MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_022107	ACG	2	6	505978	505983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350846
10003	NC_022107	GAT	2	6	506010	506015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350846
10004	NC_022107	TAA	2	6	506025	506030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350846
10005	NC_022107	ATA	2	6	506042	506047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350846
10006	NC_022107	CTT	2	6	506082	506087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350846
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10008	NC_022107	CGA	2	6	506268	506273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350846
10009	NC_022107	ACC	2	6	506350	506355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350846
10010	NC_022107	AAT	2	6	506506	506511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350846
10011	NC_022107	TAG	2	6	506532	506537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350846
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10013	NC_022107	TC	3	6	506592	506597	0 %	50 %	0 %	50 %	532350846
10014	NC_022107	ATCA	2	8	506629	506636	50 %	25 %	0 %	25 %	532350846
10015	NC_022107	AC	3	6	506723	506728	50 %	0 %	0 %	50 %	532350846
10016	NC_022107	GCAT	2	8	506777	506784	25 %	25 %	25 %	25 %	532350846
10017	NC_022107	CTT	2	6	506845	506850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350846
10018	NC_022107	GGTC	2	8	506898	506905	0 %	25 %	50 %	25 %	532350846
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10020	NC_022107	CTT	2	6	506961	506966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350846
10021	NC_022107	AAG	2	6	507040	507045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350846
10022	NC_022107	GATT	2	8	507090	507097	25 %	50 %	25 %	0 %	532350846
10023	NC_022107	TCT	3	9	507137	507145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350846
10024	NC_022107	TCA	2	6	507197	507202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350846
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10028	NC_022107	TC	3	6	507410	507415	0 %	50 %	0 %	50 %	532350846
10029	NC_022107	TTTA	2	8	507460	507467	25 %	75 %	0 %	0 %	532350846
10030	NC_022107	AAT	2	6	507628	507633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350846
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10033	NC_022107	GGTAAT	2	12	507676	507687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350846
10034	NC_022107	TCCA	2	8	507707	507714	25 %	25 %	0 %	50 %	532350846
10035	NC_022107	TTC	2	6	507759	507764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350846
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10041	NC_022107	TAA	2	6	508304	508309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350847
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10050	NC_022107	CTT	2	6	508774	508779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350848
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10054	NC_022107	TAT	2	6	509209	509214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350849
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10056	NC_022107	TCTT	2	8	509298	509305	0 %	75 %	0 %	25 %	532350849
10057	NC_022107	GAA	2	6	509326	509331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350849
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10064	NC_022107	GTTC	2	8	509740	509747	0 %	50 %	25 %	25 %	532350850
10065	NC_022107	TCT	2	6	509786	509791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350850
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10103	NC_022107	GA	3	6	511308	511313	50 %	0 %	50 %	0 %	532350850
10104	NC_022107	A	7	7	511355	511361	100 %	0 %	0 %	0 %	532350850
10105	NC_022107	A	7	7	511393	511399	100 %	0 %	0 %	0 %	532350850
10106	NC_022107	CAAA	2	8	511400	511407	75 %	0 %	0 %	25 %	532350850
10107	NC_022107	GATC	2	8	511411	511418	25 %	25 %	25 %	25 %	532350850
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10119	NC_022107	TC	3	6	511781	511786	0 %	50 %	0 %	50 %	532350851
10120	NC_022107	TAGA	2	8	511859	511866	50 %	25 %	25 %	0 %	532350851
10121	NC_022107	AGT	2	6	511923	511928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350851
10122	NC_022107	CAC	2	6	511934	511939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350851
10123	NC_022107	AGA	2	6	511968	511973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350851
10124	NC_022107	AAC	2	6	512054	512059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350851
10125	NC_022107	TG	3	6	512261	512266	0 %	50 %	50 %	0 %	532350852
10126	NC_022107	GAA	2	6	512305	512310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350852
10127	NC_022107	CGAAT	2	10	512400	512409	40 %	20 %	20 %	20 %	532350852
10128	NC_022107	ACT	2	6	512410	512415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350852
10129	NC_022107	TCT	2	6	512506	512511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350852
10130	NC_022107	CTA	2	6	512582	512587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350852
10131	NC_022107	AGC	2	6	512601	512606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350852
10132	NC_022107	AAG	2	6	512639	512644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350852
10133	NC_022107	AGC	2	6	512663	512668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350852
10134	NC_022107	CAA	2	6	512675	512680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350852
10135	NC_022107	ATT	2	6	512682	512687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350852
10136	NC_022107	ACT	2	6	512770	512775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350852
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10139	NC_022107	TACT	2	8	512936	512943	25 %	50 %	0 %	25 %	532350852
10140	NC_022107	GTT	2	6	512968	512973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350852
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10143	NC_022107	CAA	3	9	513158	513166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350852
10144	NC_022107	ACT	2	6	513214	513219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350852
10145	NC_022107	CTT	2	6	513248	513253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350852
10146	NC_022107	AGC	2	6	513332	513337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350852
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10148	NC_022107	CAG	2	6	513425	513430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350852
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10150	NC_022107	TG	3	6	513577	513582	0 %	50 %	50 %	0 %	532350852
10151	NC_022107	ATC	2	6	513597	513602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350852
10152	NC_022107	T	6	6	513718	513723	0 %	100 %	0 %	0 %	532350852
10153	NC_022107	T	6	6	513729	513734	0 %	100 %	0 %	0 %	532350852
10154	NC_022107	AGCTA	2	10	513771	513780	40 %	20 %	20 %	20 %	532350852
10155	NC_022107	AG	4	8	513792	513799	50 %	0 %	50 %	0 %	532350852
10156	NC_022107	TGA	2	6	513881	513886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350852
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10158	NC_022107	TCTT	2	8	514194	514201	0 %	75 %	0 %	25 %	532350853
10159	NC_022107	ACA	2	6	514268	514273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350853
10160	NC_022107	ACT	2	6	514274	514279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350853
10161	NC_022107	ACA	2	6	514287	514292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350853
10162	NC_022107	AGC	2	6	514301	514306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350853
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10168	NC_022107	CTT	2	6	514831	514836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350854
10169	NC_022107	CAC	2	6	514845	514850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350854
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10171	NC_022107	TGC	3	9	514943	514951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350855
10172	NC_022107	CTC	2	6	514965	514970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350855
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10184	NC_022107	CTT	2	6	515583	515588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350855
10185	NC_022107	T	6	6	515587	515592	0 %	100 %	0 %	0 %	532350855
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10187	NC_022107	TTCT	2	8	515630	515637	0 %	75 %	0 %	25 %	532350855
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10190	NC_022107	AGA	2	6	515720	515725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350855
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10193	NC_022107	CTCTT	2	10	515959	515968	0 %	60 %	0 %	40 %	532350855
10194	NC_022107	TCC	2	6	516013	516018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350855
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10205	NC_022107	ATAG	2	8	517086	517093	50 %	25 %	25 %	0 %	532350856
10206	NC_022107	TCT	2	6	517168	517173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350856
10207	NC_022107	TGC	2	6	517174	517179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350856
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10211	NC_022107	ATA	2	6	517714	517719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350857
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10227	NC_022107	ACA	2	6	518398	518403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350857
10228	NC_022107	TAATTC	2	12	518510	518521	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	532350857
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10231	NC_022107	TC	3	6	518639	518644	0 %	50 %	0 %	50 %	532350857
10232	NC_022107	A	6	6	518692	518697	100 %	0 %	0 %	0 %	532350857
10233	NC_022107	AAG	2	6	518723	518728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350857
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10235	NC_022107	TTC	2	6	518745	518750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350857
10236	NC_022107	ACTCCT	2	12	518779	518790	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532350857
10237	NC_022107	TGCAA	2	10	518841	518850	40 %	20 %	20 %	20 %	532350857
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10239	NC_022107	GCA	2	6	518981	518986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350857
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10241	NC_022107	TC	3	6	519008	519013	0 %	50 %	0 %	50 %	532350857
10242	NC_022107	TGT	2	6	519016	519021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350857
10243	NC_022107	ATC	2	6	519130	519135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350857
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10245	NC_022107	TAC	2	6	519171	519176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350857
10246	NC_022107	GAG	2	6	519217	519222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350857
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10282	NC_022107	GAT	2	6	520611	520616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350858
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10342	NC_022107	GAACT	2	10	524381	524390	40 %	20 %	20 %	20 %	532350859
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10345	NC_022107	CAT	3	9	525019	525027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350860
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10350	NC_022107	CT	3	6	525254	525259	0 %	50 %	0 %	50 %	532350860
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10354	NC_022107	A	7	7	525458	525464	100 %	0 %	0 %	0 %	532350860
10355	NC_022107	CAA	2	6	525674	525679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350860
10356	NC_022107	TAAA	2	8	525697	525704	75 %	25 %	0 %	0 %	532350860
10357	NC_022107	GTC	2	6	525763	525768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350861
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10360	NC_022107	CTT	2	6	525844	525849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350861
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10362	NC_022107	TTTC	2	8	525914	525921	0 %	75 %	0 %	25 %	532350861
10363	NC_022107	TTCT	2	8	526024	526031	0 %	75 %	0 %	25 %	532350861
10364	NC_022107	CTT	2	6	526032	526037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350861
10365	NC_022107	GTT	2	6	526107	526112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350861
10366	NC_022107	TCC	2	6	526148	526153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350861
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10476	NC_022107	AGCCAC	2	12	531469	531480	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	532351319
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10483	NC_022107	TGG	2	6	531733	531738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351319
10484	NC_022107	GTG	3	9	531768	531776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532351319
10485	NC_022107	AGC	4	12	531778	531789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532351319
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10487	NC_022107	TGC	3	9	531832	531840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532351319
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