MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_022108	TAATCT	2	12	403618	403629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532351695
8002	NC_022108	ATGG	2	8	403635	403642	25 %	25 %	50 %	0 %	532351695
8003	NC_022108	GAT	2	6	403678	403683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351695
8004	NC_022108	GCT	2	6	403752	403757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351695
8005	NC_022108	ACC	2	6	403794	403799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351695
8006	NC_022108	A	8	8	403815	403822	100 %	0 %	0 %	0 %	532351695
8007	NC_022108	T	8	8	403850	403857	0 %	100 %	0 %	0 %	532351695
8008	NC_022108	TC	3	6	403946	403951	0 %	50 %	0 %	50 %	532351696
8009	NC_022108	AGA	2	6	404088	404093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351696
8010	NC_022108	CT	3	6	404113	404118	0 %	50 %	0 %	50 %	532351696
8011	NC_022108	GAACAA	2	12	404120	404131	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	532351696
8012	NC_022108	CA	3	6	404135	404140	50 %	0 %	0 %	50 %	532351696
8013	NC_022108	A	7	7	404170	404176	100 %	0 %	0 %	0 %	532351696
8014	NC_022108	ACC	2	6	404191	404196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351696
8015	NC_022108	TCC	2	6	404200	404205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351696
8016	NC_022108	A	6	6	404207	404212	100 %	0 %	0 %	0 %	532351696
8017	NC_022108	A	7	7	404230	404236	100 %	0 %	0 %	0 %	532351696
8018	NC_022108	TGTTT	2	10	404409	404418	0 %	80 %	20 %	0 %	532351697
8019	NC_022108	GAT	2	6	404461	404466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351697
8020	NC_022108	CTAAAG	2	12	404503	404514	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532351697
8021	NC_022108	CTG	2	6	404519	404524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351697
8022	NC_022108	CCTCT	2	10	404572	404581	0 %	40 %	0 %	60 %	532351697
8023	NC_022108	GGAT	2	8	404590	404597	25 %	25 %	50 %	0 %	532351697
8024	NC_022108	TCT	2	6	404694	404699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351697
8025	NC_022108	AGC	2	6	404753	404758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351697
8026	NC_022108	TCT	2	6	405236	405241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351698
8027	NC_022108	ACA	2	6	405412	405417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351698
8028	NC_022108	CTTGG	2	10	405430	405439	0 %	40 %	40 %	20 %	532351698
8029	NC_022108	A	6	6	405609	405614	100 %	0 %	0 %	0 %	532351698
8030	NC_022108	TAA	2	6	405621	405626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351698
8031	NC_022108	CTA	2	6	405656	405661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351698
8032	NC_022108	CCTTTC	2	12	405667	405678	0 %	50 %	0 %	50 %	532351698
8033	NC_022108	CTG	2	6	405877	405882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351698
8034	NC_022108	A	6	6	405918	405923	100 %	0 %	0 %	0 %	532351698
8035	NC_022108	CTT	2	6	405938	405943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351698
8036	NC_022108	AAG	2	6	405970	405975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351698
8037	NC_022108	T	6	6	406015	406020	0 %	100 %	0 %	0 %	532351698
8038	NC_022108	ATA	2	6	406021	406026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351698
8039	NC_022108	TCT	2	6	406047	406052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351698
8040	NC_022108	AAG	2	6	406055	406060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351698
8041	NC_022108	CTT	2	6	406123	406128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351699
8042	NC_022108	CCG	2	6	406129	406134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351699
8043	NC_022108	CAT	2	6	406142	406147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351699
8044	NC_022108	TCT	2	6	406284	406289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351699
8045	NC_022108	GAA	2	6	406331	406336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351699
8046	NC_022108	TTC	2	6	406337	406342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351699
8047	NC_022108	C	6	6	406358	406363	0 %	0 %	0 %	100 %	532351699
8048	NC_022108	AAG	2	6	406402	406407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351699
8049	NC_022108	TG	3	6	406447	406452	0 %	50 %	50 %	0 %	532351699
8050	NC_022108	TG	3	6	406500	406505	0 %	50 %	50 %	0 %	532351699
8051	NC_022108	ATA	2	6	406535	406540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351699
8052	NC_022108	CAT	2	6	406589	406594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351699
8053	NC_022108	CTA	2	6	406612	406617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351699
8054	NC_022108	A	6	6	406661	406666	100 %	0 %	0 %	0 %	532351699
8055	NC_022108	TCT	2	6	406741	406746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351699
8056	NC_022108	AAT	2	6	406816	406821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351699
8057	NC_022108	A	6	6	406870	406875	100 %	0 %	0 %	0 %	532351699
8058	NC_022108	GAC	2	6	406910	406915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351699
8059	NC_022108	ATGG	2	8	406949	406956	25 %	25 %	50 %	0 %	532351699
8060	NC_022108	A	6	6	407026	407031	100 %	0 %	0 %	0 %	532351699
8061	NC_022108	ACT	2	6	407070	407075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351699
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8063	NC_022108	TTG	2	6	407468	407473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351700
8064	NC_022108	AATC	2	8	407493	407500	50 %	25 %	0 %	25 %	532351700
8065	NC_022108	TC	3	6	407504	407509	0 %	50 %	0 %	50 %	532351700
8066	NC_022108	AACCA	2	10	407554	407563	60 %	0 %	0 %	40 %	532351700
8067	NC_022108	GAA	2	6	407576	407581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351700
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8070	NC_022108	AG	3	6	407695	407700	50 %	0 %	50 %	0 %	532351700
8071	NC_022108	TCT	2	6	407746	407751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351700
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8075	NC_022108	CAA	2	6	407865	407870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351700
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8079	NC_022108	GCA	2	6	408015	408020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351700
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8085	NC_022108	TCT	2	6	408283	408288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351700
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8088	NC_022108	TCCC	2	8	408380	408387	0 %	25 %	0 %	75 %	532351700
8089	NC_022108	CAT	2	6	408394	408399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351700
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8091	NC_022108	AG	3	6	408435	408440	50 %	0 %	50 %	0 %	532351700
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8093	NC_022108	AT	3	6	408602	408607	50 %	50 %	0 %	0 %	532351700
8094	NC_022108	CAT	2	6	408631	408636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351700
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8096	NC_022108	ATC	2	6	408685	408690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351700
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8101	NC_022108	CT	3	6	409006	409011	0 %	50 %	0 %	50 %	532351700
8102	NC_022108	AAAG	2	8	409108	409115	75 %	0 %	25 %	0 %	532351700
8103	NC_022108	TTC	2	6	409231	409236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351700
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8105	NC_022108	CAC	2	6	409322	409327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351700
8106	NC_022108	GAGT	2	8	409331	409338	25 %	25 %	50 %	0 %	532351700
8107	NC_022108	A	7	7	409352	409358	100 %	0 %	0 %	0 %	532351700
8108	NC_022108	AGA	2	6	409436	409441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351700
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8111	NC_022108	A	6	6	409501	409506	100 %	0 %	0 %	0 %	532351700
8112	NC_022108	A	8	8	409508	409515	100 %	0 %	0 %	0 %	532351700
8113	NC_022108	TTTTAA	2	12	409528	409539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351700
8114	NC_022108	TAA	2	6	409583	409588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351700
8115	NC_022108	A	6	6	409587	409592	100 %	0 %	0 %	0 %	532351700
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8119	NC_022108	CT	3	6	409905	409910	0 %	50 %	0 %	50 %	532352231
8120	NC_022108	T	6	6	409929	409934	0 %	100 %	0 %	0 %	532352231
8121	NC_022108	TAG	2	6	409942	409947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352231
8122	NC_022108	GTA	2	6	409960	409965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532352231
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8373	NC_022108	GAA	2	6	421627	421632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351711
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8375	NC_022108	CA	3	6	421758	421763	50 %	0 %	0 %	50 %	532351711
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8377	NC_022108	TGAT	2	8	421811	421818	25 %	50 %	25 %	0 %	532351711
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8380	NC_022108	TTC	2	6	421925	421930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351711
8381	NC_022108	CAT	2	6	421945	421950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351711
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8494	NC_022108	GTAA	2	8	426788	426795	50 %	25 %	25 %	0 %	532351715
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8497	NC_022108	CTG	2	6	426897	426902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351715
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8499	NC_022108	TTA	2	6	426932	426937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351715
8500	NC_022108	CTA	2	6	426951	426956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351715

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