MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/11-96

Total Repeats: 20455

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_022107	TTCG	2	8	256997	257004	0 %	50 %	25 %	25 %	532350645
5002	NC_022107	CTT	2	6	257033	257038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350645
5003	NC_022107	CTA	2	6	257069	257074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350645
5004	NC_022107	TC	3	6	257088	257093	0 %	50 %	0 %	50 %	532350645
5005	NC_022107	TTC	2	6	257196	257201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350645
5006	NC_022107	CTT	2	6	257204	257209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350645
5007	NC_022107	TC	3	6	257226	257231	0 %	50 %	0 %	50 %	532350645
5008	NC_022107	TCT	2	6	257288	257293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350645
5009	NC_022107	CAA	2	6	257349	257354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350645
5010	NC_022107	GTTTT	2	10	257361	257370	0 %	80 %	20 %	0 %	532350645
5011	NC_022107	TTA	2	6	257385	257390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350645
5012	NC_022107	CATT	2	8	257409	257416	25 %	50 %	0 %	25 %	532350645
5013	NC_022107	CAC	2	6	257419	257424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350645
5014	NC_022107	GCT	2	6	257504	257509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350645
5015	NC_022107	TCA	2	6	257552	257557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350645
5016	NC_022107	TCT	2	6	257587	257592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350645
5017	NC_022107	TTC	2	6	257601	257606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350645
5018	NC_022107	TGC	2	6	257660	257665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350645
5019	NC_022107	GTT	2	6	257666	257671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350645
5020	NC_022107	TAAT	2	8	257676	257683	50 %	50 %	0 %	0 %	532350645
5021	NC_022107	A	6	6	257684	257689	100 %	0 %	0 %	0 %	532350645
5022	NC_022107	AGA	2	6	257701	257706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532350645
5023	NC_022107	A	8	8	257927	257934	100 %	0 %	0 %	0 %	532350646
5024	NC_022107	TCA	2	6	257945	257950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350646
5025	NC_022107	ATTT	2	8	257959	257966	25 %	75 %	0 %	0 %	532350646
5026	NC_022107	GAT	2	6	257971	257976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350646
5027	NC_022107	GGC	2	6	258035	258040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350646
5028	NC_022107	TTC	2	6	258051	258056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350646
5029	NC_022107	ATT	2	6	258074	258079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350646
5030	NC_022107	CT	3	6	258107	258112	0 %	50 %	0 %	50 %	532350646
5031	NC_022107	AGG	2	6	258184	258189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350646
5032	NC_022107	TAC	2	6	258224	258229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350646
5033	NC_022107	CTT	2	6	258259	258264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350646
5034	NC_022107	TAA	2	6	258421	258426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350646
5035	NC_022107	CTT	3	9	258608	258616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350646
5036	NC_022107	AAAC	2	8	258638	258645	75 %	0 %	0 %	25 %	532350646
5037	NC_022107	AAT	2	6	258683	258688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350646
5038	NC_022107	TTTCT	2	10	258693	258702	0 %	80 %	0 %	20 %	532350646
5039	NC_022107	TTTA	2	8	258800	258807	25 %	75 %	0 %	0 %	532350646
5040	NC_022107	TC	3	6	258847	258852	0 %	50 %	0 %	50 %	532350646
5041	NC_022107	T	6	6	258857	258862	0 %	100 %	0 %	0 %	532350646
5042	NC_022107	TCT	3	9	258870	258878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350646
5043	NC_022107	GGC	2	6	258892	258897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532350646
5044	NC_022107	GAT	2	6	258907	258912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350646
5045	NC_022107	TCT	2	6	258925	258930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350646
5046	NC_022107	A	6	6	258959	258964	100 %	0 %	0 %	0 %	532350646
5047	NC_022107	TCT	2	6	258977	258982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350646
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5050	NC_022107	TATT	2	8	259093	259100	25 %	75 %	0 %	0 %	532350646
5051	NC_022107	ACTT	2	8	259175	259182	25 %	50 %	0 %	25 %	532350646
5052	NC_022107	TGG	2	6	259274	259279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350646
5053	NC_022107	TCTT	2	8	259344	259351	0 %	75 %	0 %	25 %	532350646
5054	NC_022107	AAC	2	6	259385	259390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350646
5055	NC_022107	A	6	6	259579	259584	100 %	0 %	0 %	0 %	532350647
5056	NC_022107	GCA	2	6	259627	259632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350647
5057	NC_022107	TCT	2	6	259674	259679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350647
5058	NC_022107	TGC	2	6	259680	259685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350647
5059	NC_022107	TTA	2	6	259750	259755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350647
5060	NC_022107	CTT	2	6	259756	259761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350647
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5063	NC_022107	CTT	2	6	260077	260082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350648
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5065	NC_022107	TGCAA	2	10	260113	260122	40 %	20 %	20 %	20 %	532350648
5066	NC_022107	AAC	2	6	260123	260128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350648
5067	NC_022107	A	6	6	260165	260170	100 %	0 %	0 %	0 %	532350648
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5071	NC_022107	CTGG	2	8	260321	260328	0 %	25 %	50 %	25 %	532350648
5072	NC_022107	TTG	2	6	260380	260385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350648
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5082	NC_022107	CT	3	6	260793	260798	0 %	50 %	0 %	50 %	532350649
5083	NC_022107	ACCTTT	2	12	260832	260843	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	532350649
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5105	NC_022107	TAT	2	6	261721	261726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350649
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5107	NC_022107	CACT	2	8	261766	261773	25 %	25 %	0 %	50 %	532350649
5108	NC_022107	TC	4	8	261796	261803	0 %	50 %	0 %	50 %	532350649
5109	NC_022107	ATGA	2	8	261851	261858	50 %	25 %	25 %	0 %	532350649
5110	NC_022107	A	6	6	261901	261906	100 %	0 %	0 %	0 %	532350649
5111	NC_022107	TTG	2	6	261944	261949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532350649
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5113	NC_022107	A	6	6	262039	262044	100 %	0 %	0 %	0 %	532350649
5114	NC_022107	AGC	2	6	262094	262099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350649
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5122	NC_022107	AC	3	6	262506	262511	50 %	0 %	0 %	50 %	532350649
5123	NC_022107	GTTC	2	8	262573	262580	0 %	50 %	25 %	25 %	532350649
5124	NC_022107	CT	3	6	262636	262641	0 %	50 %	0 %	50 %	532350649
5125	NC_022107	GCA	2	6	262715	262720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532350649
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5127	NC_022107	GCT	2	6	262787	262792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350649
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5157	NC_022107	TTC	3	9	264827	264835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532350652
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5232	NC_022107	GAGT	2	8	269233	269240	25 %	25 %	50 %	0 %	532350656
5233	NC_022107	TTAA	2	8	269265	269272	50 %	50 %	0 %	0 %	532350656
5234	NC_022107	ATG	2	6	269299	269304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350656
5235	NC_022107	AAGTGT	2	12	269402	269413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350656
5236	NC_022107	GTTC	2	8	269421	269428	0 %	50 %	25 %	25 %	532350656
5237	NC_022107	ATTT	2	8	269539	269546	25 %	75 %	0 %	0 %	532350656
5238	NC_022107	GGA	2	6	269547	269552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350656
5239	NC_022107	ATTT	2	8	269578	269585	25 %	75 %	0 %	0 %	532350656
5240	NC_022107	A	6	6	269604	269609	100 %	0 %	0 %	0 %	532350656
5241	NC_022107	GGT	2	6	269628	269633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532350656
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5245	NC_022107	ACC	2	6	269811	269816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532350656
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5247	NC_022107	TAA	2	6	269930	269935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350656
5248	NC_022107	CTA	2	6	269998	270003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532350656
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5250	NC_022107	TCTA	2	8	270084	270091	25 %	50 %	0 %	25 %	532350656
5251	NC_022107	TTA	2	6	270096	270101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532350656
5252	NC_022107	A	6	6	270105	270110	100 %	0 %	0 %	0 %	532350656
5253	NC_022107	AAC	3	9	270158	270166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532350656
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5261	NC_022107	ATG	2	6	270444	270449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532350656
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5361	NC_022107	A	6	6	275738	275743	100 %	0 %	0 %	0 %	532350661
5362	NC_022107	TGGT	2	8	275827	275834	0 %	50 %	50 %	0 %	532350661
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5371	NC_022107	CT	3	6	276155	276160	0 %	50 %	0 %	50 %	532350661
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5374	NC_022107	CTC	2	6	276216	276221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532350661
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5492	NC_022107	ATA	2	6	282131	282136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532350665
5493	NC_022107	TGC	2	6	282138	282143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532350665
5494	NC_022107	GGA	2	6	282367	282372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532350665
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