MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_022108	CAA	2	6	451918	451923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351736
9002	NC_022108	GGA	2	6	451943	451948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351736
9003	NC_022108	GAA	2	6	452043	452048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351736
9004	NC_022108	AAT	2	6	452053	452058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351736
9005	NC_022108	A	6	6	452090	452095	100 %	0 %	0 %	0 %	532351736
9006	NC_022108	ATT	2	6	452110	452115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351736
9007	NC_022108	TAC	2	6	452202	452207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351737
9008	NC_022108	TTG	2	6	452243	452248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351737
9009	NC_022108	A	6	6	452285	452290	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9010	NC_022108	CTA	2	6	452300	452305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351737
9011	NC_022108	AGA	2	6	452427	452432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351737
9012	NC_022108	ATGAAG	2	12	452452	452463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	532351737
9013	NC_022108	CTG	2	6	452468	452473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9014	NC_022108	ATT	2	6	452593	452598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351737
9015	NC_022108	AAGG	2	8	452638	452645	50 %	0 %	50 %	0 %	532351737
9016	NC_022108	A	7	7	452650	452656	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9017	NC_022108	AGG	3	9	452673	452681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351737
9018	NC_022108	TC	3	6	452730	452735	0 %	50 %	0 %	50 %	532351737
9019	NC_022108	GAG	2	6	452759	452764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351737
9020	NC_022108	TCA	3	9	452780	452788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351737
9021	NC_022108	TGA	2	6	452799	452804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351737
9022	NC_022108	A	6	6	452809	452814	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9023	NC_022108	AAG	2	6	452816	452821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351737
9024	NC_022108	TGC	2	6	452868	452873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9025	NC_022108	ATCA	2	8	452917	452924	50 %	25 %	0 %	25 %	532351737
9026	NC_022108	TCA	2	6	452930	452935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351737
9027	NC_022108	TAACTC	2	12	452969	452980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351737
9028	NC_022108	CT	3	6	453006	453011	0 %	50 %	0 %	50 %	532351737
9029	NC_022108	AAC	2	6	453026	453031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351737
9030	NC_022108	TGA	2	6	453078	453083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351737
9031	NC_022108	TTC	2	6	453086	453091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351737
9032	NC_022108	TAA	2	6	453159	453164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351737
9033	NC_022108	GCT	2	6	453199	453204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9034	NC_022108	GTG	2	6	453212	453217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351737
9035	NC_022108	CGG	2	6	453222	453227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351737
9036	NC_022108	TGT	2	6	453245	453250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351737
9037	NC_022108	CT	3	6	453265	453270	0 %	50 %	0 %	50 %	532351737
9038	NC_022108	AG	3	6	453312	453317	50 %	0 %	50 %	0 %	532351737
9039	NC_022108	AGA	2	6	453338	453343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351737
9040	NC_022108	TCT	2	6	453350	453355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351737
9041	NC_022108	CAGC	2	8	453373	453380	25 %	0 %	25 %	50 %	532351737
9042	NC_022108	TCG	2	6	453389	453394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9043	NC_022108	TTC	2	6	453395	453400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351737
9044	NC_022108	TCC	2	6	453462	453467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351737
9045	NC_022108	CTC	2	6	453470	453475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351737
9046	NC_022108	TGC	2	6	453546	453551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9047	NC_022108	A	6	6	453566	453571	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9048	NC_022108	AAGC	2	8	453581	453588	50 %	0 %	25 %	25 %	532351737
9049	NC_022108	AGA	2	6	453600	453605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351737
9050	NC_022108	CAA	2	6	453613	453618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351737
9051	NC_022108	ACAA	2	8	453653	453660	75 %	0 %	0 %	25 %	532351737
9052	NC_022108	AAG	2	6	453665	453670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351737
9053	NC_022108	AGA	2	6	453807	453812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351737
9054	NC_022108	AGC	2	6	453834	453839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9055	NC_022108	TGA	2	6	453843	453848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351737
9056	NC_022108	A	6	6	453866	453871	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9057	NC_022108	ATCCGC	2	12	453894	453905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	532351737
9058	NC_022108	AGC	2	6	453906	453911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9059	NC_022108	TCT	2	6	453913	453918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351737
9060	NC_022108	AGG	2	6	453933	453938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351737
9061	NC_022108	A	6	6	453964	453969	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9062	NC_022108	CAG	2	6	453992	453997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351737
9063	NC_022108	ACA	2	6	454019	454024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351737
9064	NC_022108	TTG	2	6	454046	454051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351737
9065	NC_022108	T	8	8	454122	454129	0 %	100 %	0 %	0 %	532351737
9066	NC_022108	A	6	6	454130	454135	100 %	0 %	0 %	0 %	532351737
9067	NC_022108	TGGA	2	8	454527	454534	25 %	25 %	50 %	0 %	532351738
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9070	NC_022108	TCAT	2	8	454593	454600	25 %	50 %	0 %	25 %	532351738
9071	NC_022108	TTCT	2	8	454605	454612	0 %	75 %	0 %	25 %	532351738
9072	NC_022108	TAG	2	6	454629	454634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351738
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9074	NC_022108	TG	3	6	454676	454681	0 %	50 %	50 %	0 %	532351738
9075	NC_022108	GTT	2	6	454753	454758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351738
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9082	NC_022108	TGC	2	6	455184	455189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351738
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9091	NC_022108	GCT	2	6	455534	455539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351738
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9093	NC_022108	CCT	2	6	455636	455641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351738
9094	NC_022108	GAA	2	6	455645	455650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
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9102	NC_022108	A	6	6	456044	456049	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
9103	NC_022108	AGA	2	6	456055	456060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
9104	NC_022108	ATT	2	6	456089	456094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351738
9105	NC_022108	TCC	2	6	456123	456128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351738
9106	NC_022108	CAAA	2	8	456188	456195	75 %	0 %	0 %	25 %	532351738
9107	NC_022108	AGA	2	6	456205	456210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
9108	NC_022108	CA	3	6	456274	456279	50 %	0 %	0 %	50 %	532351738
9109	NC_022108	GTTG	2	8	456295	456302	0 %	50 %	50 %	0 %	532351738
9110	NC_022108	CTAAAG	2	12	456312	456323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351738
9111	NC_022108	A	7	7	456344	456350	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
9112	NC_022108	AAAGA	2	10	456368	456377	80 %	0 %	20 %	0 %	532351738
9113	NC_022108	A	6	6	456398	456403	100 %	0 %	0 %	0 %	532351738
9114	NC_022108	GAA	2	6	456418	456423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351738
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9117	NC_022108	A	6	6	456770	456775	100 %	0 %	0 %	0 %	532351739
9118	NC_022108	GAA	2	6	456836	456841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351739
9119	NC_022108	AGATC	2	10	456868	456877	40 %	20 %	20 %	20 %	532351739
9120	NC_022108	GATCA	2	10	456911	456920	40 %	20 %	20 %	20 %	532351739
9121	NC_022108	GCT	2	6	456941	456946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351739
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9494	NC_022108	GGA	2	6	475693	475698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
9495	NC_022108	TTTC	2	8	475721	475728	0 %	75 %	0 %	25 %	532351754
9496	NC_022108	CAT	2	6	475739	475744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351754
9497	NC_022108	GAA	2	6	475768	475773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351754
9498	NC_022108	GAG	2	6	475778	475783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351754
9499	NC_022108	CTAT	2	8	475784	475791	25 %	50 %	0 %	25 %	532351754
9500	NC_022108	TCAAT	2	10	475807	475816	40 %	40 %	0 %	20 %	532351754

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