MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_022108	CTT	2	6	1000577	1000582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352173
19502	NC_022108	AGA	3	9	1000619	1000627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352173
19503	NC_022108	TAT	2	6	1000661	1000666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352173
19504	NC_022108	AGA	3	9	1000697	1000705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352173
19505	NC_022108	AGA	2	6	1000718	1000723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352173
19506	NC_022108	TGG	2	6	1000784	1000789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352173
19507	NC_022108	CTT	2	6	1000833	1000838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352173
19508	NC_022108	CAA	2	6	1000962	1000967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352174
19509	NC_022108	CAA	2	6	1000974	1000979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352174
19510	NC_022108	AGGTT	2	10	1001038	1001047	20 %	40 %	40 %	0 %	532352174
19511	NC_022108	AGC	2	6	1001061	1001066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352174
19512	NC_022108	CTTTT	2	10	1001096	1001105	0 %	80 %	0 %	20 %	532352174
19513	NC_022108	ATC	2	6	1001125	1001130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352174
19514	NC_022108	CAT	2	6	1001213	1001218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352174
19515	NC_022108	GA	4	8	1001333	1001340	50 %	0 %	50 %	0 %	532352174
19516	NC_022108	CAG	2	6	1001372	1001377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352174
19517	NC_022108	T	6	6	1001541	1001546	0 %	100 %	0 %	0 %	532352174
19518	NC_022108	AGA	2	6	1001631	1001636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352174
19519	NC_022108	ATA	2	6	1001652	1001657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352174
19520	NC_022108	CCA	2	6	1001702	1001707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352174
19521	NC_022108	AAT	2	6	1001728	1001733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352174
19522	NC_022108	AG	3	6	1001803	1001808	50 %	0 %	50 %	0 %	532352175
19523	NC_022108	CAAG	2	8	1001815	1001822	50 %	0 %	25 %	25 %	532352175
19524	NC_022108	TCC	2	6	1001863	1001868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352175
19525	NC_022108	GAA	2	6	1001928	1001933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352175
19526	NC_022108	GAAG	2	8	1001974	1001981	50 %	0 %	50 %	0 %	532352175
19527	NC_022108	TCA	2	6	1001987	1001992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352175
19528	NC_022108	CCT	2	6	1002022	1002027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352175
19529	NC_022108	TAG	2	6	1002093	1002098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352175
19530	NC_022108	ATG	2	6	1002133	1002138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352175
19531	NC_022108	T	6	6	1002147	1002152	0 %	100 %	0 %	0 %	532352175
19532	NC_022108	GAAA	2	8	1002153	1002160	75 %	0 %	25 %	0 %	532352175
19533	NC_022108	T	6	6	1002163	1002168	0 %	100 %	0 %	0 %	532352175
19534	NC_022108	AAT	2	6	1002169	1002174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352175
19535	NC_022108	AG	3	6	1002190	1002195	50 %	0 %	50 %	0 %	532352175
19536	NC_022108	A	6	6	1002218	1002223	100 %	0 %	0 %	0 %	532352175
19537	NC_022108	TGT	2	6	1002284	1002289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352175
19538	NC_022108	GAT	2	6	1002355	1002360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352175
19539	NC_022108	AGCC	2	8	1002369	1002376	25 %	0 %	25 %	50 %	532352175
19540	NC_022108	GAA	2	6	1002390	1002395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352175
19541	NC_022108	TCA	3	9	1002411	1002419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352175
19542	NC_022108	TGC	2	6	1002464	1002469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352176
19543	NC_022108	GAA	2	6	1002594	1002599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352176
19544	NC_022108	ACA	2	6	1002638	1002643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352176
19545	NC_022108	ATA	2	6	1002687	1002692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352176
19546	NC_022108	AGC	2	6	1002746	1002751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352176
19547	NC_022108	CTT	2	6	1002758	1002763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352176
19548	NC_022108	CTG	2	6	1002816	1002821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352176
19549	NC_022108	AAAAT	2	10	1002825	1002834	80 %	20 %	0 %	0 %	532352176
19550	NC_022108	A	8	8	1002851	1002858	100 %	0 %	0 %	0 %	532352176
19551	NC_022108	TGG	2	6	1002890	1002895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352176
19552	NC_022108	TA	3	6	1002897	1002902	50 %	50 %	0 %	0 %	532352176
19553	NC_022108	AAG	2	6	1002907	1002912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352176
19554	NC_022108	CA	3	6	1002955	1002960	50 %	0 %	0 %	50 %	532352176
19555	NC_022108	TAA	2	6	1002994	1002999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352176
19556	NC_022108	T	6	6	1003395	1003400	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
19557	NC_022108	AGAA	2	8	1003446	1003453	75 %	0 %	25 %	0 %	532352177
19558	NC_022108	AAC	2	6	1003454	1003459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352177
19559	NC_022108	ATG	2	6	1003593	1003598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
19560	NC_022108	T	6	6	1003699	1003704	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
19561	NC_022108	CTGC	2	8	1003741	1003748	0 %	25 %	25 %	50 %	532352177
19562	NC_022108	CTC	2	6	1003763	1003768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352177
19563	NC_022108	AAG	2	6	1003824	1003829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352177
19564	NC_022108	AGA	2	6	1003842	1003847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352177
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19566	NC_022108	A	6	6	1003896	1003901	100 %	0 %	0 %	0 %	532352177
19567	NC_022108	TCCAA	2	10	1003949	1003958	40 %	20 %	0 %	40 %	532352177
19568	NC_022108	GAGTA	2	10	1003959	1003968	40 %	20 %	40 %	0 %	532352177
19569	NC_022108	TAG	2	6	1003976	1003981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
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19571	NC_022108	T	6	6	1004090	1004095	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
19572	NC_022108	A	8	8	1004107	1004114	100 %	0 %	0 %	0 %	532352177
19573	NC_022108	TGC	2	6	1004117	1004122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352177
19574	NC_022108	AAG	2	6	1004127	1004132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352177
19575	NC_022108	AGT	2	6	1004367	1004372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
19576	NC_022108	TGA	2	6	1004428	1004433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
19577	NC_022108	GAT	2	6	1004475	1004480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
19578	NC_022108	AACCA	2	10	1004498	1004507	60 %	0 %	0 %	40 %	532352177
19579	NC_022108	CAA	2	6	1004571	1004576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352177
19580	NC_022108	AGT	2	6	1004626	1004631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
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19583	NC_022108	GAT	2	6	1004802	1004807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352177
19584	NC_022108	TAA	2	6	1004819	1004824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352177
19585	NC_022108	T	6	6	1004826	1004831	0 %	100 %	0 %	0 %	532352177
19586	NC_022108	A	6	6	1004843	1004848	100 %	0 %	0 %	0 %	532352177
19587	NC_022108	GAAG	2	8	1004858	1004865	50 %	0 %	50 %	0 %	532352177
19588	NC_022108	AG	3	6	1004878	1004883	50 %	0 %	50 %	0 %	532352177
19589	NC_022108	TTG	2	6	1005095	1005100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352282
19590	NC_022108	TC	3	6	1005117	1005122	0 %	50 %	0 %	50 %	532352282
19591	NC_022108	TGA	2	6	1005132	1005137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
19592	NC_022108	ATG	2	6	1005299	1005304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
19593	NC_022108	A	7	7	1005378	1005384	100 %	0 %	0 %	0 %	532352282
19594	NC_022108	GAA	2	6	1005431	1005436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352282
19595	NC_022108	GATG	2	8	1005444	1005451	25 %	25 %	50 %	0 %	532352282
19596	NC_022108	GAG	2	6	1005625	1005630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352282
19597	NC_022108	ACT	2	6	1005663	1005668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352282
19598	NC_022108	TGC	2	6	1005670	1005675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352282
19599	NC_022108	ATG	2	6	1005687	1005692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
19600	NC_022108	T	6	6	1005763	1005768	0 %	100 %	0 %	0 %	532352282
19601	NC_022108	TTTC	2	8	1005802	1005809	0 %	75 %	0 %	25 %	532352282
19602	NC_022108	AAC	2	6	1005902	1005907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352282
19603	NC_022108	ATT	2	6	1005914	1005919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352282
19604	NC_022108	T	6	6	1005918	1005923	0 %	100 %	0 %	0 %	532352282
19605	NC_022108	CAGT	2	8	1005986	1005993	25 %	25 %	25 %	25 %	532352282
19606	NC_022108	TTA	2	6	1005998	1006003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352282
19607	NC_022108	ATT	2	6	1006029	1006034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352282
19608	NC_022108	TTGT	2	8	1006035	1006042	0 %	75 %	25 %	0 %	532352282
19609	NC_022108	AAG	2	6	1006182	1006187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352282
19610	NC_022108	TGA	2	6	1006225	1006230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352282
19611	NC_022108	CGCC	2	8	1006295	1006302	0 %	0 %	25 %	75 %	532352282
19612	NC_022108	CGGGG	2	10	1006318	1006327	0 %	0 %	80 %	20 %	532352282
19613	NC_022108	CT	3	6	1006373	1006378	0 %	50 %	0 %	50 %	532352282
19614	NC_022108	TAA	2	6	1006383	1006388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352282
19615	NC_022108	GTCG	2	8	1006524	1006531	0 %	25 %	50 %	25 %	532352178
19616	NC_022108	AAG	2	6	1006538	1006543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352178
19617	NC_022108	GGC	2	6	1006616	1006621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352178
19618	NC_022108	TAA	2	6	1006636	1006641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352178
19619	NC_022108	GGT	2	6	1006706	1006711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352178
19620	NC_022108	GTT	2	6	1006746	1006751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352178
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19623	NC_022108	CAT	2	6	1006831	1006836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352178
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19625	NC_022108	ATGA	2	8	1006930	1006937	50 %	25 %	25 %	0 %	532352178
19626	NC_022108	AATTAA	2	12	1006966	1006977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352178
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19647	NC_022108	T	6	6	1007971	1007976	0 %	100 %	0 %	0 %	532352178
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19720	NC_022108	CAT	2	6	1012441	1012446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352181
19721	NC_022108	AAAG	2	8	1012458	1012465	75 %	0 %	25 %	0 %	532352181
19722	NC_022108	ATT	2	6	1012475	1012480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352181
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19724	NC_022108	GCT	2	6	1012607	1012612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352181
19725	NC_022108	TTG	2	6	1012617	1012622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352181
19726	NC_022108	TTC	2	6	1012666	1012671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352181
19727	NC_022108	TGCTA	2	10	1012676	1012685	20 %	40 %	20 %	20 %	532352181
19728	NC_022108	TCCT	2	8	1012716	1012723	0 %	50 %	0 %	50 %	532352181
19729	NC_022108	TGTA	2	8	1012737	1012744	25 %	50 %	25 %	0 %	532352181
19730	NC_022108	GA	3	6	1012780	1012785	50 %	0 %	50 %	0 %	532352181
19731	NC_022108	AG	3	6	1012792	1012797	50 %	0 %	50 %	0 %	532352181
19732	NC_022108	GAG	2	6	1012800	1012805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352181
19733	NC_022108	ATC	2	6	1012824	1012829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352181
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19854	NC_022108	GA	3	6	1017567	1017572	50 %	0 %	50 %	0 %	532352184
19855	NC_022108	GTT	2	6	1017606	1017611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352184
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19972	NC_022108	GAA	2	6	1023679	1023684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352188
19973	NC_022108	CTT	2	6	1023783	1023788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352188
19974	NC_022108	CAG	2	6	1023795	1023800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352188
19975	NC_022108	GTC	2	6	1023849	1023854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352188
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19990	NC_022108	A	6	6	1024443	1024448	100 %	0 %	0 %	0 %	532352188
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19996	NC_022108	TAGC	2	8	1024964	1024971	25 %	25 %	25 %	25 %	532352189
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19999	NC_022108	GGC	2	6	1025060	1025065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352189
20000	NC_022108	CAG	2	6	1025083	1025088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352189

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