MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022108	CAA	2	6	551630	551635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351815
11002	NC_022108	TTC	2	6	551667	551672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351815
11003	NC_022108	TTG	2	6	551683	551688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351815
11004	NC_022108	AGA	2	6	551691	551696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351815
11005	NC_022108	ATG	2	6	551705	551710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351815
11006	NC_022108	A	7	7	551722	551728	100 %	0 %	0 %	0 %	532351815
11007	NC_022108	ACTCG	2	10	551738	551747	20 %	20 %	20 %	40 %	532351815
11008	NC_022108	TGG	2	6	551814	551819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351815
11009	NC_022108	GAA	2	6	551836	551841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351815
11010	NC_022108	A	6	6	551925	551930	100 %	0 %	0 %	0 %	532351815
11011	NC_022108	GCA	2	6	551985	551990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351815
11012	NC_022108	GCG	2	6	552022	552027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351815
11013	NC_022108	TGC	2	6	552096	552101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351815
11014	NC_022108	TGT	2	6	552144	552149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351815
11015	NC_022108	ATT	2	6	552226	552231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351816
11016	NC_022108	CT	3	6	552268	552273	0 %	50 %	0 %	50 %	532351816
11017	NC_022108	GCC	2	6	552369	552374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351816
11018	NC_022108	ACT	2	6	552543	552548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351816
11019	NC_022108	CGGG	2	8	552587	552594	0 %	0 %	75 %	25 %	532351816
11020	NC_022108	GAA	2	6	552625	552630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351816
11021	NC_022108	CT	3	6	552631	552636	0 %	50 %	0 %	50 %	532351816
11022	NC_022108	AAC	2	6	552700	552705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351816
11023	NC_022108	ATA	2	6	552715	552720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351816
11024	NC_022108	CT	3	6	552742	552747	0 %	50 %	0 %	50 %	532351817
11025	NC_022108	CTCTC	2	10	552799	552808	0 %	40 %	0 %	60 %	532351817
11026	NC_022108	A	6	6	552817	552822	100 %	0 %	0 %	0 %	532351817
11027	NC_022108	CAT	2	6	552852	552857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351817
11028	NC_022108	AGGA	2	8	552897	552904	50 %	0 %	50 %	0 %	532351817
11029	NC_022108	ATA	2	6	552916	552921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351817
11030	NC_022108	AGC	2	6	552948	552953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351817
11031	NC_022108	GA	3	6	553053	553058	50 %	0 %	50 %	0 %	532351817
11032	NC_022108	T	8	8	553059	553066	0 %	100 %	0 %	0 %	532351817
11033	NC_022108	ACA	2	6	553097	553102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351817
11034	NC_022108	ATA	2	6	553136	553141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351817
11035	NC_022108	CCA	2	6	553156	553161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351817
11036	NC_022108	ATG	2	6	553186	553191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351817
11037	NC_022108	CCA	2	6	553222	553227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351817
11038	NC_022108	CCA	2	6	553299	553304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351817
11039	NC_022108	TC	3	6	553322	553327	0 %	50 %	0 %	50 %	532351817
11040	NC_022108	CCG	2	6	553333	553338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351817
11041	NC_022108	CAT	2	6	553340	553345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351817
11042	NC_022108	GCT	2	6	553359	553364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351817
11043	NC_022108	TAA	2	6	553365	553370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351817
11044	NC_022108	ATT	2	6	553446	553451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351817
11045	NC_022108	CT	3	6	553497	553502	0 %	50 %	0 %	50 %	532351817
11046	NC_022108	CTT	2	6	553550	553555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351817
11047	NC_022108	TTG	2	6	553684	553689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351817
11048	NC_022108	A	6	6	553702	553707	100 %	0 %	0 %	0 %	532351817
11049	NC_022108	TTC	2	6	553726	553731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351817
11050	NC_022108	GAT	2	6	553802	553807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351817
11051	NC_022108	TGC	2	6	553810	553815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351817
11052	NC_022108	GCT	2	6	553850	553855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351817
11053	NC_022108	TTG	2	6	553910	553915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351817
11054	NC_022108	GAA	2	6	553916	553921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351817
11055	NC_022108	GTT	2	6	553936	553941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351817
11056	NC_022108	CA	3	6	554080	554085	50 %	0 %	0 %	50 %	532351817
11057	NC_022108	TAAAA	2	10	554106	554115	80 %	20 %	0 %	0 %	532351817
11058	NC_022108	A	6	6	554112	554117	100 %	0 %	0 %	0 %	532351817
11059	NC_022108	A	6	6	554142	554147	100 %	0 %	0 %	0 %	532351817
11060	NC_022108	TAT	2	6	554324	554329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351817
11061	NC_022108	A	6	6	554337	554342	100 %	0 %	0 %	0 %	532351817
11062	NC_022108	CCTT	2	8	554379	554386	0 %	50 %	0 %	50 %	532351817
11063	NC_022108	TCT	2	6	554387	554392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351817
11064	NC_022108	AAG	2	6	554410	554415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351817
11065	NC_022108	CAC	2	6	554485	554490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351818
11066	NC_022108	CTC	2	6	554571	554576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351818
11067	NC_022108	AGT	2	6	554579	554584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351818
11068	NC_022108	AAG	2	6	554604	554609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351818
11069	NC_022108	TCT	2	6	554699	554704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351818
11070	NC_022108	GCA	2	6	554747	554752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351818
11071	NC_022108	AAG	2	6	554820	554825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351818
11072	NC_022108	TTTA	2	8	554899	554906	25 %	75 %	0 %	0 %	532351818
11073	NC_022108	AAT	2	6	554920	554925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351818
11074	NC_022108	CAA	2	6	554937	554942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351818
11075	NC_022108	AAAAT	2	10	554955	554964	80 %	20 %	0 %	0 %	532351818
11076	NC_022108	GAT	2	6	554985	554990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351818
11077	NC_022108	ATA	2	6	555039	555044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351818
11078	NC_022108	TCC	2	6	555207	555212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351818
11079	NC_022108	TTCA	2	8	555298	555305	25 %	50 %	0 %	25 %	532351818
11080	NC_022108	TCC	2	6	555362	555367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351818
11081	NC_022108	CAA	2	6	555381	555386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351818
11082	NC_022108	CCT	2	6	555401	555406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351818
11083	NC_022108	GAAT	2	8	555408	555415	50 %	25 %	25 %	0 %	532351818
11084	NC_022108	CTG	2	6	555420	555425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351818
11085	NC_022108	GAA	2	6	555452	555457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351818
11086	NC_022108	AGC	2	6	555473	555478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351818
11087	NC_022108	CTT	2	6	555547	555552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351818
11088	NC_022108	AAT	2	6	555568	555573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351818
11089	NC_022108	A	8	8	555625	555632	100 %	0 %	0 %	0 %	532351818
11090	NC_022108	CT	3	6	555655	555660	0 %	50 %	0 %	50 %	532351818
11091	NC_022108	TACG	2	8	555689	555696	25 %	25 %	25 %	25 %	532351818
11092	NC_022108	AGC	2	6	555763	555768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351818
11093	NC_022108	GAT	2	6	555793	555798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351818
11094	NC_022108	CTC	2	6	555858	555863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351818
11095	NC_022108	T	6	6	555949	555954	0 %	100 %	0 %	0 %	532351819
11096	NC_022108	TTA	2	6	556057	556062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351819
11097	NC_022108	GAT	2	6	556089	556094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351819
11098	NC_022108	TCT	2	6	556180	556185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351819
11099	NC_022108	AAT	2	6	556250	556255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351819
11100	NC_022108	TCGT	2	8	556328	556335	0 %	50 %	25 %	25 %	532351819
11101	NC_022108	TAG	2	6	556354	556359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351819
11102	NC_022108	CGGAAA	2	12	556366	556377	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532351819
11103	NC_022108	TGT	2	6	556499	556504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351819
11104	NC_022108	ATG	2	6	556505	556510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351819
11105	NC_022108	AG	3	6	556517	556522	50 %	0 %	50 %	0 %	532351819
11106	NC_022108	AAT	2	6	556569	556574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351819
11107	NC_022108	CGAT	2	8	556582	556589	25 %	25 %	25 %	25 %	532351819
11108	NC_022108	AAAGA	2	10	556626	556635	80 %	0 %	20 %	0 %	532351819
11109	NC_022108	TGA	2	6	556674	556679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351819
11110	NC_022108	T	7	7	556681	556687	0 %	100 %	0 %	0 %	532351819
11111	NC_022108	CCTCT	2	10	556697	556706	0 %	40 %	0 %	60 %	532351819
11112	NC_022108	AGC	2	6	556707	556712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351819
11113	NC_022108	AGG	2	6	556767	556772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351819
11114	NC_022108	AG	3	6	556814	556819	50 %	0 %	50 %	0 %	532351819
11115	NC_022108	ATATAG	2	12	556837	556848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	532351819
11116	NC_022108	TCA	2	6	556912	556917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351819
11117	NC_022108	GAA	2	6	556975	556980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351819
11118	NC_022108	TCT	2	6	557029	557034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351819
11119	NC_022108	TCT	2	6	557042	557047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351819
11120	NC_022108	T	6	6	557127	557132	0 %	100 %	0 %	0 %	532351819
11121	NC_022108	AACG	2	8	557174	557181	50 %	0 %	25 %	25 %	532351819
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11228	NC_022108	TCC	2	6	562887	562892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351824
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11231	NC_022108	CTA	2	6	563192	563197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351825
11232	NC_022108	CAT	2	6	563231	563236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351825
11233	NC_022108	AATC	2	8	563285	563292	50 %	25 %	0 %	25 %	532351825
11234	NC_022108	TA	3	6	563339	563344	50 %	50 %	0 %	0 %	532351825
11235	NC_022108	GA	3	6	563373	563378	50 %	0 %	50 %	0 %	532351825
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11239	NC_022108	ATC	2	6	563505	563510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351825
11240	NC_022108	CCTT	2	8	563563	563570	0 %	50 %	0 %	50 %	532351825
11241	NC_022108	TTG	2	6	563634	563639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351825
11242	NC_022108	CGA	2	6	563663	563668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351825
11243	NC_022108	TC	3	6	563681	563686	0 %	50 %	0 %	50 %	532351825
11244	NC_022108	CCAC	2	8	563817	563824	25 %	0 %	0 %	75 %	532351825
11245	NC_022108	CT	3	6	563956	563961	0 %	50 %	0 %	50 %	532351826
11246	NC_022108	TGT	2	6	563995	564000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351826
11247	NC_022108	GAA	2	6	564023	564028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351826
11248	NC_022108	AGG	2	6	564048	564053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351826
11249	NC_022108	TA	3	6	564057	564062	50 %	50 %	0 %	0 %	532351826
11250	NC_022108	GAAC	2	8	564109	564116	50 %	0 %	25 %	25 %	532351826
11251	NC_022108	CTA	2	6	564229	564234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351826
11252	NC_022108	AGATCC	2	12	564252	564263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	532351826
11253	NC_022108	CAAA	2	8	564266	564273	75 %	0 %	0 %	25 %	532351826
11254	NC_022108	CCT	2	6	564323	564328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351826
11255	NC_022108	CAC	2	6	564330	564335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351826
11256	NC_022108	AGAA	2	8	564399	564406	75 %	0 %	25 %	0 %	532351826
11257	NC_022108	CAAA	2	8	564523	564530	75 %	0 %	0 %	25 %	532351827
11258	NC_022108	GA	3	6	564535	564540	50 %	0 %	50 %	0 %	532351827
11259	NC_022108	CCAT	2	8	564546	564553	25 %	25 %	0 %	50 %	532351827
11260	NC_022108	GGA	2	6	564600	564605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351827
11261	NC_022108	TCT	2	6	564627	564632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351827
11262	NC_022108	GCTC	2	8	564657	564664	0 %	25 %	25 %	50 %	532351827
11263	NC_022108	ATC	2	6	564695	564700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351827
11264	NC_022108	CT	3	6	564715	564720	0 %	50 %	0 %	50 %	532351827
11265	NC_022108	CAT	2	6	564727	564732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351827
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11268	NC_022108	TGA	2	6	564795	564800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351827
11269	NC_022108	AGA	2	6	564869	564874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351827
11270	NC_022108	AAT	2	6	564886	564891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351827
11271	NC_022108	A	6	6	564936	564941	100 %	0 %	0 %	0 %	532351827
11272	NC_022108	CTT	2	6	564958	564963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351827
11273	NC_022108	ATC	2	6	565007	565012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351827
11274	NC_022108	TC	3	6	565026	565031	0 %	50 %	0 %	50 %	532351827
11275	NC_022108	T	6	6	565045	565050	0 %	100 %	0 %	0 %	532351827
11276	NC_022108	CCCA	2	8	565059	565066	25 %	0 %	0 %	75 %	532351827
11277	NC_022108	CTTG	2	8	565152	565159	0 %	50 %	25 %	25 %	532351827
11278	NC_022108	AGA	2	6	565162	565167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351827
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11281	NC_022108	TCA	2	6	565378	565383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
11282	NC_022108	CAT	2	6	565458	565463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
11283	NC_022108	CA	3	6	565556	565561	50 %	0 %	0 %	50 %	532351828
11284	NC_022108	AAT	2	6	565590	565595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351828
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11286	NC_022108	C	6	6	565632	565637	0 %	0 %	0 %	100 %	532351828
11287	NC_022108	TCA	2	6	565639	565644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351828
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11333	NC_022108	CGA	2	6	568443	568448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351830
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11343	NC_022108	CTA	2	6	568806	568811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351831
11344	NC_022108	T	6	6	569018	569023	0 %	100 %	0 %	0 %	532351831
11345	NC_022108	ACAG	2	8	569051	569058	50 %	0 %	25 %	25 %	532351831
11346	NC_022108	TTC	2	6	569110	569115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
11347	NC_022108	ATA	2	6	569130	569135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
11348	NC_022108	TAA	3	9	569152	569160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
11349	NC_022108	TTAA	2	8	569216	569223	50 %	50 %	0 %	0 %	532351832
11350	NC_022108	GCA	2	6	569228	569233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351832
11351	NC_022108	CT	3	6	569317	569322	0 %	50 %	0 %	50 %	532351832
11352	NC_022108	TAA	2	6	569376	569381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
11353	NC_022108	CTG	2	6	569385	569390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
11354	NC_022108	CTG	2	6	569476	569481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
11355	NC_022108	GCT	3	9	569523	569531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
11356	NC_022108	CT	3	6	569607	569612	0 %	50 %	0 %	50 %	532351832
11357	NC_022108	AAT	2	6	569664	569669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
11358	NC_022108	CAG	2	6	569670	569675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351832
11359	NC_022108	A	6	6	569678	569683	100 %	0 %	0 %	0 %	532351832
11360	NC_022108	T	6	6	569695	569700	0 %	100 %	0 %	0 %	532351832
11361	NC_022108	ACA	2	6	569874	569879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351832
11362	NC_022108	AAT	2	6	569914	569919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351832
11363	NC_022108	TCT	2	6	569930	569935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
11364	NC_022108	TTC	2	6	570079	570084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
11365	NC_022108	TCT	2	6	570218	570223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
11366	NC_022108	AAAT	2	8	570232	570239	75 %	25 %	0 %	0 %	532351832
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11368	NC_022108	A	7	7	570342	570348	100 %	0 %	0 %	0 %	532351832
11369	NC_022108	CTT	2	6	570354	570359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351832
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11372	NC_022108	CTG	2	6	570441	570446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351832
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11374	NC_022108	A	6	6	570532	570537	100 %	0 %	0 %	0 %	532351832
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11470	NC_022108	A	8	8	574892	574899	100 %	0 %	0 %	0 %	532351835
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11474	NC_022108	AGAAA	2	10	575037	575046	80 %	0 %	20 %	0 %	532351835
11475	NC_022108	AAAG	2	8	575066	575073	75 %	0 %	25 %	0 %	532351835
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11477	NC_022108	ACCA	2	8	575581	575588	50 %	0 %	0 %	50 %	532351836
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