MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_022108	CAA	2	6	353973	353978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351657
7003	NC_022108	CAAA	2	8	354123	354130	75 %	0 %	0 %	25 %	532351657
7004	NC_022108	ATT	2	6	354214	354219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351657
7005	NC_022108	TAA	2	6	354225	354230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351657
7006	NC_022108	CCA	2	6	354272	354277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351657
7007	NC_022108	AAC	2	6	354310	354315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351657
7008	NC_022108	CCAT	2	8	354333	354340	25 %	25 %	0 %	50 %	532351657
7009	NC_022108	GAA	2	6	354353	354358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351657
7010	NC_022108	CTC	2	6	354498	354503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351657
7011	NC_022108	CAA	2	6	354540	354545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351657
7012	NC_022108	CAT	2	6	354561	354566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351657
7013	NC_022108	AAG	2	6	354568	354573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351657
7014	NC_022108	TTC	2	6	354578	354583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351657
7015	NC_022108	AAC	2	6	354610	354615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351657
7016	NC_022108	TAA	2	6	354626	354631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351657
7017	NC_022108	GTT	2	6	354689	354694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351657
7018	NC_022108	GAA	2	6	354697	354702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351657
7019	NC_022108	TTCT	2	8	354744	354751	0 %	75 %	0 %	25 %	532351657
7020	NC_022108	CA	4	8	354792	354799	50 %	0 %	0 %	50 %	532351657
7021	NC_022108	TCT	2	6	354816	354821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351657
7022	NC_022108	TAG	2	6	354852	354857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351657
7023	NC_022108	CTT	2	6	355008	355013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351657
7024	NC_022108	TC	3	6	355059	355064	0 %	50 %	0 %	50 %	532351657
7025	NC_022108	CAA	2	6	355065	355070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351657
7026	NC_022108	T	6	6	355074	355079	0 %	100 %	0 %	0 %	532351657
7027	NC_022108	CTA	2	6	355086	355091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351657
7028	NC_022108	AAGT	2	8	355168	355175	50 %	25 %	25 %	0 %	532351658
7029	NC_022108	CGAT	2	8	355188	355195	25 %	25 %	25 %	25 %	532351658
7030	NC_022108	TTC	2	6	355209	355214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351658
7031	NC_022108	TCG	2	6	355223	355228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7032	NC_022108	TCC	2	6	355312	355317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351658
7033	NC_022108	TGC	2	6	355343	355348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7034	NC_022108	GA	3	6	355354	355359	50 %	0 %	50 %	0 %	532351658
7035	NC_022108	ATC	2	6	355514	355519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351658
7036	NC_022108	GCA	2	6	355589	355594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7037	NC_022108	ATC	2	6	355661	355666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351658
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7039	NC_022108	AGAA	2	8	355906	355913	75 %	0 %	25 %	0 %	532351658
7040	NC_022108	CAT	2	6	355926	355931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351658
7041	NC_022108	CT	3	6	355969	355974	0 %	50 %	0 %	50 %	532351658
7042	NC_022108	CTT	2	6	356013	356018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351658
7043	NC_022108	ACG	2	6	356038	356043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7044	NC_022108	TC	3	6	356094	356099	0 %	50 %	0 %	50 %	532351658
7045	NC_022108	TTCT	2	8	356137	356144	0 %	75 %	0 %	25 %	532351658
7046	NC_022108	CTT	2	6	356166	356171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351658
7047	NC_022108	TCA	2	6	356180	356185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351658
7048	NC_022108	CTG	2	6	356210	356215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7049	NC_022108	AGG	2	6	356251	356256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351658
7050	NC_022108	AG	3	6	356264	356269	50 %	0 %	50 %	0 %	532351658
7051	NC_022108	CCG	2	6	356283	356288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351658
7052	NC_022108	TC	3	6	356292	356297	0 %	50 %	0 %	50 %	532351658
7053	NC_022108	CAA	2	6	356311	356316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351658
7054	NC_022108	CAA	2	6	356364	356369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351658
7055	NC_022108	TCT	2	6	356471	356476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351658
7056	NC_022108	TTC	2	6	356512	356517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351658
7057	NC_022108	GAT	2	6	356563	356568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351658
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7059	NC_022108	ATT	2	6	356785	356790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351658
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7061	NC_022108	AAT	2	6	356854	356859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351658
7062	NC_022108	GCA	2	6	356876	356881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7063	NC_022108	CAA	2	6	356901	356906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351658
7064	NC_022108	AGC	2	6	356908	356913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7065	NC_022108	AAT	2	6	356924	356929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351658
7066	NC_022108	TCG	2	6	356978	356983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
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7068	NC_022108	TCT	2	6	357164	357169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351658
7069	NC_022108	CTG	2	6	357177	357182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
7070	NC_022108	CACGA	2	10	357220	357229	40 %	0 %	20 %	40 %	532351658
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7073	NC_022108	AAT	2	6	357523	357528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351658
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7076	NC_022108	TCG	2	6	357652	357657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351658
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7091	NC_022108	AAT	2	6	358345	358350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351658
7092	NC_022108	CT	4	8	358437	358444	0 %	50 %	0 %	50 %	532351658
7093	NC_022108	TAA	3	9	358452	358460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351658
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7104	NC_022108	T	6	6	359274	359279	0 %	100 %	0 %	0 %	532351659
7105	NC_022108	CTT	2	6	359319	359324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351659
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7109	NC_022108	GCA	2	6	359480	359485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351659
7110	NC_022108	AAT	2	6	359507	359512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351659
7111	NC_022108	T	6	6	359512	359517	0 %	100 %	0 %	0 %	532351659
7112	NC_022108	CTA	2	6	359559	359564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351659
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7122	NC_022108	TCT	2	6	359925	359930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351660
7123	NC_022108	A	6	6	359966	359971	100 %	0 %	0 %	0 %	532351660
7124	NC_022108	CAG	2	6	359998	360003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351660
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7126	NC_022108	GCA	2	6	360042	360047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351660
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7152	NC_022108	T	6	6	361626	361631	0 %	100 %	0 %	0 %	532351663
7153	NC_022108	T	6	6	361654	361659	0 %	100 %	0 %	0 %	532351663
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7232	NC_022108	TAT	2	6	366124	366129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532352227
7233	NC_022108	ACG	2	6	366133	366138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352227
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7235	NC_022108	GCA	2	6	366306	366311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352227
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7237	NC_022108	TC	3	6	366333	366338	0 %	50 %	0 %	50 %	532352227
7238	NC_022108	ATC	2	6	366341	366346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532352227
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7240	NC_022108	TA	3	6	366403	366408	50 %	50 %	0 %	0 %	532352227
7241	NC_022108	CAA	2	6	366439	366444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532352227
7242	NC_022108	AGGC	2	8	366457	366464	25 %	0 %	50 %	25 %	532352227
7243	NC_022108	TCCA	2	8	366513	366520	25 %	25 %	0 %	50 %	532352227
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7245	NC_022108	AGC	2	6	366564	366569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532352227
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7493	NC_022108	CTT	2	6	378842	378847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351677
7494	NC_022108	AGA	2	6	378855	378860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351677
7495	NC_022108	TCT	2	6	378910	378915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351677
7496	NC_022108	CCT	2	6	378955	378960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351677
7497	NC_022108	CGC	2	6	378966	378971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351677
7498	NC_022108	TC	3	6	379017	379022	0 %	50 %	0 %	50 %	532351677
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