MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_022108	GGAG	2	8	527810	527817	25 %	0 %	75 %	0 %	532351795
10502	NC_022108	TCA	2	6	527820	527825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351795
10503	NC_022108	TCA	2	6	527863	527868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351795
10504	NC_022108	ACT	2	6	527993	527998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351795
10505	NC_022108	A	6	6	528053	528058	100 %	0 %	0 %	0 %	532351795
10506	NC_022108	CAA	2	6	528122	528127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351795
10507	NC_022108	ACA	2	6	528169	528174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351795
10508	NC_022108	CTT	2	6	528175	528180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351795
10509	NC_022108	TCA	2	6	528213	528218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351795
10510	NC_022108	CTA	2	6	528263	528268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351796
10511	NC_022108	ATCG	2	8	528351	528358	25 %	25 %	25 %	25 %	532351796
10512	NC_022108	TCC	2	6	528369	528374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351796
10513	NC_022108	CTAG	2	8	528442	528449	25 %	25 %	25 %	25 %	532351796
10514	NC_022108	TGC	2	6	528492	528497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351796
10515	NC_022108	TTA	2	6	528512	528517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351796
10516	NC_022108	TCT	2	6	528526	528531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351796
10517	NC_022108	AGG	2	6	528701	528706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351796
10518	NC_022108	TCA	2	6	528711	528716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351796
10519	NC_022108	AGA	2	6	528720	528725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351796
10520	NC_022108	TA	3	6	528737	528742	50 %	50 %	0 %	0 %	532351796
10521	NC_022108	A	6	6	528742	528747	100 %	0 %	0 %	0 %	532351796
10522	NC_022108	CG	3	6	528753	528758	0 %	0 %	50 %	50 %	532351796
10523	NC_022108	AGA	2	6	528765	528770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351796
10524	NC_022108	A	6	6	528781	528786	100 %	0 %	0 %	0 %	532351796
10525	NC_022108	GCG	2	6	528920	528925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351796
10526	NC_022108	CAA	2	6	529076	529081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351796
10527	NC_022108	CAA	2	6	529111	529116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351796
10528	NC_022108	AGC	2	6	529194	529199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351796
10529	NC_022108	CTTC	2	8	529207	529214	0 %	50 %	0 %	50 %	532351796
10530	NC_022108	GAA	2	6	529265	529270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351796
10531	NC_022108	GA	3	6	529289	529294	50 %	0 %	50 %	0 %	532351796
10532	NC_022108	CAG	2	6	529322	529327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351796
10533	NC_022108	AGA	3	9	529374	529382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351796
10534	NC_022108	TCT	2	6	529438	529443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351796
10535	NC_022108	TC	3	6	529510	529515	0 %	50 %	0 %	50 %	532351796
10536	NC_022108	AAG	2	6	529577	529582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351796
10537	NC_022108	AGA	2	6	529608	529613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351796
10538	NC_022108	TTC	2	6	529729	529734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351796
10539	NC_022108	CGAA	2	8	529797	529804	50 %	0 %	25 %	25 %	532351796
10540	NC_022108	GC	3	6	530054	530059	0 %	0 %	50 %	50 %	532351797
10541	NC_022108	ATGA	2	8	530104	530111	50 %	25 %	25 %	0 %	532351797
10542	NC_022108	GAT	2	6	530124	530129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351797
10543	NC_022108	AAAT	2	8	530173	530180	75 %	25 %	0 %	0 %	532351797
10544	NC_022108	AAC	2	6	530256	530261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351797
10545	NC_022108	CTGA	2	8	530265	530272	25 %	25 %	25 %	25 %	532351797
10546	NC_022108	GA	3	6	530271	530276	50 %	0 %	50 %	0 %	532351797
10547	NC_022108	GTT	2	6	530292	530297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351797
10548	NC_022108	TAA	2	6	530307	530312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351797
10549	NC_022108	AGA	2	6	530336	530341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351797
10550	NC_022108	CCT	2	6	530405	530410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351797
10551	NC_022108	A	6	6	530429	530434	100 %	0 %	0 %	0 %	532351797
10552	NC_022108	GC	3	6	530452	530457	0 %	0 %	50 %	50 %	532351797
10553	NC_022108	AGC	2	6	530507	530512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351797
10554	NC_022108	AAT	2	6	530528	530533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351797
10555	NC_022108	TGT	2	6	530594	530599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351797
10556	NC_022108	AATCA	2	10	530630	530639	60 %	20 %	0 %	20 %	532351797
10557	NC_022108	AGC	2	6	530657	530662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351797
10558	NC_022108	TAA	2	6	530668	530673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351797
10559	NC_022108	TCGT	2	8	530674	530681	0 %	50 %	25 %	25 %	532351797
10560	NC_022108	AGGGT	2	10	530732	530741	20 %	20 %	60 %	0 %	532351797
10561	NC_022108	TG	3	6	530749	530754	0 %	50 %	50 %	0 %	532351797
10562	NC_022108	CAA	2	6	530758	530763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351797
10563	NC_022108	TCA	2	6	530793	530798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351797
10564	NC_022108	CTT	2	6	530822	530827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351797
10565	NC_022108	ACG	2	6	530909	530914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351797
10566	NC_022108	AAC	2	6	530916	530921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351797
10567	NC_022108	GGA	2	6	530966	530971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351797
10568	NC_022108	AGG	2	6	531129	531134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351797
10569	NC_022108	TTC	2	6	531246	531251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351797
10570	NC_022108	A	10	10	531302	531311	100 %	0 %	0 %	0 %	532351797
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10572	NC_022108	CTA	2	6	531542	531547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352241
10573	NC_022108	ACA	2	6	531580	531585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352241
10574	NC_022108	TCT	2	6	531601	531606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352241
10575	NC_022108	GA	3	6	531620	531625	50 %	0 %	50 %	0 %	532352241
10576	NC_022108	GTA	2	6	531628	531633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
10577	NC_022108	ACTGTA	2	12	531661	531672	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352241
10578	NC_022108	CTT	2	6	531683	531688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532352241
10579	NC_022108	CA	3	6	531690	531695	50 %	0 %	0 %	50 %	532352241
10580	NC_022108	AGCCAC	2	12	531696	531707	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532352241
10581	NC_022108	TCA	2	6	531787	531792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352241
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10583	NC_022108	GTAG	2	8	531865	531872	25 %	25 %	50 %	0 %	532352241
10584	NC_022108	AAC	2	6	531874	531879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352241
10585	NC_022108	TGC	3	9	531906	531914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352241
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10587	NC_022108	TGG	2	6	531960	531965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352241
10588	NC_022108	GTG	3	9	531995	532003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352241
10589	NC_022108	AGC	4	12	532005	532016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352241
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10591	NC_022108	TGC	3	9	532059	532067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352241
10592	NC_022108	ACT	2	6	532087	532092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352241
10593	NC_022108	TGG	2	6	532113	532118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352241
10594	NC_022108	GTG	3	9	532148	532156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352241
10595	NC_022108	CAG	4	12	532157	532168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352241
10596	NC_022108	CTC	2	6	532188	532193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532352241
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10598	NC_022108	CTTC	2	8	532261	532268	0 %	50 %	0 %	50 %	532352241
10599	NC_022108	AGT	2	6	532378	532383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
10600	NC_022108	AGA	2	6	532452	532457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532352241
10601	NC_022108	TG	3	6	532484	532489	0 %	50 %	50 %	0 %	532352241
10602	NC_022108	ATG	2	6	532549	532554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
10603	NC_022108	AAT	2	6	532609	532614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352241
10604	NC_022108	GGA	2	6	532714	532719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532352241
10605	NC_022108	TAA	2	6	532743	532748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532352241
10606	NC_022108	TAG	2	6	532776	532781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
10607	NC_022108	GCT	2	6	532834	532839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352241
10608	NC_022108	ATC	2	6	532867	532872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352241
10609	NC_022108	AATGTC	2	12	532873	532884	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532352241
10610	NC_022108	ACACC	2	10	532937	532946	40 %	0 %	0 %	60 %	532352241
10611	NC_022108	AAC	2	6	532947	532952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352241
10612	NC_022108	CAA	2	6	533004	533009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352241
10613	NC_022108	TGA	2	6	533016	533021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
10614	NC_022108	GACA	2	8	533031	533038	50 %	0 %	25 %	25 %	532352241
10615	NC_022108	TGG	2	6	533055	533060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532352241
10616	NC_022108	AT	3	6	533072	533077	50 %	50 %	0 %	0 %	532352241
10617	NC_022108	GAT	2	6	533101	533106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
10618	NC_022108	CGT	2	6	533208	533213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352241
10619	NC_022108	CAA	2	6	533357	533362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352241
10620	NC_022108	GCT	2	6	533368	533373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352241
10621	NC_022108	GAT	2	6	533428	533433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352241
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10743	NC_022108	ACCT	2	8	539040	539047	25 %	25 %	0 %	50 %	532351803
10744	NC_022108	TC	3	6	539115	539120	0 %	50 %	0 %	50 %	532351803
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10748	NC_022108	TCT	2	6	539292	539297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351804
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10755	NC_022108	CTTT	2	8	539732	539739	0 %	75 %	0 %	25 %	532351804
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10863	NC_022108	T	6	6	544817	544822	0 %	100 %	0 %	0 %	532351809
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10988	NC_022108	CAG	2	6	550908	550913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351814
10989	NC_022108	GA	3	6	550990	550995	50 %	0 %	50 %	0 %	532351814
10990	NC_022108	ACGA	2	8	551046	551053	50 %	0 %	25 %	25 %	532351814
10991	NC_022108	AGA	3	9	551074	551082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351814
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10993	NC_022108	TAA	2	6	551238	551243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351815
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