MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022107	GCT	2	6	282701	282706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350665
5502	NC_022107	CCA	2	6	282733	282738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350665
5503	NC_022107	CT	3	6	282745	282750	0 %	50 %	0 %	50 %	532350665
5504	NC_022107	TAT	2	6	282764	282769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350665
5505	NC_022107	ACA	2	6	282778	282783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350665
5506	NC_022107	CT	3	6	282857	282862	0 %	50 %	0 %	50 %	532350665
5507	NC_022107	ATA	2	6	282900	282905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350665
5508	NC_022107	CT	3	6	282996	283001	0 %	50 %	0 %	50 %	532350665
5509	NC_022107	TCT	2	6	283036	283041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350665
5510	NC_022107	GTA	2	6	283128	283133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350665
5511	NC_022107	AC	3	6	283207	283212	50 %	0 %	0 %	50 %	532350665
5512	NC_022107	TCT	2	6	283213	283218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350665
5513	NC_022107	ATTC	2	8	283247	283254	25 %	50 %	0 %	25 %	532350665
5514	NC_022107	ATG	2	6	283274	283279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350665
5515	NC_022107	CTA	2	6	283370	283375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350665
5516	NC_022107	CTT	2	6	283433	283438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350665
5517	NC_022107	AAG	2	6	283505	283510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350665
5518	NC_022107	CAG	2	6	283551	283556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350665
5519	NC_022107	CTC	2	6	283605	283610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350665
5520	NC_022107	TAC	2	6	283629	283634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350665
5521	NC_022107	GCT	2	6	283679	283684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350665
5522	NC_022107	GAA	2	6	283725	283730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350665
5523	NC_022107	ATA	2	6	283772	283777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350665
5524	NC_022107	CGTT	2	8	283779	283786	0 %	50 %	25 %	25 %	532350665
5525	NC_022107	ATTC	2	8	283788	283795	25 %	50 %	0 %	25 %	532350665
5526	NC_022107	CAT	2	6	284107	284112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350666
5527	NC_022107	T	9	9	284112	284120	0 %	100 %	0 %	0 %	532350666
5528	NC_022107	TTC	2	6	284196	284201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350666
5529	NC_022107	GT	3	6	284220	284225	0 %	50 %	50 %	0 %	532350666
5530	NC_022107	CTG	2	6	284276	284281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350666
5531	NC_022107	CCA	2	6	284401	284406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350666
5532	NC_022107	A	6	6	284411	284416	100 %	0 %	0 %	0 %	532350666
5533	NC_022107	CAC	2	6	284592	284597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350666
5534	NC_022107	CCT	2	6	284626	284631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350666
5535	NC_022107	CTCC	2	8	284674	284681	0 %	25 %	0 %	75 %	532350666
5536	NC_022107	AAGC	2	8	284696	284703	50 %	0 %	25 %	25 %	532350666
5537	NC_022107	ATG	2	6	284713	284718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350666
5538	NC_022107	T	6	6	284769	284774	0 %	100 %	0 %	0 %	532350666
5539	NC_022107	CTC	2	6	284775	284780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350666
5540	NC_022107	GAT	2	6	284824	284829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350666
5541	NC_022107	A	7	7	284830	284836	100 %	0 %	0 %	0 %	532350666
5542	NC_022107	AG	3	6	284897	284902	50 %	0 %	50 %	0 %	532350666
5543	NC_022107	CTT	2	6	285200	285205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350667
5544	NC_022107	ACT	2	6	285229	285234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350667
5545	NC_022107	GCTGT	2	10	285242	285251	0 %	40 %	40 %	20 %	532350667
5546	NC_022107	GTC	2	6	285310	285315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350667
5547	NC_022107	T	6	6	285329	285334	0 %	100 %	0 %	0 %	532350667
5548	NC_022107	ACT	2	6	285357	285362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350667
5549	NC_022107	ACT	2	6	285426	285431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350667
5550	NC_022107	TGC	2	6	285462	285467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350667
5551	NC_022107	T	7	7	285472	285478	0 %	100 %	0 %	0 %	532350667
5552	NC_022107	CTCCTA	2	12	285479	285490	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	532350667
5553	NC_022107	AAC	2	6	285564	285569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350667
5554	NC_022107	TC	3	6	285679	285684	0 %	50 %	0 %	50 %	532350667
5555	NC_022107	ATC	2	6	285704	285709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350667
5556	NC_022107	TGGC	2	8	285714	285721	0 %	25 %	50 %	25 %	532350667
5557	NC_022107	TTCGA	2	10	285733	285742	20 %	40 %	20 %	20 %	532350667
5558	NC_022107	ATT	2	6	285768	285773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350667
5559	NC_022107	AG	3	6	285775	285780	50 %	0 %	50 %	0 %	532350667
5560	NC_022107	TTG	2	6	285782	285787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350667
5561	NC_022107	ACT	2	6	285815	285820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350667
5562	NC_022107	AT	3	6	285825	285830	50 %	50 %	0 %	0 %	532350667
5563	NC_022107	TTG	2	6	285857	285862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350668
5564	NC_022107	T	6	6	285889	285894	0 %	100 %	0 %	0 %	532350668
5565	NC_022107	CTTTT	2	10	286046	286055	0 %	80 %	0 %	20 %	532350668
5566	NC_022107	T	7	7	286052	286058	0 %	100 %	0 %	0 %	532350668
5567	NC_022107	GAA	2	6	286106	286111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350668
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5569	NC_022107	ATT	2	6	286200	286205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350668
5570	NC_022107	AAC	2	6	286235	286240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350668
5571	NC_022107	GAA	2	6	286264	286269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350668
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5573	NC_022107	T	6	6	286351	286356	0 %	100 %	0 %	0 %	532350668
5574	NC_022107	TTC	2	6	286375	286380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350668
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5578	NC_022107	TCTTT	2	10	286490	286499	0 %	80 %	0 %	20 %	532350668
5579	NC_022107	TTTA	2	8	286510	286517	25 %	75 %	0 %	0 %	532350668
5580	NC_022107	A	8	8	286598	286605	100 %	0 %	0 %	0 %	532350668
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5583	NC_022107	TTC	2	6	286846	286851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350669
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5585	NC_022107	CGA	2	6	286901	286906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350669
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5588	NC_022107	AGTA	2	8	286993	287000	50 %	25 %	25 %	0 %	532350669
5589	NC_022107	TA	3	6	287080	287085	50 %	50 %	0 %	0 %	532350669
5590	NC_022107	TTC	2	6	287182	287187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350669
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5593	NC_022107	CTT	2	6	287470	287475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350670
5594	NC_022107	A	6	6	287501	287506	100 %	0 %	0 %	0 %	532350670
5595	NC_022107	TCT	2	6	287569	287574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350670
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5599	NC_022107	GTC	2	6	287926	287931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350670
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5602	NC_022107	T	6	6	288001	288006	0 %	100 %	0 %	0 %	532350670
5603	NC_022107	ATG	2	6	288007	288012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350670
5604	NC_022107	TA	3	6	288034	288039	50 %	50 %	0 %	0 %	532350670
5605	NC_022107	GGT	2	6	288090	288095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350670
5606	NC_022107	CTT	2	6	288132	288137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350670
5607	NC_022107	GAA	2	6	288165	288170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350670
5608	NC_022107	ATC	2	6	288235	288240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350670
5609	NC_022107	TAT	2	6	288266	288271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350670
5610	NC_022107	TGA	2	6	288275	288280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350670
5611	NC_022107	TGA	2	6	288335	288340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350670
5612	NC_022107	CTCA	2	8	288376	288383	25 %	25 %	0 %	50 %	532350670
5613	NC_022107	TGT	2	6	288392	288397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350670
5614	NC_022107	TGC	2	6	288401	288406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350670
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5617	NC_022107	TA	3	6	288597	288602	50 %	50 %	0 %	0 %	532350670
5618	NC_022107	AACT	2	8	288618	288625	50 %	25 %	0 %	25 %	532350670
5619	NC_022107	CCT	2	6	288651	288656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350671
5620	NC_022107	ATG	2	6	288685	288690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350671
5621	NC_022107	A	6	6	288751	288756	100 %	0 %	0 %	0 %	532350671
5622	NC_022107	TTA	2	6	288776	288781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350671
5623	NC_022107	TCA	2	6	288850	288855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350671
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5742	NC_022107	A	6	6	294497	294502	100 %	0 %	0 %	0 %	532350677
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5744	NC_022107	AT	3	6	294549	294554	50 %	50 %	0 %	0 %	532350677
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5972	NC_022107	TC	3	6	305559	305564	0 %	50 %	0 %	50 %	532350687
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5975	NC_022107	A	6	6	305672	305677	100 %	0 %	0 %	0 %	532350687
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5990	NC_022107	A	6	6	306710	306715	100 %	0 %	0 %	0 %	532350689
5991	NC_022107	GTT	2	6	306770	306775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350689
5992	NC_022107	AGCTTA	2	12	306861	306872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	532350689
5993	NC_022107	TCCA	2	8	306907	306914	25 %	25 %	0 %	50 %	532350689
5994	NC_022107	TGC	2	6	306946	306951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350689
5995	NC_022107	TATT	2	8	306978	306985	25 %	75 %	0 %	0 %	532350689
5996	NC_022107	TGG	2	6	306988	306993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350689
5997	NC_022107	CAT	2	6	307049	307054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350689
5998	NC_022107	TTA	2	6	307092	307097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350689
5999	NC_022107	TCA	2	6	307108	307113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350689
6000	NC_022107	ATCG	2	8	307152	307159	25 %	25 %	25 %	25 %	532350689

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