MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 20283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11003	NC_021889	GAT	2	6	561543	561548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320199
11004	NC_021889	C	6	6	561568	561573	0 %	0 %	0 %	100 %	527320199
11005	NC_021889	TCA	2	6	561575	561580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320199
11006	NC_021889	TAA	2	6	561641	561646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320199
11007	NC_021889	CGT	2	6	561678	561683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320199
11008	NC_021889	ATC	2	6	561742	561747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320199
11009	NC_021889	TCT	2	6	561755	561760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320199
11010	NC_021889	T	6	6	561847	561852	0 %	100 %	0 %	0 %	527320199
11011	NC_021889	ATCA	2	8	561916	561923	50 %	25 %	0 %	25 %	527320199
11012	NC_021889	CTA	2	6	562029	562034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320199
11013	NC_021889	A	6	6	562079	562084	100 %	0 %	0 %	0 %	527320199
11014	NC_021889	AGA	2	6	562112	562117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320199
11015	NC_021889	AGGTA	2	10	562254	562263	40 %	20 %	40 %	0 %	527320199
11016	NC_021889	CAA	2	6	562370	562375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320199
11017	NC_021889	CTC	2	6	562401	562406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320199
11018	NC_021889	CTT	2	6	562470	562475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320199
11019	NC_021889	CGTC	2	8	562477	562484	0 %	25 %	25 %	50 %	527320199
11020	NC_021889	TTG	2	6	562703	562708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320200
11021	NC_021889	CCT	2	6	562744	562749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320200
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11023	NC_021889	CTA	2	6	562852	562857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320200
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11028	NC_021889	ATCA	2	8	563239	563246	50 %	25 %	0 %	25 %	527320201
11029	NC_021889	TCC	2	6	563272	563277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320201
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11040	NC_021889	TCA	2	6	564056	564061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320201
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11052	NC_021889	CAA	2	6	564656	564661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320202
11053	NC_021889	AC	3	6	564666	564671	50 %	0 %	0 %	50 %	527320202
11054	NC_021889	TCT	2	6	564688	564693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320202
11055	NC_021889	CTA	2	6	564745	564750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320202
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11057	NC_021889	ACAG	2	8	564990	564997	50 %	0 %	25 %	25 %	527320203
11058	NC_021889	TTC	2	6	565049	565054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320203
11059	NC_021889	ATA	2	6	565069	565074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320203
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11061	NC_021889	TTAA	2	8	565155	565162	50 %	50 %	0 %	0 %	527320203
11062	NC_021889	GCA	2	6	565167	565172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320203
11063	NC_021889	CT	3	6	565256	565261	0 %	50 %	0 %	50 %	527320203
11064	NC_021889	TAA	2	6	565315	565320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320203
11065	NC_021889	CTG	2	6	565324	565329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320203
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11083	NC_021889	CACT	2	8	566350	566357	25 %	25 %	0 %	50 %	527320203
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11087	NC_021889	AAGCA	2	10	566483	566492	60 %	0 %	20 %	20 %	527320203
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11089	NC_021889	TTGG	2	8	566528	566535	0 %	50 %	50 %	0 %	527320203
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11100	NC_021889	T	6	6	567182	567187	0 %	100 %	0 %	0 %	527320203
11101	NC_021889	CAT	2	6	567205	567210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320203
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11104	NC_021889	GA	3	6	567394	567399	50 %	0 %	50 %	0 %	527320203
11105	NC_021889	T	6	6	567533	567538	0 %	100 %	0 %	0 %	527320203
11106	NC_021889	TTG	2	6	567582	567587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320204
11107	NC_021889	A	6	6	567664	567669	100 %	0 %	0 %	0 %	527320204
11108	NC_021889	AACCC	2	10	567677	567686	40 %	0 %	0 %	60 %	527320204
11109	NC_021889	TTC	2	6	567729	567734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320204
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11114	NC_021889	AATA	2	8	567798	567805	75 %	25 %	0 %	0 %	527320204
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11487	NC_021889	CTA	2	6	585243	585248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320225
11488	NC_021889	CTC	2	6	585267	585272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320225
11489	NC_021889	AAC	2	6	585280	585285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320225
11490	NC_021889	T	6	6	585353	585358	0 %	100 %	0 %	0 %	527320225
11491	NC_021889	CAT	2	6	585426	585431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320225
11492	NC_021889	TA	3	6	585552	585557	50 %	50 %	0 %	0 %	527320225
11493	NC_021889	T	6	6	585595	585600	0 %	100 %	0 %	0 %	527320226
11494	NC_021889	GCT	2	6	585611	585616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320226
11495	NC_021889	ACG	2	6	585628	585633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320226
11496	NC_021889	AACT	2	8	585718	585725	50 %	25 %	0 %	25 %	527320226
11497	NC_021889	TCTA	2	8	585961	585968	25 %	50 %	0 %	25 %	527320226
11498	NC_021889	AACA	2	8	585988	585995	75 %	0 %	0 %	25 %	527320226
11499	NC_021889	CTT	2	6	586023	586028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320226
11500	NC_021889	TCA	2	6	586076	586081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320226

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