MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_021892	AGA	2	6	689211	689216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323135
13503	NC_021892	A	6	6	689238	689243	100 %	0 %	0 %	0 %	527323135
13504	NC_021892	ATT	2	6	689256	689261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323135
13505	NC_021892	AGA	2	6	689313	689318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323135
13506	NC_021892	GAA	2	6	689434	689439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323135
13507	NC_021892	CTT	2	6	689443	689448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323135
13508	NC_021892	GAACG	2	10	689573	689582	40 %	0 %	40 %	20 %	527323135
13509	NC_021892	CAG	2	6	689595	689600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323135
13510	NC_021892	TTA	2	6	689603	689608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323135
13511	NC_021892	GCATCA	2	12	689652	689663	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	527323136
13512	NC_021892	TCC	2	6	689805	689810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323136
13513	NC_021892	CTT	2	6	689875	689880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323136
13514	NC_021892	CAA	2	6	690043	690048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323136
13515	NC_021892	CTA	2	6	690100	690105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323136
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13517	NC_021892	TAT	2	6	690135	690140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323136
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13521	NC_021892	C	6	6	690291	690296	0 %	0 %	0 %	100 %	527323136
13522	NC_021892	CTT	2	6	690341	690346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323136
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13529	NC_021892	GAA	2	6	690499	690504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323136
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13532	NC_021892	A	6	6	690559	690564	100 %	0 %	0 %	0 %	527323136
13533	NC_021892	CT	4	8	690610	690617	0 %	50 %	0 %	50 %	527323136
13534	NC_021892	ATA	2	6	690647	690652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323136
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13537	NC_021892	ACG	2	6	690840	690845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323136
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13543	NC_021892	A	6	6	691105	691110	100 %	0 %	0 %	0 %	527323137
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13552	NC_021892	ATC	2	6	691560	691565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323137
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13555	NC_021892	AAT	2	6	691713	691718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323137
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13557	NC_021892	CAT	2	6	691755	691760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323137
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13559	NC_021892	A	6	6	691791	691796	100 %	0 %	0 %	0 %	527323138
13560	NC_021892	ACAA	2	8	691931	691938	75 %	0 %	0 %	25 %	527323138
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13569	NC_021892	AT	3	6	692264	692269	50 %	50 %	0 %	0 %	527323138
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13600	NC_021892	CCGCT	2	10	693527	693536	0 %	20 %	20 %	60 %	527323140
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13609	NC_021892	AGAA	2	8	693884	693891	75 %	0 %	25 %	0 %	527323140
13610	NC_021892	ATCAAT	2	12	693977	693988	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527323140
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13617	NC_021892	CT	3	6	694294	694299	0 %	50 %	0 %	50 %	527323141
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13984	NC_021892	GCT	2	6	713156	713161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323152
13985	NC_021892	GGA	2	6	713162	713167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527323152
13986	NC_021892	ACC	2	6	713207	713212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527323152
13987	NC_021892	CGA	2	6	713249	713254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323152
13988	NC_021892	TGG	2	6	713271	713276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527323152
13989	NC_021892	TGAA	2	8	713295	713302	50 %	25 %	25 %	0 %	527323152
13990	NC_021892	CAT	2	6	713317	713322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323152
13991	NC_021892	A	6	6	713376	713381	100 %	0 %	0 %	0 %	527323152
13992	NC_021892	GT	3	6	713387	713392	0 %	50 %	50 %	0 %	527323152
13993	NC_021892	AGC	2	6	713455	713460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323152
13994	NC_021892	AAAG	2	8	713474	713481	75 %	0 %	25 %	0 %	527323152
13995	NC_021892	C	6	6	713520	713525	0 %	0 %	0 %	100 %	527323152
13996	NC_021892	TCC	2	6	713539	713544	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323152
13997	NC_021892	TTG	2	6	713547	713552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323152
13998	NC_021892	CTT	2	6	713555	713560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323152
13999	NC_021892	AAC	2	6	713563	713568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323152
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