MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021896	TCA	2	6	561362	561367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326027
11002	NC_021896	CAT	2	6	561442	561447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326027
11003	NC_021896	CA	3	6	561540	561545	50 %	0 %	0 %	50 %	527326027
11004	NC_021896	AAT	2	6	561574	561579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326027
11005	NC_021896	GAT	2	6	561591	561596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527326027
11006	NC_021896	C	6	6	561616	561621	0 %	0 %	0 %	100 %	527326027
11007	NC_021896	TCA	2	6	561623	561628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326027
11008	NC_021896	TAA	2	6	561689	561694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326027
11009	NC_021896	CGT	2	6	561726	561731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326027
11010	NC_021896	ATC	2	6	561790	561795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326027
11011	NC_021896	TCT	2	6	561803	561808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326027
11012	NC_021896	T	6	6	561895	561900	0 %	100 %	0 %	0 %	527326027
11013	NC_021896	ATCA	2	8	561964	561971	50 %	25 %	0 %	25 %	527326027
11014	NC_021896	CTA	2	6	562077	562082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326027
11015	NC_021896	A	6	6	562127	562132	100 %	0 %	0 %	0 %	527326027
11016	NC_021896	AGA	2	6	562160	562165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326027
11017	NC_021896	AGGTA	2	10	562302	562311	40 %	20 %	40 %	0 %	527326027
11018	NC_021896	CAA	2	6	562418	562423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326027
11019	NC_021896	CTC	2	6	562449	562454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326027
11020	NC_021896	CTT	2	6	562518	562523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326027
11021	NC_021896	CGTC	2	8	562525	562532	0 %	25 %	25 %	50 %	527326027
11022	NC_021896	TTG	2	6	562750	562755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326028
11023	NC_021896	TTC	2	6	562777	562782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326028
11024	NC_021896	CCT	2	6	562791	562796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326028
11025	NC_021896	AAAG	2	8	562851	562858	75 %	0 %	25 %	0 %	527326028
11026	NC_021896	CTA	2	6	562899	562904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326028
11027	NC_021896	ATC	2	6	562956	562961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326028
11028	NC_021896	AAC	2	6	563104	563109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326029
11029	NC_021896	ACA	2	6	563138	563143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326029
11030	NC_021896	TTC	2	6	563145	563150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326029
11031	NC_021896	ATCA	2	8	563286	563293	50 %	25 %	0 %	25 %	527326029
11032	NC_021896	TCC	2	6	563319	563324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326029
11033	NC_021896	GAA	2	6	563349	563354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326029
11034	NC_021896	GTT	2	6	563546	563551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326029
11035	NC_021896	CGA	2	6	563567	563572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326029
11036	NC_021896	TCA	2	6	563620	563625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326029
11037	NC_021896	ATT	2	6	563655	563660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326029
11038	NC_021896	GAG	2	6	563711	563716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527326029
11039	NC_021896	T	6	6	563964	563969	0 %	100 %	0 %	0 %	527326029
11040	NC_021896	ACG	2	6	563979	563984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326029
11041	NC_021896	TCT	2	6	564010	564015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326029
11042	NC_021896	GGAA	2	8	564018	564025	50 %	0 %	50 %	0 %	527326029
11043	NC_021896	TCA	2	6	564103	564108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326029
11044	NC_021896	TTTC	2	8	564266	564273	0 %	75 %	0 %	25 %	527326029
11045	NC_021896	TCT	2	6	564274	564279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326029
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11048	NC_021896	CGA	2	6	564429	564434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326030
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11050	NC_021896	ATT	2	6	564452	564457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326030
11051	NC_021896	T	6	6	564484	564489	0 %	100 %	0 %	0 %	527326030
11052	NC_021896	AGA	2	6	564497	564502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326030
11053	NC_021896	T	7	7	564547	564553	0 %	100 %	0 %	0 %	527326030
11054	NC_021896	ACA	2	6	564634	564639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326030
11055	NC_021896	CAA	2	6	564703	564708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326030
11056	NC_021896	AC	3	6	564713	564718	50 %	0 %	0 %	50 %	527326030
11057	NC_021896	TCT	2	6	564735	564740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326030
11058	NC_021896	CTA	2	6	564792	564797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326030
11059	NC_021896	T	6	6	565004	565009	0 %	100 %	0 %	0 %	527326031
11060	NC_021896	ACAG	2	8	565037	565044	50 %	0 %	25 %	25 %	527326031
11061	NC_021896	TTC	2	6	565096	565101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326031
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11063	NC_021896	AAT	2	6	565139	565144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326031
11064	NC_021896	TTAA	2	8	565202	565209	50 %	50 %	0 %	0 %	527326031
11065	NC_021896	GCA	2	6	565214	565219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326031
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11067	NC_021896	CT	3	6	565303	565308	0 %	50 %	0 %	50 %	527326031
11068	NC_021896	TAA	2	6	565362	565367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326031
11069	NC_021896	CTG	2	6	565371	565376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326031
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11071	NC_021896	CT	3	6	565593	565598	0 %	50 %	0 %	50 %	527326031
11072	NC_021896	AAT	2	6	565650	565655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527326031
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11080	NC_021896	TCT	2	6	566204	566209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326031
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11083	NC_021896	A	7	7	566328	566334	100 %	0 %	0 %	0 %	527326031
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11086	NC_021896	CACT	2	8	566397	566404	25 %	25 %	0 %	50 %	527326031
11087	NC_021896	CTG	2	6	566427	566432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326031
11088	NC_021896	A	6	6	566494	566499	100 %	0 %	0 %	0 %	527326031
11089	NC_021896	A	6	6	566518	566523	100 %	0 %	0 %	0 %	527326031
11090	NC_021896	AAGCA	2	10	566530	566539	60 %	0 %	20 %	20 %	527326031
11091	NC_021896	TA	3	6	566563	566568	50 %	50 %	0 %	0 %	527326031
11092	NC_021896	AAG	2	6	566613	566618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527326031
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11100	NC_021896	GCT	2	6	567160	567165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326031
11101	NC_021896	AC	3	6	567202	567207	50 %	0 %	0 %	50 %	527326031
11102	NC_021896	T	6	6	567229	567234	0 %	100 %	0 %	0 %	527326031
11103	NC_021896	CAT	2	6	567252	567257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326031
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11105	NC_021896	TTA	2	6	567401	567406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527326031
11106	NC_021896	GA	3	6	567441	567446	50 %	0 %	50 %	0 %	527326031
11107	NC_021896	T	6	6	567580	567585	0 %	100 %	0 %	0 %	527326031
11108	NC_021896	TTG	2	6	567629	567634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527326032
11109	NC_021896	A	6	6	567711	567716	100 %	0 %	0 %	0 %	527326032
11110	NC_021896	AACCC	2	10	567724	567733	40 %	0 %	0 %	60 %	527326032
11111	NC_021896	TTC	2	6	567776	567781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326032
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11116	NC_021896	AATA	2	8	567845	567852	75 %	25 %	0 %	0 %	527326032
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11122	NC_021896	TTC	2	6	568215	568220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527326032
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11243	NC_021896	CTG	2	6	573455	573460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326038
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11484	NC_021896	AGC	2	6	585026	585031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326052
11485	NC_021896	AAACT	2	10	585129	585138	60 %	20 %	0 %	20 %	527326052
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11487	NC_021896	AAC	2	6	585152	585157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326052
11488	NC_021896	ACA	2	6	585161	585166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326052
11489	NC_021896	GAC	2	6	585173	585178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326052
11490	NC_021896	CT	3	6	585265	585270	0 %	50 %	0 %	50 %	527326053
11491	NC_021896	CTA	2	6	585291	585296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326053
11492	NC_021896	CTC	2	6	585315	585320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527326053
11493	NC_021896	AAC	2	6	585328	585333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527326053
11494	NC_021896	T	6	6	585401	585406	0 %	100 %	0 %	0 %	527326053
11495	NC_021896	AAAT	2	8	585447	585454	75 %	25 %	0 %	0 %	527326053
11496	NC_021896	CAT	2	6	585474	585479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527326053
11497	NC_021896	TA	3	6	585600	585605	50 %	50 %	0 %	0 %	527326053
11498	NC_021896	T	6	6	585643	585648	0 %	100 %	0 %	0 %	527326054
11499	NC_021896	GCT	2	6	585659	585664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527326054
11500	NC_021896	ACG	2	6	585676	585681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527326054

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