MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022108	ATA	2	6	837405	837410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352053
16502	NC_022108	TTC	2	6	837436	837441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352053
16503	NC_022108	AGCC	2	8	837482	837489	25 %	0 %	25 %	50 %	532352053
16504	NC_022108	CCT	2	6	837533	837538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352053
16505	NC_022108	AG	3	6	837554	837559	50 %	0 %	50 %	0 %	532352053
16506	NC_022108	AGA	2	6	837660	837665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352053
16507	NC_022108	TAG	2	6	837667	837672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352053
16508	NC_022108	AG	3	6	837671	837676	50 %	0 %	50 %	0 %	532352053
16509	NC_022108	GGA	2	6	837722	837727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352053
16510	NC_022108	A	6	6	837744	837749	100 %	0 %	0 %	0 %	532352053
16511	NC_022108	AAT	2	6	837829	837834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352053
16512	NC_022108	AGA	2	6	837859	837864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352053
16513	NC_022108	TAA	2	6	837951	837956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352053
16514	NC_022108	TACA	2	8	838075	838082	50 %	25 %	0 %	25 %	532352053
16515	NC_022108	T	6	6	838129	838134	0 %	100 %	0 %	0 %	532352053
16516	NC_022108	AGA	2	6	838177	838182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352053
16517	NC_022108	ATCACA	2	12	838199	838210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352053
16518	NC_022108	ATG	2	6	838229	838234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352053
16519	NC_022108	T	7	7	838275	838281	0 %	100 %	0 %	0 %	532352053
16520	NC_022108	GAAG	2	8	838318	838325	50 %	0 %	50 %	0 %	532352053
16521	NC_022108	T	6	6	838383	838388	0 %	100 %	0 %	0 %	532352053
16522	NC_022108	CGA	2	6	838536	838541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
16523	NC_022108	GA	3	6	838571	838576	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
16524	NC_022108	CAC	2	6	838598	838603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352054
16525	NC_022108	ATC	2	6	838701	838706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352054
16526	NC_022108	CATA	2	8	838838	838845	50 %	25 %	0 %	25 %	532352054
16527	NC_022108	GCA	2	6	838884	838889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
16528	NC_022108	CGTGG	2	10	838891	838900	0 %	20 %	60 %	20 %	532352054
16529	NC_022108	AAGC	2	8	838938	838945	50 %	0 %	25 %	25 %	532352054
16530	NC_022108	CGC	2	6	838960	838965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352054
16531	NC_022108	TTC	2	6	839009	839014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352054
16532	NC_022108	AACGT	2	10	839018	839027	40 %	20 %	20 %	20 %	532352054
16533	NC_022108	GAC	2	6	839181	839186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
16534	NC_022108	GTA	2	6	839268	839273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352054
16535	NC_022108	CGC	2	6	839332	839337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352054
16536	NC_022108	AG	3	6	839493	839498	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
16537	NC_022108	CCT	2	6	839499	839504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352054
16538	NC_022108	TGA	2	6	839549	839554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352054
16539	NC_022108	GTT	2	6	839569	839574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352054
16540	NC_022108	AAC	2	6	839603	839608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352054
16541	NC_022108	TGA	2	6	839614	839619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352054
16542	NC_022108	GGA	2	6	839650	839655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352054
16543	NC_022108	AGA	2	6	839762	839767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352054
16544	NC_022108	AAT	2	6	839777	839782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352054
16545	NC_022108	AAC	2	6	839798	839803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352054
16546	NC_022108	A	6	6	840123	840128	100 %	0 %	0 %	0 %	532352054
16547	NC_022108	GA	3	6	840150	840155	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
16548	NC_022108	AAG	2	6	840179	840184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352054
16549	NC_022108	ACG	2	6	840245	840250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
16550	NC_022108	T	7	7	840252	840258	0 %	100 %	0 %	0 %	532352054
16551	NC_022108	GA	3	6	840259	840264	50 %	0 %	50 %	0 %	532352054
16552	NC_022108	A	7	7	840299	840305	100 %	0 %	0 %	0 %	532352054
16553	NC_022108	A	6	6	840337	840342	100 %	0 %	0 %	0 %	532352054
16554	NC_022108	CTA	2	6	840363	840368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352054
16555	NC_022108	AAT	2	6	840383	840388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352054
16556	NC_022108	AGC	2	6	840399	840404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352054
16557	NC_022108	TAA	2	6	840420	840425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352054
16558	NC_022108	T	6	6	840464	840469	0 %	100 %	0 %	0 %	532352054
16559	NC_022108	CTTG	2	8	840606	840613	0 %	50 %	25 %	25 %	532352055
16560	NC_022108	TCT	2	6	840629	840634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352055
16561	NC_022108	AAGAG	2	10	840671	840680	60 %	0 %	40 %	0 %	532352055
16562	NC_022108	AC	3	6	840691	840696	50 %	0 %	0 %	50 %	532352055
16563	NC_022108	TCTT	2	8	840794	840801	0 %	75 %	0 %	25 %	532352055
16564	NC_022108	TGC	2	6	840844	840849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352055
16565	NC_022108	A	6	6	840873	840878	100 %	0 %	0 %	0 %	532352055
16566	NC_022108	AGAA	2	8	840941	840948	75 %	0 %	25 %	0 %	532352055
16567	NC_022108	A	6	6	840961	840966	100 %	0 %	0 %	0 %	532352055
16568	NC_022108	CAAT	2	8	840980	840987	50 %	25 %	0 %	25 %	532352055
16569	NC_022108	T	7	7	841018	841024	0 %	100 %	0 %	0 %	532352055
16570	NC_022108	TGA	2	6	841028	841033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352055
16571	NC_022108	CTT	2	6	841068	841073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352055
16572	NC_022108	TCC	2	6	841082	841087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352055
16573	NC_022108	CTC	2	6	841133	841138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352055
16574	NC_022108	GAA	2	6	841212	841217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352055
16575	NC_022108	GAC	2	6	841228	841233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352055
16576	NC_022108	TCG	2	6	841360	841365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352056
16577	NC_022108	ATCG	2	8	841441	841448	25 %	25 %	25 %	25 %	532352056
16578	NC_022108	CAGA	2	8	841515	841522	50 %	0 %	25 %	25 %	532352056
16579	NC_022108	TTC	2	6	841525	841530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352056
16580	NC_022108	T	6	6	841545	841550	0 %	100 %	0 %	0 %	532352056
16581	NC_022108	CTT	3	9	841560	841568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352056
16582	NC_022108	AGT	2	6	841576	841581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352056
16583	NC_022108	TGG	2	6	841610	841615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352056
16584	NC_022108	TCGT	2	8	841630	841637	0 %	50 %	25 %	25 %	532352056
16585	NC_022108	CTC	2	6	841641	841646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352056
16586	NC_022108	CT	3	6	841657	841662	0 %	50 %	0 %	50 %	532352056
16587	NC_022108	GCA	2	6	841682	841687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352056
16588	NC_022108	AG	3	6	841692	841697	50 %	0 %	50 %	0 %	532352056
16589	NC_022108	GAC	2	6	841744	841749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352056
16590	NC_022108	CTG	2	6	841752	841757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352056
16591	NC_022108	AGGG	2	8	841863	841870	25 %	0 %	75 %	0 %	532352056
16592	NC_022108	TGCT	2	8	841891	841898	0 %	50 %	25 %	25 %	532352056
16593	NC_022108	AGA	2	6	841907	841912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352056
16594	NC_022108	TAAG	2	8	841913	841920	50 %	25 %	25 %	0 %	532352056
16595	NC_022108	AGA	2	6	841934	841939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352056
16596	NC_022108	GCCA	2	8	841962	841969	25 %	0 %	25 %	50 %	532352056
16597	NC_022108	GGGA	2	8	842041	842048	25 %	0 %	75 %	0 %	532352056
16598	NC_022108	TCT	2	6	842156	842161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352056
16599	NC_022108	GTT	2	6	842186	842191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352056
16600	NC_022108	CTT	2	6	842226	842231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352056
16601	NC_022108	ATA	2	6	842286	842291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352056
16602	NC_022108	AGG	2	6	842357	842362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352056
16603	NC_022108	T	8	8	842386	842393	0 %	100 %	0 %	0 %	532352056
16604	NC_022108	CAA	2	6	842508	842513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352056
16605	NC_022108	T	6	6	842517	842522	0 %	100 %	0 %	0 %	532352056
16606	NC_022108	TGGG	2	8	842580	842587	0 %	25 %	75 %	0 %	532352056
16607	NC_022108	TG	3	6	842589	842594	0 %	50 %	50 %	0 %	532352056
16608	NC_022108	TG	3	6	842610	842615	0 %	50 %	50 %	0 %	532352057
16609	NC_022108	TGT	2	6	842727	842732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352057
16610	NC_022108	TTAA	2	8	842766	842773	50 %	50 %	0 %	0 %	532352057
16611	NC_022108	TGC	2	6	842783	842788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352057
16612	NC_022108	GATCCG	2	12	842808	842819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	532352057
16613	NC_022108	A	6	6	842829	842834	100 %	0 %	0 %	0 %	532352057
16614	NC_022108	AGC	2	6	842852	842857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352057
16615	NC_022108	AGG	2	6	842890	842895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352057
16616	NC_022108	CTT	2	6	842902	842907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352057
16617	NC_022108	TGA	2	6	842953	842958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352057
16618	NC_022108	CAG	2	6	842962	842967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352057
16619	NC_022108	GAG	2	6	842995	843000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352057
16620	NC_022108	ATC	2	6	843002	843007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352057
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16622	NC_022108	GTTT	2	8	843093	843100	0 %	75 %	25 %	0 %	532352057
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16744	NC_022108	GAA	2	6	850426	850431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352064
16745	NC_022108	GTT	2	6	850447	850452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352064
16746	NC_022108	GA	3	6	850503	850508	50 %	0 %	50 %	0 %	532352064
16747	NC_022108	AGAAA	2	10	850555	850564	80 %	0 %	20 %	0 %	532352064
16748	NC_022108	GA	3	6	850672	850677	50 %	0 %	50 %	0 %	532352064
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16754	NC_022108	GTAG	2	8	850845	850852	25 %	25 %	50 %	0 %	532352065
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16988	NC_022108	AGA	2	6	868153	868158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352073
16989	NC_022108	TCT	2	6	868159	868164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352073
16990	NC_022108	AGG	2	6	868167	868172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352073
16991	NC_022108	AG	3	6	868174	868179	50 %	0 %	50 %	0 %	532352073
16992	NC_022108	ATC	2	6	868233	868238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352073
16993	NC_022108	GTTT	2	8	868444	868451	0 %	75 %	25 %	0 %	532352073
16994	NC_022108	TGTT	2	8	868464	868471	0 %	75 %	25 %	0 %	532352073
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16997	NC_022108	CT	3	6	868665	868670	0 %	50 %	0 %	50 %	532352073
16998	NC_022108	TTC	2	6	868701	868706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352073
16999	NC_022108	A	7	7	868722	868728	100 %	0 %	0 %	0 %	532352073
17000	NC_022108	CCA	2	6	868789	868794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352073

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