MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_022108	AG	3	6	699697	699702	50 %	0 %	50 %	0 %	532351956
14002	NC_022108	ATA	2	6	699727	699732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351956
14003	NC_022108	TGCG	2	8	699760	699767	0 %	25 %	50 %	25 %	532351956
14004	NC_022108	CTAG	2	8	699823	699830	25 %	25 %	25 %	25 %	532351956
14005	NC_022108	AAC	2	6	699860	699865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351956
14006	NC_022108	AT	3	6	699883	699888	50 %	50 %	0 %	0 %	532351956
14007	NC_022108	TCCT	2	8	699948	699955	0 %	50 %	0 %	50 %	532351956
14008	NC_022108	GAA	2	6	699973	699978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
14009	NC_022108	GTA	2	6	699984	699989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351956
14010	NC_022108	TTA	2	6	700009	700014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351956
14011	NC_022108	AGG	2	6	700024	700029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351956
14012	NC_022108	AGC	2	6	700044	700049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351956
14013	NC_022108	TTG	2	6	700054	700059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351956
14014	NC_022108	CTT	2	6	700067	700072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
14015	NC_022108	AAG	2	6	700190	700195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
14016	NC_022108	AAG	2	6	700220	700225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
14017	NC_022108	TTG	2	6	700275	700280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351956
14018	NC_022108	CAG	3	9	700346	700354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351956
14019	NC_022108	T	6	6	700364	700369	0 %	100 %	0 %	0 %	532351956
14020	NC_022108	TTG	2	6	700417	700422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351956
14021	NC_022108	TAGT	2	8	700435	700442	25 %	50 %	25 %	0 %	532351956
14022	NC_022108	ATC	2	6	700455	700460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
14023	NC_022108	A	6	6	700479	700484	100 %	0 %	0 %	0 %	532351956
14024	NC_022108	T	6	6	700491	700496	0 %	100 %	0 %	0 %	532351956
14025	NC_022108	GTTC	2	8	700499	700506	0 %	50 %	25 %	25 %	532351956
14026	NC_022108	CT	3	6	700813	700818	0 %	50 %	0 %	50 %	532351956
14027	NC_022108	TGCTTG	2	12	700824	700835	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	532351956
14028	NC_022108	AAG	2	6	700837	700842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
14029	NC_022108	ACC	2	6	700933	700938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351956
14030	NC_022108	TG	3	6	701011	701016	0 %	50 %	50 %	0 %	532351956
14031	NC_022108	TAC	2	6	701021	701026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
14032	NC_022108	TCC	2	6	701032	701037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351956
14033	NC_022108	CTT	2	6	701096	701101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
14034	NC_022108	ATT	2	6	701136	701141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351956
14035	NC_022108	TCCA	2	8	701149	701156	25 %	25 %	0 %	50 %	532351956
14036	NC_022108	TGCT	2	8	701273	701280	0 %	50 %	25 %	25 %	532351956
14037	NC_022108	TG	3	6	701308	701313	0 %	50 %	50 %	0 %	532351956
14038	NC_022108	TCA	2	6	701323	701328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
14039	NC_022108	ATA	2	6	701331	701336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351956
14040	NC_022108	AGCTG	2	10	701395	701404	20 %	20 %	40 %	20 %	532351956
14041	NC_022108	CTT	2	6	701420	701425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
14042	NC_022108	TTCT	2	8	701442	701449	0 %	75 %	0 %	25 %	532351956
14043	NC_022108	CTG	2	6	701535	701540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
14044	NC_022108	TGC	2	6	701562	701567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
14045	NC_022108	TCT	2	6	701608	701613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
14046	NC_022108	TAC	2	6	701686	701691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351956
14047	NC_022108	CTG	2	6	701704	701709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
14048	NC_022108	TGC	2	6	701716	701721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
14049	NC_022108	CTT	2	6	701733	701738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956
14050	NC_022108	C	6	6	701740	701745	0 %	0 %	0 %	100 %	532351956
14051	NC_022108	TCC	2	6	701750	701755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351956
14052	NC_022108	CTC	2	6	701858	701863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351956
14053	NC_022108	TGGC	2	8	701872	701879	0 %	25 %	50 %	25 %	532351956
14054	NC_022108	TAAA	2	8	701926	701933	75 %	25 %	0 %	0 %	532351956
14055	NC_022108	AGT	2	6	701948	701953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351956
14056	NC_022108	AAG	2	6	701974	701979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351956
14057	NC_022108	AAAAC	2	10	701985	701994	80 %	0 %	0 %	20 %	532351956
14058	NC_022108	A	6	6	702026	702031	100 %	0 %	0 %	0 %	532351956
14059	NC_022108	T	7	7	702033	702039	0 %	100 %	0 %	0 %	532351956
14060	NC_022108	TGTT	2	8	702043	702050	0 %	75 %	25 %	0 %	532351956
14061	NC_022108	A	6	6	702222	702227	100 %	0 %	0 %	0 %	532351957
14062	NC_022108	ATG	2	6	702282	702287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
14063	NC_022108	AGTT	2	8	702306	702313	25 %	50 %	25 %	0 %	532351957
14064	NC_022108	TCT	2	6	702323	702328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
14065	NC_022108	TTGG	2	8	702443	702450	0 %	50 %	50 %	0 %	532351957
14066	NC_022108	TC	3	6	702454	702459	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14067	NC_022108	CAA	2	6	702503	702508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351957
14068	NC_022108	TCC	2	6	702511	702516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351957
14069	NC_022108	TTTG	2	8	702544	702551	0 %	75 %	25 %	0 %	532351957
14070	NC_022108	ACT	2	6	702560	702565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
14071	NC_022108	TAG	2	6	702567	702572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
14072	NC_022108	TCCT	2	8	702624	702631	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14073	NC_022108	CAAT	2	8	702694	702701	50 %	25 %	0 %	25 %	532351957
14074	NC_022108	GAT	2	6	702838	702843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
14075	NC_022108	ATCT	2	8	702918	702925	25 %	50 %	0 %	25 %	532351957
14076	NC_022108	ATC	2	6	702932	702937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
14077	NC_022108	TTC	2	6	702940	702945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
14078	NC_022108	TC	4	8	702944	702951	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14079	NC_022108	TATC	2	8	703011	703018	25 %	50 %	0 %	25 %	532351957
14080	NC_022108	TA	3	6	703052	703057	50 %	50 %	0 %	0 %	532351957
14081	NC_022108	CT	3	6	703072	703077	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14082	NC_022108	TCA	2	6	703107	703112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
14083	NC_022108	ACT	2	6	703144	703149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
14084	NC_022108	AACG	2	8	703158	703165	50 %	0 %	25 %	25 %	532351957
14085	NC_022108	GC	3	6	703194	703199	0 %	0 %	50 %	50 %	532351957
14086	NC_022108	AACT	2	8	703220	703227	50 %	25 %	0 %	25 %	532351957
14087	NC_022108	TGA	2	6	703269	703274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
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14089	NC_022108	GAC	2	6	703353	703358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351957
14090	NC_022108	TAA	2	6	703442	703447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351957
14091	NC_022108	AG	3	6	703493	703498	50 %	0 %	50 %	0 %	532351957
14092	NC_022108	CTT	2	6	703566	703571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
14093	NC_022108	T	6	6	703647	703652	0 %	100 %	0 %	0 %	532351957
14094	NC_022108	CTT	2	6	703718	703723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351957
14095	NC_022108	AGA	2	6	703726	703731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351957
14096	NC_022108	T	6	6	703753	703758	0 %	100 %	0 %	0 %	532351957
14097	NC_022108	CT	3	6	703793	703798	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14098	NC_022108	CTTC	2	8	703803	703810	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14099	NC_022108	GATT	2	8	703853	703860	25 %	50 %	25 %	0 %	532351957
14100	NC_022108	CTAC	2	8	703957	703964	25 %	25 %	0 %	50 %	532351957
14101	NC_022108	ACA	2	6	703988	703993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351957
14102	NC_022108	ACA	2	6	704069	704074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351957
14103	NC_022108	ATG	2	6	704281	704286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351957
14104	NC_022108	GGA	2	6	704343	704348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351957
14105	NC_022108	AGA	2	6	704381	704386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351957
14106	NC_022108	CTTC	2	8	704403	704410	0 %	50 %	0 %	50 %	532351957
14107	NC_022108	ATC	2	6	704415	704420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351957
14108	NC_022108	GGA	2	6	704424	704429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351957
14109	NC_022108	CAAG	2	8	704442	704449	50 %	0 %	25 %	25 %	532351957
14110	NC_022108	CAA	2	6	704463	704468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351957
14111	NC_022108	AAATGC	2	12	704503	704514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351957
14112	NC_022108	GCA	2	6	704528	704533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351957
14113	NC_022108	ATCT	2	8	704576	704583	25 %	50 %	0 %	25 %	532351957
14114	NC_022108	CTAG	2	8	704600	704607	25 %	25 %	25 %	25 %	532351957
14115	NC_022108	AGC	2	6	704620	704625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351957
14116	NC_022108	GCT	2	6	704646	704651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351957
14117	NC_022108	ATT	2	6	704662	704667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351957
14118	NC_022108	AAAT	2	8	704703	704710	75 %	25 %	0 %	0 %	532351957
14119	NC_022108	CTG	2	6	704819	704824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351958
14120	NC_022108	ATG	2	6	705028	705033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351958
14121	NC_022108	TCA	2	6	705120	705125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351958
14122	NC_022108	TTG	2	6	705140	705145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351958
14123	NC_022108	GCT	2	6	705165	705170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351958
14124	NC_022108	TTTCT	2	10	705200	705209	0 %	80 %	0 %	20 %	532351958
14125	NC_022108	ACA	2	6	705273	705278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351958
14126	NC_022108	TACA	2	8	705326	705333	50 %	25 %	0 %	25 %	532351958
14127	NC_022108	AGACG	2	10	705390	705399	40 %	0 %	40 %	20 %	532351958
14128	NC_022108	TCAA	2	8	705441	705448	50 %	25 %	0 %	25 %	532351958
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14130	NC_022108	GAAT	2	8	705613	705620	50 %	25 %	25 %	0 %	532351958
14131	NC_022108	TCA	2	6	705714	705719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351958
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14135	NC_022108	CTG	2	6	705968	705973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351958
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14155	NC_022108	TCTA	2	8	706936	706943	25 %	50 %	0 %	25 %	532351958
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14210	NC_022108	TAGT	2	8	709616	709623	25 %	50 %	25 %	0 %	532351960
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14230	NC_022108	T	7	7	710866	710872	0 %	100 %	0 %	0 %	532351960
14231	NC_022108	CTTA	2	8	710892	710899	25 %	50 %	0 %	25 %	532351960
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14234	NC_022108	GAA	2	6	710975	710980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352253
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14238	NC_022108	A	6	6	711154	711159	100 %	0 %	0 %	0 %	532351961
14239	NC_022108	TTG	2	6	711173	711178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351961
14240	NC_022108	TACG	2	8	711203	711210	25 %	25 %	25 %	25 %	532351961
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14242	NC_022108	GCT	2	6	711249	711254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351961
14243	NC_022108	CT	3	6	711282	711287	0 %	50 %	0 %	50 %	532351961
14244	NC_022108	ACG	2	6	711367	711372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351961
14245	NC_022108	AAG	2	6	711376	711381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351961
14246	NC_022108	GCA	2	6	711453	711458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351961
14247	NC_022108	CTT	2	6	711492	711497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351961
14248	NC_022108	ATAGA	2	10	711500	711509	60 %	20 %	20 %	0 %	532351961
14249	NC_022108	GAG	2	6	711520	711525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351961
14250	NC_022108	ATA	2	6	711540	711545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351961
14251	NC_022108	TGT	2	6	711590	711595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351961
14252	NC_022108	GCAAA	2	10	711634	711643	60 %	0 %	20 %	20 %	532351961
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14254	NC_022108	TTG	2	6	711719	711724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351961
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14256	NC_022108	AAAT	2	8	711788	711795	75 %	25 %	0 %	0 %	532351961
14257	NC_022108	CTG	2	6	711806	711811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351961
14258	NC_022108	AT	3	6	711855	711860	50 %	50 %	0 %	0 %	532351961
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14263	NC_022108	ACC	2	6	712429	712434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351961
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14265	NC_022108	AGCC	2	8	712468	712475	25 %	0 %	25 %	50 %	532351961
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14271	NC_022108	CTC	2	6	712622	712627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351961
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14347	NC_022108	CAAA	2	8	716515	716522	75 %	0 %	0 %	25 %	532351965
14348	NC_022108	CAA	2	6	716524	716529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351965
14349	NC_022108	C	8	8	716549	716556	0 %	0 %	0 %	100 %	532351965
14350	NC_022108	T	7	7	716630	716636	0 %	100 %	0 %	0 %	532351965
14351	NC_022108	TCGA	2	8	716643	716650	25 %	25 %	25 %	25 %	532351965
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14354	NC_022108	TCA	2	6	716695	716700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351965
14355	NC_022108	TTTG	2	8	716704	716711	0 %	75 %	25 %	0 %	532351965
14356	NC_022108	GTT	2	6	716718	716723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351965
14357	NC_022108	GAA	2	6	716746	716751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351965
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14360	NC_022108	ATCTA	2	10	716894	716903	40 %	40 %	0 %	20 %	532351966
14361	NC_022108	AGC	2	6	716978	716983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351966
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14363	NC_022108	AT	3	6	717069	717074	50 %	50 %	0 %	0 %	532351966
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