MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_021892	TC	3	6	565281	565286	0 %	50 %	0 %	50 %	527323008
11003	NC_021892	T	6	6	565300	565305	0 %	100 %	0 %	0 %	527323008
11004	NC_021892	CCCA	2	8	565314	565321	25 %	0 %	0 %	75 %	527323008
11005	NC_021892	CT	3	6	565484	565489	0 %	50 %	0 %	50 %	527323009
11006	NC_021892	GAT	2	6	565530	565535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323009
11007	NC_021892	AAC	2	6	565548	565553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323009
11008	NC_021892	CAG	2	6	565624	565629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323009
11009	NC_021892	TCA	2	6	565633	565638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323009
11010	NC_021892	CAT	2	6	565713	565718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323009
11011	NC_021892	CA	3	6	565811	565816	50 %	0 %	0 %	50 %	527323009
11012	NC_021892	AAT	2	6	565845	565850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323009
11013	NC_021892	GAT	2	6	565862	565867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527323009
11014	NC_021892	C	6	6	565887	565892	0 %	0 %	0 %	100 %	527323009
11015	NC_021892	TCA	2	6	565894	565899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323009
11016	NC_021892	TAA	2	6	565960	565965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527323009
11017	NC_021892	CGT	2	6	565997	566002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323009
11018	NC_021892	ATC	2	6	566061	566066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323009
11019	NC_021892	TCT	2	6	566074	566079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323009
11020	NC_021892	T	6	6	566166	566171	0 %	100 %	0 %	0 %	527323009
11021	NC_021892	ATCA	2	8	566235	566242	50 %	25 %	0 %	25 %	527323009
11022	NC_021892	CTA	2	6	566348	566353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323009
11023	NC_021892	A	6	6	566398	566403	100 %	0 %	0 %	0 %	527323009
11024	NC_021892	AGA	2	6	566431	566436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323009
11025	NC_021892	AGGTA	2	10	566573	566582	40 %	20 %	40 %	0 %	527323009
11026	NC_021892	CAA	2	6	566689	566694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323009
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11028	NC_021892	CTT	2	6	566789	566794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323009
11029	NC_021892	CGTC	2	8	566796	566803	0 %	25 %	25 %	50 %	527323009
11030	NC_021892	TTG	2	6	567022	567027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527323010
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11032	NC_021892	AAAG	2	8	567123	567130	75 %	0 %	25 %	0 %	527323010
11033	NC_021892	CTA	2	6	567171	567176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323010
11034	NC_021892	ATC	2	6	567228	567233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323010
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11039	NC_021892	TCC	2	6	567591	567596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323011
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11050	NC_021892	TCA	2	6	568375	568380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323011
11051	NC_021892	TTTC	2	8	568538	568545	0 %	75 %	0 %	25 %	527323011
11052	NC_021892	TCT	2	6	568546	568551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323011
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11055	NC_021892	CGA	2	6	568701	568706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323012
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11058	NC_021892	T	6	6	568756	568761	0 %	100 %	0 %	0 %	527323012
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11060	NC_021892	T	7	7	568819	568825	0 %	100 %	0 %	0 %	527323012
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11064	NC_021892	TCT	2	6	569007	569012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323012
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11093	NC_021892	CACT	2	8	570669	570676	25 %	25 %	0 %	50 %	527323013
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11102	NC_021892	TGC	2	6	571043	571048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527323013
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11106	NC_021892	AACT	2	8	571228	571235	50 %	25 %	0 %	25 %	527323013
11107	NC_021892	GAA	2	6	571313	571318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527323013
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11109	NC_021892	AC	3	6	571474	571479	50 %	0 %	0 %	50 %	527323013
11110	NC_021892	T	6	6	571501	571506	0 %	100 %	0 %	0 %	527323013
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11118	NC_021892	AACCC	2	10	571996	572005	40 %	0 %	0 %	60 %	527323014
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11122	NC_021892	CTT	2	6	572095	572100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527323014
11123	NC_021892	GCTT	2	8	572106	572113	0 %	50 %	25 %	25 %	527323014
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11488	NC_021892	ATT	2	6	589099	589104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527323035
11489	NC_021892	CAT	2	6	589224	589229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323035
11490	NC_021892	TCC	2	6	589258	589263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323035
11491	NC_021892	T	6	6	589289	589294	0 %	100 %	0 %	0 %	527323035
11492	NC_021892	AGC	2	6	589297	589302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323035
11493	NC_021892	AAACT	2	10	589400	589409	60 %	20 %	0 %	20 %	527323035
11494	NC_021892	CCT	2	6	589415	589420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323035
11495	NC_021892	AAC	2	6	589423	589428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323035
11496	NC_021892	ACA	2	6	589432	589437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527323035
11497	NC_021892	GAC	2	6	589444	589449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527323035
11498	NC_021892	CT	3	6	589536	589541	0 %	50 %	0 %	50 %	527323036
11499	NC_021892	CTA	2	6	589562	589567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527323036
11500	NC_021892	CTC	2	6	589586	589591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527323036

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