MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J(s)/122

Total Repeats: 20527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021891	TGG	2	6	55087	55092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321617
1002	NC_021891	GGTTCA	2	12	55110	55121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	527321617
1003	NC_021891	TTATC	2	10	55211	55220	20 %	60 %	0 %	20 %	527321617
1004	NC_021891	AGAA	2	8	55284	55291	75 %	0 %	25 %	0 %	527321617
1005	NC_021891	CTG	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321617
1006	NC_021891	GAG	2	6	55312	55317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321617
1007	NC_021891	AT	3	6	55556	55561	50 %	50 %	0 %	0 %	527321617
1008	NC_021891	TTA	2	6	55571	55576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321617
1009	NC_021891	CTGG	3	12	55849	55860	0 %	25 %	50 %	25 %	527321618
1010	NC_021891	ATT	2	6	55864	55869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321618
1011	NC_021891	GAT	2	6	55877	55882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321618
1012	NC_021891	TCT	2	6	55895	55900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321618
1013	NC_021891	TCC	2	6	55909	55914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321618
1014	NC_021891	TCC	2	6	55927	55932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321618
1015	NC_021891	TTA	2	6	55940	55945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321618
1016	NC_021891	TTGC	2	8	55983	55990	0 %	50 %	25 %	25 %	527321618
1017	NC_021891	AGCG	2	8	56023	56030	25 %	0 %	50 %	25 %	527321618
1018	NC_021891	T	6	6	56035	56040	0 %	100 %	0 %	0 %	527321618
1019	NC_021891	GTA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321618
1020	NC_021891	GTT	2	6	56177	56182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321618
1021	NC_021891	GAT	2	6	56195	56200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321618
1022	NC_021891	GTTGT	2	10	56276	56285	0 %	60 %	40 %	0 %	527321618
1023	NC_021891	T	6	6	56331	56336	0 %	100 %	0 %	0 %	527321618
1024	NC_021891	GAT	2	6	57628	57633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321619
1025	NC_021891	TCC	2	6	57645	57650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321619
1026	NC_021891	GAG	2	6	57664	57669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321619
1027	NC_021891	AGTTGT	2	12	57706	57717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	527321619
1028	NC_021891	AGA	2	6	57777	57782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321619
1029	NC_021891	CTA	2	6	57793	57798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321619
1030	NC_021891	CTG	2	6	57965	57970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321619
1031	NC_021891	TGT	2	6	58032	58037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321619
1032	NC_021891	TTG	2	6	58070	58075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321619
1033	NC_021891	GAAA	2	8	58105	58112	75 %	0 %	25 %	0 %	527321619
1034	NC_021891	CT	3	6	58115	58120	0 %	50 %	0 %	50 %	527321619
1035	NC_021891	GTT	2	6	58124	58129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321619
1036	NC_021891	AGGT	2	8	58144	58151	25 %	25 %	50 %	0 %	527321619
1037	NC_021891	AGA	2	6	59103	59108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321620
1038	NC_021891	TCT	2	6	59119	59124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321620
1039	NC_021891	T	6	6	59151	59156	0 %	100 %	0 %	0 %	527321620
1040	NC_021891	CGTT	2	8	59302	59309	0 %	50 %	25 %	25 %	527321620
1041	NC_021891	GGAG	2	8	59311	59318	25 %	0 %	75 %	0 %	527321620
1042	NC_021891	GTAA	2	8	59363	59370	50 %	25 %	25 %	0 %	527321620
1043	NC_021891	TCCTAA	2	12	59430	59441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321620
1044	NC_021891	AGT	2	6	59459	59464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321620
1045	NC_021891	T	6	6	59491	59496	0 %	100 %	0 %	0 %	527321620
1046	NC_021891	AGC	2	6	59539	59544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321620
1047	NC_021891	GCT	2	6	59551	59556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321620
1048	NC_021891	GTC	2	6	59577	59582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321620
1049	NC_021891	ATGG	2	8	59590	59597	25 %	25 %	50 %	0 %	527321620
1050	NC_021891	AGG	2	6	59624	59629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321620
1051	NC_021891	GA	3	6	59676	59681	50 %	0 %	50 %	0 %	527321620
1052	NC_021891	CAA	2	6	59699	59704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321620
1053	NC_021891	ATAA	2	8	59736	59743	75 %	25 %	0 %	0 %	527321620
1054	NC_021891	GAGCA	2	10	59776	59785	40 %	0 %	40 %	20 %	527321620
1055	NC_021891	GT	3	6	59814	59819	0 %	50 %	50 %	0 %	527321620
1056	NC_021891	TAG	2	6	59826	59831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321620
1057	NC_021891	AAG	2	6	60011	60016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321620
1058	NC_021891	CTC	2	6	60023	60028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321620
1059	NC_021891	AAC	2	6	60056	60061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321620
1060	NC_021891	T	7	7	60075	60081	0 %	100 %	0 %	0 %	527321620
1061	NC_021891	CTT	2	6	60125	60130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321620
1062	NC_021891	AAT	2	6	60155	60160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321620
1063	NC_021891	TTC	2	6	60166	60171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321620
1064	NC_021891	ATGT	2	8	60186	60193	25 %	50 %	25 %	0 %	527321620
1065	NC_021891	CATT	2	8	60215	60222	25 %	50 %	0 %	25 %	527321620
1066	NC_021891	ATG	2	6	60236	60241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321621
1067	NC_021891	CCT	2	6	60242	60247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321621
1068	NC_021891	AGT	2	6	60297	60302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321621
1069	NC_021891	TCT	2	6	60320	60325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321621
1070	NC_021891	TCA	2	6	60332	60337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321621
1071	NC_021891	TTC	2	6	60453	60458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321621
1072	NC_021891	CTTT	2	8	60488	60495	0 %	75 %	0 %	25 %	527321621
1073	NC_021891	TTCT	2	8	60511	60518	0 %	75 %	0 %	25 %	527321621
1074	NC_021891	TTC	2	6	60550	60555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321621
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1077	NC_021891	T	7	7	60634	60640	0 %	100 %	0 %	0 %	527321621
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1083	NC_021891	TGA	2	6	61200	61205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321622
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1093	NC_021891	GAA	2	6	61532	61537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321622
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1095	NC_021891	GA	3	6	61587	61592	50 %	0 %	50 %	0 %	527321622
1096	NC_021891	ATG	2	6	61829	61834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321622
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1101	NC_021891	TGTGA	2	10	62225	62234	20 %	40 %	40 %	0 %	527321622
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1104	NC_021891	ATT	2	6	62344	62349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321622
1105	NC_021891	TTC	2	6	62386	62391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321622
1106	NC_021891	GA	3	6	62402	62407	50 %	0 %	50 %	0 %	527321622
1107	NC_021891	CTT	2	6	62519	62524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321622
1108	NC_021891	AAG	2	6	62553	62558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321622
1109	NC_021891	TTA	2	6	62630	62635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321622
1110	NC_021891	GA	3	6	62661	62666	50 %	0 %	50 %	0 %	527321622
1111	NC_021891	TTA	2	6	62711	62716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321622
1112	NC_021891	AAG	2	6	62718	62723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321622
1113	NC_021891	TC	3	6	62817	62822	0 %	50 %	0 %	50 %	527321622
1114	NC_021891	CAA	2	6	62918	62923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321622
1115	NC_021891	AT	3	6	62998	63003	50 %	50 %	0 %	0 %	527321622
1116	NC_021891	TTC	2	6	63004	63009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321622
1117	NC_021891	GTT	2	6	63143	63148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321622
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1119	NC_021891	AG	3	6	63198	63203	50 %	0 %	50 %	0 %	527321622
1120	NC_021891	CT	4	8	63206	63213	0 %	50 %	0 %	50 %	527321622
1121	NC_021891	T	6	6	63225	63230	0 %	100 %	0 %	0 %	527321622
1122	NC_021891	GTTCTT	2	12	63344	63355	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	527321622
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1124	NC_021891	AG	3	6	63433	63438	50 %	0 %	50 %	0 %	527321622
1125	NC_021891	AGA	2	6	63457	63462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321622
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1127	NC_021891	AAG	2	6	63516	63521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321622
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1255	NC_021891	GA	3	6	70351	70356	50 %	0 %	50 %	0 %	527321628
1256	NC_021891	AGCT	2	8	70392	70399	25 %	25 %	25 %	25 %	527321628
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