MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_022108	GGA	2	6	427007	427012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351716
8502	NC_022108	TGG	2	6	427038	427043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351716
8503	NC_022108	CGGAAT	2	12	427087	427098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	532351716
8504	NC_022108	T	6	6	427100	427105	0 %	100 %	0 %	0 %	532351716
8505	NC_022108	TAT	2	6	427132	427137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351716
8506	NC_022108	TTC	2	6	427286	427291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351716
8507	NC_022108	CCA	2	6	427292	427297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351716
8508	NC_022108	GGA	2	6	427307	427312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351716
8509	NC_022108	TTA	2	6	427331	427336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351716
8510	NC_022108	ATT	2	6	427406	427411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351716
8511	NC_022108	TATT	2	8	427443	427450	25 %	75 %	0 %	0 %	532351716
8512	NC_022108	TCA	2	6	427452	427457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351716
8513	NC_022108	GTA	2	6	427598	427603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351716
8514	NC_022108	GCT	2	6	427616	427621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351716
8515	NC_022108	TC	3	6	427624	427629	0 %	50 %	0 %	50 %	532351716
8516	NC_022108	AT	3	6	427676	427681	50 %	50 %	0 %	0 %	532351716
8517	NC_022108	CTG	2	6	427752	427757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351716
8518	NC_022108	CTT	2	6	427935	427940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351716
8519	NC_022108	CTA	2	6	427982	427987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351716
8520	NC_022108	TCT	2	6	427997	428002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351716
8521	NC_022108	TTC	2	6	428043	428048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351716
8522	NC_022108	TAAG	2	8	428091	428098	50 %	25 %	25 %	0 %	532351716
8523	NC_022108	GAT	2	6	428137	428142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351716
8524	NC_022108	CT	3	6	428167	428172	0 %	50 %	0 %	50 %	532351716
8525	NC_022108	GGA	2	6	428189	428194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351716
8526	NC_022108	A	6	6	428277	428282	100 %	0 %	0 %	0 %	532351716
8527	NC_022108	TAA	2	6	428362	428367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351716
8528	NC_022108	AG	4	8	428379	428386	50 %	0 %	50 %	0 %	532351716
8529	NC_022108	CGT	2	6	428398	428403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351716
8530	NC_022108	TCT	2	6	428684	428689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351717
8531	NC_022108	CTT	2	6	428693	428698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351717
8532	NC_022108	A	6	6	428714	428719	100 %	0 %	0 %	0 %	532351717
8533	NC_022108	CAC	2	6	428752	428757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351717
8534	NC_022108	TC	3	6	428765	428770	0 %	50 %	0 %	50 %	532351717
8535	NC_022108	TCC	2	6	428823	428828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351717
8536	NC_022108	GTG	2	6	428899	428904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351717
8537	NC_022108	ATA	2	6	428994	428999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351717
8538	NC_022108	AT	3	6	429004	429009	50 %	50 %	0 %	0 %	532351717
8539	NC_022108	ATT	2	6	429104	429109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351717
8540	NC_022108	CCA	2	6	429218	429223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351717
8541	NC_022108	AT	3	6	429244	429249	50 %	50 %	0 %	0 %	532351717
8542	NC_022108	ACA	2	6	429260	429265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351717
8543	NC_022108	CAAC	2	8	429301	429308	50 %	0 %	0 %	50 %	532351717
8544	NC_022108	ATT	2	6	429402	429407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351717
8545	NC_022108	AGG	2	6	429481	429486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351717
8546	NC_022108	TCT	2	6	429502	429507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351717
8547	NC_022108	AT	3	6	429565	429570	50 %	50 %	0 %	0 %	532351717
8548	NC_022108	AGC	2	6	429601	429606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351717
8549	NC_022108	CT	3	6	429618	429623	0 %	50 %	0 %	50 %	532351717
8550	NC_022108	A	6	6	429628	429633	100 %	0 %	0 %	0 %	532351717
8551	NC_022108	T	6	6	429644	429649	0 %	100 %	0 %	0 %	532351717
8552	NC_022108	AC	3	6	429829	429834	50 %	0 %	0 %	50 %	532351718
8553	NC_022108	GAA	2	6	429839	429844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351718
8554	NC_022108	CTT	2	6	429855	429860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351718
8555	NC_022108	AT	3	6	429868	429873	50 %	50 %	0 %	0 %	532351718
8556	NC_022108	AGC	2	6	429880	429885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351718
8557	NC_022108	TGC	2	6	429901	429906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351718
8558	NC_022108	ATA	2	6	429974	429979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351718
8559	NC_022108	TTCT	2	8	430178	430185	0 %	75 %	0 %	25 %	532351718
8560	NC_022108	AAT	2	6	430187	430192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351718
8561	NC_022108	CAA	3	9	430242	430250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351718
8562	NC_022108	TGT	2	6	430273	430278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351718
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8565	NC_022108	CAT	2	6	430401	430406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351718
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8567	NC_022108	TAA	2	6	430435	430440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351718
8568	NC_022108	CAT	2	6	430452	430457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351718
8569	NC_022108	TCC	2	6	430594	430599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351718
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8571	NC_022108	AACT	2	8	430688	430695	50 %	25 %	0 %	25 %	532351718
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8582	NC_022108	AAT	2	6	431552	431557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351719
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8585	NC_022108	ATTCC	2	10	431614	431623	20 %	40 %	0 %	40 %	532351719
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8590	NC_022108	AGC	2	6	431783	431788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351719
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8605	NC_022108	CT	3	6	432446	432451	0 %	50 %	0 %	50 %	532351719
8606	NC_022108	AGC	2	6	432477	432482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351719
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8609	NC_022108	A	6	6	432635	432640	100 %	0 %	0 %	0 %	532351719
8610	NC_022108	CAT	2	6	432649	432654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351719
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8621	NC_022108	CAAT	2	8	433414	433421	50 %	25 %	0 %	25 %	532351720
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