MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_022108	GCG	2	6	926762	926767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352115
18002	NC_022108	TTG	2	6	926945	926950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352115
18003	NC_022108	AGA	2	6	927168	927173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352115
18004	NC_022108	GAT	2	6	927178	927183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352115
18005	NC_022108	GA	3	6	927260	927265	50 %	0 %	50 %	0 %	532352115
18006	NC_022108	TG	3	6	927340	927345	0 %	50 %	50 %	0 %	532352115
18007	NC_022108	AG	3	6	927350	927355	50 %	0 %	50 %	0 %	532352115
18008	NC_022108	TAG	2	6	927412	927417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352115
18009	NC_022108	TGCT	2	8	927476	927483	0 %	50 %	25 %	25 %	532352115
18010	NC_022108	CTGTC	2	10	927501	927510	0 %	40 %	20 %	40 %	532352115
18011	NC_022108	GATT	2	8	927541	927548	25 %	50 %	25 %	0 %	532352115
18012	NC_022108	TAA	2	6	927560	927565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352115
18013	NC_022108	GTTC	2	8	927588	927595	0 %	50 %	25 %	25 %	532352115
18014	NC_022108	AGT	2	6	927645	927650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352115
18015	NC_022108	TTTG	2	8	927657	927664	0 %	75 %	25 %	0 %	532352115
18016	NC_022108	TGT	2	6	927693	927698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352115
18017	NC_022108	AG	3	6	927716	927721	50 %	0 %	50 %	0 %	532352115
18018	NC_022108	GAA	3	9	927733	927741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352115
18019	NC_022108	GT	3	6	927742	927747	0 %	50 %	50 %	0 %	532352115
18020	NC_022108	TA	3	6	927841	927846	50 %	50 %	0 %	0 %	532352115
18021	NC_022108	TTG	2	6	927853	927858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352115
18022	NC_022108	GTT	2	6	927922	927927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352115
18023	NC_022108	TAA	2	6	927928	927933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352115
18024	NC_022108	T	7	7	927942	927948	0 %	100 %	0 %	0 %	532352115
18025	NC_022108	AGCC	2	8	927983	927990	25 %	0 %	25 %	50 %	532352115
18026	NC_022108	TAT	2	6	928018	928023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352115
18027	NC_022108	CAA	2	6	928033	928038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352115
18028	NC_022108	GA	3	6	928068	928073	50 %	0 %	50 %	0 %	532352115
18029	NC_022108	AG	3	6	928078	928083	50 %	0 %	50 %	0 %	532352115
18030	NC_022108	TTGA	2	8	928091	928098	25 %	50 %	25 %	0 %	532352115
18031	NC_022108	AGA	2	6	928136	928141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352115
18032	NC_022108	TAT	2	6	928210	928215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352115
18033	NC_022108	ATCC	2	8	928270	928277	25 %	25 %	0 %	50 %	532352115
18034	NC_022108	A	6	6	928367	928372	100 %	0 %	0 %	0 %	532352115
18035	NC_022108	TGC	2	6	928443	928448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352115
18036	NC_022108	TG	3	6	928465	928470	0 %	50 %	50 %	0 %	532352115
18037	NC_022108	A	6	6	928500	928505	100 %	0 %	0 %	0 %	532352115
18038	NC_022108	T	6	6	928506	928511	0 %	100 %	0 %	0 %	532352115
18039	NC_022108	GTA	2	6	928516	928521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352115
18040	NC_022108	A	6	6	928625	928630	100 %	0 %	0 %	0 %	532352115
18041	NC_022108	CA	3	6	928653	928658	50 %	0 %	0 %	50 %	532352115
18042	NC_022108	A	8	8	928726	928733	100 %	0 %	0 %	0 %	532352115
18043	NC_022108	AAGAG	2	10	928771	928780	60 %	0 %	40 %	0 %	532352115
18044	NC_022108	CAA	2	6	928781	928786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352115
18045	NC_022108	GCTAG	2	10	928797	928806	20 %	20 %	40 %	20 %	532352115
18046	NC_022108	AGA	2	6	928819	928824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352115
18047	NC_022108	CAG	2	6	929030	929035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352116
18048	NC_022108	TTCT	2	8	929041	929048	0 %	75 %	0 %	25 %	532352116
18049	NC_022108	TTG	2	6	929091	929096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352116
18050	NC_022108	T	6	6	929168	929173	0 %	100 %	0 %	0 %	532352116
18051	NC_022108	TTA	2	6	929183	929188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352116
18052	NC_022108	TA	3	6	929223	929228	50 %	50 %	0 %	0 %	532352116
18053	NC_022108	CGATA	2	10	929245	929254	40 %	20 %	20 %	20 %	532352116
18054	NC_022108	ATT	2	6	929290	929295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352116
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18056	NC_022108	TTTG	2	8	929371	929378	0 %	75 %	25 %	0 %	532352116
18057	NC_022108	TCT	2	6	929432	929437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352116
18058	NC_022108	AAG	2	6	929448	929453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352116
18059	NC_022108	GTG	2	6	929460	929465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352116
18060	NC_022108	AT	3	6	929470	929475	50 %	50 %	0 %	0 %	532352116
18061	NC_022108	A	6	6	929501	929506	100 %	0 %	0 %	0 %	532352116
18062	NC_022108	TAT	2	6	929514	929519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352116
18063	NC_022108	TGAT	2	8	929601	929608	25 %	50 %	25 %	0 %	532352116
18064	NC_022108	GCT	2	6	929630	929635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352116
18065	NC_022108	CTT	2	6	929643	929648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352116
18066	NC_022108	AGTT	2	8	929670	929677	25 %	50 %	25 %	0 %	532352116
18067	NC_022108	TTAT	2	8	929698	929705	25 %	75 %	0 %	0 %	532352116
18068	NC_022108	TGC	2	6	929719	929724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352116
18069	NC_022108	CTTC	2	8	929795	929802	0 %	50 %	0 %	50 %	532352116
18070	NC_022108	T	6	6	929821	929826	0 %	100 %	0 %	0 %	532352116
18071	NC_022108	AGAGG	2	10	929867	929876	40 %	0 %	60 %	0 %	532352116
18072	NC_022108	CTTTC	2	10	929882	929891	0 %	60 %	0 %	40 %	532352116
18073	NC_022108	ATTC	2	8	929906	929913	25 %	50 %	0 %	25 %	532352116
18074	NC_022108	GTT	2	6	929976	929981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352116
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18078	NC_022108	A	8	8	930166	930173	100 %	0 %	0 %	0 %	532352116
18079	NC_022108	GAT	2	6	930184	930189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352116
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18093	NC_022108	AGC	2	6	931022	931027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352117
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18096	NC_022108	TAG	2	6	931278	931283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352118
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18104	NC_022108	CTTT	2	8	931636	931643	0 %	75 %	0 %	25 %	532352118
18105	NC_022108	GAA	2	6	931651	931656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352118
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18108	NC_022108	AGT	2	6	931820	931825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352119
18109	NC_022108	AGC	2	6	931845	931850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352119
18110	NC_022108	TGT	2	6	931967	931972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352119
18111	NC_022108	GCA	2	6	931978	931983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352119
18112	NC_022108	TTC	2	6	932005	932010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352119
18113	NC_022108	CAAA	2	8	932137	932144	75 %	0 %	0 %	25 %	532352119
18114	NC_022108	CTT	2	6	932165	932170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352119
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18118	NC_022108	CGT	2	6	932293	932298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352119
18119	NC_022108	GAG	2	6	932317	932322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352119
18120	NC_022108	AG	3	6	932349	932354	50 %	0 %	50 %	0 %	532352119
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18122	NC_022108	TAA	2	6	932382	932387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352119
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18240	NC_022108	TGAA	2	8	938787	938794	50 %	25 %	25 %	0 %	532352123
18241	NC_022108	AGA	2	6	938830	938835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352123
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18353	NC_022108	AT	3	6	943118	943123	50 %	50 %	0 %	0 %	532352129
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18361	NC_022108	GA	3	6	943472	943477	50 %	0 %	50 %	0 %	532352129
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18489	NC_022108	TTA	2	6	949654	949659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352277
18490	NC_022108	GAG	2	6	949727	949732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352132
18491	NC_022108	GTT	2	6	949747	949752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352132
18492	NC_022108	TTC	2	6	949772	949777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352132
18493	NC_022108	CGTTC	2	10	949864	949873	0 %	40 %	20 %	40 %	532352133
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