MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022108	TGCAG	2	10	899942	899951	20 %	20 %	40 %	20 %	532352092
17502	NC_022108	TAA	2	6	899975	899980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352092
17503	NC_022108	AGG	2	6	899996	900001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352092
17504	NC_022108	AGC	2	6	900073	900078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352092
17505	NC_022108	ATT	2	6	900183	900188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352092
17506	NC_022108	ATT	2	6	900201	900206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352092
17507	NC_022108	ATA	2	6	900319	900324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352092
17508	NC_022108	AGA	2	6	900350	900355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352092
17509	NC_022108	GCT	2	6	900387	900392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352092
17510	NC_022108	TTC	2	6	900407	900412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352092
17511	NC_022108	CCA	2	6	900468	900473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352092
17512	NC_022108	TTA	2	6	900502	900507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352092
17513	NC_022108	AG	3	6	900567	900572	50 %	0 %	50 %	0 %	532352092
17514	NC_022108	GAT	2	6	900597	900602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352092
17515	NC_022108	AGA	2	6	900610	900615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352092
17516	NC_022108	AG	3	6	900661	900666	50 %	0 %	50 %	0 %	532352092
17517	NC_022108	TCA	2	6	900779	900784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352092
17518	NC_022108	GTC	2	6	900802	900807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352093
17519	NC_022108	CTTC	2	8	900837	900844	0 %	50 %	0 %	50 %	532352093
17520	NC_022108	ATG	2	6	900858	900863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352093
17521	NC_022108	A	7	7	900887	900893	100 %	0 %	0 %	0 %	532352093
17522	NC_022108	TAT	2	6	900966	900971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352093
17523	NC_022108	A	6	6	901000	901005	100 %	0 %	0 %	0 %	532352093
17524	NC_022108	TCT	2	6	901058	901063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352093
17525	NC_022108	CAT	2	6	901084	901089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352093
17526	NC_022108	T	7	7	901158	901164	0 %	100 %	0 %	0 %	532352093
17527	NC_022108	CTC	3	9	901206	901214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352093
17528	NC_022108	AGC	2	6	901285	901290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352093
17529	NC_022108	A	7	7	901311	901317	100 %	0 %	0 %	0 %	532352093
17530	NC_022108	AAG	2	6	901329	901334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352093
17531	NC_022108	T	6	6	901343	901348	0 %	100 %	0 %	0 %	532352093
17532	NC_022108	AGT	2	6	901371	901376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352093
17533	NC_022108	CTC	2	6	901398	901403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352093
17534	NC_022108	TCA	2	6	901463	901468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352093
17535	NC_022108	GAA	2	6	901490	901495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352093
17536	NC_022108	GTT	2	6	901599	901604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352093
17537	NC_022108	TCCT	2	8	901666	901673	0 %	50 %	0 %	50 %	532352093
17538	NC_022108	T	8	8	901752	901759	0 %	100 %	0 %	0 %	532352093
17539	NC_022108	AGCA	2	8	901831	901838	50 %	0 %	25 %	25 %	532352093
17540	NC_022108	TGC	2	6	901842	901847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352093
17541	NC_022108	AAG	2	6	901852	901857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352093
17542	NC_022108	GAA	2	6	901977	901982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352094
17543	NC_022108	CAG	2	6	902091	902096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352094
17544	NC_022108	GGA	2	6	902099	902104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352094
17545	NC_022108	GAA	2	6	902183	902188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352094
17546	NC_022108	TAG	2	6	902199	902204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352094
17547	NC_022108	AGAA	2	8	902268	902275	75 %	0 %	25 %	0 %	532352094
17548	NC_022108	GAG	2	6	902285	902290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352094
17549	NC_022108	TCT	2	6	902381	902386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352094
17550	NC_022108	T	6	6	902450	902455	0 %	100 %	0 %	0 %	532352094
17551	NC_022108	AG	3	6	902579	902584	50 %	0 %	50 %	0 %	532352094
17552	NC_022108	AAG	2	6	902591	902596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352094
17553	NC_022108	AAGAA	2	10	902611	902620	80 %	0 %	20 %	0 %	532352094
17554	NC_022108	GCA	2	6	902632	902637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352094
17555	NC_022108	GCT	2	6	902639	902644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352094
17556	NC_022108	TATC	2	8	902648	902655	25 %	50 %	0 %	25 %	532352094
17557	NC_022108	TCT	2	6	902660	902665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352094
17558	NC_022108	T	6	6	902670	902675	0 %	100 %	0 %	0 %	532352094
17559	NC_022108	GCT	2	6	902759	902764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352094
17560	NC_022108	GAAG	2	8	902782	902789	50 %	0 %	50 %	0 %	532352094
17561	NC_022108	TC	3	6	902892	902897	0 %	50 %	0 %	50 %	532352094
17562	NC_022108	ATG	3	9	902904	902912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352094
17563	NC_022108	GA	5	10	902958	902967	50 %	0 %	50 %	0 %	532352094
17564	NC_022108	GAAA	2	8	902980	902987	75 %	0 %	25 %	0 %	532352094
17565	NC_022108	AAG	2	6	903126	903131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352094
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17568	NC_022108	AATCA	2	10	903182	903191	60 %	20 %	0 %	20 %	532352094
17569	NC_022108	AGA	2	6	903223	903228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352094
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17572	NC_022108	TGG	2	6	903396	903401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352094
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17577	NC_022108	A	7	7	904115	904121	100 %	0 %	0 %	0 %	532352095
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17586	NC_022108	CTTA	2	8	904484	904491	25 %	50 %	0 %	25 %	532352096
17587	NC_022108	A	6	6	904495	904500	100 %	0 %	0 %	0 %	532352096
17588	NC_022108	TTA	2	6	904523	904528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352096
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17601	NC_022108	GAAT	2	8	905297	905304	50 %	25 %	25 %	0 %	532352096
17602	NC_022108	AGG	2	6	905343	905348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352096
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17605	NC_022108	TTTTGG	2	12	905499	905510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352096
17606	NC_022108	ATT	2	6	905529	905534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352096
17607	NC_022108	ATG	2	6	905556	905561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352096
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17609	NC_022108	AAG	2	6	905701	905706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352096
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17621	NC_022108	CTT	2	6	906142	906147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352097
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