MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_022107	GTG	2	6	829600	829605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351122
16503	NC_022107	TC	3	6	829617	829622	0 %	50 %	0 %	50 %	532351122
16504	NC_022107	CTT	2	6	829638	829643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351122
16505	NC_022107	ATA	2	6	829683	829688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351122
16506	NC_022107	TGC	2	6	829729	829734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351122
16507	NC_022107	GAT	2	6	829783	829788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351122
16508	NC_022107	CTT	2	6	829812	829817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351122
16509	NC_022107	GTTG	2	8	829821	829828	0 %	50 %	50 %	0 %	532351122
16510	NC_022107	ATTG	2	8	829876	829883	25 %	50 %	25 %	0 %	532351122
16511	NC_022107	AGA	2	6	829913	829918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351122
16512	NC_022107	CTC	2	6	829929	829934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351122
16513	NC_022107	AGG	2	6	829979	829984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351122
16514	NC_022107	GAA	2	6	830054	830059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351122
16515	NC_022107	TCC	2	6	830095	830100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532351122
16516	NC_022107	AG	3	6	830159	830164	50 %	0 %	50 %	0 %	532351122
16517	NC_022107	ACT	2	6	830183	830188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351122
16518	NC_022107	TAA	2	6	830230	830235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351122
16519	NC_022107	AGA	2	6	830342	830347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351122
16520	NC_022107	TCT	2	6	830414	830419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351122
16521	NC_022107	GAGT	2	8	830512	830519	25 %	25 %	50 %	0 %	532351123
16522	NC_022107	TGTCT	2	10	830551	830560	0 %	60 %	20 %	20 %	532351123
16523	NC_022107	TAGC	2	8	830589	830596	25 %	25 %	25 %	25 %	532351123
16524	NC_022107	GA	3	6	830713	830718	50 %	0 %	50 %	0 %	532351123
16525	NC_022107	ATG	2	6	830735	830740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351123
16526	NC_022107	TTC	2	6	830771	830776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351123
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16528	NC_022107	AG	3	6	830873	830878	50 %	0 %	50 %	0 %	532351123
16529	NC_022107	AGAA	2	8	830915	830922	75 %	0 %	25 %	0 %	532351123
16530	NC_022107	GA	3	6	830931	830936	50 %	0 %	50 %	0 %	532351123
16531	NC_022107	CTT	2	6	830938	830943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351123
16532	NC_022107	AG	3	6	830950	830955	50 %	0 %	50 %	0 %	532351123
16533	NC_022107	GAG	2	6	831007	831012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351123
16534	NC_022107	TTC	2	6	831069	831074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351124
16535	NC_022107	AAG	2	6	831087	831092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351124
16536	NC_022107	TTC	2	6	831093	831098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351124
16537	NC_022107	GA	3	6	831121	831126	50 %	0 %	50 %	0 %	532351124
16538	NC_022107	TCA	2	6	831158	831163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351124
16539	NC_022107	T	6	6	831197	831202	0 %	100 %	0 %	0 %	532351124
16540	NC_022107	GA	3	6	831212	831217	50 %	0 %	50 %	0 %	532351124
16541	NC_022107	TG	3	6	831326	831331	0 %	50 %	50 %	0 %	532351124
16542	NC_022107	GA	3	6	831388	831393	50 %	0 %	50 %	0 %	532351124
16543	NC_022107	GAA	2	6	831527	831532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351124
16544	NC_022107	AG	3	6	831587	831592	50 %	0 %	50 %	0 %	532351124
16545	NC_022107	TCT	3	9	831751	831759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351124
16546	NC_022107	CTTT	2	8	831824	831831	0 %	75 %	0 %	25 %	532351124
16547	NC_022107	T	6	6	831891	831896	0 %	100 %	0 %	0 %	532351124
16548	NC_022107	GAG	2	6	831926	831931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351124
16549	NC_022107	ACA	2	6	831944	831949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351124
16550	NC_022107	TGA	2	6	831950	831955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351124
16551	NC_022107	AAG	2	6	831975	831980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351124
16552	NC_022107	T	6	6	832012	832017	0 %	100 %	0 %	0 %	532351124
16553	NC_022107	CTT	3	9	832145	832153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351339
16554	NC_022107	AAG	2	6	832160	832165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351339
16555	NC_022107	TAG	2	6	832320	832325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351125
16556	NC_022107	TAA	2	6	832350	832355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532351125
16557	NC_022107	CGA	2	6	832502	832507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351125
16558	NC_022107	TCA	2	6	832526	832531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351125
16559	NC_022107	GA	3	6	832564	832569	50 %	0 %	50 %	0 %	532351125
16560	NC_022107	GAAAGG	2	12	832629	832640	50 %	0 %	50 %	0 %	532351125
16561	NC_022107	CA	3	6	832662	832667	50 %	0 %	0 %	50 %	532351125
16562	NC_022107	AG	3	6	832709	832714	50 %	0 %	50 %	0 %	532351125
16563	NC_022107	GA	3	6	832715	832720	50 %	0 %	50 %	0 %	532351125
16564	NC_022107	TCT	2	6	832723	832728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351125
16565	NC_022107	CTT	2	6	832760	832765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351125
16566	NC_022107	CCAG	2	8	832913	832920	25 %	0 %	25 %	50 %	532351125
16567	NC_022107	TTC	2	6	832980	832985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351125
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16571	NC_022107	CTT	2	6	833134	833139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351126
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16573	NC_022107	AAG	2	6	833217	833222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351126
16574	NC_022107	GA	3	6	833224	833229	50 %	0 %	50 %	0 %	532351126
16575	NC_022107	GGAAA	2	10	833303	833312	60 %	0 %	40 %	0 %	532351126
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16579	NC_022107	CCA	2	6	833616	833621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532351126
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16582	NC_022107	GCA	2	6	833739	833744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351126
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16585	NC_022107	TGA	2	6	833914	833919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532351126
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16589	NC_022107	AGA	2	6	833985	833990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351126
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16602	NC_022107	CTT	2	6	834516	834521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351340
16603	NC_022107	T	6	6	834527	834532	0 %	100 %	0 %	0 %	532351340
16604	NC_022107	ATC	2	6	834587	834592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351340
16605	NC_022107	TCA	2	6	834699	834704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351340
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16607	NC_022107	TTG	2	6	834790	834795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351340
16608	NC_022107	T	7	7	834830	834836	0 %	100 %	0 %	0 %	532351340
16609	NC_022107	AAG	2	6	834871	834876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351340
16610	NC_022107	AG	3	6	834883	834888	50 %	0 %	50 %	0 %	532351340
16611	NC_022107	TGGCA	2	10	835174	835183	20 %	20 %	40 %	20 %	532351127
16612	NC_022107	CAG	2	6	835212	835217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351127
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16617	NC_022107	TGT	2	6	835449	835454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532351127
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16972	NC_022107	A	7	7	854138	854144	100 %	0 %	0 %	0 %	532351341
16973	NC_022107	GT	3	6	854183	854188	0 %	50 %	50 %	0 %	532351341
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16976	NC_022107	A	6	6	854253	854258	100 %	0 %	0 %	0 %	532351341
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16983	NC_022107	CTT	2	6	860247	860252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532351144
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16988	NC_022107	AT	3	6	860463	860468	50 %	50 %	0 %	0 %	532351144
16989	NC_022107	GGTCG	2	10	860494	860503	0 %	20 %	60 %	20 %	532351144
16990	NC_022107	AGG	2	6	860521	860526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351144
16991	NC_022107	CTG	2	6	860565	860570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351144
16992	NC_022107	AAG	2	6	860574	860579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351144
16993	NC_022107	AGAT	2	8	860617	860624	50 %	25 %	25 %	0 %	532351144
16994	NC_022107	AGG	2	6	860719	860724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532351144
16995	NC_022107	AGAA	2	8	860782	860789	75 %	0 %	25 %	0 %	532351144
16996	NC_022107	ACA	2	6	860828	860833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532351144
16997	NC_022107	AAG	3	9	860844	860852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532351144
16998	NC_022107	CTTCTA	2	12	860868	860879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532351144
16999	NC_022107	TGC	2	6	860936	860941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351144
17000	NC_022107	TCA	2	6	860975	860980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532351144

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