAGC	2	12	160947	160958	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532352421
3051	NC_022109	AGT	2	6	160990	160995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352421
3052	NC_022109	TGG	2	6	161076	161081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352421
3053	NC_022109	TC	3	6	161403	161408	0 %	50 %	0 %	50 %	532352421
3054	NC_022109	A	6	6	161421	161426	100 %	0 %	0 %	0 %	532352421
3055	NC_022109	CTG	2	6	161489	161494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352421
3056	NC_022109	GCG	2	6	161505	161510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352421
3057	NC_022109	ACA	2	6	161551	161556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352421
3058	NC_022109	GCA	2	6	161575	161580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352421
3059	NC_022109	CTT	2	6	161594	161599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352421
3060	NC_022109	ATTG	2	8	161613	161620	25 %	50 %	25 %	0 %	532352421
3061	NC_022109	TCT	2	6	161644	161649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352421
3062	NC_022109	CT	4	8	161648	161655	0 %	50 %	0 %	50 %	532352421
3063	NC_022109	TGT	2	6	161676	161681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352421
3064	NC_022109	TGG	2	6	162091	162096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352422
3065	NC_022109	TGT	2	6	162134	162139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3066	NC_022109	GAA	2	6	162144	162149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3067	NC_022109	GGAA	2	8	162186	162193	50 %	0 %	50 %	0 %	532352422
3068	NC_022109	GAA	3	9	162201	162209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3069	NC_022109	TTTC	2	8	162304	162311	0 %	75 %	0 %	25 %	532352422
3070	NC_022109	ATCT	2	8	162330	162337	25 %	50 %	0 %	25 %	532352422
3071	NC_022109	CTT	2	6	162355	162360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352422
3072	NC_022109	CCA	2	6	162382	162387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352422
3073	NC_022109	GA	3	6	162409	162414	50 %	0 %	50 %	0 %	532352422
3074	NC_022109	TTG	2	6	162435	162440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3075	NC_022109	GAA	2	6	162456	162461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3076	NC_022109	TTA	2	6	162512	162517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352422
3077	NC_022109	TAG	2	6	162523	162528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352422
3078	NC_022109	GTT	2	6	162610	162615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3079	NC_022109	ACA	3	9	162617	162625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352422
3080	NC_022109	AGA	2	6	162737	162742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3081	NC_022109	TG	3	6	162796	162801	0 %	50 %	50 %	0 %	532352422
3082	NC_022109	AGC	2	6	162814	162819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352422
3083	NC_022109	TAG	2	6	162832	162837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352422
3084	NC_022109	TCGA	2	8	162846	162853	25 %	25 %	25 %	25 %	532352422
3085	NC_022109	AGAGA	2	10	162975	162984	60 %	0 %	40 %	0 %	532352422
3086	NC_022109	ATT	2	6	162998	163003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352422
3087	NC_022109	GAGG	2	8	163023	163030	25 %	0 %	75 %	0 %	532352422
3088	NC_022109	TC	3	6	163036	163041	0 %	50 %	0 %	50 %	532352422
3089	NC_022109	TGT	2	6	163268	163273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3090	NC_022109	CTT	3	9	163294	163302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352422
3091	NC_022109	TTG	2	6	163307	163312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352422
3092	NC_022109	AGC	2	6	163352	163357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352422
3093	NC_022109	AGG	2	6	163361	163366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352422
3094	NC_022109	GAA	2	6	163395	163400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352422
3095	NC_022109	AGCAA	2	10	163410	163419	60 %	0 %	20 %	20 %	532352422
3096	NC_022109	TAC	2	6	163436	163441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352422
3097	NC_022109	TGGC	2	8	163486	163493	0 %	25 %	50 %	25 %	532352422
3098	NC_022109	CCT	2	6	163575	163580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352422
3099	NC_022109	GT	3	6	163594	163599	0 %	50 %	50 %	0 %	532352422
3100	NC_022109	GAG	2	6	163603	163608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352422
3101	NC_022109	GAT	2	6	163629	163634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352422
3102	NC_022109	AAT	2	6	163659	163664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352422
3103	NC_022109	GAT	2	6	163747	163752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352423
3104	NC_022109	TAT	2	6	163795	163800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352423
3105	NC_022109	TCAA	2	8	163805	163812	50 %	25 %	0 %	25 %	532352423
3106	NC_022109	CGA	2	6	163814	163819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352423
3107	NC_022109	ATG	2	6	163835	163840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352423
3108	NC_022109	TGT	2	6	163967	163972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352423
3109	NC_022109	T	7	7	164011	164017	0 %	100 %	0 %	0 %	532352423
3110	NC_022109	ATT	2	6	164031	164036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352423
3111	NC_022109	GAG	2	6	164234	164239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3112	NC_022109	TTTC	2	8	164245	164252	0 %	75 %	0 %	25 %	532352423
3113	NC_022109	GGA	2	6	164332	164337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3114	NC_022109	TCT	2	6	164353	164358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352423
3115	NC_022109	GCT	2	6	164365	164370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352423
3116	NC_022109	A	8	8	164414	164421	100 %	0 %	0 %	0 %	532352423
3117	NC_022109	GA	3	6	164525	164530	50 %	0 %	50 %	0 %	532352423
3118	NC_022109	GC	3	6	164541	164546	0 %	0 %	50 %	50 %	532352423
3119	NC_022109	GTC	2	6	164572	164577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352423
3120	NC_022109	GGA	2	6	164685	164690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
3121	NC_022109	T	7	7	164750	164756	0 %	100 %	0 %	0 %	532352423
3122	NC_022109	A	8	8	164807	164814	100 %	0 %	0 %	0 %	532352423
3123	NC_022109	AGG	2	6	164850	164855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352423
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3235	NC_022109	A	7	7	170166	170172	100 %	0 %	0 %	0 %	532352424
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3241	NC_022109	T	6	6	170480	170485	0 %	100 %	0 %	0 %	532352425
3242	NC_022109	TAA	2	6	170583	170588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352425
3243	NC_022109	GGGA	2	8	170619	170626	25 %	0 %	75 %	0 %	532352425
3244	NC_022109	GCA	2	6	170645	170650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352425
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3247	NC_022109	GAA	2	6	170801	170806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352425
3248	NC_022109	T	6	6	170812	170817	0 %	100 %	0 %	0 %	532352425
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3251	NC_022109	GA	3	6	170972	170977	50 %	0 %	50 %	0 %	532352425
3252	NC_022109	AGA	2	6	171031	171036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352425
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3264	NC_022109	GTT	2	6	171501	171506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352425
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3493	NC_022109	GAG	2	6	183303	183308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532353133
3494	NC_022109	GAA	2	6	183323	183328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353133
3495	NC_022109	TTG	2	6	183334	183339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532353133
3496	NC_022109	AGA	2	6	183466	183471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532353133
3497	NC_022109	TGA	2	6	183488	183493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532353133
3498	NC_022109	CAG	3	9	183561	183569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532353133
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