MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021896	GAA	2	6	661418	661423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326129
13002	NC_021896	TTA	2	6	661528	661533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326129
13003	NC_021896	GACA	2	8	661663	661670	50 %	0 %	25 %	25 %	527326130
13004	NC_021896	CTT	2	6	661686	661691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326130
13005	NC_021896	CTC	2	6	661714	661719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326130
13006	NC_021896	CTTT	3	12	661740	661751	0 %	75 %	0 %	25 %	527326130
13007	NC_021896	AAC	2	6	661769	661774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326130
13008	NC_021896	GAAAA	2	10	661824	661833	80 %	0 %	20 %	0 %	527326130
13009	NC_021896	T	6	6	661907	661912	0 %	100 %	0 %	0 %	527326130
13010	NC_021896	GAT	2	6	661931	661936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326130
13011	NC_021896	TTC	2	6	661973	661978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326130
13012	NC_021896	TA	3	6	662028	662033	50 %	50 %	0 %	0 %	527326130
13013	NC_021896	AACA	2	8	662232	662239	75 %	0 %	0 %	25 %	527326130
13014	NC_021896	TCT	2	6	662252	662257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326130
13015	NC_021896	TC	4	8	662325	662332	0 %	50 %	0 %	50 %	527326130
13016	NC_021896	CT	4	8	662350	662357	0 %	50 %	0 %	50 %	527326130
13017	NC_021896	CTT	2	6	662368	662373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326130
13018	NC_021896	ATT	2	6	662396	662401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326130
13019	NC_021896	GATGG	2	10	662582	662591	20 %	20 %	60 %	0 %	527326130
13020	NC_021896	CT	3	6	662595	662600	0 %	50 %	0 %	50 %	527326130
13021	NC_021896	TACTT	2	10	662741	662750	20 %	60 %	0 %	20 %	527326130
13022	NC_021896	CTG	2	6	662754	662759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326130
13023	NC_021896	AT	3	6	662786	662791	50 %	50 %	0 %	0 %	527326130
13024	NC_021896	TTA	2	6	662802	662807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326130
13025	NC_021896	TC	3	6	662825	662830	0 %	50 %	0 %	50 %	527326130
13026	NC_021896	TC	3	6	662868	662873	0 %	50 %	0 %	50 %	527326130
13027	NC_021896	AGG	2	6	662876	662881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326130
13028	NC_021896	ATT	2	6	662896	662901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326130
13029	NC_021896	AAC	2	6	662911	662916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326130
13030	NC_021896	GGTTG	2	10	662934	662943	0 %	40 %	60 %	0 %	527326130
13031	NC_021896	CTT	2	6	663004	663009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326130
13032	NC_021896	CT	3	6	663021	663026	0 %	50 %	0 %	50 %	527326130
13033	NC_021896	TGA	2	6	663104	663109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326130
13034	NC_021896	AAC	2	6	663110	663115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326130
13035	NC_021896	TTC	2	6	663164	663169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326130
13036	NC_021896	TCC	2	6	663203	663208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326130
13037	NC_021896	AAC	3	9	663253	663261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326130
13038	NC_021896	CAT	2	6	663308	663313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326130
13039	NC_021896	AAC	2	6	663398	663403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326130
13040	NC_021896	A	7	7	663484	663490	100 %	0 %	0 %	0 %	527326131
13041	NC_021896	TGG	2	6	663518	663523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527326131
13042	NC_021896	CCA	2	6	663613	663618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326131
13043	NC_021896	AAT	2	6	663625	663630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13044	NC_021896	AAG	2	6	663713	663718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326131
13045	NC_021896	AGC	2	6	663752	663757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326131
13046	NC_021896	TCT	2	6	663777	663782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326131
13047	NC_021896	TAA	2	6	663812	663817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13048	NC_021896	ATA	2	6	663850	663855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13049	NC_021896	TCT	2	6	663876	663881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326131
13050	NC_021896	GAA	2	6	663915	663920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326131
13051	NC_021896	AAG	2	6	663931	663936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326131
13052	NC_021896	CTG	2	6	663962	663967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326131
13053	NC_021896	CTA	2	6	664027	664032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326131
13054	NC_021896	TCA	2	6	664038	664043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326131
13055	NC_021896	GAAA	2	8	664057	664064	75 %	0 %	25 %	0 %	527326131
13056	NC_021896	GA	3	6	664101	664106	50 %	0 %	50 %	0 %	527326131
13057	NC_021896	TCA	2	6	664107	664112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326131
13058	NC_021896	TAA	2	6	664171	664176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13059	NC_021896	AT	3	6	664181	664186	50 %	50 %	0 %	0 %	527326131
13060	NC_021896	A	6	6	664215	664220	100 %	0 %	0 %	0 %	527326131
13061	NC_021896	CA	3	6	664239	664244	50 %	0 %	0 %	50 %	527326131
13062	NC_021896	TC	3	6	664245	664250	0 %	50 %	0 %	50 %	527326131
13063	NC_021896	GCT	3	9	664335	664343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326131
13064	NC_021896	A	6	6	664412	664417	100 %	0 %	0 %	0 %	527326131
13065	NC_021896	TGC	2	6	664418	664423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326131
13066	NC_021896	AAT	2	6	664483	664488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13067	NC_021896	CTA	2	6	664492	664497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326131
13068	NC_021896	TCC	2	6	664511	664516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326131
13069	NC_021896	CCT	2	6	664618	664623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326131
13070	NC_021896	A	6	6	664733	664738	100 %	0 %	0 %	0 %	527326131
13071	NC_021896	TTC	2	6	664760	664765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326131
13072	NC_021896	CTC	2	6	664800	664805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326131
13073	NC_021896	ATA	2	6	664816	664821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13074	NC_021896	CT	3	6	664862	664867	0 %	50 %	0 %	50 %	527326131
13075	NC_021896	T	7	7	664951	664957	0 %	100 %	0 %	0 %	527326131
13076	NC_021896	GCA	2	6	664971	664976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326131
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13079	NC_021896	TCA	3	9	665199	665207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326131
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13081	NC_021896	TTG	2	6	665245	665250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326131
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13086	NC_021896	GATA	2	8	665539	665546	50 %	25 %	25 %	0 %	527326131
13087	NC_021896	TAG	2	6	665558	665563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326131
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13093	NC_021896	AC	3	6	665709	665714	50 %	0 %	0 %	50 %	527326131
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13095	NC_021896	CGGAA	2	10	665729	665738	40 %	0 %	40 %	20 %	527326131
13096	NC_021896	TC	3	6	665740	665745	0 %	50 %	0 %	50 %	527326131
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13099	NC_021896	AAT	2	6	665886	665891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326131
13100	NC_021896	AAG	2	6	665986	665991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326131
13101	NC_021896	A	6	6	665996	666001	100 %	0 %	0 %	0 %	527326131
13102	NC_021896	ATC	2	6	666029	666034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326131
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13104	NC_021896	CTT	2	6	666166	666171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326131
13105	NC_021896	T	9	9	666213	666221	0 %	100 %	0 %	0 %	527326131
13106	NC_021896	CAC	2	6	666265	666270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527326131
13107	NC_021896	CCT	2	6	666277	666282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326131
13108	NC_021896	TTA	2	6	666303	666308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326131
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13110	NC_021896	AAT	2	6	666477	666482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326132
13111	NC_021896	CA	3	6	666563	666568	50 %	0 %	0 %	50 %	527326132
13112	NC_021896	CT	3	6	666627	666632	0 %	50 %	0 %	50 %	527326132
13113	NC_021896	TC	3	6	666640	666645	0 %	50 %	0 %	50 %	527326132
13114	NC_021896	T	6	6	666703	666708	0 %	100 %	0 %	0 %	527326132
13115	NC_021896	CTT	2	6	666784	666789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326132
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13117	NC_021896	ATCC	2	8	666834	666841	25 %	25 %	0 %	50 %	527326132
13118	NC_021896	TCT	2	6	666849	666854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326132
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13120	NC_021896	ACA	2	6	667047	667052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326132
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13122	NC_021896	CAT	2	6	667390	667395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326133
13123	NC_021896	TAA	2	6	667445	667450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326133
13124	NC_021896	GAA	2	6	667533	667538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326133
13125	NC_021896	T	7	7	667553	667559	0 %	100 %	0 %	0 %	527326133
13126	NC_021896	TTCT	2	8	667561	667568	0 %	75 %	0 %	25 %	527326133
13127	NC_021896	TTC	2	6	667595	667600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326133
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13132	NC_021896	TC	3	6	667702	667707	0 %	50 %	0 %	50 %	527326133
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13227	NC_021896	TCT	2	6	672245	672250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326137
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13234	NC_021896	AAC	2	6	672751	672756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326137
13235	NC_021896	TCC	2	6	672794	672799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326137
13236	NC_021896	CAAT	2	8	672897	672904	50 %	25 %	0 %	25 %	527326137
13237	NC_021896	TCT	2	6	672989	672994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326137
13238	NC_021896	AGCA	2	8	673022	673029	50 %	0 %	25 %	25 %	527326137
13239	NC_021896	A	6	6	673033	673038	100 %	0 %	0 %	0 %	527326137
13240	NC_021896	CAT	2	6	673235	673240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326138
13241	NC_021896	AAG	2	6	673252	673257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326138
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13492	NC_021896	A	6	6	684928	684933	100 %	0 %	0 %	0 %	527326152
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