MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain E/12-94 genome

Total Repeats: 20379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022108	T	6	6	304460	304465	0 %	100 %	0 %	0 %	532351617
6002	NC_022108	ATC	2	6	304526	304531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351617
6003	NC_022108	CCA	2	6	304563	304568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351617
6004	NC_022108	TTTC	2	8	304673	304680	0 %	75 %	0 %	25 %	532351617
6005	NC_022108	AGGA	2	8	304690	304697	50 %	0 %	50 %	0 %	532351617
6006	NC_022108	TCTTTT	2	12	304741	304752	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	532351617
6007	NC_022108	T	6	6	304749	304754	0 %	100 %	0 %	0 %	532351617
6008	NC_022108	GCA	2	6	304776	304781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351617
6009	NC_022108	CTC	2	6	304782	304787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351617
6010	NC_022108	TCT	2	6	304830	304835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351617
6011	NC_022108	CACTT	2	10	304853	304862	20 %	40 %	0 %	40 %	532351617
6012	NC_022108	GAT	2	6	304903	304908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351617
6013	NC_022108	GTT	2	6	304940	304945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351617
6014	NC_022108	AGCA	2	8	304973	304980	50 %	0 %	25 %	25 %	532351617
6015	NC_022108	CAT	2	6	304984	304989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351617
6016	NC_022108	CTT	2	6	305017	305022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351617
6017	NC_022108	AAG	2	6	305026	305031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351617
6018	NC_022108	CAGA	2	8	305092	305099	50 %	0 %	25 %	25 %	532351617
6019	NC_022108	A	6	6	305145	305150	100 %	0 %	0 %	0 %	532351617
6020	NC_022108	ACC	2	6	305162	305167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351617
6021	NC_022108	TCACA	2	10	305179	305188	40 %	20 %	0 %	40 %	532351617
6022	NC_022108	ACT	2	6	305193	305198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351617
6023	NC_022108	AAT	2	6	305214	305219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351617
6024	NC_022108	CT	3	6	305226	305231	0 %	50 %	0 %	50 %	532351617
6025	NC_022108	TTA	2	6	305291	305296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351617
6026	NC_022108	TCCA	2	8	305297	305304	25 %	25 %	0 %	50 %	532351617
6027	NC_022108	CTA	2	6	305305	305310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351617
6028	NC_022108	CAAA	2	8	305724	305731	75 %	0 %	0 %	25 %	532351618
6029	NC_022108	A	7	7	305733	305739	100 %	0 %	0 %	0 %	532351618
6030	NC_022108	TCC	2	6	305759	305764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351618
6031	NC_022108	AAC	2	6	305779	305784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351618
6032	NC_022108	CTTA	2	8	305797	305804	25 %	50 %	0 %	25 %	532351618
6033	NC_022108	TC	3	6	305811	305816	0 %	50 %	0 %	50 %	532351618
6034	NC_022108	CAAGAC	2	12	305832	305843	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	532351618
6035	NC_022108	A	6	6	305848	305853	100 %	0 %	0 %	0 %	532351618
6036	NC_022108	A	6	6	305924	305929	100 %	0 %	0 %	0 %	532351618
6037	NC_022108	CTC	2	6	305936	305941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351618
6038	NC_022108	ACA	2	6	305960	305965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351618
6039	NC_022108	AGA	2	6	305990	305995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351618
6040	NC_022108	GAA	2	6	306162	306167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351618
6041	NC_022108	T	8	8	306231	306238	0 %	100 %	0 %	0 %	532351619
6042	NC_022108	AGG	2	6	306289	306294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351619
6043	NC_022108	AGA	2	6	306421	306426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351619
6044	NC_022108	CGT	2	6	306453	306458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351619
6045	NC_022108	TAC	2	6	306495	306500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351619
6046	NC_022108	C	6	6	306515	306520	0 %	0 %	0 %	100 %	532351619
6047	NC_022108	TCT	2	6	306570	306575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351619
6048	NC_022108	GA	3	6	306577	306582	50 %	0 %	50 %	0 %	532351619
6049	NC_022108	GCT	2	6	306839	306844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351620
6050	NC_022108	AGA	2	6	306888	306893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351620
6051	NC_022108	A	6	6	306902	306907	100 %	0 %	0 %	0 %	532351620
6052	NC_022108	A	6	6	306961	306966	100 %	0 %	0 %	0 %	532351620
6053	NC_022108	GTT	2	6	307021	307026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351620
6054	NC_022108	AGCTTA	2	12	307112	307123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532351620
6055	NC_022108	TCCA	2	8	307158	307165	25 %	25 %	0 %	50 %	532351620
6056	NC_022108	TGC	2	6	307197	307202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351620
6057	NC_022108	TATT	2	8	307229	307236	25 %	75 %	0 %	0 %	532351620
6058	NC_022108	TGG	2	6	307239	307244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351620
6059	NC_022108	CAT	2	6	307300	307305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351620
6060	NC_022108	TTA	2	6	307343	307348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351620
6061	NC_022108	TCA	2	6	307359	307364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351620
6062	NC_022108	ATCG	2	8	307403	307410	25 %	25 %	25 %	25 %	532351620
6063	NC_022108	TCG	2	6	307424	307429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351620
6064	NC_022108	TTG	2	6	307517	307522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351620
6065	NC_022108	TTG	2	6	307592	307597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351620
6066	NC_022108	TA	3	6	307693	307698	50 %	50 %	0 %	0 %	532351620
6067	NC_022108	TAA	2	6	307743	307748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351620
6068	NC_022108	TAA	2	6	307773	307778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351620
6069	NC_022108	AAC	2	6	307791	307796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351620
6070	NC_022108	TTG	2	6	307991	307996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351620
6071	NC_022108	TGC	2	6	308004	308009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351620
6072	NC_022108	ACTC	2	8	308020	308027	25 %	25 %	0 %	50 %	532351620
6073	NC_022108	A	6	6	308085	308090	100 %	0 %	0 %	0 %	532351620
6074	NC_022108	AAT	2	6	308110	308115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351620
6075	NC_022108	CAC	2	6	308129	308134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351620
6076	NC_022108	ATT	2	6	308164	308169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351620
6077	NC_022108	GTG	2	6	308258	308263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351621
6078	NC_022108	TA	3	6	308283	308288	50 %	50 %	0 %	0 %	532351621
6079	NC_022108	AGAAC	2	10	308296	308305	60 %	0 %	20 %	20 %	532351621
6080	NC_022108	AAG	2	6	308369	308374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351621
6081	NC_022108	CAA	2	6	308395	308400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351621
6082	NC_022108	GAA	2	6	308401	308406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351621
6083	NC_022108	GAA	2	6	308434	308439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351621
6084	NC_022108	ACT	2	6	308446	308451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351621
6085	NC_022108	GA	3	6	308491	308496	50 %	0 %	50 %	0 %	532351621
6086	NC_022108	ATT	2	6	308548	308553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351621
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6088	NC_022108	TG	3	6	308701	308706	0 %	50 %	50 %	0 %	532351621
6089	NC_022108	TG	3	6	308723	308728	0 %	50 %	50 %	0 %	532351621
6090	NC_022108	TTC	2	6	308816	308821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351621
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6092	NC_022108	CTG	2	6	308869	308874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351622
6093	NC_022108	CTTTT	2	10	308884	308893	0 %	80 %	0 %	20 %	532351622
6094	NC_022108	TC	3	6	308957	308962	0 %	50 %	0 %	50 %	532351622
6095	NC_022108	GAA	2	6	308973	308978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351622
6096	NC_022108	AGC	2	6	309026	309031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351622
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6098	NC_022108	TAC	2	6	309226	309231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351622
6099	NC_022108	CGC	2	6	309234	309239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532351622
6100	NC_022108	CAA	2	6	309240	309245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351622
6101	NC_022108	TC	3	6	309256	309261	0 %	50 %	0 %	50 %	532351622
6102	NC_022108	GCA	2	6	309281	309286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351622
6103	NC_022108	AAC	2	6	309332	309337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351622
6104	NC_022108	T	6	6	309342	309347	0 %	100 %	0 %	0 %	532351622
6105	NC_022108	TAA	2	6	309362	309367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351622
6106	NC_022108	TC	3	6	309404	309409	0 %	50 %	0 %	50 %	532351622
6107	NC_022108	AC	3	6	309524	309529	50 %	0 %	0 %	50 %	532351623
6108	NC_022108	TCT	2	6	309534	309539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351623
6109	NC_022108	CGTT	2	8	309544	309551	0 %	50 %	25 %	25 %	532351623
6110	NC_022108	GAT	2	6	309578	309583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351623
6111	NC_022108	GTTG	2	8	309584	309591	0 %	50 %	50 %	0 %	532351623
6112	NC_022108	CTC	2	6	309786	309791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351623
6113	NC_022108	AGG	2	6	309809	309814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351623
6114	NC_022108	TAT	2	6	309836	309841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351623
6115	NC_022108	TCCT	2	8	309898	309905	0 %	50 %	0 %	50 %	532351623
6116	NC_022108	CTA	2	6	309907	309912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351623
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6118	NC_022108	GGC	2	6	309975	309980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532351623
6119	NC_022108	GAAT	2	8	309985	309992	50 %	25 %	25 %	0 %	532351623
6120	NC_022108	AAAG	2	8	310092	310099	75 %	0 %	25 %	0 %	532351623
6121	NC_022108	AGA	2	6	310126	310131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351623
6122	NC_022108	CTC	2	6	310183	310188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351623
6123	NC_022108	AAC	2	6	310333	310338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351623
6124	NC_022108	ACT	2	6	310353	310358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351623
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6126	NC_022108	CTT	2	6	310383	310388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351623
6127	NC_022108	GA	3	6	310492	310497	50 %	0 %	50 %	0 %	532351623
6128	NC_022108	CTT	2	6	310530	310535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351623
6129	NC_022108	CTT	2	6	310552	310557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351623
6130	NC_022108	T	6	6	310589	310594	0 %	100 %	0 %	0 %	532351623
6131	NC_022108	AAC	2	6	310628	310633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351623
6132	NC_022108	TTC	2	6	310742	310747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351623
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6136	NC_022108	TAT	2	6	311031	311036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532351624
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6139	NC_022108	TA	3	6	311164	311169	50 %	50 %	0 %	0 %	532351624
6140	NC_022108	CTC	2	6	311203	311208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351624
6141	NC_022108	TCTT	2	8	311285	311292	0 %	75 %	0 %	25 %	532351624
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6144	NC_022108	TTC	2	6	311461	311466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351624
6145	NC_022108	CTAT	2	8	311494	311501	25 %	50 %	0 %	25 %	532351624
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6148	NC_022108	A	6	6	311625	311630	100 %	0 %	0 %	0 %	532351624
6149	NC_022108	GCA	2	6	311712	311717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351624
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6152	NC_022108	TTG	2	6	311829	311834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351624
6153	NC_022108	TTC	2	6	311838	311843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351624
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6156	NC_022108	GCT	2	6	312029	312034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351625
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6160	NC_022108	TTG	2	6	312182	312187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351625
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6230	NC_022108	A	6	6	315526	315531	100 %	0 %	0 %	0 %	532351628
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6233	NC_022108	AAAC	2	8	315658	315665	75 %	0 %	0 %	25 %	532351628
6234	NC_022108	CTT	2	6	315690	315695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351628
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6237	NC_022108	T	6	6	315733	315738	0 %	100 %	0 %	0 %	532351628
6238	NC_022108	AAT	2	6	315742	315747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351628
6239	NC_022108	A	9	9	315757	315765	100 %	0 %	0 %	0 %	532351628
6240	NC_022108	ACT	2	6	315771	315776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351628
6241	NC_022108	TCA	2	6	315990	315995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351629
6242	NC_022108	TAC	2	6	316034	316039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351629
6243	NC_022108	CTT	2	6	316057	316062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351629
6244	NC_022108	AATC	2	8	316066	316073	50 %	25 %	0 %	25 %	532351629
6245	NC_022108	CTT	2	6	316106	316111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351629
6246	NC_022108	ATC	2	6	316145	316150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351629
6247	NC_022108	TAAT	2	8	316287	316294	50 %	50 %	0 %	0 %	532351629
6248	NC_022108	AGCA	2	8	316384	316391	50 %	0 %	25 %	25 %	532351629
6249	NC_022108	AT	3	6	316406	316411	50 %	50 %	0 %	0 %	532351629
6250	NC_022108	A	6	6	316427	316432	100 %	0 %	0 %	0 %	532351629
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6252	NC_022108	GTT	2	6	316499	316504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351629
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6255	NC_022108	ATC	2	6	316643	316648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351629
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6261	NC_022108	ATC	2	6	317033	317038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351629
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6263	NC_022108	GCT	2	6	317095	317100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351629
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6353	NC_022108	AGA	2	6	320799	320804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351631
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6355	NC_022108	AGA	3	9	320823	320831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351631
6356	NC_022108	TGA	2	6	320883	320888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351631
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6358	NC_022108	TAAAG	2	10	321129	321138	60 %	20 %	20 %	0 %	532351632
6359	NC_022108	GAT	2	6	321139	321144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351632
6360	NC_022108	TCC	2	6	321215	321220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351632
6361	NC_022108	TAA	2	6	321252	321257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351632
6362	NC_022108	TGT	2	6	321285	321290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351632
6363	NC_022108	AAT	2	6	321302	321307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351632
6364	NC_022108	T	7	7	321389	321395	0 %	100 %	0 %	0 %	532351632
6365	NC_022108	CTT	2	6	321415	321420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351632
6366	NC_022108	CTC	2	6	321565	321570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351632
6367	NC_022108	AAT	2	6	321574	321579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351632
6368	NC_022108	A	6	6	321591	321596	100 %	0 %	0 %	0 %	532351632
6369	NC_022108	CTT	2	6	321617	321622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351632
6370	NC_022108	TAA	2	6	321626	321631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351632
6371	NC_022108	ATGGA	2	10	321754	321763	40 %	20 %	40 %	0 %	532351632
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6373	NC_022108	CTT	2	6	321881	321886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351632
6374	NC_022108	CAA	2	6	321898	321903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351632
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6377	NC_022108	CAT	2	6	322005	322010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351632
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6401	NC_022108	A	6	6	323110	323115	100 %	0 %	0 %	0 %	532351633
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6472	NC_022108	GAAA	2	8	326175	326182	75 %	0 %	25 %	0 %	532351636
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6477	NC_022108	AATG	2	8	326471	326478	50 %	25 %	25 %	0 %	532351637
6478	NC_022108	GAA	2	6	326551	326556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351637
6479	NC_022108	GCTA	2	8	326573	326580	25 %	25 %	25 %	25 %	532351637
6480	NC_022108	GAAC	2	8	326592	326599	50 %	0 %	25 %	25 %	532351637
6481	NC_022108	CT	3	6	326653	326658	0 %	50 %	0 %	50 %	532351637
6482	NC_022108	CCT	2	6	326799	326804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351637
6483	NC_022108	ATC	2	6	326822	326827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351637
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6485	NC_022108	GTT	2	6	326934	326939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351638
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6487	NC_022108	TAC	2	6	326957	326962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351638
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6489	NC_022108	AAT	2	6	327086	327091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351638
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6492	NC_022108	CTC	2	6	327124	327129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351638
6493	NC_022108	A	6	6	327223	327228	100 %	0 %	0 %	0 %	532351638
6494	NC_022108	TC	3	6	327319	327324	0 %	50 %	0 %	50 %	532351638
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