MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022108	T	6	6	950322	950327	0 %	100 %	0 %	0 %	532352133
18502	NC_022108	CGG	2	6	950414	950419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352133
18503	NC_022108	TAT	2	6	950511	950516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352133
18504	NC_022108	GGA	2	6	950578	950583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352133
18505	NC_022108	GATT	2	8	950595	950602	25 %	50 %	25 %	0 %	532352133
18506	NC_022108	A	6	6	950702	950707	100 %	0 %	0 %	0 %	532352133
18507	NC_022108	GTC	2	6	950760	950765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352133
18508	NC_022108	AGC	2	6	951272	951277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352134
18509	NC_022108	T	6	6	951307	951312	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
18510	NC_022108	TTG	2	6	951324	951329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352134
18511	NC_022108	TAG	2	6	951334	951339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352134
18512	NC_022108	CTT	2	6	951372	951377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18513	NC_022108	AGA	2	6	951403	951408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18514	NC_022108	CAT	2	6	951447	951452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352134
18515	NC_022108	TTC	2	6	951454	951459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18516	NC_022108	G	6	6	951469	951474	0 %	0 %	100 %	0 %	532352134
18517	NC_022108	TAC	2	6	951535	951540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352134
18518	NC_022108	ATC	2	6	951573	951578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352134
18519	NC_022108	GGA	2	6	951587	951592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18520	NC_022108	CTTT	2	8	951597	951604	0 %	75 %	0 %	25 %	532352134
18521	NC_022108	GA	3	6	951624	951629	50 %	0 %	50 %	0 %	532352134
18522	NC_022108	GGA	2	6	951719	951724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18523	NC_022108	TGC	2	6	951730	951735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352134
18524	NC_022108	CTT	2	6	951774	951779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18525	NC_022108	GGA	2	6	951803	951808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18526	NC_022108	TCT	2	6	951920	951925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18527	NC_022108	AGG	2	6	951991	951996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18528	NC_022108	GCTT	2	8	952064	952071	0 %	50 %	25 %	25 %	532352134
18529	NC_022108	AGG	3	9	952072	952080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18530	NC_022108	GAGG	2	8	952139	952146	25 %	0 %	75 %	0 %	532352134
18531	NC_022108	GGA	2	6	952160	952165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18532	NC_022108	TTC	2	6	952186	952191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18533	NC_022108	GGT	2	6	952196	952201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352134
18534	NC_022108	GAA	2	6	952231	952236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18535	NC_022108	TC	3	6	952254	952259	0 %	50 %	0 %	50 %	532352134
18536	NC_022108	GAG	3	9	952305	952313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18537	NC_022108	ACA	2	6	952371	952376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352134
18538	NC_022108	GAG	3	9	952413	952421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18539	NC_022108	AAT	2	6	952454	952459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352134
18540	NC_022108	GGA	2	6	952463	952468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18541	NC_022108	A	6	6	952538	952543	100 %	0 %	0 %	0 %	532352134
18542	NC_022108	CT	3	6	952556	952561	0 %	50 %	0 %	50 %	532352134
18543	NC_022108	GAG	2	6	952578	952583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18544	NC_022108	AGT	2	6	952624	952629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352134
18545	NC_022108	TGCAG	2	10	952647	952656	20 %	20 %	40 %	20 %	532352134
18546	NC_022108	GAA	3	9	952658	952666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18547	NC_022108	ATT	2	6	952672	952677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352134
18548	NC_022108	GTT	2	6	952680	952685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352134
18549	NC_022108	GGA	2	6	952688	952693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18550	NC_022108	GGAT	2	8	952707	952714	25 %	25 %	50 %	0 %	532352134
18551	NC_022108	TTG	2	6	952725	952730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352134
18552	NC_022108	TAA	2	6	952753	952758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352134
18553	NC_022108	AGG	2	6	952783	952788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18554	NC_022108	GAG	3	9	952863	952871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18555	NC_022108	GAGG	2	8	952938	952945	25 %	0 %	75 %	0 %	532352134
18556	NC_022108	ACA	2	6	953022	953027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352134
18557	NC_022108	GAA	2	6	953048	953053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18558	NC_022108	AAT	2	6	953102	953107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352134
18559	NC_022108	CTTT	2	8	953111	953118	0 %	75 %	0 %	25 %	532352134
18560	NC_022108	TTA	2	6	953142	953147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352134
18561	NC_022108	TCT	2	6	953210	953215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18562	NC_022108	GAA	2	6	953216	953221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18563	NC_022108	AGA	2	6	953231	953236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18564	NC_022108	GGA	2	6	953246	953251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18565	NC_022108	AAC	2	6	953309	953314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352134
18566	NC_022108	GGC	2	6	953330	953335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352134
18567	NC_022108	TGT	2	6	953419	953424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352134
18568	NC_022108	T	6	6	953424	953429	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
18569	NC_022108	TGA	2	6	953449	953454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352134
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18571	NC_022108	GAG	2	6	953556	953561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18572	NC_022108	GGA	2	6	953606	953611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18573	NC_022108	TTC	2	6	953632	953637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18574	NC_022108	ACG	2	6	953733	953738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352134
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18576	NC_022108	CTG	2	6	953772	953777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352134
18577	NC_022108	AAAGT	2	10	953844	953853	60 %	20 %	20 %	0 %	532352134
18578	NC_022108	ACA	2	6	953872	953877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352134
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18580	NC_022108	GAA	2	6	954082	954087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
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18585	NC_022108	CTC	2	6	954180	954185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352134
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18587	NC_022108	AGTT	2	8	954237	954244	25 %	50 %	25 %	0 %	532352134
18588	NC_022108	ACA	2	6	954248	954253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352134
18589	NC_022108	GAA	2	6	954283	954288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18590	NC_022108	TGA	2	6	954328	954333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352134
18591	NC_022108	GTA	2	6	954383	954388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352134
18592	NC_022108	GAA	2	6	954401	954406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18593	NC_022108	GAA	2	6	954539	954544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352134
18594	NC_022108	TGTCT	2	10	954550	954559	0 %	60 %	20 %	20 %	532352134
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18596	NC_022108	TG	3	6	954628	954633	0 %	50 %	50 %	0 %	532352134
18597	NC_022108	TGG	2	6	954646	954651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352134
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18599	NC_022108	GCT	2	6	954773	954778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352134
18600	NC_022108	GTT	2	6	954833	954838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352134
18601	NC_022108	TA	3	6	954846	954851	50 %	50 %	0 %	0 %	532352134
18602	NC_022108	TTC	2	6	954875	954880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18603	NC_022108	CTT	2	6	954954	954959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352134
18604	NC_022108	GAG	2	6	954969	954974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18605	NC_022108	AGG	2	6	955258	955263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18606	NC_022108	GGGA	2	8	955296	955303	25 %	0 %	75 %	0 %	532352134
18607	NC_022108	ATA	2	6	955350	955355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352134
18608	NC_022108	GGA	2	6	955406	955411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18609	NC_022108	T	8	8	955534	955541	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
18610	NC_022108	T	8	8	955577	955584	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
18611	NC_022108	GAG	2	6	955604	955609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352134
18612	NC_022108	T	8	8	955627	955634	0 %	100 %	0 %	0 %	532352134
18613	NC_022108	TGT	2	6	955858	955863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352278
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18615	NC_022108	AGG	2	6	955897	955902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352135
18616	NC_022108	GGATTA	2	12	955919	955930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352135
18617	NC_022108	TGC	2	6	955945	955950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352135
18618	NC_022108	TGC	2	6	955973	955978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352135
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18620	NC_022108	GAT	2	6	956144	956149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352135
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