MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis J/6276tet1

Total Repeats: 20968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021892	CTT	2	6	515445	515450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322959
10003	NC_021892	ATG	2	6	515451	515456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322959
10004	NC_021892	AGA	2	6	515495	515500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322959
10005	NC_021892	CTT	2	6	515520	515525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322959
10006	NC_021892	ACA	2	6	515549	515554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322959
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10008	NC_021892	AAG	2	6	515629	515634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322959
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10010	NC_021892	GAA	2	6	515687	515692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322959
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10012	NC_021892	CTT	2	6	515930	515935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322959
10013	NC_021892	T	6	6	515934	515939	0 %	100 %	0 %	0 %	527322959
10014	NC_021892	A	6	6	515960	515965	100 %	0 %	0 %	0 %	527322959
10015	NC_021892	TTCT	2	8	515977	515984	0 %	75 %	0 %	25 %	527322959
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10017	NC_021892	CCCA	2	8	516047	516054	25 %	0 %	0 %	75 %	527322959
10018	NC_021892	AGA	2	6	516067	516072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322959
10019	NC_021892	ATC	2	6	516138	516143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322959
10020	NC_021892	CTCTT	2	10	516306	516315	0 %	60 %	0 %	40 %	527322959
10021	NC_021892	TCC	2	6	516360	516365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322959
10022	NC_021892	CCGC	2	8	516389	516396	0 %	0 %	25 %	75 %	527322959
10023	NC_021892	GAG	2	6	516413	516418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322959
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10025	NC_021892	CTC	2	6	516515	516520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527322959
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10029	NC_021892	CTTC	2	8	517119	517126	0 %	50 %	0 %	50 %	527322960
10030	NC_021892	TCT	2	6	517230	517235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322960
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10034	NC_021892	TCT	2	6	517511	517516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322960
10035	NC_021892	TGC	2	6	517517	517522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322960
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10041	NC_021892	TAA	2	6	518190	518195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322961
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10045	NC_021892	ATCC	2	8	518310	518317	25 %	25 %	0 %	50 %	527322961
10046	NC_021892	CAT	2	6	518345	518350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322961
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10053	NC_021892	AAT	2	6	518550	518555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322961
10054	NC_021892	AAT	2	6	518595	518600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322961
10055	NC_021892	CAG	2	6	518735	518740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322961
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10057	NC_021892	CGA	2	6	518868	518873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322961
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10059	NC_021892	TC	3	6	518975	518980	0 %	50 %	0 %	50 %	527322961
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10061	NC_021892	AAG	2	6	519059	519064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322961
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10065	NC_021892	CTG	2	6	519269	519274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322961
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10091	NC_021892	AATC	2	8	520193	520200	50 %	25 %	0 %	25 %	527322963
10092	NC_021892	AGCAC	2	10	520234	520243	40 %	0 %	20 %	40 %	527322963
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10103	NC_021892	ACT	2	6	520780	520785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322963
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10106	NC_021892	TC	4	8	520868	520875	0 %	50 %	0 %	50 %	527322963
10107	NC_021892	GAT	2	6	520947	520952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322963
10108	NC_021892	CAG	2	6	520995	521000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322963
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10110	NC_021892	ATA	2	6	521167	521172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527322963
10111	NC_021892	CAG	2	6	521241	521246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322963
10112	NC_021892	GTA	2	6	521280	521285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322963
10113	NC_021892	CAACA	2	10	521319	521328	60 %	0 %	0 %	40 %	527322963
10114	NC_021892	GA	3	6	521329	521334	50 %	0 %	50 %	0 %	527322963
10115	NC_021892	CTT	2	6	521378	521383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322963
10116	NC_021892	CTCC	2	8	521557	521564	0 %	25 %	0 %	75 %	527322963
10117	NC_021892	T	6	6	521578	521583	0 %	100 %	0 %	0 %	527322963
10118	NC_021892	CTT	2	6	521597	521602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322963
10119	NC_021892	TTG	2	6	521631	521636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322963
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10121	NC_021892	AAG	2	6	521840	521845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322963
10122	NC_021892	GAG	2	6	521978	521983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322963
10123	NC_021892	CTT	2	6	522055	522060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322963
10124	NC_021892	AGA	2	6	522120	522125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322963
10125	NC_021892	CTG	2	6	522131	522136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322963
10126	NC_021892	TCA	2	6	522223	522228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322963
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10130	NC_021892	TAC	2	6	522507	522512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322963
10131	NC_021892	TGT	2	6	522697	522702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322963
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10143	NC_021892	TGT	2	6	523333	523338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322963
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10145	NC_021892	TTG	2	6	523547	523552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527322963
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10147	NC_021892	AAG	2	6	523628	523633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322963
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10152	NC_021892	TCT	2	6	523765	523770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322963
10153	NC_021892	TGC	2	6	523813	523818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322963
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10158	NC_021892	CAA	2	6	524561	524566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322964
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10164	NC_021892	CAT	3	9	525346	525354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322965
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10229	NC_021892	TGC	2	6	528588	528593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322970
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10237	NC_021892	AGA	2	6	528861	528866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322970
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10239	NC_021892	GCG	2	6	529016	529021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	527322970
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10241	NC_021892	CAA	2	6	529207	529212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322970
10242	NC_021892	AGC	2	6	529290	529295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322970
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10343	NC_021892	TCTCC	2	10	533729	533738	0 %	40 %	0 %	60 %	527322972
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10345	NC_021892	CGTA	2	8	533808	533815	25 %	25 %	25 %	25 %	527322972
10346	NC_021892	TGG	2	6	533847	533852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322972
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10350	NC_021892	ACT	2	6	534006	534011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322972
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10352	NC_021892	ACA	2	6	534040	534045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322972
10353	NC_021892	ACC	2	6	534067	534072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527322972
10354	NC_021892	TGA	2	6	534080	534085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527322972
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10357	NC_021892	TGG	2	6	534120	534125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527322972
10358	NC_021892	GGA	2	6	534127	534132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527322972
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10360	NC_021892	GCT	2	6	534162	534167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527322972
10361	NC_021892	AGC	2	6	534378	534383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527322972
10362	NC_021892	ATC	2	6	534453	534458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527322972
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10474	NC_021892	CTTT	2	8	539987	539994	0 %	75 %	0 %	25 %	527322979
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10483	NC_021892	TTC	2	6	540410	540415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527322980
10484	NC_021892	GCGTA	2	10	540467	540476	20 %	20 %	40 %	20 %	527322980
10485	NC_021892	AGA	2	6	540485	540490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527322980
10486	NC_021892	ACA	2	6	540498	540503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527322980
10487	NC_021892	TTCC	2	8	540514	540521	0 %	50 %	0 %	50 %	527322980
10488	NC_021892	GA	3	6	540528	540533	50 %	0 %	50 %	0 %	527322980
10489	NC_021892	TCTA	2	8	540599	540606	25 %	50 %	0 %	25 %	527322980
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10491	NC_021892	A	6	6	540621	540626	100 %	0 %	0 %	0 %	527322980
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