MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_022108	GTT	2	6	975307	975312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352150
19003	NC_022108	AGA	2	6	975381	975386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19004	NC_022108	AGA	2	6	975414	975419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19005	NC_022108	GTT	2	6	975474	975479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352150
19006	NC_022108	GC	4	8	975490	975497	0 %	0 %	50 %	50 %	532352150
19007	NC_022108	GCG	2	6	975526	975531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352150
19008	NC_022108	AGT	2	6	975585	975590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352150
19009	NC_022108	TAT	2	6	975600	975605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352150
19010	NC_022108	GGC	2	6	975606	975611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352150
19011	NC_022108	TGC	2	6	975651	975656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352150
19012	NC_022108	TA	3	6	975677	975682	50 %	50 %	0 %	0 %	532352150
19013	NC_022108	CTGAA	2	10	975785	975794	40 %	20 %	20 %	20 %	532352150
19014	NC_022108	ATCT	2	8	975833	975840	25 %	50 %	0 %	25 %	532352150
19015	NC_022108	CAC	2	6	975898	975903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352150
19016	NC_022108	T	6	6	975932	975937	0 %	100 %	0 %	0 %	532352150
19017	NC_022108	CAAGA	2	10	975973	975982	60 %	0 %	20 %	20 %	532352150
19018	NC_022108	CTT	2	6	975983	975988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352150
19019	NC_022108	GCTAT	2	10	976147	976156	20 %	40 %	20 %	20 %	532352150
19020	NC_022108	AGG	2	6	976167	976172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352150
19021	NC_022108	CGG	2	6	976190	976195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352150
19022	NC_022108	TTAA	2	8	976213	976220	50 %	50 %	0 %	0 %	532352150
19023	NC_022108	GAA	2	6	976232	976237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19024	NC_022108	TTA	2	6	976256	976261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352150
19025	NC_022108	CAG	2	6	976277	976282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352150
19026	NC_022108	GGT	2	6	976297	976302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352150
19027	NC_022108	ATG	2	6	976406	976411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352150
19028	NC_022108	TAGC	2	8	976418	976425	25 %	25 %	25 %	25 %	532352150
19029	NC_022108	TTC	2	6	976441	976446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352150
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19031	NC_022108	GAA	2	6	976522	976527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19032	NC_022108	GAA	2	6	976543	976548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19033	NC_022108	GA	3	6	976571	976576	50 %	0 %	50 %	0 %	532352150
19034	NC_022108	AAG	2	6	976588	976593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19035	NC_022108	ATCC	2	8	976670	976677	25 %	25 %	0 %	50 %	532352150
19036	NC_022108	GTG	2	6	976708	976713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352150
19037	NC_022108	GTT	2	6	976715	976720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352150
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19039	NC_022108	CT	3	6	976837	976842	0 %	50 %	0 %	50 %	532352150
19040	NC_022108	TGAT	2	8	976880	976887	25 %	50 %	25 %	0 %	532352150
19041	NC_022108	CAA	2	6	976901	976906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352150
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19043	NC_022108	CTT	2	6	977066	977071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352150
19044	NC_022108	GTT	2	6	977157	977162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352150
19045	NC_022108	GAG	2	6	977174	977179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352150
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19049	NC_022108	GAA	2	6	977412	977417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19050	NC_022108	CCAG	2	8	977616	977623	25 %	0 %	25 %	50 %	532352150
19051	NC_022108	A	6	6	977629	977634	100 %	0 %	0 %	0 %	532352150
19052	NC_022108	A	6	6	977661	977666	100 %	0 %	0 %	0 %	532352150
19053	NC_022108	TAT	2	6	977682	977687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352150
19054	NC_022108	TCA	2	6	977697	977702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352150
19055	NC_022108	TAA	2	6	977735	977740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352150
19056	NC_022108	GAA	2	6	977765	977770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19057	NC_022108	ATT	2	6	977790	977795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352150
19058	NC_022108	GAA	2	6	977807	977812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
19059	NC_022108	CTGT	2	8	977818	977825	0 %	50 %	25 %	25 %	532352150
19060	NC_022108	GAA	2	6	977832	977837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352150
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19062	NC_022108	CAAC	2	8	977979	977986	50 %	0 %	0 %	50 %	532352150
19063	NC_022108	GCG	2	6	978117	978122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352151
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19065	NC_022108	AG	3	6	978159	978164	50 %	0 %	50 %	0 %	532352151
19066	NC_022108	TTGG	2	8	978166	978173	0 %	50 %	50 %	0 %	532352151
19067	NC_022108	AAT	2	6	978175	978180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352151
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19069	NC_022108	CA	3	6	978268	978273	50 %	0 %	0 %	50 %	532352151
19070	NC_022108	GAAA	2	8	978309	978316	75 %	0 %	25 %	0 %	532352151
19071	NC_022108	TGC	2	6	978339	978344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352151
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19078	NC_022108	GAT	2	6	978531	978536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352151
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19088	NC_022108	T	8	8	979056	979063	0 %	100 %	0 %	0 %	532352151
19089	NC_022108	ATA	2	6	979073	979078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352151
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19093	NC_022108	T	7	7	979523	979529	0 %	100 %	0 %	0 %	532352280
19094	NC_022108	A	6	6	979557	979562	100 %	0 %	0 %	0 %	532352280
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19101	NC_022108	ATG	2	6	979957	979962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352280
19102	NC_022108	T	6	6	979970	979975	0 %	100 %	0 %	0 %	532352280
19103	NC_022108	ATG	2	6	979986	979991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352280
19104	NC_022108	GATA	2	8	980000	980007	50 %	25 %	25 %	0 %	532352280
19105	NC_022108	GTT	2	6	980151	980156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352152
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19107	NC_022108	TTA	2	6	980211	980216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352152
19108	NC_022108	ATT	2	6	980232	980237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352152
19109	NC_022108	TAC	2	6	980333	980338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352152
19110	NC_022108	GTT	2	6	980409	980414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352152
19111	NC_022108	AAG	2	6	980431	980436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352152
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19116	NC_022108	T	6	6	980628	980633	0 %	100 %	0 %	0 %	532352152
19117	NC_022108	TAA	2	6	980685	980690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352152
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19119	NC_022108	GTT	2	6	980826	980831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352153
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