MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_022108	TTG	2	6	762303	762308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351993
15002	NC_022108	TTGA	2	8	762468	762475	25 %	50 %	25 %	0 %	532351993
15003	NC_022108	GTA	2	6	762484	762489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351993
15004	NC_022108	TTG	2	6	762502	762507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351993
15005	NC_022108	CT	3	6	762537	762542	0 %	50 %	0 %	50 %	532351993
15006	NC_022108	GTT	2	6	762552	762557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351993
15007	NC_022108	AAC	2	6	762566	762571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351993
15008	NC_022108	TGC	2	6	762593	762598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15009	NC_022108	CGA	2	6	762619	762624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15010	NC_022108	TCT	2	6	762627	762632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351993
15011	NC_022108	GTC	2	6	762652	762657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15012	NC_022108	TGC	2	6	762677	762682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15013	NC_022108	GGAAGA	2	12	762692	762703	50 %	0 %	50 %	0 %	532351993
15014	NC_022108	AGAGA	2	10	762704	762713	60 %	0 %	40 %	0 %	532351993
15015	NC_022108	GCTCT	2	10	762771	762780	0 %	40 %	20 %	40 %	532351993
15016	NC_022108	CTT	2	6	762796	762801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351993
15017	NC_022108	GAAG	2	8	762812	762819	50 %	0 %	50 %	0 %	532351993
15018	NC_022108	CAG	2	6	762870	762875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15019	NC_022108	AAC	2	6	762906	762911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351993
15020	NC_022108	GTT	2	6	762917	762922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351993
15021	NC_022108	CT	3	6	762982	762987	0 %	50 %	0 %	50 %	532351993
15022	NC_022108	GAT	2	6	763005	763010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351993
15023	NC_022108	AGA	2	6	763139	763144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351993
15024	NC_022108	AGC	2	6	763148	763153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15025	NC_022108	ATA	2	6	763204	763209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351993
15026	NC_022108	AT	3	6	763319	763324	50 %	50 %	0 %	0 %	532351993
15027	NC_022108	AAT	2	6	763326	763331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351993
15028	NC_022108	GAA	2	6	763397	763402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351993
15029	NC_022108	TGC	2	6	763414	763419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15030	NC_022108	AGA	2	6	763424	763429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351993
15031	NC_022108	TGT	2	6	763511	763516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351993
15032	NC_022108	AATA	2	8	763632	763639	75 %	25 %	0 %	0 %	532351993
15033	NC_022108	TTTA	2	8	763652	763659	25 %	75 %	0 %	0 %	532351993
15034	NC_022108	TTC	2	6	763661	763666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351993
15035	NC_022108	GCT	2	6	763723	763728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351993
15036	NC_022108	GTT	2	6	763734	763739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351993
15037	NC_022108	TCT	2	6	763822	763827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351994
15038	NC_022108	ACA	2	6	763863	763868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351994
15039	NC_022108	AG	3	6	763949	763954	50 %	0 %	50 %	0 %	532351994
15040	NC_022108	GTT	2	6	763975	763980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351994
15041	NC_022108	ACA	2	6	764036	764041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351994
15042	NC_022108	AT	3	6	764132	764137	50 %	50 %	0 %	0 %	532351995
15043	NC_022108	TAA	2	6	764211	764216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351995
15044	NC_022108	AGA	2	6	764255	764260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351995
15045	NC_022108	TTG	2	6	764268	764273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351995
15046	NC_022108	AAGC	2	8	764311	764318	50 %	0 %	25 %	25 %	532351995
15047	NC_022108	TTG	2	6	764388	764393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351996
15048	NC_022108	TTG	2	6	764443	764448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351996
15049	NC_022108	TCAC	2	8	764487	764494	25 %	25 %	0 %	50 %	532351996
15050	NC_022108	ATG	2	6	764499	764504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351996
15051	NC_022108	TTC	2	6	764509	764514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351996
15052	NC_022108	AG	4	8	764541	764548	50 %	0 %	50 %	0 %	532351996
15053	NC_022108	GCT	2	6	764557	764562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351996
15054	NC_022108	ATG	2	6	764641	764646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351996
15055	NC_022108	GTG	2	6	764662	764667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351996
15056	NC_022108	TGC	2	6	764751	764756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351996
15057	NC_022108	ATG	2	6	764884	764889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351997
15058	NC_022108	GATC	2	8	764910	764917	25 %	25 %	25 %	25 %	532351997
15059	NC_022108	GGA	2	6	764925	764930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351997
15060	NC_022108	ATGCAA	2	12	765004	765015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351997
15061	NC_022108	TTG	2	6	765062	765067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351997
15062	NC_022108	ACA	2	6	765108	765113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351997
15063	NC_022108	GAA	2	6	765139	765144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351997
15064	NC_022108	GAA	2	6	765187	765192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351997
15065	NC_022108	TGT	2	6	765209	765214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351997
15066	NC_022108	GAGAAA	2	12	765233	765244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351997
15067	NC_022108	AGT	2	6	765334	765339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351997
15068	NC_022108	TAT	2	6	765451	765456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351997
15069	NC_022108	TGT	2	6	765484	765489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351997
15070	NC_022108	GGT	2	6	765556	765561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351998
15071	NC_022108	GAGT	2	8	765612	765619	25 %	25 %	50 %	0 %	532351998
15072	NC_022108	CTT	2	6	765621	765626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351998
15073	NC_022108	GTC	2	6	766066	766071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351998
15074	NC_022108	TGC	2	6	766087	766092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351998
15075	NC_022108	TGA	2	6	766149	766154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351998
15076	NC_022108	CCT	2	6	766213	766218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351998
15077	NC_022108	GAT	2	6	766333	766338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351998
15078	NC_022108	TTCT	2	8	766391	766398	0 %	75 %	0 %	25 %	532351998
15079	NC_022108	AAC	2	6	766484	766489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351998
15080	NC_022108	ATT	2	6	766495	766500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351998
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15084	NC_022108	TAAAT	2	10	766614	766623	60 %	40 %	0 %	0 %	532351998
15085	NC_022108	A	6	6	766649	766654	100 %	0 %	0 %	0 %	532351998
15086	NC_022108	GCT	2	6	766669	766674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351998
15087	NC_022108	TAG	2	6	766712	766717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351998
15088	NC_022108	TG	3	6	766721	766726	0 %	50 %	50 %	0 %	532351998
15089	NC_022108	AAG	2	6	766760	766765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351998
15090	NC_022108	CAGAG	2	10	766777	766786	40 %	0 %	40 %	20 %	532351998
15091	NC_022108	GTT	2	6	766790	766795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351998
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15093	NC_022108	GCGAT	2	10	766929	766938	20 %	20 %	40 %	20 %	532351999
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15097	NC_022108	GCA	3	9	767027	767035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351999
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15100	NC_022108	A	6	6	767088	767093	100 %	0 %	0 %	0 %	532351999
15101	NC_022108	AGA	2	6	767107	767112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351999
15102	NC_022108	AAG	2	6	767121	767126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351999
15103	NC_022108	AGA	2	6	767134	767139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351999
15104	NC_022108	GAA	2	6	767150	767155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351999
15105	NC_022108	AGATG	2	10	767164	767173	40 %	20 %	40 %	0 %	532351999
15106	NC_022108	TCA	2	6	767185	767190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351999
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15108	NC_022108	TAAA	2	8	767241	767248	75 %	25 %	0 %	0 %	532351999
15109	NC_022108	ATC	2	6	767286	767291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351999
15110	NC_022108	GAAG	2	8	767348	767355	50 %	0 %	50 %	0 %	532351999
15111	NC_022108	GAA	2	6	767394	767399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352000
15112	NC_022108	CGTCA	2	10	767403	767412	20 %	20 %	20 %	40 %	532352000
15113	NC_022108	TCT	2	6	767417	767422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352000
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15115	NC_022108	TCT	2	6	767468	767473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352000
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15117	NC_022108	TTC	2	6	767501	767506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352000
15118	NC_022108	TGG	2	6	767509	767514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352000
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15485	NC_022108	GAT	2	6	787444	787449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352013
15486	NC_022108	GCT	2	6	787450	787455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352013
15487	NC_022108	GCT	2	6	787464	787469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352013
15488	NC_022108	T	8	8	787509	787516	0 %	100 %	0 %	0 %	532352013
15489	NC_022108	TGAA	2	8	787529	787536	50 %	25 %	25 %	0 %	532352013
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15491	NC_022108	GA	3	6	787550	787555	50 %	0 %	50 %	0 %	532352013
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