MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022108	ATA	2	6	327913	327918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351639
6502	NC_022108	CA	3	6	327929	327934	50 %	0 %	0 %	50 %	532351639
6503	NC_022108	ATC	2	6	327953	327958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351639
6504	NC_022108	GTC	2	6	327962	327967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351639
6505	NC_022108	CCAG	2	8	328042	328049	25 %	0 %	25 %	50 %	532351639
6506	NC_022108	GCA	2	6	328061	328066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351639
6507	NC_022108	GAA	2	6	328067	328072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351639
6508	NC_022108	TAA	2	6	328074	328079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351639
6509	NC_022108	T	6	6	328082	328087	0 %	100 %	0 %	0 %	532351639
6510	NC_022108	GAG	2	6	328143	328148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351639
6511	NC_022108	C	8	8	328154	328161	0 %	0 %	0 %	100 %	532351639
6512	NC_022108	AG	3	6	328193	328198	50 %	0 %	50 %	0 %	532351639
6513	NC_022108	CCA	2	6	328214	328219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351639
6514	NC_022108	GATT	2	8	328236	328243	25 %	50 %	25 %	0 %	532351639
6515	NC_022108	ATT	2	6	328309	328314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351639
6516	NC_022108	TA	3	6	328315	328320	50 %	50 %	0 %	0 %	532351639
6517	NC_022108	TGA	2	6	328337	328342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351639
6518	NC_022108	AAG	2	6	328416	328421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351639
6519	NC_022108	A	6	6	328441	328446	100 %	0 %	0 %	0 %	532351639
6520	NC_022108	GCTA	2	8	328486	328493	25 %	25 %	25 %	25 %	532351639
6521	NC_022108	ATA	2	6	328752	328757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351640
6522	NC_022108	AATT	2	8	328851	328858	50 %	50 %	0 %	0 %	532351640
6523	NC_022108	ATA	2	6	328971	328976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351640
6524	NC_022108	T	6	6	329030	329035	0 %	100 %	0 %	0 %	532351640
6525	NC_022108	GCA	2	6	329065	329070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351640
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6527	NC_022108	CTC	2	6	329121	329126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351640
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6529	NC_022108	T	6	6	329171	329176	0 %	100 %	0 %	0 %	532351640
6530	NC_022108	TA	3	6	329181	329186	50 %	50 %	0 %	0 %	532351640
6531	NC_022108	TGT	2	6	329253	329258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351640
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6534	NC_022108	CTT	2	6	329375	329380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351640
6535	NC_022108	ACC	2	6	329392	329397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351640
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6540	NC_022108	TCT	2	6	329662	329667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351640
6541	NC_022108	AT	3	6	329734	329739	50 %	50 %	0 %	0 %	532351640
6542	NC_022108	GAT	2	6	329741	329746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351640
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6544	NC_022108	CAG	2	6	329759	329764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351640
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6548	NC_022108	AAT	2	6	330023	330028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351640
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6550	NC_022108	CT	3	6	330204	330209	0 %	50 %	0 %	50 %	532351640
6551	NC_022108	ACA	2	6	330262	330267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351640
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6553	NC_022108	AGAAA	2	10	330583	330592	80 %	0 %	20 %	0 %	532351641
6554	NC_022108	AGC	2	6	330626	330631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351641
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6556	NC_022108	CAG	2	6	330723	330728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351641
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6558	NC_022108	ATC	2	6	330758	330763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351641
6559	NC_022108	TC	4	8	330792	330799	0 %	50 %	0 %	50 %	532351641
6560	NC_022108	CCT	2	6	330834	330839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351641
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6563	NC_022108	CTT	2	6	331163	331168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351642
6564	NC_022108	CTG	2	6	331187	331192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351642
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6571	NC_022108	A	6	6	331391	331396	100 %	0 %	0 %	0 %	532351642
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6592	NC_022108	GA	3	6	332320	332325	50 %	0 %	50 %	0 %	532351643
6593	NC_022108	CAAAA	2	10	332352	332361	80 %	0 %	0 %	20 %	532351643
6594	NC_022108	TAT	2	6	332377	332382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351643
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6602	NC_022108	TA	3	6	332787	332792	50 %	50 %	0 %	0 %	532351643
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6606	NC_022108	GA	3	6	332922	332927	50 %	0 %	50 %	0 %	532351643
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6624	NC_022108	C	6	6	333692	333697	0 %	0 %	0 %	100 %	532351644
6625	NC_022108	ATC	2	6	333703	333708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351644
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6634	NC_022108	CA	3	6	334767	334772	50 %	0 %	0 %	50 %	532351645
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6740	NC_022108	CAGAG	2	10	340778	340787	40 %	0 %	40 %	20 %	532351647
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6745	NC_022108	CA	3	6	340923	340928	50 %	0 %	0 %	50 %	532351647
6746	NC_022108	ACTG	2	8	340995	341002	25 %	25 %	25 %	25 %	532352225
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6983	NC_022108	AATC	2	8	352873	352880	50 %	25 %	0 %	25 %	532351657
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6985	NC_022108	TAA	2	6	353005	353010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351657
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6993	NC_022108	ATGTC	2	10	353523	353532	20 %	40 %	20 %	20 %	532351657
6994	NC_022108	AGA	2	6	353560	353565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351657
6995	NC_022108	TGT	2	6	353577	353582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351657
6996	NC_022108	CAT	2	6	353590	353595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351657
6997	NC_022108	GA	3	6	353627	353632	50 %	0 %	50 %	0 %	532351657
6998	NC_022108	CCTTC	2	10	353709	353718	0 %	40 %	0 %	60 %	532351657
6999	NC_022108	ATT	2	6	353798	353803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351657
7000	NC_022108	ATC	2	6	353843	353848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351657

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