MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 20283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_021889	AGC	2	6	759171	759176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320382
15003	NC_021889	ATA	2	6	759227	759232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320382
15004	NC_021889	AT	3	6	759342	759347	50 %	50 %	0 %	0 %	527320382
15005	NC_021889	AAT	2	6	759349	759354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320382
15006	NC_021889	GAA	2	6	759420	759425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320382
15007	NC_021889	TGC	2	6	759437	759442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320382
15008	NC_021889	AGA	2	6	759447	759452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320382
15009	NC_021889	TGT	2	6	759534	759539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320382
15010	NC_021889	AATA	2	8	759655	759662	75 %	25 %	0 %	0 %	527320382
15011	NC_021889	GCT	2	6	759746	759751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320383
15012	NC_021889	GTT	2	6	759757	759762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320383
15013	NC_021889	TCT	2	6	759845	759850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320383
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15015	NC_021889	GTT	2	6	759998	760003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320384
15016	NC_021889	ACA	2	6	760059	760064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320384
15017	NC_021889	AT	3	6	760155	760160	50 %	50 %	0 %	0 %	527320384
15018	NC_021889	TAA	2	6	760234	760239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320384
15019	NC_021889	AGA	2	6	760278	760283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320385
15020	NC_021889	TTG	2	6	760291	760296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320385
15021	NC_021889	AAGC	2	8	760334	760341	50 %	0 %	25 %	25 %	527320385
15022	NC_021889	TTG	2	6	760411	760416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320385
15023	NC_021889	TTG	2	6	760466	760471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320385
15024	NC_021889	TCAC	2	8	760510	760517	25 %	25 %	0 %	50 %	527320385
15025	NC_021889	ATG	2	6	760522	760527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320385
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15028	NC_021889	GCT	2	6	760580	760585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320385
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15032	NC_021889	TGC	2	6	760858	760863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320386
15033	NC_021889	ATG	2	6	760907	760912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320386
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15035	NC_021889	GGA	2	6	760948	760953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320386
15036	NC_021889	ATGCAA	2	12	761027	761038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	527320386
15037	NC_021889	TTG	2	6	761085	761090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320386
15038	NC_021889	ACA	2	6	761131	761136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320386
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15040	NC_021889	GAA	2	6	761210	761215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320386
15041	NC_021889	TGT	2	6	761232	761237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320386
15042	NC_021889	GAGAAA	2	12	761256	761267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320386
15043	NC_021889	AGT	2	6	761357	761362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320386
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15046	NC_021889	GAGT	2	8	761635	761642	25 %	25 %	50 %	0 %	527320387
15047	NC_021889	CTT	2	6	761644	761649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320387
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15050	NC_021889	GTC	2	6	762089	762094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320387
15051	NC_021889	TGC	2	6	762110	762115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320387
15052	NC_021889	TGA	2	6	762172	762177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320387
15053	NC_021889	CCT	2	6	762237	762242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320387
15054	NC_021889	GAT	2	6	762357	762362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320387
15055	NC_021889	TTCT	2	8	762415	762422	0 %	75 %	0 %	25 %	527320387
15056	NC_021889	AAC	2	6	762508	762513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320387
15057	NC_021889	ATT	2	6	762519	762524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320387
15058	NC_021889	AG	3	6	762534	762539	50 %	0 %	50 %	0 %	527320387
15059	NC_021889	TCG	2	6	762590	762595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320387
15060	NC_021889	GGATC	2	10	762597	762606	20 %	20 %	40 %	20 %	527320387
15061	NC_021889	TAAAT	2	10	762638	762647	60 %	40 %	0 %	0 %	527320387
15062	NC_021889	A	6	6	762673	762678	100 %	0 %	0 %	0 %	527320387
15063	NC_021889	GCT	2	6	762693	762698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320387
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15065	NC_021889	AAG	2	6	762784	762789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320388
15066	NC_021889	CAGAG	2	10	762801	762810	40 %	0 %	40 %	20 %	527320388
15067	NC_021889	GTT	2	6	762814	762819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320388
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15069	NC_021889	GCGAT	2	10	762953	762962	20 %	20 %	40 %	20 %	527320388
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15087	NC_021889	GAA	2	6	763418	763423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320389
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15090	NC_021889	TCT	2	6	763492	763497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320389
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15101	NC_021889	GTTG	2	8	763929	763936	0 %	50 %	50 %	0 %	527320389
15102	NC_021889	A	6	6	763970	763975	100 %	0 %	0 %	0 %	527320389
15103	NC_021889	TGC	2	6	763998	764003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320389
15104	NC_021889	CAT	2	6	764014	764019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320389
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15106	NC_021889	AAG	2	6	764036	764041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320389
15107	NC_021889	GTC	2	6	764048	764053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320389
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15109	NC_021889	AGA	2	6	764091	764096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320389
15110	NC_021889	AT	3	6	764102	764107	50 %	50 %	0 %	0 %	527320389
15111	NC_021889	GCA	2	6	764128	764133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320390
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15113	NC_021889	GAAG	2	8	764193	764200	50 %	0 %	50 %	0 %	527320390
15114	NC_021889	TTTTC	2	10	764206	764215	0 %	80 %	0 %	20 %	527320390
15115	NC_021889	GAA	2	6	764269	764274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320390
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15117	NC_021889	GCT	2	6	764317	764322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320390
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15483	NC_021889	GAA	2	6	784344	784349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320406
15484	NC_021889	AAG	2	6	784353	784358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320406
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15488	NC_021889	TCA	2	6	784547	784552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320406
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