MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/966

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021898	CT	3	6	511463	511468	0 %	50 %	0 %	50 %	527327827
10003	NC_021898	CTT	2	6	511647	511652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327827
10004	NC_021898	T	6	6	511651	511656	0 %	100 %	0 %	0 %	527327827
10005	NC_021898	A	6	6	511677	511682	100 %	0 %	0 %	0 %	527327827
10006	NC_021898	TTCT	2	8	511694	511701	0 %	75 %	0 %	25 %	527327827
10007	NC_021898	AGA	2	6	511730	511735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327827
10008	NC_021898	CCCA	2	8	511764	511771	25 %	0 %	0 %	75 %	527327827
10009	NC_021898	AGA	2	6	511784	511789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327827
10010	NC_021898	ATC	2	6	511855	511860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327827
10011	NC_021898	ACGAC	2	10	511940	511949	40 %	0 %	20 %	40 %	527327827
10012	NC_021898	CTCTT	2	10	512023	512032	0 %	60 %	0 %	40 %	527327827
10013	NC_021898	TCC	2	6	512077	512082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327827
10014	NC_021898	CCGC	2	8	512106	512113	0 %	0 %	25 %	75 %	527327827
10015	NC_021898	GAG	2	6	512130	512135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327827
10016	NC_021898	T	6	6	512185	512190	0 %	100 %	0 %	0 %	527327827
10017	NC_021898	CTC	2	6	512232	512237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327827
10018	NC_021898	CAC	2	6	512270	512275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527327827
10019	NC_021898	CTCTAT	2	12	512732	512743	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527327828
10020	NC_021898	TC	3	6	512798	512803	0 %	50 %	0 %	50 %	527327828
10021	NC_021898	CTTC	2	8	512835	512842	0 %	50 %	0 %	50 %	527327828
10022	NC_021898	TCT	2	6	512946	512951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327828
10023	NC_021898	AGT	2	6	513103	513108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327828
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10025	NC_021898	ATAG	2	8	513145	513152	50 %	25 %	25 %	0 %	527327828
10026	NC_021898	TCT	2	6	513227	513232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327828
10027	NC_021898	TGC	2	6	513233	513238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327828
10028	NC_021898	TGAACT	2	12	513239	513250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527327828
10029	NC_021898	TTG	2	6	513274	513279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327828
10030	NC_021898	CAA	2	6	513731	513736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327829
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10033	NC_021898	TAA	2	6	513905	513910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327829
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10037	NC_021898	ATCC	2	8	514025	514032	25 %	25 %	0 %	50 %	527327829
10038	NC_021898	CAT	2	6	514060	514065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327829
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10041	NC_021898	TCT	2	6	514125	514130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327829
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10043	NC_021898	GAA	2	6	514195	514200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327829
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10047	NC_021898	CAG	2	6	514450	514455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527327829
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10051	NC_021898	TC	3	6	514690	514695	0 %	50 %	0 %	50 %	527327829
10052	NC_021898	A	6	6	514743	514748	100 %	0 %	0 %	0 %	527327829
10053	NC_021898	AAG	2	6	514774	514779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327829
10054	NC_021898	CTG	2	6	514784	514789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327829
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10057	NC_021898	TGCAA	2	10	514892	514901	40 %	20 %	20 %	20 %	527327829
10058	NC_021898	CTG	2	6	514984	514989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327829
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10062	NC_021898	TGT	2	6	515067	515072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327829
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10065	NC_021898	GAG	2	6	515268	515273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527327829
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10085	NC_021898	AGCAC	2	10	515949	515958	40 %	0 %	20 %	40 %	527327831
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10093	NC_021898	TTG	2	6	516341	516346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327831
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10100	NC_021898	GAT	2	6	516662	516667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327831
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10105	NC_021898	GTA	2	6	516995	517000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527327831
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10107	NC_021898	GA	3	6	517044	517049	50 %	0 %	50 %	0 %	527327831
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10111	NC_021898	T	6	6	517293	517298	0 %	100 %	0 %	0 %	527327831
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10121	NC_021898	TAA	2	6	517973	517978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327831
10122	NC_021898	CCT	2	6	518019	518024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327831
10123	NC_021898	TCT	2	6	518206	518211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327831
10124	NC_021898	TAC	2	6	518222	518227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327831
10125	NC_021898	TGT	2	6	518412	518417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527327831
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10141	NC_021898	AAG	2	6	519343	519348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327831
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10152	NC_021898	CAA	2	6	520276	520281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327832
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10229	NC_021898	A	6	6	524552	524557	100 %	0 %	0 %	0 %	527327838
10230	NC_021898	CG	3	6	524563	524568	0 %	0 %	50 %	50 %	527327838
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10233	NC_021898	GCG	2	6	524730	524735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527327838
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10238	NC_021898	GAA	2	6	525075	525080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327838
10239	NC_021898	GA	3	6	525099	525104	50 %	0 %	50 %	0 %	527327838
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10360	NC_021898	GCT	2	6	529870	529875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527327840
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10481	NC_021898	C	6	6	535859	535864	0 %	0 %	0 %	100 %	527327847
10482	NC_021898	TAA	2	6	535913	535918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327847
10483	NC_021898	TTC	2	6	536116	536121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527327848
10484	NC_021898	GCGTA	2	10	536173	536182	20 %	20 %	40 %	20 %	527327848
10485	NC_021898	AGA	2	6	536191	536196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527327848
10486	NC_021898	ACA	2	6	536204	536209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527327848
10487	NC_021898	TTCC	2	8	536220	536227	0 %	50 %	0 %	50 %	527327848
10488	NC_021898	GA	3	6	536234	536239	50 %	0 %	50 %	0 %	527327848
10489	NC_021898	TCTA	2	8	536305	536312	25 %	50 %	0 %	25 %	527327848
10490	NC_021898	A	6	6	536312	536317	100 %	0 %	0 %	0 %	527327848
10491	NC_021898	TCCC	2	8	536378	536385	0 %	25 %	0 %	75 %	527327848
10492	NC_021898	AAT	2	6	536400	536405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327848
10493	NC_021898	AG	3	6	536416	536421	50 %	0 %	50 %	0 %	527327848
10494	NC_021898	ATAAA	2	10	536467	536476	80 %	20 %	0 %	0 %	527327848
10495	NC_021898	TAA	2	6	536491	536496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527327848
10496	NC_021898	A	6	6	536510	536515	100 %	0 %	0 %	0 %	527327848
10497	NC_021898	CTC	2	6	536646	536651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527327849
10498	NC_021898	CACAA	2	10	536732	536741	60 %	0 %	0 %	40 %	527327849
10499	NC_021898	CGCTC	2	10	536781	536790	0 %	20 %	20 %	60 %	527327849
10500	NC_021898	ACT	2	6	536833	536838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527327849

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