MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022108	GAA	2	6	676090	676095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351931
13502	NC_022108	GCC	2	6	676105	676110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351931
13503	NC_022108	TTAA	2	8	676114	676121	50 %	50 %	0 %	0 %	532351931
13504	NC_022108	ATG	2	6	676162	676167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351931
13505	NC_022108	TAA	2	6	676170	676175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351931
13506	NC_022108	CCA	2	6	676180	676185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351931
13507	NC_022108	AAG	2	6	676197	676202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351931
13508	NC_022108	AG	3	6	676206	676211	50 %	0 %	50 %	0 %	532351931
13509	NC_022108	TCT	2	6	676252	676257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351931
13510	NC_022108	ACT	2	6	676273	676278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351931
13511	NC_022108	CAT	2	6	676286	676291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351931
13512	NC_022108	CTG	2	6	676463	676468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351931
13513	NC_022108	GCA	2	6	676513	676518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351931
13514	NC_022108	GAA	2	6	676624	676629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351931
13515	NC_022108	ACC	2	6	676726	676731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351931
13516	NC_022108	AAC	2	6	676758	676763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351931
13517	NC_022108	TCC	2	6	676801	676806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351931
13518	NC_022108	CAAT	2	8	676904	676911	50 %	25 %	0 %	25 %	532351931
13519	NC_022108	TCT	2	6	676996	677001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351931
13520	NC_022108	AGCA	2	8	677029	677036	50 %	0 %	25 %	25 %	532351931
13521	NC_022108	A	6	6	677040	677045	100 %	0 %	0 %	0 %	532351931
13522	NC_022108	ACA	2	6	677071	677076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351931
13523	NC_022108	CT	3	6	677077	677082	0 %	50 %	0 %	50 %	532351931
13524	NC_022108	ATC	2	6	677095	677100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351931
13525	NC_022108	ACA	2	6	677103	677108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351931
13526	NC_022108	GTT	2	6	677114	677119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351931
13527	NC_022108	AC	3	6	677139	677144	50 %	0 %	0 %	50 %	532351931
13528	NC_022108	TCA	2	6	677332	677337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351932
13529	NC_022108	TAA	2	6	677394	677399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351932
13530	NC_022108	A	6	6	677398	677403	100 %	0 %	0 %	0 %	532351932
13531	NC_022108	CT	4	8	677415	677422	0 %	50 %	0 %	50 %	532351932
13532	NC_022108	GAAC	2	8	677522	677529	50 %	0 %	25 %	25 %	532351932
13533	NC_022108	CT	3	6	677601	677606	0 %	50 %	0 %	50 %	532351932
13534	NC_022108	TAAA	2	8	677607	677614	75 %	25 %	0 %	0 %	532351932
13535	NC_022108	ATG	2	6	677734	677739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351932
13536	NC_022108	AAC	2	6	677763	677768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351932
13537	NC_022108	TTG	2	6	677783	677788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351932
13538	NC_022108	TAG	2	6	677801	677806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351932
13539	NC_022108	TC	3	6	677840	677845	0 %	50 %	0 %	50 %	532351932
13540	NC_022108	CTTTT	2	10	677864	677873	0 %	80 %	0 %	20 %	532351932
13541	NC_022108	AGA	3	9	677939	677947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351932
13542	NC_022108	CTC	2	6	677965	677970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351932
13543	NC_022108	TTA	2	6	678022	678027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351933
13544	NC_022108	A	6	6	678078	678083	100 %	0 %	0 %	0 %	532351933
13545	NC_022108	ACCAT	2	10	678121	678130	40 %	20 %	0 %	40 %	532351933
13546	NC_022108	TC	3	6	678153	678158	0 %	50 %	0 %	50 %	532351933
13547	NC_022108	GCT	2	6	678215	678220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351933
13548	NC_022108	GAA	2	6	678276	678281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351933
13549	NC_022108	AACT	2	8	678315	678322	50 %	25 %	0 %	25 %	532351933
13550	NC_022108	ATC	2	6	678365	678370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351933
13551	NC_022108	GGA	2	6	678383	678388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351933
13552	NC_022108	A	7	7	678411	678417	100 %	0 %	0 %	0 %	532351933
13553	NC_022108	TC	3	6	678427	678432	0 %	50 %	0 %	50 %	532351934
13554	NC_022108	TCG	2	6	678450	678455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351934
13555	NC_022108	A	6	6	678526	678531	100 %	0 %	0 %	0 %	532351934
13556	NC_022108	A	6	6	678548	678553	100 %	0 %	0 %	0 %	532351934
13557	NC_022108	CAAA	2	8	678603	678610	75 %	0 %	0 %	25 %	532351934
13558	NC_022108	CGC	2	6	678621	678626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351934
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13560	NC_022108	A	6	6	678662	678667	100 %	0 %	0 %	0 %	532351934
13561	NC_022108	CAG	2	6	678806	678811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351934
13562	NC_022108	TCT	2	6	678874	678879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351934
13563	NC_022108	CTA	2	6	678897	678902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351934
13564	NC_022108	ACA	2	6	678919	678924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351934
13565	NC_022108	TCTT	2	8	678959	678966	0 %	75 %	0 %	25 %	532351934
13566	NC_022108	TGA	2	6	679028	679033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351934
13567	NC_022108	TTCTC	2	10	679056	679065	0 %	60 %	0 %	40 %	532351934
13568	NC_022108	TCT	2	6	679077	679082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351934
13569	NC_022108	CT	3	6	679081	679086	0 %	50 %	0 %	50 %	532351934
13570	NC_022108	CT	3	6	679134	679139	0 %	50 %	0 %	50 %	532351935
13571	NC_022108	TCA	2	6	679165	679170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351935
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13573	NC_022108	CTG	2	6	679246	679251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351935
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13575	NC_022108	A	7	7	679323	679329	100 %	0 %	0 %	0 %	532351935
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13577	NC_022108	TC	3	6	679355	679360	0 %	50 %	0 %	50 %	532351935
13578	NC_022108	CT	3	6	679366	679371	0 %	50 %	0 %	50 %	532351935
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13589	NC_022108	CCTT	2	8	679875	679882	0 %	50 %	0 %	50 %	532351935
13590	NC_022108	TC	3	6	679954	679959	0 %	50 %	0 %	50 %	532351935
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13593	NC_022108	A	7	7	679988	679994	100 %	0 %	0 %	0 %	532351935
13594	NC_022108	A	7	7	680034	680040	100 %	0 %	0 %	0 %	532351935
13595	NC_022108	TG	3	6	680079	680084	0 %	50 %	50 %	0 %	532351935
13596	NC_022108	AAAG	2	8	680136	680143	75 %	0 %	25 %	0 %	532351935
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13602	NC_022108	TAT	2	6	680352	680357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351935
13603	NC_022108	CTT	2	6	680363	680368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351935
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13605	NC_022108	GAA	2	6	680474	680479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351936
13606	NC_022108	CAA	2	6	680483	680488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351936
13607	NC_022108	TTG	2	6	680493	680498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351936
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13609	NC_022108	TA	4	8	680664	680671	50 %	50 %	0 %	0 %	532351936
13610	NC_022108	TCG	2	6	680725	680730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351936
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13613	NC_022108	TCG	2	6	680854	680859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351936
13614	NC_022108	TAA	2	6	680899	680904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351936
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13617	NC_022108	ACCT	2	8	681091	681098	25 %	25 %	0 %	50 %	532351937
13618	NC_022108	TCT	2	6	681183	681188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351937
13619	NC_022108	AAAT	2	8	681194	681201	75 %	25 %	0 %	0 %	532351937
13620	NC_022108	CAA	2	6	681213	681218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351937
13621	NC_022108	A	8	8	681223	681230	100 %	0 %	0 %	0 %	532351937
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13854	NC_022108	A	6	6	692324	692329	100 %	0 %	0 %	0 %	532351949
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13859	NC_022108	ATG	2	6	692507	692512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351949
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13862	NC_022108	CTC	2	6	692592	692597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351949
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13990	NC_022108	GCA	2	6	699153	699158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351955
13991	NC_022108	TCT	2	6	699249	699254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351955
13992	NC_022108	TTCT	2	8	699282	699289	0 %	75 %	0 %	25 %	532351955
13993	NC_022108	TA	3	6	699336	699341	50 %	50 %	0 %	0 %	532351955
13994	NC_022108	T	8	8	699351	699358	0 %	100 %	0 %	0 %	532351955
13995	NC_022108	GCT	2	6	699376	699381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351955
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13998	NC_022108	TGC	2	6	699576	699581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351956
13999	NC_022108	TCTT	2	8	699661	699668	0 %	75 %	0 %	25 %	532351956
14000	NC_022108	CTT	2	6	699688	699693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351956

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