MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022108	TCC	2	6	649264	649269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351914
13002	NC_022108	TTC	2	6	649440	649445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351914
13003	NC_022108	TAC	2	6	649485	649490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351914
13004	NC_022108	TGA	2	6	649504	649509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351914
13005	NC_022108	GAA	2	6	649524	649529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351914
13006	NC_022108	CGAT	2	8	649552	649559	25 %	25 %	25 %	25 %	532351914
13007	NC_022108	GCA	2	6	649603	649608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351914
13008	NC_022108	CCT	2	6	649675	649680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351914
13009	NC_022108	A	6	6	649701	649706	100 %	0 %	0 %	0 %	532351914
13010	NC_022108	GCT	2	6	649707	649712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351914
13011	NC_022108	A	6	6	649722	649727	100 %	0 %	0 %	0 %	532351914
13012	NC_022108	A	6	6	649759	649764	100 %	0 %	0 %	0 %	532351914
13013	NC_022108	CAAG	2	8	649773	649780	50 %	0 %	25 %	25 %	532351914
13014	NC_022108	CA	3	6	649781	649786	50 %	0 %	0 %	50 %	532351914
13015	NC_022108	CTT	2	6	649787	649792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351914
13016	NC_022108	A	6	6	649825	649830	100 %	0 %	0 %	0 %	532351914
13017	NC_022108	GAT	2	6	649863	649868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351915
13018	NC_022108	ATG	2	6	649939	649944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351915
13019	NC_022108	GCA	2	6	649945	649950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351915
13020	NC_022108	CT	3	6	649968	649973	0 %	50 %	0 %	50 %	532351915
13021	NC_022108	TAAA	2	8	650084	650091	75 %	25 %	0 %	0 %	532351915
13022	NC_022108	TGA	2	6	650100	650105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351915
13023	NC_022108	TCGTC	2	10	650113	650122	0 %	40 %	20 %	40 %	532351915
13024	NC_022108	AGA	2	6	650140	650145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351915
13025	NC_022108	TCT	2	6	650164	650169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351915
13026	NC_022108	TAG	2	6	650181	650186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351915
13027	NC_022108	CTG	2	6	650342	650347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13028	NC_022108	GCTTCT	2	12	650362	650373	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	532351916
13029	NC_022108	AGC	2	6	650399	650404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13030	NC_022108	GAAA	2	8	650421	650428	75 %	0 %	25 %	0 %	532351916
13031	NC_022108	AGCT	2	8	650475	650482	25 %	25 %	25 %	25 %	532351916
13032	NC_022108	CAA	2	6	650485	650490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351916
13033	NC_022108	AGA	2	6	650496	650501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351916
13034	NC_022108	TCT	2	6	650524	650529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351916
13035	NC_022108	CTA	2	6	650603	650608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351916
13036	NC_022108	GAA	2	6	650622	650627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351916
13037	NC_022108	AAG	2	6	650672	650677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351916
13038	NC_022108	AGC	2	6	650736	650741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13039	NC_022108	A	7	7	650842	650848	100 %	0 %	0 %	0 %	532351916
13040	NC_022108	TGA	2	6	650906	650911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351916
13041	NC_022108	GTA	2	6	650944	650949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351916
13042	NC_022108	ATT	2	6	650955	650960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351916
13043	NC_022108	CTG	3	9	650987	650995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13044	NC_022108	CAG	2	6	651005	651010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13045	NC_022108	CAG	3	9	651026	651034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13046	NC_022108	ACA	2	6	651058	651063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351916
13047	NC_022108	TAT	2	6	651114	651119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351916
13048	NC_022108	AAGC	2	8	651190	651197	50 %	0 %	25 %	25 %	532351916
13049	NC_022108	GGC	2	6	651204	651209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351916
13050	NC_022108	TAGGAG	2	12	651329	651340	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532351916
13051	NC_022108	CAG	2	6	651347	651352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13052	NC_022108	AGAA	2	8	651401	651408	75 %	0 %	25 %	0 %	532351916
13053	NC_022108	AAG	2	6	651425	651430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351916
13054	NC_022108	ATG	2	6	651457	651462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351916
13055	NC_022108	CAA	2	6	651484	651489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351916
13056	NC_022108	AAAC	2	8	651508	651515	75 %	0 %	0 %	25 %	532351916
13057	NC_022108	CAG	2	6	651538	651543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351916
13058	NC_022108	GCC	2	6	651601	651606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351916
13059	NC_022108	T	6	6	651623	651628	0 %	100 %	0 %	0 %	532351916
13060	NC_022108	GT	3	6	651639	651644	0 %	50 %	50 %	0 %	532351916
13061	NC_022108	ACA	2	6	651649	651654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351916
13062	NC_022108	AGCTC	2	10	651693	651702	20 %	20 %	20 %	40 %	532351916
13063	NC_022108	A	6	6	651741	651746	100 %	0 %	0 %	0 %	532351917
13064	NC_022108	CTTC	2	8	652000	652007	0 %	50 %	0 %	50 %	532351917
13065	NC_022108	GTT	2	6	652033	652038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351917
13066	NC_022108	GCAA	2	8	652095	652102	50 %	0 %	25 %	25 %	532351917
13067	NC_022108	CAA	3	9	652129	652137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351917
13068	NC_022108	CCAAGC	2	12	652209	652220	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532351917
13069	NC_022108	CAG	2	6	652237	652242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351917
13070	NC_022108	TAG	2	6	652268	652273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351917
13071	NC_022108	AGG	3	9	652290	652298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351917
13072	NC_022108	GCA	2	6	652366	652371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351917
13073	NC_022108	GAT	2	6	652417	652422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351917
13074	NC_022108	AGC	2	6	652467	652472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351917
13075	NC_022108	CT	3	6	652537	652542	0 %	50 %	0 %	50 %	532351917
13076	NC_022108	AGG	2	6	652563	652568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351917
13077	NC_022108	ATT	2	6	652569	652574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351917
13078	NC_022108	TCT	2	6	652681	652686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351917
13079	NC_022108	TCG	2	6	652739	652744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351917
13080	NC_022108	CAA	2	6	652861	652866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351917
13081	NC_022108	CTCTG	2	10	652929	652938	0 %	40 %	20 %	40 %	532351917
13082	NC_022108	CTTT	2	8	652970	652977	0 %	75 %	0 %	25 %	532351917
13083	NC_022108	AGG	2	6	653136	653141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351918
13084	NC_022108	AAG	2	6	653154	653159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351918
13085	NC_022108	CAAC	2	8	653160	653167	50 %	0 %	0 %	50 %	532351918
13086	NC_022108	A	6	6	653169	653174	100 %	0 %	0 %	0 %	532351918
13087	NC_022108	GAA	2	6	653221	653226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351918
13088	NC_022108	CAAAT	2	10	653260	653269	60 %	20 %	0 %	20 %	532351918
13089	NC_022108	A	6	6	653273	653278	100 %	0 %	0 %	0 %	532351918
13090	NC_022108	CACAGG	2	12	653322	653333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351918
13091	NC_022108	CAG	2	6	653351	653356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351918
13092	NC_022108	ACA	2	6	653369	653374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351918
13093	NC_022108	AAG	2	6	653465	653470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351918
13094	NC_022108	GCT	2	6	653482	653487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351918
13095	NC_022108	CAG	2	6	653553	653558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351918
13096	NC_022108	CT	3	6	653619	653624	0 %	50 %	0 %	50 %	532351918
13097	NC_022108	ATAA	2	8	653670	653677	75 %	25 %	0 %	0 %	532351918
13098	NC_022108	ATA	2	6	653810	653815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351918
13099	NC_022108	ACT	2	6	653830	653835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351918
13100	NC_022108	AC	3	6	653975	653980	50 %	0 %	0 %	50 %	532351918
13101	NC_022108	AAC	2	6	654004	654009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351918
13102	NC_022108	CCA	2	6	654020	654025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351918
13103	NC_022108	AAC	2	6	654063	654068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351918
13104	NC_022108	TTG	2	6	654074	654079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351918
13105	NC_022108	A	7	7	654093	654099	100 %	0 %	0 %	0 %	532351918
13106	NC_022108	AAG	2	6	654353	654358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351919
13107	NC_022108	TTA	2	6	654437	654442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351919
13108	NC_022108	CCA	2	6	654464	654469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351919
13109	NC_022108	GAT	2	6	654508	654513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351919
13110	NC_022108	AC	3	6	654537	654542	50 %	0 %	0 %	50 %	532351919
13111	NC_022108	CTA	2	6	654627	654632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351919
13112	NC_022108	GAA	2	6	654658	654663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351919
13113	NC_022108	AGA	2	6	654702	654707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351919
13114	NC_022108	GCT	2	6	654748	654753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351919
13115	NC_022108	GAA	2	6	654808	654813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351919
13116	NC_022108	CCTT	2	8	654870	654877	0 %	50 %	0 %	50 %	532351919
13117	NC_022108	TCT	2	6	654916	654921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351919
13118	NC_022108	AT	3	6	654964	654969	50 %	50 %	0 %	0 %	532351919
13119	NC_022108	TCA	2	6	655011	655016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351919
13120	NC_022108	AGA	2	6	655020	655025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351919
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13241	NC_022108	AAG	2	6	661851	661856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351924
13242	NC_022108	AGC	2	6	661930	661935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351924
13243	NC_022108	TGA	2	6	661977	661982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351924
13244	NC_022108	GCA	2	6	661985	661990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351924
13245	NC_022108	A	7	7	661990	661996	100 %	0 %	0 %	0 %	532351924
13246	NC_022108	CTC	2	6	662000	662005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351924
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13248	NC_022108	CTA	2	6	662080	662085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351924
13249	NC_022108	GCGT	2	8	662308	662315	0 %	25 %	50 %	25 %	532351925
13250	NC_022108	TGAT	2	8	662486	662493	25 %	50 %	25 %	0 %	532351925
13251	NC_022108	GCT	2	6	662566	662571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351925
13252	NC_022108	TGG	2	6	662607	662612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351925
13253	NC_022108	ATG	2	6	662641	662646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351925
13254	NC_022108	TCA	2	6	662651	662656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351925
13255	NC_022108	ATGC	2	8	662665	662672	25 %	25 %	25 %	25 %	532351925
13256	NC_022108	A	8	8	662772	662779	100 %	0 %	0 %	0 %	532351925
13257	NC_022108	TGA	2	6	662814	662819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351925
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13260	NC_022108	TCT	2	6	662941	662946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351925
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13265	NC_022108	TCA	2	6	663197	663202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351925
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13268	NC_022108	AGA	2	6	663303	663308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351925
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13273	NC_022108	CTC	2	6	663753	663758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351926
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13330	NC_022108	AACA	2	8	666250	666257	75 %	0 %	0 %	25 %	532351927
13331	NC_022108	TCT	2	6	666270	666275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351927
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13343	NC_022108	TC	3	6	666886	666891	0 %	50 %	0 %	50 %	532351927
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13350	NC_022108	TGA	2	6	667122	667127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351927
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13353	NC_022108	TCC	2	6	667221	667226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351927
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13355	NC_022108	CAT	2	6	667326	667331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351927
13356	NC_022108	AAC	2	6	667416	667421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351927
13357	NC_022108	TC	4	8	667489	667496	0 %	50 %	0 %	50 %	532351927
13358	NC_022108	A	7	7	667502	667508	100 %	0 %	0 %	0 %	532351927
13359	NC_022108	TGG	2	6	667536	667541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351927
13360	NC_022108	AAT	2	6	667643	667648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351928
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13485	NC_022108	TCA	2	6	675343	675348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351931
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13487	NC_022108	CAG	2	6	675479	675484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351931
13488	NC_022108	AAG	2	6	675501	675506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351931
13489	NC_022108	AGCA	2	8	675567	675574	50 %	0 %	25 %	25 %	532351931
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