MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022108	TTTTG	2	10	576355	576364	0 %	80 %	20 %	0 %	532351837
11502	NC_022108	T	6	6	576386	576391	0 %	100 %	0 %	0 %	532351837
11503	NC_022108	CAT	2	6	576426	576431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351837
11504	NC_022108	A	7	7	576457	576463	100 %	0 %	0 %	0 %	532351837
11505	NC_022108	AG	3	6	576517	576522	50 %	0 %	50 %	0 %	532351837
11506	NC_022108	GAA	2	6	576526	576531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351837
11507	NC_022108	TACTC	2	10	576534	576543	20 %	40 %	0 %	40 %	532351837
11508	NC_022108	AAG	2	6	576591	576596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351837
11509	NC_022108	GAAA	2	8	576600	576607	75 %	0 %	25 %	0 %	532351837
11510	NC_022108	CTAC	2	8	576636	576643	25 %	25 %	0 %	50 %	532351837
11511	NC_022108	CT	3	6	576760	576765	0 %	50 %	0 %	50 %	532351837
11512	NC_022108	AGA	2	6	576783	576788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351837
11513	NC_022108	TGA	2	6	576809	576814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351837
11514	NC_022108	CGC	2	6	576874	576879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351837
11515	NC_022108	CAG	2	6	576911	576916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351837
11516	NC_022108	GCTG	2	8	577003	577010	0 %	25 %	50 %	25 %	532351837
11517	NC_022108	CTT	2	6	577063	577068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351837
11518	NC_022108	A	7	7	577105	577111	100 %	0 %	0 %	0 %	532351837
11519	NC_022108	TGC	2	6	577395	577400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351838
11520	NC_022108	GTCT	2	8	577413	577420	0 %	50 %	25 %	25 %	532351838
11521	NC_022108	CTG	2	6	577469	577474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351838
11522	NC_022108	AGG	2	6	577476	577481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351838
11523	NC_022108	AATTC	2	10	577557	577566	40 %	40 %	0 %	20 %	532351838
11524	NC_022108	CTC	2	6	577604	577609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351838
11525	NC_022108	TCATAT	2	12	577635	577646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532351838
11526	NC_022108	AAG	2	6	577745	577750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351838
11527	NC_022108	GTT	2	6	577774	577779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351838
11528	NC_022108	TCT	2	6	577783	577788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351838
11529	NC_022108	CTT	2	6	577859	577864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351838
11530	NC_022108	GTTT	2	8	577993	578000	0 %	75 %	25 %	0 %	532351838
11531	NC_022108	TGTT	2	8	578018	578025	0 %	75 %	25 %	0 %	532351838
11532	NC_022108	CAAA	2	8	578071	578078	75 %	0 %	0 %	25 %	532351838
11533	NC_022108	CCA	2	6	578199	578204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351838
11534	NC_022108	AC	3	6	578231	578236	50 %	0 %	0 %	50 %	532351838
11535	NC_022108	AAG	2	6	578237	578242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351838
11536	NC_022108	TC	3	6	578256	578261	0 %	50 %	0 %	50 %	532351838
11537	NC_022108	ATT	2	6	578293	578298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351838
11538	NC_022108	ATC	2	6	578326	578331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351838
11539	NC_022108	CTT	2	6	578387	578392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351838
11540	NC_022108	CTT	2	6	578418	578423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351838
11541	NC_022108	GAA	2	6	578455	578460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351838
11542	NC_022108	TAAA	2	8	578498	578505	75 %	25 %	0 %	0 %	532351838
11543	NC_022108	TCC	2	6	578517	578522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351838
11544	NC_022108	GCC	2	6	578534	578539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351838
11545	NC_022108	GAT	2	6	578566	578571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351838
11546	NC_022108	TTA	2	6	578632	578637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351838
11547	NC_022108	CT	3	6	578665	578670	0 %	50 %	0 %	50 %	532351838
11548	NC_022108	ACT	2	6	578691	578696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351838
11549	NC_022108	AGCG	2	8	578701	578708	25 %	0 %	50 %	25 %	532351838
11550	NC_022108	CTATG	2	10	578709	578718	20 %	40 %	20 %	20 %	532351838
11551	NC_022108	GTC	2	6	578819	578824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351838
11552	NC_022108	CTT	2	6	578845	578850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351838
11553	NC_022108	CTT	2	6	578897	578902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351838
11554	NC_022108	TGGAGA	2	12	578903	578914	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	532351838
11555	NC_022108	ACA	2	6	578940	578945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351838
11556	NC_022108	GTA	2	6	578957	578962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351838
11557	NC_022108	GA	3	6	578965	578970	50 %	0 %	50 %	0 %	532351838
11558	NC_022108	GCTTA	2	10	579021	579030	20 %	40 %	20 %	20 %	532351838
11559	NC_022108	GAA	2	6	579135	579140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351838
11560	NC_022108	GAA	2	6	579206	579211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351838
11561	NC_022108	TCTG	2	8	579240	579247	0 %	50 %	25 %	25 %	532351839
11562	NC_022108	AGA	2	6	579328	579333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351839
11563	NC_022108	TAT	2	6	579343	579348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351839
11564	NC_022108	GCG	2	6	579360	579365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351839
11565	NC_022108	T	7	7	579375	579381	0 %	100 %	0 %	0 %	532351839
11566	NC_022108	CTCCAT	2	12	579426	579437	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532351839
11567	NC_022108	T	6	6	579523	579528	0 %	100 %	0 %	0 %	532351839
11568	NC_022108	A	7	7	579533	579539	100 %	0 %	0 %	0 %	532351839
11569	NC_022108	TCA	2	6	579580	579585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351839
11570	NC_022108	CA	3	6	579584	579589	50 %	0 %	0 %	50 %	532351839
11571	NC_022108	CTT	2	6	579654	579659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351839
11572	NC_022108	ATG	2	6	579678	579683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351839
11573	NC_022108	AGA	2	6	579721	579726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351839
11574	NC_022108	GCA	2	6	579752	579757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351839
11575	NC_022108	ACTC	2	8	579793	579800	25 %	25 %	0 %	50 %	532351839
11576	NC_022108	A	9	9	579843	579851	100 %	0 %	0 %	0 %	532351839
11577	NC_022108	C	6	6	579854	579859	0 %	0 %	0 %	100 %	532351839
11578	NC_022108	G	6	6	579875	579880	0 %	0 %	100 %	0 %	532351839
11579	NC_022108	TCGAA	2	10	580021	580030	40 %	20 %	20 %	20 %	532351840
11580	NC_022108	CTT	2	6	580041	580046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351840
11581	NC_022108	CT	3	6	580069	580074	0 %	50 %	0 %	50 %	532351840
11582	NC_022108	TAC	2	6	580111	580116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351840
11583	NC_022108	A	6	6	580154	580159	100 %	0 %	0 %	0 %	532351840
11584	NC_022108	TC	3	6	580162	580167	0 %	50 %	0 %	50 %	532351840
11585	NC_022108	AAC	2	6	580174	580179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351840
11586	NC_022108	GA	3	6	580205	580210	50 %	0 %	50 %	0 %	532351840
11587	NC_022108	GCA	2	6	580226	580231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351840
11588	NC_022108	AAT	2	6	580261	580266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351840
11589	NC_022108	CT	3	6	580343	580348	0 %	50 %	0 %	50 %	532351840
11590	NC_022108	GCAC	2	8	580364	580371	25 %	0 %	25 %	50 %	532351840
11591	NC_022108	CTG	2	6	580572	580577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351841
11592	NC_022108	GA	3	6	580584	580589	50 %	0 %	50 %	0 %	532351841
11593	NC_022108	CTT	2	6	580617	580622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351841
11594	NC_022108	AGA	2	6	580627	580632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351841
11595	NC_022108	AGGA	2	8	580644	580651	50 %	0 %	50 %	0 %	532351841
11596	NC_022108	CCA	2	6	580707	580712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351841
11597	NC_022108	CTG	2	6	580722	580727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351841
11598	NC_022108	T	7	7	580728	580734	0 %	100 %	0 %	0 %	532351841
11599	NC_022108	GC	3	6	580777	580782	0 %	0 %	50 %	50 %	532351841
11600	NC_022108	ATAG	2	8	580820	580827	50 %	25 %	25 %	0 %	532351841
11601	NC_022108	TAA	2	6	580861	580866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351841
11602	NC_022108	GC	3	6	580970	580975	0 %	0 %	50 %	50 %	532351841
11603	NC_022108	CTA	2	6	580980	580985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351841
11604	NC_022108	A	6	6	580985	580990	100 %	0 %	0 %	0 %	532351841
11605	NC_022108	ATA	2	6	581003	581008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351841
11606	NC_022108	TCA	2	6	581048	581053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351841
11607	NC_022108	TCT	2	6	581119	581124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351841
11608	NC_022108	TCT	2	6	581196	581201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351842
11609	NC_022108	AAT	2	6	581223	581228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351842
11610	NC_022108	CTT	2	6	581252	581257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351842
11611	NC_022108	CAG	2	6	581278	581283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351842
11612	NC_022108	T	6	6	581285	581290	0 %	100 %	0 %	0 %	532351842
11613	NC_022108	TAA	3	9	581342	581350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351842
11614	NC_022108	ACA	2	6	581418	581423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351842
11615	NC_022108	TTG	2	6	581438	581443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351842
11616	NC_022108	AAC	2	6	581466	581471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351842
11617	NC_022108	GA	3	6	581503	581508	50 %	0 %	50 %	0 %	532351842
11618	NC_022108	AAAGG	2	10	581678	581687	60 %	0 %	40 %	0 %	532351842
11619	NC_022108	CTG	2	6	581824	581829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351843
11620	NC_022108	CAT	2	6	581868	581873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351843
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11622	NC_022108	TTG	2	6	581887	581892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351843
11623	NC_022108	TGT	2	6	582005	582010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351843
11624	NC_022108	CTT	2	6	582061	582066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351843
11625	NC_022108	AACA	2	8	582096	582103	75 %	0 %	0 %	25 %	532351843
11626	NC_022108	ACA	2	6	582108	582113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351843
11627	NC_022108	TTC	2	6	582190	582195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351843
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11641	NC_022108	CTT	2	6	583081	583086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351844
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11652	NC_022108	AGA	2	6	583605	583610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351845
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11658	NC_022108	CGT	2	6	583695	583700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351845
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11741	NC_022108	TGT	2	6	587778	587783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351850
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11821	NC_022108	TGA	2	6	592247	592252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351859
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11825	NC_022108	T	6	6	592306	592311	0 %	100 %	0 %	0 %	532352247
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11851	NC_022108	ATT	2	6	593422	593427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351861
11852	NC_022108	CT	3	6	593517	593522	0 %	50 %	0 %	50 %	532351861
11853	NC_022108	CAA	2	6	593526	593531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351861
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11858	NC_022108	T	6	6	593869	593874	0 %	100 %	0 %	0 %	532351862
11859	NC_022108	TTG	2	6	593898	593903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351862
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11986	NC_022108	CCA	2	6	600382	600387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351870
11987	NC_022108	TCAT	2	8	600450	600457	25 %	50 %	0 %	25 %	532351870
11988	NC_022108	TGC	2	6	600476	600481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351870
11989	NC_022108	GAA	2	6	600518	600523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351870
11990	NC_022108	A	6	6	600554	600559	100 %	0 %	0 %	0 %	532351871
11991	NC_022108	TCA	2	6	600617	600622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351871
11992	NC_022108	ATA	2	6	600666	600671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351871
11993	NC_022108	CCT	2	6	600692	600697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351871
11994	NC_022108	TTC	2	6	600778	600783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351871
11995	NC_022108	TGC	2	6	600874	600879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351871
11996	NC_022108	CTGATA	2	12	600892	600903	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532351871
11997	NC_022108	CTGCTC	2	12	600940	600951	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532351871
11998	NC_022108	CCTG	2	8	600959	600966	0 %	25 %	25 %	50 %	532351871
11999	NC_022108	ATT	2	6	601042	601047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351871
12000	NC_022108	CAA	2	6	601072	601077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351871

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