MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022108	AATA	2	8	813261	813268	75 %	25 %	0 %	0 %	532352034
16002	NC_022108	CGC	2	6	813282	813287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532352034
16003	NC_022108	CAA	2	6	813300	813305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352034
16004	NC_022108	TG	3	6	813326	813331	0 %	50 %	50 %	0 %	532352034
16005	NC_022108	AGAAA	2	10	813389	813398	80 %	0 %	20 %	0 %	532352034
16006	NC_022108	ATG	2	6	813435	813440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352034
16007	NC_022108	CATC	2	8	813649	813656	25 %	25 %	0 %	50 %	532352035
16008	NC_022108	AT	3	6	813657	813662	50 %	50 %	0 %	0 %	532352035
16009	NC_022108	TTC	2	6	813668	813673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16010	NC_022108	CCTT	2	8	813736	813743	0 %	50 %	0 %	50 %	532352035
16011	NC_022108	CTT	2	6	813757	813762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16012	NC_022108	AG	3	6	813842	813847	50 %	0 %	50 %	0 %	532352035
16013	NC_022108	TTC	2	6	813851	813856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16014	NC_022108	CT	3	6	813873	813878	0 %	50 %	0 %	50 %	532352035
16015	NC_022108	CTT	2	6	813946	813951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16016	NC_022108	TTC	2	6	813983	813988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16017	NC_022108	AAG	2	6	814081	814086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352035
16018	NC_022108	AGGA	2	8	814097	814104	50 %	0 %	50 %	0 %	532352035
16019	NC_022108	ATTT	2	8	814212	814219	25 %	75 %	0 %	0 %	532352035
16020	NC_022108	TCA	2	6	814247	814252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352035
16021	NC_022108	A	6	6	814330	814335	100 %	0 %	0 %	0 %	532352035
16022	NC_022108	T	6	6	814346	814351	0 %	100 %	0 %	0 %	532352035
16023	NC_022108	TCT	2	6	814367	814372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16024	NC_022108	GAAA	2	8	814459	814466	75 %	0 %	25 %	0 %	532352035
16025	NC_022108	GAG	2	6	814505	814510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352035
16026	NC_022108	CA	3	6	814542	814547	50 %	0 %	0 %	50 %	532352035
16027	NC_022108	CAA	2	6	814626	814631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352035
16028	NC_022108	TAT	2	6	814632	814637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352035
16029	NC_022108	ACA	2	6	814670	814675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352035
16030	NC_022108	T	8	8	814676	814683	0 %	100 %	0 %	0 %	532352035
16031	NC_022108	CTT	2	6	814698	814703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16032	NC_022108	TG	3	6	814715	814720	0 %	50 %	50 %	0 %	532352035
16033	NC_022108	ACACA	2	10	814749	814758	60 %	0 %	0 %	40 %	532352035
16034	NC_022108	TCT	2	6	814769	814774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352035
16035	NC_022108	TGA	2	6	814859	814864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352035
16036	NC_022108	GAA	2	6	814927	814932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352035
16037	NC_022108	GAA	2	6	815085	815090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352260
16038	NC_022108	AAG	2	6	815196	815201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352260
16039	NC_022108	TCTT	2	8	815496	815503	0 %	75 %	0 %	25 %	532352036
16040	NC_022108	GAG	2	6	815509	815514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352036
16041	NC_022108	GAG	2	6	815560	815565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352036
16042	NC_022108	TGC	2	6	815616	815621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352036
16043	NC_022108	CTT	3	9	815643	815651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16044	NC_022108	TGTTT	2	10	815691	815700	0 %	80 %	20 %	0 %	532352036
16045	NC_022108	A	7	7	815708	815714	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
16046	NC_022108	TCT	2	6	815726	815731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16047	NC_022108	GAA	2	6	815857	815862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16048	NC_022108	ATT	2	6	815963	815968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
16049	NC_022108	GAT	2	6	816002	816007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
16050	NC_022108	GA	5	10	816061	816070	50 %	0 %	50 %	0 %	532352036
16051	NC_022108	AGA	2	6	816101	816106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16052	NC_022108	CTTTG	2	10	816109	816118	0 %	60 %	20 %	20 %	532352036
16053	NC_022108	TTA	2	6	816180	816185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
16054	NC_022108	TTG	2	6	816199	816204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
16055	NC_022108	AGCA	2	8	816229	816236	50 %	0 %	25 %	25 %	532352036
16056	NC_022108	TTC	2	6	816238	816243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16057	NC_022108	ATT	2	6	816264	816269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
16058	NC_022108	TGGA	2	8	816499	816506	25 %	25 %	50 %	0 %	532352036
16059	NC_022108	ACG	2	6	816535	816540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352036
16060	NC_022108	CTT	2	6	816559	816564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16061	NC_022108	AAG	2	6	816580	816585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16062	NC_022108	AG	3	6	816635	816640	50 %	0 %	50 %	0 %	532352036
16063	NC_022108	AGA	2	6	816650	816655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16064	NC_022108	GAA	2	6	816713	816718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16065	NC_022108	TAA	2	6	816749	816754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352036
16066	NC_022108	GCATC	2	10	816758	816767	20 %	20 %	20 %	40 %	532352036
16067	NC_022108	TTTA	2	8	816801	816808	25 %	75 %	0 %	0 %	532352036
16068	NC_022108	TGA	2	6	816809	816814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
16069	NC_022108	ACT	2	6	816856	816861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352036
16070	NC_022108	ACTT	2	8	816910	816917	25 %	50 %	0 %	25 %	532352036
16071	NC_022108	GAA	2	6	816935	816940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16072	NC_022108	CTT	2	6	816944	816949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16073	NC_022108	A	6	6	816978	816983	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
16074	NC_022108	GCG	2	6	816986	816991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352036
16075	NC_022108	A	6	6	817042	817047	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
16076	NC_022108	GAT	2	6	817095	817100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
16077	NC_022108	TTG	2	6	817102	817107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
16078	NC_022108	AGA	2	6	817184	817189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16079	NC_022108	AGAA	2	8	817282	817289	75 %	0 %	25 %	0 %	532352036
16080	NC_022108	ATT	2	6	817377	817382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
16081	NC_022108	GGC	2	6	817410	817415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352036
16082	NC_022108	AGA	2	6	817463	817468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16083	NC_022108	AGA	2	6	817550	817555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16084	NC_022108	ATG	2	6	817558	817563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
16085	NC_022108	CTT	2	6	817573	817578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16086	NC_022108	GTT	2	6	817632	817637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
16087	NC_022108	AGC	2	6	817797	817802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352036
16088	NC_022108	AAG	2	6	817877	817882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16089	NC_022108	TTC	2	6	817900	817905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16090	NC_022108	AGA	2	6	817928	817933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16091	NC_022108	CCT	2	6	817938	817943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352036
16092	NC_022108	AAG	2	6	818047	818052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16093	NC_022108	GA	3	6	818058	818063	50 %	0 %	50 %	0 %	532352036
16094	NC_022108	TGT	2	6	818109	818114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352036
16095	NC_022108	TAT	2	6	818252	818257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352036
16096	NC_022108	CCA	2	6	818308	818313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352036
16097	NC_022108	TCT	2	6	818357	818362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352036
16098	NC_022108	GGA	2	6	818388	818393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352036
16099	NC_022108	TTGG	2	8	818406	818413	0 %	50 %	50 %	0 %	532352036
16100	NC_022108	TGG	2	6	818442	818447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352036
16101	NC_022108	CTG	2	6	818452	818457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352036
16102	NC_022108	GAA	2	6	818544	818549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16103	NC_022108	A	6	6	818548	818553	100 %	0 %	0 %	0 %	532352036
16104	NC_022108	AAAG	2	8	818588	818595	75 %	0 %	25 %	0 %	532352036
16105	NC_022108	TGA	3	9	818606	818614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352036
16106	NC_022108	GAA	2	6	818637	818642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352036
16107	NC_022108	TA	3	6	818690	818695	50 %	50 %	0 %	0 %	532352036
16108	NC_022108	T	8	8	818760	818767	0 %	100 %	0 %	0 %	532352036
16109	NC_022108	GTA	2	6	819032	819037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352037
16110	NC_022108	GCA	2	6	819160	819165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352037
16111	NC_022108	GCA	2	6	819199	819204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352037
16112	NC_022108	ATT	2	6	819211	819216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352037
16113	NC_022108	ACA	2	6	819232	819237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352037
16114	NC_022108	TAT	2	6	819246	819251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352037
16115	NC_022108	GGA	2	6	819259	819264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352037
16116	NC_022108	TAT	2	6	819315	819320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352037
16117	NC_022108	CAG	2	6	819365	819370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352037
16118	NC_022108	TCC	2	6	819561	819566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352037
16119	NC_022108	CT	3	6	819571	819576	0 %	50 %	0 %	50 %	532352037
16120	NC_022108	TAG	2	6	819584	819589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352037
16121	NC_022108	GGA	3	9	819610	819618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352037
16122	NC_022108	CT	3	6	819664	819669	0 %	50 %	0 %	50 %	532352037
16123	NC_022108	TTA	2	6	819671	819676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352037
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16131	NC_022108	TCT	2	6	819972	819977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352038
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16152	NC_022108	CTT	2	6	820942	820947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352038
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16154	NC_022108	TGG	2	6	821000	821005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352038
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16237	NC_022108	TA	3	6	825156	825161	50 %	50 %	0 %	0 %	532352040
16238	NC_022108	CTAG	2	8	825174	825181	25 %	25 %	25 %	25 %	532352040
16239	NC_022108	TCT	2	6	825195	825200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352040
16240	NC_022108	AAGAG	2	10	825226	825235	60 %	0 %	40 %	0 %	532352040
16241	NC_022108	G	6	6	825241	825246	0 %	0 %	100 %	0 %	532352040
16242	NC_022108	TCC	2	6	825259	825264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352040
16243	NC_022108	GC	3	6	825278	825283	0 %	0 %	50 %	50 %	532352040
16244	NC_022108	CTTC	2	8	825296	825303	0 %	50 %	0 %	50 %	532352040
16245	NC_022108	AGA	2	6	825312	825317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352040
16246	NC_022108	TCT	2	6	825413	825418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352041
16247	NC_022108	T	6	6	825421	825426	0 %	100 %	0 %	0 %	532352041
16248	NC_022108	GTC	2	6	825433	825438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352041
16249	NC_022108	TAAG	2	8	825475	825482	50 %	25 %	25 %	0 %	532352041
16250	NC_022108	GAA	2	6	825483	825488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352041
16251	NC_022108	GTA	2	6	825506	825511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352041
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16256	NC_022108	CAAA	2	8	825698	825705	75 %	0 %	0 %	25 %	532352041
16257	NC_022108	ATC	2	6	825728	825733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352041
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16259	NC_022108	GTA	2	6	825805	825810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352041
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16265	NC_022108	CAT	2	6	826098	826103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352041
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16267	NC_022108	CTTT	2	8	826282	826289	0 %	75 %	0 %	25 %	532352041
16268	NC_022108	A	6	6	826327	826332	100 %	0 %	0 %	0 %	532352041
16269	NC_022108	TC	3	6	826354	826359	0 %	50 %	0 %	50 %	532352041
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16272	NC_022108	ACC	2	6	826566	826571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352042
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16300	NC_022108	TCT	2	6	827948	827953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352043
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16356	NC_022108	AG	3	6	830171	830176	50 %	0 %	50 %	0 %	532352045
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16362	NC_022108	TC	3	6	830485	830490	0 %	50 %	0 %	50 %	532352045
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