MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/943

Total Repeats: 20313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021896	AGA	2	6	511212	511217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325978
10003	NC_021896	CTT	2	6	511237	511242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325978
10004	NC_021896	ACA	2	6	511266	511271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325978
10005	NC_021896	CTC	2	6	511312	511317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325978
10006	NC_021896	AAG	2	6	511346	511351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325978
10007	NC_021896	AG	3	6	511398	511403	50 %	0 %	50 %	0 %	527325978
10008	NC_021896	GAA	2	6	511404	511409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325978
10009	NC_021896	CT	3	6	511463	511468	0 %	50 %	0 %	50 %	527325978
10010	NC_021896	CTT	2	6	511647	511652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325978
10011	NC_021896	T	6	6	511651	511656	0 %	100 %	0 %	0 %	527325978
10012	NC_021896	A	6	6	511677	511682	100 %	0 %	0 %	0 %	527325978
10013	NC_021896	TTCT	2	8	511694	511701	0 %	75 %	0 %	25 %	527325978
10014	NC_021896	AGA	2	6	511730	511735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325978
10015	NC_021896	CCCA	2	8	511764	511771	25 %	0 %	0 %	75 %	527325978
10016	NC_021896	AGA	2	6	511784	511789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325978
10017	NC_021896	ATC	2	6	511855	511860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325978
10018	NC_021896	CTCTT	2	10	512023	512032	0 %	60 %	0 %	40 %	527325978
10019	NC_021896	TCC	2	6	512077	512082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325978
10020	NC_021896	CCGC	2	8	512106	512113	0 %	0 %	25 %	75 %	527325978
10021	NC_021896	GAG	2	6	512130	512135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527325978
10022	NC_021896	T	6	6	512185	512190	0 %	100 %	0 %	0 %	527325978
10023	NC_021896	CTC	2	6	512232	512237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527325978
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10027	NC_021896	CTTC	2	8	512836	512843	0 %	50 %	0 %	50 %	527325979
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10029	NC_021896	AGT	2	6	513104	513109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325979
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10032	NC_021896	TCT	2	6	513228	513233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325979
10033	NC_021896	TGC	2	6	513234	513239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325979
10034	NC_021896	TGAACT	2	12	513240	513251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527325979
10035	NC_021896	TTG	2	6	513275	513280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527325979
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10044	NC_021896	CAT	2	6	514062	514067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527325980
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10053	NC_021896	CAG	2	6	514452	514457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325980
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10055	NC_021896	CGA	2	6	514585	514590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325980
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10057	NC_021896	TC	3	6	514692	514697	0 %	50 %	0 %	50 %	527325980
10058	NC_021896	A	6	6	514745	514750	100 %	0 %	0 %	0 %	527325980
10059	NC_021896	AAG	2	6	514776	514781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325980
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10062	NC_021896	ACTCCT	2	12	514832	514843	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527325980
10063	NC_021896	CTG	2	6	514986	514991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325980
10064	NC_021896	GCA	2	6	515034	515039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325980
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10088	NC_021896	TTGC	2	8	515901	515908	0 %	50 %	25 %	25 %	527325982
10089	NC_021896	AATC	2	8	515910	515917	50 %	25 %	0 %	25 %	527325982
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10104	NC_021896	TC	4	8	516585	516592	0 %	50 %	0 %	50 %	527325982
10105	NC_021896	GAT	2	6	516664	516669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325982
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10110	NC_021896	GTA	2	6	516997	517002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527325982
10111	NC_021896	CAACA	2	10	517036	517045	60 %	0 %	0 %	40 %	527325982
10112	NC_021896	GA	3	6	517046	517051	50 %	0 %	50 %	0 %	527325982
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10115	NC_021896	T	6	6	517295	517300	0 %	100 %	0 %	0 %	527325982
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10121	NC_021896	CTT	2	6	517772	517777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325982
10122	NC_021896	AGA	2	6	517837	517842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325982
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10234	NC_021896	CG	3	6	524566	524571	0 %	0 %	50 %	50 %	527325989
10235	NC_021896	AGA	2	6	524578	524583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325989
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10361	NC_021896	GAC	2	6	530186	530191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325991
10362	NC_021896	AGC	3	9	530224	530232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527325991
10363	NC_021896	AAC	2	6	530236	530241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325991
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10367	NC_021896	TAA	2	6	530483	530488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527325992
10368	NC_021896	AAG	2	6	530532	530537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527325992
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10370	NC_021896	TCG	2	6	530547	530552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527325992
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10372	NC_021896	TA	3	6	530653	530658	50 %	50 %	0 %	0 %	527325992
10373	NC_021896	CAA	2	6	530752	530757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325992
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10375	NC_021896	CTT	2	6	530797	530802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325992
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10380	NC_021896	A	6	6	530971	530976	100 %	0 %	0 %	0 %	527325992
10381	NC_021896	CT	3	6	531239	531244	0 %	50 %	0 %	50 %	527325993
10382	NC_021896	TCT	2	6	531290	531295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325993
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10395	NC_021896	CTAT	2	8	531912	531919	25 %	50 %	0 %	25 %	527325994
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10480	NC_021896	TTC	2	6	536127	536132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527325999
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10483	NC_021896	ACA	2	6	536215	536220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527325999
10484	NC_021896	TTCC	2	8	536231	536238	0 %	50 %	0 %	50 %	527325999
10485	NC_021896	GA	3	6	536245	536250	50 %	0 %	50 %	0 %	527325999
10486	NC_021896	TCTA	2	8	536316	536323	25 %	50 %	0 %	25 %	527325999
10487	NC_021896	A	6	6	536323	536328	100 %	0 %	0 %	0 %	527325999
10488	NC_021896	TCCC	2	8	536389	536396	0 %	25 %	0 %	75 %	527325999
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10490	NC_021896	AG	3	6	536427	536432	50 %	0 %	50 %	0 %	527325999
10491	NC_021896	ATAAA	2	10	536478	536487	80 %	20 %	0 %	0 %	527325999
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