MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/342

Total Repeats: 20809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021890	CAG	2	6	524041	524046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321071
10003	NC_021890	TAG	2	6	524064	524069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321071
10004	NC_021890	ATA	2	6	524213	524218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321071
10005	NC_021890	CAG	2	6	524287	524292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321071
10006	NC_021890	GTA	2	6	524326	524331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321071
10007	NC_021890	CAACA	2	10	524365	524374	60 %	0 %	0 %	40 %	527321071
10008	NC_021890	GA	3	6	524375	524380	50 %	0 %	50 %	0 %	527321071
10009	NC_021890	CTT	2	6	524424	524429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321071
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10011	NC_021890	CTCC	2	8	524603	524610	0 %	25 %	0 %	75 %	527321071
10012	NC_021890	T	6	6	524624	524629	0 %	100 %	0 %	0 %	527321071
10013	NC_021890	CTT	2	6	524643	524648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321071
10014	NC_021890	TTG	2	6	524677	524682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321071
10015	NC_021890	CT	3	6	524839	524844	0 %	50 %	0 %	50 %	527321071
10016	NC_021890	AAG	2	6	524886	524891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321071
10017	NC_021890	GAG	2	6	525024	525029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321071
10018	NC_021890	CTT	2	6	525101	525106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321071
10019	NC_021890	AGA	2	6	525166	525171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321071
10020	NC_021890	CTG	2	6	525177	525182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321071
10021	NC_021890	TCA	2	6	525269	525274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321071
10022	NC_021890	TAA	2	6	525304	525309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527321071
10023	NC_021890	CCT	2	6	525350	525355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321071
10024	NC_021890	TCT	2	6	525537	525542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321071
10025	NC_021890	TAC	2	6	525553	525558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321071
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10029	NC_021890	GCC	2	6	526037	526042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527321071
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10031	NC_021890	AGC	2	6	526180	526185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321071
10032	NC_021890	AAC	2	6	526208	526213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321071
10033	NC_021890	GA	3	6	526251	526256	50 %	0 %	50 %	0 %	527321071
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10040	NC_021890	TTG	2	6	526593	526598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321071
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10042	NC_021890	AAG	2	6	526674	526679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321071
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10053	NC_021890	TTGGA	2	10	527277	527286	20 %	40 %	40 %	0 %	527321072
10054	NC_021890	T	6	6	527300	527305	0 %	100 %	0 %	0 %	527321072
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10057	NC_021890	T	6	6	527433	527438	0 %	100 %	0 %	0 %	527321072
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10060	NC_021890	CAA	2	6	527606	527611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321073
10061	NC_021890	GAACT	2	10	527763	527772	40 %	20 %	20 %	20 %	527321073
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10103	NC_021890	AAG	2	6	530264	530269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321077
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10107	NC_021890	CAA	2	6	530533	530538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321077
10108	NC_021890	AG	3	6	530539	530544	50 %	0 %	50 %	0 %	527321077
10109	NC_021890	AGA	2	6	530706	530711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321078
10110	NC_021890	AAGC	2	8	530728	530735	50 %	0 %	25 %	25 %	527321078
10111	NC_021890	TAT	2	6	530756	530761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527321078
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10114	NC_021890	ATTC	2	8	530857	530864	25 %	50 %	0 %	25 %	527321078
10115	NC_021890	TGC	2	6	530921	530926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321078
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10121	NC_021890	A	6	6	531204	531209	100 %	0 %	0 %	0 %	527321078
10122	NC_021890	CAA	2	6	531273	531278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321078
10123	NC_021890	ACA	2	6	531320	531325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321079
10124	NC_021890	CTT	2	6	531326	531331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321079
10125	NC_021890	TCA	2	6	531364	531369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321079
10126	NC_021890	CTA	2	6	531414	531419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321079
10127	NC_021890	ATCG	2	8	531502	531509	25 %	25 %	25 %	25 %	527321079
10128	NC_021890	TCC	2	6	531520	531525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321079
10129	NC_021890	CTAG	2	8	531593	531600	25 %	25 %	25 %	25 %	527321079
10130	NC_021890	TGC	2	6	531643	531648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321079
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10132	NC_021890	TCT	2	6	531677	531682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321079
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10134	NC_021890	TCA	2	6	531862	531867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321079
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10151	NC_021890	TC	3	6	532661	532666	0 %	50 %	0 %	50 %	527321079
10152	NC_021890	AAG	2	6	532728	532733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527321079
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10156	NC_021890	GC	3	6	533205	533210	0 %	0 %	50 %	50 %	527321080
10157	NC_021890	ATGA	2	8	533255	533262	50 %	25 %	25 %	0 %	527321080
10158	NC_021890	GAT	2	6	533275	533280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321080
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10161	NC_021890	CTGA	2	8	533416	533423	25 %	25 %	25 %	25 %	527321080
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10163	NC_021890	GTT	2	6	533443	533448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527321080
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10200	NC_021890	TGC	3	9	535061	535069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321081
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10209	NC_021890	GTG	3	9	535303	535311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321081
10210	NC_021890	CAG	4	12	535312	535323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527321081
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10221	NC_021890	TAG	2	6	535931	535936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321081
10222	NC_021890	GCT	2	6	535989	535994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321081
10223	NC_021890	ATC	2	6	536022	536027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321081
10224	NC_021890	AATGTC	2	12	536028	536039	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527321081
10225	NC_021890	ACACC	2	10	536092	536101	40 %	0 %	0 %	60 %	527321081
10226	NC_021890	AAC	2	6	536102	536107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321081
10227	NC_021890	CAA	2	6	536159	536164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321081
10228	NC_021890	TGA	2	6	536171	536176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321081
10229	NC_021890	GACA	2	8	536186	536193	50 %	0 %	25 %	25 %	527321081
10230	NC_021890	TGG	2	6	536210	536215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527321081
10231	NC_021890	AT	3	6	536227	536232	50 %	50 %	0 %	0 %	527321081
10232	NC_021890	GAT	2	6	536256	536261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321081
10233	NC_021890	CGT	2	6	536363	536368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321081
10234	NC_021890	CAA	2	6	536512	536517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321081
10235	NC_021890	GCT	2	6	536523	536528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527321081
10236	NC_021890	GAT	2	6	536583	536588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527321081
10237	NC_021890	GGA	2	6	536625	536630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527321081
10238	NC_021890	TCTCC	2	10	536632	536641	0 %	40 %	0 %	60 %	527321081
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10240	NC_021890	CGTA	2	8	536711	536718	25 %	25 %	25 %	25 %	527321081
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10485	NC_021890	CTT	2	6	548152	548157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527321095
10486	NC_021890	A	6	6	548169	548174	100 %	0 %	0 %	0 %	527321095
10487	NC_021890	CAA	2	6	548242	548247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527321095
10488	NC_021890	TCC	2	6	548250	548255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527321095
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10490	NC_021890	T	8	8	548451	548458	0 %	100 %	0 %	0 %	527321095
10491	NC_021890	CTA	2	6	548470	548475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527321095
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