MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_022108	GA	3	6	601188	601193	50 %	0 %	50 %	0 %	532351871
12002	NC_022108	TAT	2	6	601342	601347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351871
12003	NC_022108	T	12	12	601350	601361	0 %	100 %	0 %	0 %	532351871
12004	NC_022108	AGCA	2	8	601362	601369	50 %	0 %	25 %	25 %	532351871
12005	NC_022108	A	6	6	601379	601384	100 %	0 %	0 %	0 %	532351871
12006	NC_022108	TAC	2	6	601386	601391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351871
12007	NC_022108	GCA	2	6	601641	601646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351872
12008	NC_022108	TG	3	6	601655	601660	0 %	50 %	50 %	0 %	532351872
12009	NC_022108	TTG	2	6	601784	601789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351872
12010	NC_022108	CAG	2	6	602038	602043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351872
12011	NC_022108	ATCCA	2	10	602133	602142	40 %	20 %	0 %	40 %	532351872
12012	NC_022108	ACTT	2	8	602245	602252	25 %	50 %	0 %	25 %	532351872
12013	NC_022108	AAACC	2	10	602301	602310	60 %	0 %	0 %	40 %	532351872
12014	NC_022108	TCC	2	6	602331	602336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351872
12015	NC_022108	TGCA	2	8	602338	602345	25 %	25 %	25 %	25 %	532351872
12016	NC_022108	CTT	2	6	602407	602412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351872
12017	NC_022108	TAA	2	6	602494	602499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351872
12018	NC_022108	TGC	2	6	602503	602508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351872
12019	NC_022108	AT	3	6	602517	602522	50 %	50 %	0 %	0 %	532351872
12020	NC_022108	GCA	2	6	602525	602530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351872
12021	NC_022108	A	6	6	602560	602565	100 %	0 %	0 %	0 %	532351872
12022	NC_022108	GCCA	2	8	602604	602611	25 %	0 %	25 %	50 %	532351872
12023	NC_022108	ATA	2	6	602644	602649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351872
12024	NC_022108	TTGC	2	8	602707	602714	0 %	50 %	25 %	25 %	532351872
12025	NC_022108	ACA	2	6	602716	602721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351872
12026	NC_022108	CA	3	6	602723	602728	50 %	0 %	0 %	50 %	532351872
12027	NC_022108	CAAA	2	8	602783	602790	75 %	0 %	0 %	25 %	532351872
12028	NC_022108	AGTCCA	2	12	602851	602862	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532351872
12029	NC_022108	TTC	2	6	602885	602890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351872
12030	NC_022108	CTA	2	6	602904	602909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351872
12031	NC_022108	AGCCC	2	10	602918	602927	20 %	0 %	20 %	60 %	532351872
12032	NC_022108	AAC	2	6	602956	602961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351872
12033	NC_022108	ACA	2	6	602969	602974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351872
12034	NC_022108	GAT	2	6	603016	603021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351872
12035	NC_022108	GA	3	6	603077	603082	50 %	0 %	50 %	0 %	532351872
12036	NC_022108	TTC	2	6	603160	603165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352249
12037	NC_022108	AAAGT	2	10	603227	603236	60 %	20 %	20 %	0 %	532351873
12038	NC_022108	GCA	2	6	603337	603342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351873
12039	NC_022108	TCA	2	6	603462	603467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351873
12040	NC_022108	CCA	2	6	603473	603478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351873
12041	NC_022108	T	6	6	603553	603558	0 %	100 %	0 %	0 %	532351873
12042	NC_022108	TCT	2	6	603566	603571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351873
12043	NC_022108	TTA	2	6	603572	603577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351873
12044	NC_022108	TCCT	2	8	603578	603585	0 %	50 %	0 %	50 %	532351873
12045	NC_022108	AAC	2	6	603869	603874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351874
12046	NC_022108	TG	3	6	603930	603935	0 %	50 %	50 %	0 %	532351874
12047	NC_022108	CATT	2	8	603987	603994	25 %	50 %	0 %	25 %	532351874
12048	NC_022108	GAT	2	6	604014	604019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351874
12049	NC_022108	TGA	2	6	604025	604030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351874
12050	NC_022108	ATT	2	6	604066	604071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351874
12051	NC_022108	TATC	2	8	604107	604114	25 %	50 %	0 %	25 %	532351874
12052	NC_022108	ATG	2	6	604120	604125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351874
12053	NC_022108	CGA	2	6	604200	604205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351874
12054	NC_022108	CTG	2	6	604311	604316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351874
12055	NC_022108	GCTC	2	8	604322	604329	0 %	25 %	25 %	50 %	532351874
12056	NC_022108	AAT	2	6	604357	604362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351874
12057	NC_022108	TCA	2	6	604364	604369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351874
12058	NC_022108	GCA	2	6	604385	604390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351874
12059	NC_022108	T	6	6	604409	604414	0 %	100 %	0 %	0 %	532351874
12060	NC_022108	GTT	2	6	604427	604432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351874
12061	NC_022108	AAAC	2	8	604442	604449	75 %	0 %	0 %	25 %	532351874
12062	NC_022108	A	6	6	604495	604500	100 %	0 %	0 %	0 %	532351874
12063	NC_022108	TACT	2	8	604530	604537	25 %	50 %	0 %	25 %	532351874
12064	NC_022108	AGCG	2	8	604556	604563	25 %	0 %	50 %	25 %	532351874
12065	NC_022108	CA	3	6	604570	604575	50 %	0 %	0 %	50 %	532351875
12066	NC_022108	TCT	2	6	604637	604642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351875
12067	NC_022108	ATA	2	6	604854	604859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351875
12068	NC_022108	AAC	2	6	604861	604866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351875
12069	NC_022108	TAG	2	6	604896	604901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351875
12070	NC_022108	GAGT	2	8	604925	604932	25 %	25 %	50 %	0 %	532351875
12071	NC_022108	TCC	2	6	605017	605022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351875
12072	NC_022108	CTT	2	6	605087	605092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351876
12073	NC_022108	GTAA	2	8	605108	605115	50 %	25 %	25 %	0 %	532351876
12074	NC_022108	AG	3	6	605135	605140	50 %	0 %	50 %	0 %	532351876
12075	NC_022108	AAC	2	6	605155	605160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351876
12076	NC_022108	ATAG	2	8	605181	605188	50 %	25 %	25 %	0 %	532351876
12077	NC_022108	ATC	2	6	605241	605246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351876
12078	NC_022108	A	6	6	605254	605259	100 %	0 %	0 %	0 %	532351876
12079	NC_022108	CT	3	6	605286	605291	0 %	50 %	0 %	50 %	532351876
12080	NC_022108	AAG	2	6	605303	605308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351876
12081	NC_022108	AGA	2	6	605424	605429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351876
12082	NC_022108	TC	3	6	605446	605451	0 %	50 %	0 %	50 %	532351876
12083	NC_022108	TCT	2	6	605456	605461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351876
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12085	NC_022108	AAC	2	6	605526	605531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351876
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12087	NC_022108	TTTG	2	8	605621	605628	0 %	75 %	25 %	0 %	532351876
12088	NC_022108	TTC	2	6	605689	605694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351876
12089	NC_022108	CTTC	2	8	605708	605715	0 %	50 %	0 %	50 %	532351876
12090	NC_022108	GCA	2	6	606493	606498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351877
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12093	NC_022108	CT	3	6	606682	606687	0 %	50 %	0 %	50 %	532351877
12094	NC_022108	AAT	2	6	606732	606737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351877
12095	NC_022108	CATA	2	8	606763	606770	50 %	25 %	0 %	25 %	532351877
12096	NC_022108	CT	4	8	606917	606924	0 %	50 %	0 %	50 %	532351878
12097	NC_022108	ATA	2	6	606929	606934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351878
12098	NC_022108	A	6	6	606958	606963	100 %	0 %	0 %	0 %	532351878
12099	NC_022108	CTT	2	6	606991	606996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351878
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12101	NC_022108	AAAG	2	8	607017	607024	75 %	0 %	25 %	0 %	532351878
12102	NC_022108	AAT	2	6	607033	607038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351878
12103	NC_022108	CT	3	6	607048	607053	0 %	50 %	0 %	50 %	532351878
12104	NC_022108	CA	3	6	607118	607123	50 %	0 %	0 %	50 %	532351878
12105	NC_022108	GAA	2	6	607168	607173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351878
12106	NC_022108	A	6	6	607184	607189	100 %	0 %	0 %	0 %	532351878
12107	NC_022108	TCG	2	6	607221	607226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351878
12108	NC_022108	ACTTC	2	10	607240	607249	20 %	40 %	0 %	40 %	532351878
12109	NC_022108	AG	3	6	607260	607265	50 %	0 %	50 %	0 %	532351878
12110	NC_022108	ATGT	2	8	607307	607314	25 %	50 %	25 %	0 %	532351879
12111	NC_022108	CTT	2	6	607333	607338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351879
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12113	NC_022108	GAA	2	6	607416	607421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351879
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12115	NC_022108	TTA	2	6	607527	607532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351879
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12117	NC_022108	TCT	2	6	607818	607823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351879
12118	NC_022108	AT	3	6	607918	607923	50 %	50 %	0 %	0 %	532351879
12119	NC_022108	TTC	2	6	607935	607940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351879
12120	NC_022108	T	6	6	607971	607976	0 %	100 %	0 %	0 %	532351879
12121	NC_022108	A	9	9	608013	608021	100 %	0 %	0 %	0 %	532351879
12122	NC_022108	CAT	2	6	608188	608193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351880
12123	NC_022108	GGA	2	6	608228	608233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351880
12124	NC_022108	A	6	6	608257	608262	100 %	0 %	0 %	0 %	532351880
12125	NC_022108	TAA	2	6	608299	608304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351880
12126	NC_022108	ATTTT	2	10	608312	608321	20 %	80 %	0 %	0 %	532351880
12127	NC_022108	GAAC	2	8	608396	608403	50 %	0 %	25 %	25 %	532351880
12128	NC_022108	GAT	2	6	608460	608465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351880
12129	NC_022108	GCT	2	6	608615	608620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351880
12130	NC_022108	T	6	6	608728	608733	0 %	100 %	0 %	0 %	532351880
12131	NC_022108	CAA	2	6	608900	608905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351880
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12133	NC_022108	CCA	2	6	609068	609073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351880
12134	NC_022108	CGCA	2	8	609118	609125	25 %	0 %	25 %	50 %	532351880
12135	NC_022108	TCA	2	6	609131	609136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351880
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12137	NC_022108	GATA	2	8	609237	609244	50 %	25 %	25 %	0 %	532351880
12138	NC_022108	AGT	2	6	609258	609263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351880
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12140	NC_022108	TCA	2	6	609452	609457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351880
12141	NC_022108	ACA	2	6	609489	609494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351880
12142	NC_022108	GAA	2	6	609503	609508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351880
12143	NC_022108	CA	3	6	609583	609588	50 %	0 %	0 %	50 %	532351880
12144	NC_022108	TGA	2	6	609623	609628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351880
12145	NC_022108	AC	3	6	609652	609657	50 %	0 %	0 %	50 %	532351880
12146	NC_022108	CACC	2	8	609727	609734	25 %	0 %	0 %	75 %	532351880
12147	NC_022108	AACC	2	8	609806	609813	50 %	0 %	0 %	50 %	532351880
12148	NC_022108	TTG	2	6	609827	609832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351880
12149	NC_022108	ACAA	2	8	609911	609918	75 %	0 %	0 %	25 %	532351881
12150	NC_022108	TTG	2	6	609926	609931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351881
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12152	NC_022108	CTT	2	6	609962	609967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351881
12153	NC_022108	CTGC	2	8	610039	610046	0 %	25 %	25 %	50 %	532351881
12154	NC_022108	CCAAAA	2	12	610140	610151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351881
12155	NC_022108	TCA	2	6	610188	610193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351881
12156	NC_022108	CGCC	2	8	610197	610204	0 %	0 %	25 %	75 %	532351881
12157	NC_022108	TAA	2	6	610266	610271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351881
12158	NC_022108	GATT	2	8	610294	610301	25 %	50 %	25 %	0 %	532351881
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12161	NC_022108	TCTT	2	8	610460	610467	0 %	75 %	0 %	25 %	532351881
12162	NC_022108	GAA	2	6	610502	610507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351881
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12164	NC_022108	AG	4	8	610614	610621	50 %	0 %	50 %	0 %	532351881
12165	NC_022108	TGA	2	6	610674	610679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351881
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12180	NC_022108	T	8	8	611131	611138	0 %	100 %	0 %	0 %	532351881
12181	NC_022108	ACC	2	6	611153	611158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351881
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12198	NC_022108	GATT	2	8	611817	611824	25 %	50 %	25 %	0 %	532351882
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12201	NC_022108	GGTT	2	8	611900	611907	0 %	50 %	50 %	0 %	532351882
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12229	NC_022108	A	6	6	612668	612673	100 %	0 %	0 %	0 %	532351882
12230	NC_022108	AGC	2	6	612721	612726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351882
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12232	NC_022108	TCAA	2	8	612948	612955	50 %	25 %	0 %	25 %	532351882
12233	NC_022108	TTG	2	6	612961	612966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351882
12234	NC_022108	CGCT	2	8	612994	613001	0 %	25 %	25 %	50 %	532351883
12235	NC_022108	TTTG	2	8	613019	613026	0 %	75 %	25 %	0 %	532351883
12236	NC_022108	ATC	2	6	613074	613079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351883
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12238	NC_022108	CTT	2	6	613161	613166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351883
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12240	NC_022108	TTTG	2	8	613195	613202	0 %	75 %	25 %	0 %	532351883
12241	NC_022108	CTCTC	2	10	613203	613212	0 %	40 %	0 %	60 %	532351883
12242	NC_022108	ATAG	2	8	613248	613255	50 %	25 %	25 %	0 %	532351883
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12384	NC_022108	A	6	6	620263	620268	100 %	0 %	0 %	0 %	532351888
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12490	NC_022108	AGC	2	6	625142	625147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351893
12491	NC_022108	CTT	2	6	625170	625175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12492	NC_022108	TGG	2	6	625200	625205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351893
12493	NC_022108	ATT	2	6	625220	625225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351893
12494	NC_022108	TAAG	2	8	625228	625235	50 %	25 %	25 %	0 %	532351893
12495	NC_022108	CTC	2	6	625237	625242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351893
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12498	NC_022108	TC	3	6	625432	625437	0 %	50 %	0 %	50 %	532351893
12499	NC_022108	CTT	2	6	625483	625488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351893
12500	NC_022108	GGAA	2	8	625505	625512	50 %	0 %	50 %	0 %	532351893

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