MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021898	AGC	2	6	210739	210744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327559
4002	NC_021898	CAT	2	6	210762	210767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327559
4003	NC_021898	AGA	2	6	210864	210869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327559
4004	NC_021898	CG	3	6	210967	210972	0 %	0 %	50 %	50 %	527327559
4005	NC_021898	CTGGAT	2	12	210999	211010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527327559
4006	NC_021898	GTA	2	6	211224	211229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327559
4007	NC_021898	ACC	2	6	211238	211243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327559
4008	NC_021898	CTTG	2	8	211266	211273	0 %	50 %	25 %	25 %	527327559
4009	NC_021898	GAAATA	2	12	211322	211333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	527327559
4010	NC_021898	AAC	2	6	211354	211359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327559
4011	NC_021898	CCA	2	6	211404	211409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327559
4012	NC_021898	CGT	2	6	211515	211520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327559
4013	NC_021898	TTTCT	2	10	211522	211531	0 %	80 %	0 %	20 %	527327559
4014	NC_021898	TAA	2	6	211551	211556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327560
4015	NC_021898	CTG	2	6	211589	211594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327560
4016	NC_021898	CTT	2	6	211719	211724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327560
4017	NC_021898	ACG	2	6	211857	211862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327560
4018	NC_021898	ACA	2	6	212105	212110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327561
4019	NC_021898	AATA	2	8	212150	212157	75 %	25 %	0 %	0 %	527327561
4020	NC_021898	CTT	2	6	212200	212205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327561
4021	NC_021898	CAG	2	6	212210	212215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327561
4022	NC_021898	TTG	2	6	212333	212338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327561
4023	NC_021898	TCC	2	6	212343	212348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327561
4024	NC_021898	AAG	2	6	212383	212388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327561
4025	NC_021898	CTT	2	6	212389	212394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327561
4026	NC_021898	CTT	2	6	212416	212421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327561
4027	NC_021898	CTG	2	6	212475	212480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327561
4028	NC_021898	CCA	2	6	212538	212543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327561
4029	NC_021898	CAAA	2	8	212558	212565	75 %	0 %	0 %	25 %	527327561
4030	NC_021898	CCA	2	6	212577	212582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327561
4031	NC_021898	GCA	2	6	212589	212594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327561
4032	NC_021898	CAA	2	6	212602	212607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327561
4033	NC_021898	TAC	2	6	212653	212658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327561
4034	NC_021898	CTT	2	6	212716	212721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327561
4035	NC_021898	TA	3	6	212842	212847	50 %	50 %	0 %	0 %	527327562
4036	NC_021898	ATG	2	6	212895	212900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327562
4037	NC_021898	TGT	2	6	212903	212908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327562
4038	NC_021898	GC	3	6	212968	212973	0 %	0 %	50 %	50 %	527327562
4039	NC_021898	AGA	2	6	213030	213035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327562
4040	NC_021898	ATT	2	6	213045	213050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327562
4041	NC_021898	CTG	2	6	213197	213202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327562
4042	NC_021898	CAC	2	6	213225	213230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327562
4043	NC_021898	TCT	2	6	213295	213300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327562
4044	NC_021898	C	6	6	213339	213344	0 %	0 %	0 %	100 %	527327562
4045	NC_021898	ATGA	2	8	213345	213352	50 %	25 %	25 %	0 %	527327562
4046	NC_021898	T	6	6	213379	213384	0 %	100 %	0 %	0 %	527327562
4047	NC_021898	GCA	2	6	213467	213472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327562
4048	NC_021898	GAA	2	6	213485	213490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327562
4049	NC_021898	GAAA	2	8	213538	213545	75 %	0 %	25 %	0 %	527327562
4050	NC_021898	TCA	2	6	213586	213591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327562
4051	NC_021898	ATG	2	6	213601	213606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327562
4052	NC_021898	TCC	2	6	213612	213617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327562
4053	NC_021898	T	6	6	213618	213623	0 %	100 %	0 %	0 %	527327562
4054	NC_021898	TAA	2	6	213698	213703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327562
4055	NC_021898	AGC	2	6	213744	213749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327562
4056	NC_021898	GAT	2	6	213779	213784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327562
4057	NC_021898	T	7	7	213921	213927	0 %	100 %	0 %	0 %	527327562
4058	NC_021898	AGA	2	6	214211	214216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327563
4059	NC_021898	AGT	2	6	214236	214241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327563
4060	NC_021898	CTC	2	6	214295	214300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327563
4061	NC_021898	AAC	2	6	214309	214314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327563
4062	NC_021898	ACA	2	6	214335	214340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327563
4063	NC_021898	TC	3	6	214412	214417	0 %	50 %	0 %	50 %	527327563
4064	NC_021898	TTC	2	6	214418	214423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4065	NC_021898	AAAG	2	8	214429	214436	75 %	0 %	25 %	0 %	527327563
4066	NC_021898	TAC	2	6	214451	214456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327563
4067	NC_021898	TGC	2	6	214469	214474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327563
4068	NC_021898	GAA	2	6	214518	214523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327563
4069	NC_021898	T	6	6	214553	214558	0 %	100 %	0 %	0 %	527327563
4070	NC_021898	TAA	2	6	214604	214609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327563
4071	NC_021898	TCT	2	6	214669	214674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4072	NC_021898	GTC	2	6	214675	214680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327563
4073	NC_021898	TCT	2	6	214714	214719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4074	NC_021898	TTC	2	6	214767	214772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4075	NC_021898	CTT	2	6	214823	214828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4076	NC_021898	AAT	2	6	214902	214907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327563
4077	NC_021898	ATT	2	6	214989	214994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327563
4078	NC_021898	CTT	2	6	215012	215017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4079	NC_021898	GTT	2	6	215023	215028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327563
4080	NC_021898	A	6	6	215043	215048	100 %	0 %	0 %	0 %	527327563
4081	NC_021898	TTCC	2	8	215077	215084	0 %	50 %	0 %	50 %	527327563
4082	NC_021898	TTC	2	6	215141	215146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4083	NC_021898	ATC	2	6	215166	215171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327563
4084	NC_021898	TAA	3	9	215276	215284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327563
4085	NC_021898	TA	3	6	215381	215386	50 %	50 %	0 %	0 %	527327563
4086	NC_021898	CTG	2	6	215423	215428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327563
4087	NC_021898	CTT	2	6	215444	215449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327563
4088	NC_021898	TCA	2	6	215467	215472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327563
4089	NC_021898	ATG	2	6	215979	215984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327564
4090	NC_021898	GAT	2	6	216037	216042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327564
4091	NC_021898	AGA	2	6	216056	216061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327564
4092	NC_021898	AAC	2	6	216081	216086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327564
4093	NC_021898	C	6	6	216127	216132	0 %	0 %	0 %	100 %	527327564
4094	NC_021898	T	7	7	216149	216155	0 %	100 %	0 %	0 %	527327564
4095	NC_021898	A	6	6	216159	216164	100 %	0 %	0 %	0 %	527327564
4096	NC_021898	CTC	2	6	216174	216179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327564
4097	NC_021898	CGAA	2	8	216181	216188	50 %	0 %	25 %	25 %	527327564
4098	NC_021898	ATT	2	6	216196	216201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327564
4099	NC_021898	GCT	2	6	216281	216286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327564
4100	NC_021898	CAA	2	6	216313	216318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327564
4101	NC_021898	AACA	2	8	216348	216355	75 %	0 %	0 %	25 %	527327564
4102	NC_021898	TGTC	2	8	216375	216382	0 %	50 %	25 %	25 %	527327564
4103	NC_021898	ACG	2	6	216494	216499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327564
4104	NC_021898	GGA	2	6	216524	216529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327564
4105	NC_021898	TCTA	2	8	216562	216569	25 %	50 %	0 %	25 %	527327564
4106	NC_021898	CTT	2	6	216624	216629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327564
4107	NC_021898	CA	3	6	216633	216638	50 %	0 %	0 %	50 %	527327564
4108	NC_021898	GA	3	6	216660	216665	50 %	0 %	50 %	0 %	527327564
4109	NC_021898	TCT	2	6	216678	216683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327564
4110	NC_021898	TAGC	2	8	216726	216733	25 %	25 %	25 %	25 %	527327564
4111	NC_021898	C	6	6	216733	216738	0 %	0 %	0 %	100 %	527327564
4112	NC_021898	AAATA	2	10	216742	216751	80 %	20 %	0 %	0 %	527327564
4113	NC_021898	GAA	2	6	216756	216761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327564
4114	NC_021898	ACA	2	6	216823	216828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327564
4115	NC_021898	ACA	2	6	216842	216847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327564
4116	NC_021898	ACA	2	6	216857	216862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327564
4117	NC_021898	TAA	2	6	216867	216872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327564
4118	NC_021898	AAG	3	9	216894	216902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327564
4119	NC_021898	AGG	2	6	217000	217005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327564
4120	NC_021898	CAA	2	6	217259	217264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327565
4121	NC_021898	CT	3	6	217281	217286	0 %	50 %	0 %	50 %	527327565
4122	NC_021898	GCT	2	6	217324	217329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327565
4123	NC_021898	T	7	7	217335	217341	0 %	100 %	0 %	0 %	527327565
4124	NC_021898	ATC	2	6	217343	217348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327565
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4126	NC_021898	ATT	2	6	217389	217394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327565
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4129	NC_021898	CT	3	6	217517	217522	0 %	50 %	0 %	50 %	527327565
4130	NC_021898	CTT	2	6	217754	217759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327566
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4135	NC_021898	CTAT	2	8	217906	217913	25 %	50 %	0 %	25 %	527327566
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4142	NC_021898	GCA	2	6	218371	218376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327566
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4149	NC_021898	AGG	2	6	218618	218623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327566
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4153	NC_021898	GAT	2	6	218754	218759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327567
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4158	NC_021898	A	6	6	218925	218930	100 %	0 %	0 %	0 %	527327567
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4163	NC_021898	T	6	6	219063	219068	0 %	100 %	0 %	0 %	527327567
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4228	NC_021898	TAT	2	6	221792	221797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327569
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4234	NC_021898	CTT	2	6	222062	222067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327569
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4237	NC_021898	GTC	2	6	222190	222195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327570
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4242	NC_021898	CAT	2	6	222508	222513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327570
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4245	NC_021898	ATT	2	6	222679	222684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527327570
4246	NC_021898	CTA	2	6	222775	222780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327570
4247	NC_021898	TCA	2	6	222782	222787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327570
4248	NC_021898	TG	3	6	222815	222820	0 %	50 %	50 %	0 %	527327570
4249	NC_021898	TCCTAG	2	12	222936	222947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	527327570
4250	NC_021898	CAA	2	6	222974	222979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327570
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4254	NC_021898	TCGA	2	8	223185	223192	25 %	25 %	25 %	25 %	527327571
4255	NC_021898	TCC	2	6	223202	223207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327571
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4260	NC_021898	AAG	2	6	223342	223347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327571
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4264	NC_021898	AATT	2	8	223471	223478	50 %	50 %	0 %	0 %	527327571
4265	NC_021898	ATTT	2	8	223534	223541	25 %	75 %	0 %	0 %	527327571
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4273	NC_021898	TGA	2	6	224212	224217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327572
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4351	NC_021898	A	6	6	228080	228085	100 %	0 %	0 %	0 %	527327575
4352	NC_021898	AAG	2	6	228176	228181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327575
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4360	NC_021898	AAG	2	6	228578	228583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327575
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4490	NC_021898	TCA	2	6	236247	236252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327580
4491	NC_021898	TCT	2	6	236274	236279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327580
4492	NC_021898	A	6	6	236365	236370	100 %	0 %	0 %	0 %	527327580
4493	NC_021898	AATCT	2	10	236460	236469	40 %	40 %	0 %	20 %	527327581
4494	NC_021898	TCA	2	6	236485	236490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327581
4495	NC_021898	CA	3	6	236502	236507	50 %	0 %	0 %	50 %	527327581
4496	NC_021898	ACT	2	6	236650	236655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327581
4497	NC_021898	AGAT	2	8	236664	236671	50 %	25 %	25 %	0 %	527327581
4498	NC_021898	CTT	2	6	236726	236731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327581
4499	NC_021898	CTG	2	6	236732	236737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327581
4500	NC_021898	T	6	6	236751	236756	0 %	100 %	0 %	0 %	527327581

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