MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9502	NC_022108	AGG	2	6	475881	475886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
9503	NC_022108	GAA	2	6	475906	475911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351754
9504	NC_022108	A	8	8	475950	475957	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
9505	NC_022108	CTT	2	6	475967	475972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351754
9506	NC_022108	TCCTC	2	10	476017	476026	0 %	40 %	0 %	60 %	532351754
9507	NC_022108	GGT	2	6	476212	476217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351754
9508	NC_022108	GGA	2	6	476296	476301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
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9511	NC_022108	TAAT	2	8	476447	476454	50 %	50 %	0 %	0 %	532351754
9512	NC_022108	TGG	3	9	476472	476480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351754
9513	NC_022108	TC	3	6	476501	476506	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
9514	NC_022108	AGG	2	6	476589	476594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
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9517	NC_022108	GCA	2	6	476668	476673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
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9519	NC_022108	CA	3	6	476692	476697	50 %	0 %	0 %	50 %	532351754
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9521	NC_022108	GCA	2	6	476740	476745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351754
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9532	NC_022108	CTG	2	6	477242	477247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351754
9533	NC_022108	GCT	3	9	477250	477258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351754
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9538	NC_022108	GGA	2	6	477325	477330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
9539	NC_022108	CTAT	2	8	477332	477339	25 %	50 %	0 %	25 %	532351754
9540	NC_022108	TC	3	6	477356	477361	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
9541	NC_022108	TCCC	2	8	477411	477418	0 %	25 %	0 %	75 %	532351754
9542	NC_022108	ATC	2	6	477420	477425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351754
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9548	NC_022108	GGA	2	6	477691	477696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
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9550	NC_022108	A	6	6	477836	477841	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
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9554	NC_022108	TCAA	2	8	477944	477951	50 %	25 %	0 %	25 %	532351754
9555	NC_022108	ATG	2	6	477965	477970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351754
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9559	NC_022108	CAA	2	6	478197	478202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351754
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9562	NC_022108	TG	3	6	478315	478320	0 %	50 %	50 %	0 %	532351754
9563	NC_022108	A	7	7	478333	478339	100 %	0 %	0 %	0 %	532351754
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9594	NC_022108	CTGT	2	8	479866	479873	0 %	50 %	25 %	25 %	532351754
9595	NC_022108	CT	3	6	479986	479991	0 %	50 %	0 %	50 %	532351754
9596	NC_022108	ACTAT	2	10	479998	480007	40 %	40 %	0 %	20 %	532351754
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9605	NC_022108	ACTA	2	8	480640	480647	50 %	25 %	0 %	25 %	532351755
9606	NC_022108	CT	5	10	480664	480673	0 %	50 %	0 %	50 %	532351755
9607	NC_022108	TTC	2	6	480707	480712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351755
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9610	NC_022108	CTA	2	6	480809	480814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351755
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9991	NC_022108	AAGA	2	8	500401	500408	75 %	0 %	25 %	0 %	532351771
9992	NC_022108	CTTA	2	8	500430	500437	25 %	50 %	0 %	25 %	532351771
9993	NC_022108	A	6	6	500481	500486	100 %	0 %	0 %	0 %	532351771
9994	NC_022108	T	6	6	500535	500540	0 %	100 %	0 %	0 %	532351771
9995	NC_022108	AGA	2	6	500745	500750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351771
9996	NC_022108	AGAGA	2	10	500884	500893	60 %	0 %	40 %	0 %	532351771
9997	NC_022108	TCGA	2	8	500947	500954	25 %	25 %	25 %	25 %	532351771
9998	NC_022108	AAT	2	6	501007	501012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351772
9999	NC_022108	TCC	2	6	501079	501084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351772
10000	NC_022108	GC	3	6	501109	501114	0 %	0 %	50 %	50 %	532351772

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