MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022108	T	7	7	788163	788169	0 %	100 %	0 %	0 %	532352014
15502	NC_022108	TGT	2	6	788190	788195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352014
15503	NC_022108	AGA	2	6	788196	788201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352014
15504	NC_022108	GAA	2	6	788224	788229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352014
15505	NC_022108	GAA	2	6	788308	788313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352014
15506	NC_022108	AAG	2	6	788317	788322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352014
15507	NC_022108	TA	3	6	788338	788343	50 %	50 %	0 %	0 %	532352014
15508	NC_022108	AGGGA	2	10	788355	788364	40 %	0 %	60 %	0 %	532352014
15509	NC_022108	AGAA	2	8	788493	788500	75 %	0 %	25 %	0 %	532352014
15510	NC_022108	TCA	2	6	788511	788516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352014
15511	NC_022108	G	6	6	788534	788539	0 %	0 %	100 %	0 %	532352014
15512	NC_022108	GCT	2	6	788614	788619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352014
15513	NC_022108	CAT	2	6	788680	788685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352014
15514	NC_022108	ACT	2	6	788698	788703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352014
15515	NC_022108	G	6	6	788754	788759	0 %	0 %	100 %	0 %	532352014
15516	NC_022108	TTA	2	6	788818	788823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352014
15517	NC_022108	A	6	6	789062	789067	100 %	0 %	0 %	0 %	532352014
15518	NC_022108	GT	3	6	789142	789147	0 %	50 %	50 %	0 %	532352014
15519	NC_022108	TTC	2	6	789175	789180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352014
15520	NC_022108	A	7	7	789451	789457	100 %	0 %	0 %	0 %	532352015
15521	NC_022108	GAT	2	6	789467	789472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352015
15522	NC_022108	TTC	2	6	789567	789572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352015
15523	NC_022108	A	6	6	789743	789748	100 %	0 %	0 %	0 %	532352015
15524	NC_022108	TCC	2	6	789766	789771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352015
15525	NC_022108	AGG	3	9	789778	789786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352015
15526	NC_022108	ATTAGG	2	12	789877	789888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352015
15527	NC_022108	GCG	2	6	789890	789895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352015
15528	NC_022108	ATT	2	6	789900	789905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352015
15529	NC_022108	AGC	2	6	789966	789971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352015
15530	NC_022108	GTA	2	6	790035	790040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352015
15531	NC_022108	T	6	6	790075	790080	0 %	100 %	0 %	0 %	532352015
15532	NC_022108	CAGC	2	8	790127	790134	25 %	0 %	25 %	50 %	532352015
15533	NC_022108	TTC	2	6	790203	790208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352015
15534	NC_022108	TCGT	2	8	790246	790253	0 %	50 %	25 %	25 %	532352015
15535	NC_022108	AG	3	6	790272	790277	50 %	0 %	50 %	0 %	532352015
15536	NC_022108	CTGT	2	8	790345	790352	0 %	50 %	25 %	25 %	532352015
15537	NC_022108	TCC	2	6	790534	790539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352016
15538	NC_022108	TAT	2	6	790577	790582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352016
15539	NC_022108	GC	3	6	790609	790614	0 %	0 %	50 %	50 %	532352016
15540	NC_022108	TGT	2	6	790645	790650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352016
15541	NC_022108	TGA	2	6	790669	790674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352016
15542	NC_022108	GCA	2	6	790679	790684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352016
15543	NC_022108	TAAACC	2	12	790716	790727	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	532352016
15544	NC_022108	TTG	2	6	790761	790766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352016
15545	NC_022108	A	6	6	790796	790801	100 %	0 %	0 %	0 %	532352016
15546	NC_022108	GAA	2	6	790807	790812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352016
15547	NC_022108	TC	3	6	790845	790850	0 %	50 %	0 %	50 %	532352016
15548	NC_022108	A	6	6	790869	790874	100 %	0 %	0 %	0 %	532352016
15549	NC_022108	GA	3	6	790884	790889	50 %	0 %	50 %	0 %	532352016
15550	NC_022108	CTT	2	6	791031	791036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
15551	NC_022108	AAG	2	6	791040	791045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352016
15552	NC_022108	TTC	2	6	791050	791055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
15553	NC_022108	CTT	2	6	791061	791066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
15554	NC_022108	CAA	2	6	791097	791102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352016
15555	NC_022108	T	6	6	791156	791161	0 %	100 %	0 %	0 %	532352016
15556	NC_022108	TCT	3	9	791210	791218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
15557	NC_022108	CTTAA	2	10	791227	791236	40 %	40 %	0 %	20 %	532352016
15558	NC_022108	CGG	2	6	791253	791258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532352016
15559	NC_022108	AGC	2	6	791289	791294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352016
15560	NC_022108	GT	3	6	791299	791304	0 %	50 %	50 %	0 %	532352016
15561	NC_022108	TGC	2	6	791310	791315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352016
15562	NC_022108	TCT	2	6	791331	791336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352016
15563	NC_022108	GAC	2	6	791399	791404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352017
15564	NC_022108	AAAT	2	8	791419	791426	75 %	25 %	0 %	0 %	532352017
15565	NC_022108	TTG	2	6	791444	791449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352017
15566	NC_022108	ATAG	2	8	791487	791494	50 %	25 %	25 %	0 %	532352017
15567	NC_022108	TCA	2	6	791514	791519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352017
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15569	NC_022108	CCA	2	6	791629	791634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532352017
15570	NC_022108	TTC	2	6	791666	791671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352017
15571	NC_022108	GAT	2	6	791686	791691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352017
15572	NC_022108	CCTT	2	8	791792	791799	0 %	50 %	0 %	50 %	532352017
15573	NC_022108	T	6	6	791798	791803	0 %	100 %	0 %	0 %	532352017
15574	NC_022108	AAT	2	6	791921	791926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352017
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15576	NC_022108	TAA	2	6	792009	792014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352017
15577	NC_022108	GCTT	2	8	792029	792036	0 %	50 %	25 %	25 %	532352017
15578	NC_022108	ATT	2	6	792050	792055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352017
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15585	NC_022108	T	9	9	792401	792409	0 %	100 %	0 %	0 %	532352018
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15588	NC_022108	GT	3	6	792651	792656	0 %	50 %	50 %	0 %	532352018
15589	NC_022108	TTG	2	6	792675	792680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352018
15590	NC_022108	GAG	2	6	792780	792785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352018
15591	NC_022108	TTA	2	6	792793	792798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352018
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15593	NC_022108	AAT	2	6	792891	792896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352018
15594	NC_022108	CA	3	6	793010	793015	50 %	0 %	0 %	50 %	532352018
15595	NC_022108	CTA	2	6	793030	793035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352018
15596	NC_022108	A	7	7	793069	793075	100 %	0 %	0 %	0 %	532352018
15597	NC_022108	A	6	6	793077	793082	100 %	0 %	0 %	0 %	532352018
15598	NC_022108	AT	5	10	793113	793122	50 %	50 %	0 %	0 %	532352018
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15602	NC_022108	TTC	2	6	793400	793405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352019
15603	NC_022108	CG	3	6	793412	793417	0 %	0 %	50 %	50 %	532352019
15604	NC_022108	TTG	2	6	793483	793488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532352019
15605	NC_022108	GAG	2	6	793522	793527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352019
15606	NC_022108	TTC	2	6	793531	793536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352019
15607	NC_022108	GA	3	6	793589	793594	50 %	0 %	50 %	0 %	532352019
15608	NC_022108	TCT	2	6	793612	793617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352019
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15613	NC_022108	GAGT	2	8	793823	793830	25 %	25 %	50 %	0 %	532352019
15614	NC_022108	AGA	2	6	793839	793844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352019
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15620	NC_022108	CTT	2	6	794152	794157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352020
15621	NC_022108	ATC	2	6	794217	794222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352020
15622	NC_022108	ATT	2	6	794292	794297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352020
15623	NC_022108	GGA	2	6	794298	794303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352020
15624	NC_022108	TCT	2	6	794320	794325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352020
15625	NC_022108	TA	3	6	794347	794352	50 %	50 %	0 %	0 %	532352020
15626	NC_022108	ATT	2	6	794406	794411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352020
15627	NC_022108	GTG	2	6	794440	794445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352020
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15629	NC_022108	CTT	2	6	794537	794542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352020
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15631	NC_022108	TTC	2	6	794569	794574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352020
15632	NC_022108	ATT	2	6	794582	794587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352020
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15634	NC_022108	CTTA	2	8	794653	794660	25 %	50 %	0 %	25 %	532352020
15635	NC_022108	GAT	2	6	794663	794668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352020
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15641	NC_022108	TCC	2	6	794940	794945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352020
15642	NC_022108	CTA	2	6	794962	794967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352020
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15645	NC_022108	CTG	2	6	795076	795081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352020
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15650	NC_022108	TTC	2	6	795179	795184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352020
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15654	NC_022108	TTC	2	6	795596	795601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352021
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15987	NC_022108	T	9	9	812690	812698	0 %	100 %	0 %	0 %	532352033
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15991	NC_022108	T	6	6	812832	812837	0 %	100 %	0 %	0 %	532352033
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15997	NC_022108	CTG	2	6	813105	813110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352034
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