MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022108	CA	3	6	501147	501152	50 %	0 %	0 %	50 %	532351772
10002	NC_022108	TGC	2	6	501175	501180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351772
10003	NC_022108	AAC	2	6	501190	501195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351772
10004	NC_022108	GCA	2	6	501341	501346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351772
10005	NC_022108	GAA	2	6	501370	501375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351772
10006	NC_022108	ACG	2	6	501379	501384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351772
10007	NC_022108	CAA	2	6	501391	501396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351772
10008	NC_022108	TCTA	2	8	501400	501407	25 %	50 %	0 %	25 %	532351772
10009	NC_022108	CAT	2	6	501427	501432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351772
10010	NC_022108	TAA	2	6	501507	501512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351772
10011	NC_022108	ATA	2	6	501628	501633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
10012	NC_022108	CTT	2	6	501641	501646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
10013	NC_022108	TCT	2	6	501781	501786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
10014	NC_022108	AAT	2	6	501822	501827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
10015	NC_022108	CCA	2	6	501847	501852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351773
10016	NC_022108	CTT	2	6	501950	501955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
10017	NC_022108	AGC	2	6	501972	501977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351773
10018	NC_022108	GCC	2	6	501996	502001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351773
10019	NC_022108	CAT	2	6	502002	502007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351773
10020	NC_022108	T	6	6	502044	502049	0 %	100 %	0 %	0 %	532351773
10021	NC_022108	CGT	3	9	502092	502100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351773
10022	NC_022108	TCT	2	6	502132	502137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
10023	NC_022108	AC	3	6	502145	502150	50 %	0 %	0 %	50 %	532351773
10024	NC_022108	TCT	2	6	502207	502212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
10025	NC_022108	TCA	2	6	502312	502317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351773
10026	NC_022108	AAT	2	6	502324	502329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
10027	NC_022108	TCT	2	6	502541	502546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351773
10028	NC_022108	TAA	2	6	502569	502574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
10029	NC_022108	AAT	2	6	502624	502629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351773
10030	NC_022108	ACA	2	6	502677	502682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351773
10031	NC_022108	GTAA	2	8	502726	502733	50 %	25 %	25 %	0 %	532351773
10032	NC_022108	AGA	2	6	502761	502766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351773
10033	NC_022108	GAT	2	6	502859	502864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351773
10034	NC_022108	ATG	2	6	502868	502873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351773
10035	NC_022108	CT	4	8	503016	503023	0 %	50 %	0 %	50 %	532351773
10036	NC_022108	AATCT	2	10	503037	503046	40 %	40 %	0 %	20 %	532351773
10037	NC_022108	TGA	2	6	503049	503054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351773
10038	NC_022108	ATCC	2	8	503338	503345	25 %	25 %	0 %	50 %	532352238
10039	NC_022108	CTG	2	6	503362	503367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532352238
10040	NC_022108	TAT	2	6	503378	503383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352238
10041	NC_022108	T	8	8	503489	503496	0 %	100 %	0 %	0 %	532351774
10042	NC_022108	CTT	2	6	503565	503570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351774
10043	NC_022108	TTC	2	6	503637	503642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351774
10044	NC_022108	CTTC	2	8	503657	503664	0 %	50 %	0 %	50 %	532351774
10045	NC_022108	CTC	2	6	503668	503673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351774
10046	NC_022108	CTCG	2	8	503696	503703	0 %	25 %	25 %	50 %	532351774
10047	NC_022108	CT	3	6	503716	503721	0 %	50 %	0 %	50 %	532351774
10048	NC_022108	TCC	2	6	503741	503746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351774
10049	NC_022108	TTC	2	6	503799	503804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351774
10050	NC_022108	TAT	2	6	503815	503820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351774
10051	NC_022108	TCGT	2	8	503838	503845	0 %	50 %	25 %	25 %	532351774
10052	NC_022108	GA	3	6	503898	503903	50 %	0 %	50 %	0 %	532351774
10053	NC_022108	GCA	2	6	503909	503914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351774
10054	NC_022108	CTC	2	6	503937	503942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351774
10055	NC_022108	T	6	6	503955	503960	0 %	100 %	0 %	0 %	532351774
10056	NC_022108	TATT	2	8	503999	504006	25 %	75 %	0 %	0 %	532351774
10057	NC_022108	AAG	2	6	504024	504029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351774
10058	NC_022108	ATT	2	6	504212	504217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351775
10059	NC_022108	TGT	2	6	504259	504264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351775
10060	NC_022108	GGA	2	6	504317	504322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351775
10061	NC_022108	TCTA	2	8	504369	504376	25 %	50 %	0 %	25 %	532351775
10062	NC_022108	AAG	2	6	504378	504383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351775
10063	NC_022108	TTC	2	6	504498	504503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351775
10064	NC_022108	TAT	2	6	504601	504606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351775
10065	NC_022108	TCT	2	6	504645	504650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351775
10066	NC_022108	T	7	7	504723	504729	0 %	100 %	0 %	0 %	532351776
10067	NC_022108	CAAA	2	8	504734	504741	75 %	0 %	0 %	25 %	532351776
10068	NC_022108	AAAG	2	8	504742	504749	75 %	0 %	25 %	0 %	532351776
10069	NC_022108	CTT	2	6	504750	504755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351776
10070	NC_022108	CTT	2	6	504765	504770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351776
10071	NC_022108	TTG	2	6	504784	504789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351776
10072	NC_022108	AGAAT	2	10	504927	504936	60 %	20 %	20 %	0 %	532351776
10073	NC_022108	TGT	2	6	504968	504973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351776
10074	NC_022108	A	6	6	505115	505120	100 %	0 %	0 %	0 %	532351776
10075	NC_022108	GAA	2	6	505211	505216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351776
10076	NC_022108	A	6	6	505340	505345	100 %	0 %	0 %	0 %	532351776
10077	NC_022108	TTG	2	6	505497	505502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351776
10078	NC_022108	GAAC	2	8	505544	505551	50 %	0 %	25 %	25 %	532351776
10079	NC_022108	CCA	2	6	505595	505600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351776
10080	NC_022108	GAA	2	6	505613	505618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351776
10081	NC_022108	CAG	2	6	505723	505728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351776
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10083	NC_022108	GAG	2	6	505840	505845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351777
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10085	NC_022108	TTG	2	6	505873	505878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351777
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10087	NC_022108	CAA	2	6	505927	505932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351777
10088	NC_022108	TGC	2	6	506001	506006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351777
10089	NC_022108	AT	3	6	506010	506015	50 %	50 %	0 %	0 %	532351777
10090	NC_022108	CTT	2	6	506022	506027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351777
10091	NC_022108	TCT	2	6	506035	506040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351777
10092	NC_022108	AT	3	6	506125	506130	50 %	50 %	0 %	0 %	532351778
10093	NC_022108	ACG	2	6	506211	506216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351778
10094	NC_022108	GAT	2	6	506243	506248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351778
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10096	NC_022108	ATA	2	6	506275	506280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351778
10097	NC_022108	CTT	2	6	506315	506320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351778
10098	NC_022108	CCAG	2	8	506422	506429	25 %	0 %	25 %	50 %	532351778
10099	NC_022108	CGA	2	6	506501	506506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351778
10100	NC_022108	ACC	2	6	506583	506588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351778
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10102	NC_022108	TAG	2	6	506765	506770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351778
10103	NC_022108	AG	4	8	506796	506803	50 %	0 %	50 %	0 %	532351778
10104	NC_022108	TC	3	6	506825	506830	0 %	50 %	0 %	50 %	532351778
10105	NC_022108	ATCA	2	8	506862	506869	50 %	25 %	0 %	25 %	532351778
10106	NC_022108	AC	3	6	506956	506961	50 %	0 %	0 %	50 %	532351778
10107	NC_022108	GCAT	2	8	507010	507017	25 %	25 %	25 %	25 %	532351778
10108	NC_022108	CTT	2	6	507078	507083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351778
10109	NC_022108	GGTC	2	8	507131	507138	0 %	25 %	50 %	25 %	532351778
10110	NC_022108	AGC	2	6	507156	507161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351778
10111	NC_022108	CTT	2	6	507194	507199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351778
10112	NC_022108	AAG	2	6	507273	507278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351778
10113	NC_022108	GATT	2	8	507323	507330	25 %	50 %	25 %	0 %	532351778
10114	NC_022108	TCT	3	9	507370	507378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351778
10115	NC_022108	TCA	2	6	507430	507435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351778
10116	NC_022108	TTC	2	6	507447	507452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351778
10117	NC_022108	TAA	2	6	507453	507458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351778
10118	NC_022108	GA	3	6	507560	507565	50 %	0 %	50 %	0 %	532351778
10119	NC_022108	TC	3	6	507643	507648	0 %	50 %	0 %	50 %	532351778
10120	NC_022108	TTTA	2	8	507693	507700	25 %	75 %	0 %	0 %	532351778
10121	NC_022108	AAT	2	6	507861	507866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351778
10122	NC_022108	CCAG	2	8	507881	507888	25 %	0 %	25 %	50 %	532351778
10123	NC_022108	AGC	2	6	507900	507905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351778
10124	NC_022108	GGTAAT	2	12	507909	507920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351778
10125	NC_022108	TCCA	2	8	507940	507947	25 %	25 %	0 %	50 %	532351778
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10134	NC_022108	TAA	2	6	508537	508542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351779
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10142	NC_022108	CTT	2	6	509007	509012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351780
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10159	NC_022108	GTTC	2	8	509972	509979	0 %	50 %	25 %	25 %	532351782
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10223	NC_022108	T	7	7	512357	512363	0 %	100 %	0 %	0 %	532351783
10224	NC_022108	CGAAT	2	10	512632	512641	40 %	20 %	20 %	20 %	532351784
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10230	NC_022108	AGC	2	6	512895	512900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351784
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10232	NC_022108	ATT	2	6	512914	512919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351784
10233	NC_022108	ACT	2	6	513002	513007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351784
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10235	NC_022108	ACG	2	6	513074	513079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351784
10236	NC_022108	TACT	2	8	513168	513175	25 %	50 %	0 %	25 %	532351784
10237	NC_022108	GTT	2	6	513200	513205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351784
10238	NC_022108	TCC	2	6	513226	513231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351784
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10240	NC_022108	CAA	3	9	513390	513398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351784
10241	NC_022108	ACT	2	6	513446	513451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351784
10242	NC_022108	CTT	2	6	513480	513485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351784
10243	NC_022108	AGC	2	6	513564	513569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351784
10244	NC_022108	CTT	2	6	513573	513578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351784
10245	NC_022108	CAG	2	6	513657	513662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351784
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10248	NC_022108	ATC	2	6	513829	513834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351784
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10250	NC_022108	T	6	6	513961	513966	0 %	100 %	0 %	0 %	532351784
10251	NC_022108	AGCTA	2	10	514003	514012	40 %	20 %	20 %	20 %	532351784
10252	NC_022108	AG	4	8	514024	514031	50 %	0 %	50 %	0 %	532351784
10253	NC_022108	TGA	2	6	514113	514118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351784
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10256	NC_022108	TTA	2	6	514181	514186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351784
10257	NC_022108	ACC	2	6	514413	514418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351785
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10261	NC_022108	ACA	2	6	514519	514524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351785
10262	NC_022108	AGC	2	6	514533	514538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351785
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10264	NC_022108	TC	3	6	515032	515037	0 %	50 %	0 %	50 %	532351786
10265	NC_022108	CTT	2	6	515063	515068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351786
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10271	NC_022108	ATG	2	6	515336	515341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351787
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10274	NC_022108	ACA	2	6	515434	515439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351787
10275	NC_022108	CTC	2	6	515480	515485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351787
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10283	NC_022108	A	6	6	515845	515850	100 %	0 %	0 %	0 %	532351787
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10349	NC_022108	GGA	2	6	519639	519644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351789
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10351	NC_022108	CTCC	2	8	519665	519672	0 %	25 %	0 %	75 %	532351789
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10358	NC_022108	AATG	2	8	519849	519856	50 %	25 %	25 %	0 %	532351790
10359	NC_022108	GTT	2	6	519913	519918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351790
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10363	NC_022108	AAT	2	6	520026	520031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351790
10364	NC_022108	TCA	2	6	520064	520069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351790
10365	NC_022108	TTGC	2	8	520079	520086	0 %	50 %	25 %	25 %	532351790
10366	NC_022108	AATC	2	8	520088	520095	50 %	25 %	0 %	25 %	532351790
10367	NC_022108	AGCAC	2	10	520129	520138	40 %	0 %	20 %	40 %	532351790
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10369	NC_022108	AAT	2	6	520240	520245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351790
10370	NC_022108	AGT	2	6	520332	520337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351790
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10372	NC_022108	GAT	2	6	520379	520384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351790
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10382	NC_022108	GAT	2	6	520842	520847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351790
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10387	NC_022108	GTA	2	6	521175	521180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351790
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10439	NC_022108	A	7	7	524333	524339	100 %	0 %	0 %	0 %	532352240
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10457	NC_022108	A	7	7	525689	525695	100 %	0 %	0 %	0 %	532351792
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10473	NC_022108	A	6	6	526507	526512	100 %	0 %	0 %	0 %	532351793
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10482	NC_022108	CAGGAA	2	12	526879	526890	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	532351793
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10484	NC_022108	AGA	2	6	527009	527014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351794
10485	NC_022108	CCT	2	6	527028	527033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351794
10486	NC_022108	TTTC	2	8	527035	527042	0 %	75 %	0 %	25 %	532351794
10487	NC_022108	AAG	2	6	527113	527118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351794
10488	NC_022108	TCT	2	6	527266	527271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351794
10489	NC_022108	ACG	2	6	527300	527305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351794
10490	NC_022108	CCTC	2	8	527315	527322	0 %	25 %	0 %	75 %	532351794
10491	NC_022108	CAA	2	6	527382	527387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351794
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10493	NC_022108	AGA	2	6	527555	527560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351794
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10497	NC_022108	AGCT	2	8	527679	527686	25 %	25 %	25 %	25 %	532351795
10498	NC_022108	ATTC	2	8	527706	527713	25 %	50 %	0 %	25 %	532351795
10499	NC_022108	TGC	2	6	527770	527775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351795
10500	NC_022108	GCT	2	6	527786	527791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351795

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