MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-J/953

Total Repeats: 20283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021889	CTC	2	6	511276	511281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320150
10003	NC_021889	AAG	2	6	511310	511315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320150
10004	NC_021889	AG	3	6	511362	511367	50 %	0 %	50 %	0 %	527320150
10005	NC_021889	GAA	2	6	511368	511373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320150
10006	NC_021889	CT	3	6	511427	511432	0 %	50 %	0 %	50 %	527320150
10007	NC_021889	CTT	2	6	511611	511616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320150
10008	NC_021889	T	6	6	511615	511620	0 %	100 %	0 %	0 %	527320150
10009	NC_021889	A	6	6	511641	511646	100 %	0 %	0 %	0 %	527320150
10010	NC_021889	TTCT	2	8	511658	511665	0 %	75 %	0 %	25 %	527320150
10011	NC_021889	AGA	2	6	511694	511699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320150
10012	NC_021889	CCCA	2	8	511728	511735	25 %	0 %	0 %	75 %	527320150
10013	NC_021889	AGA	2	6	511748	511753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320150
10014	NC_021889	ATC	2	6	511819	511824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320150
10015	NC_021889	CTCTT	2	10	511987	511996	0 %	60 %	0 %	40 %	527320150
10016	NC_021889	TCC	2	6	512041	512046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320150
10017	NC_021889	CCGC	2	8	512070	512077	0 %	0 %	25 %	75 %	527320150
10018	NC_021889	GAG	2	6	512094	512099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320150
10019	NC_021889	T	6	6	512149	512154	0 %	100 %	0 %	0 %	527320150
10020	NC_021889	CTC	2	6	512196	512201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320150
10021	NC_021889	CAC	2	6	512234	512239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	527320150
10022	NC_021889	CTCTAT	2	12	512697	512708	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	527320151
10023	NC_021889	CT	3	6	512762	512767	0 %	50 %	0 %	50 %	527320151
10024	NC_021889	CTTC	2	8	512800	512807	0 %	50 %	0 %	50 %	527320151
10025	NC_021889	TCT	2	6	512911	512916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320151
10026	NC_021889	AGT	2	6	513068	513073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320151
10027	NC_021889	TCT	2	6	513091	513096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320151
10028	NC_021889	ATAG	2	8	513110	513117	50 %	25 %	25 %	0 %	527320151
10029	NC_021889	TCT	2	6	513192	513197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320151
10030	NC_021889	TGC	2	6	513198	513203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320151
10031	NC_021889	TGAACT	2	12	513204	513215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	527320151
10032	NC_021889	TTG	2	6	513239	513244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320151
10033	NC_021889	CAA	2	6	513697	513702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320152
10034	NC_021889	ATA	2	6	513731	513736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320152
10035	NC_021889	TC	3	6	513829	513834	0 %	50 %	0 %	50 %	527320152
10036	NC_021889	TAA	2	6	513871	513876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320152
10037	NC_021889	AGA	2	6	513909	513914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320152
10038	NC_021889	AAG	2	6	513946	513951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320152
10039	NC_021889	GA	3	6	513984	513989	50 %	0 %	50 %	0 %	527320152
10040	NC_021889	ATCC	2	8	513991	513998	25 %	25 %	0 %	50 %	527320152
10041	NC_021889	CAT	2	6	514026	514031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320152
10042	NC_021889	AGA	2	6	514042	514047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320152
10043	NC_021889	T	6	6	514066	514071	0 %	100 %	0 %	0 %	527320152
10044	NC_021889	TCT	2	6	514091	514096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320152
10045	NC_021889	A	6	6	514141	514146	100 %	0 %	0 %	0 %	527320152
10046	NC_021889	GAA	2	6	514161	514166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320152
10047	NC_021889	TAA	2	6	514171	514176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320152
10048	NC_021889	AAT	2	6	514231	514236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320152
10049	NC_021889	AAT	2	6	514276	514281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320152
10050	NC_021889	CAG	2	6	514416	514421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320152
10051	NC_021889	TAATTC	2	12	514527	514538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	527320152
10052	NC_021889	CGA	2	6	514549	514554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320152
10053	NC_021889	T	6	6	514592	514597	0 %	100 %	0 %	0 %	527320152
10054	NC_021889	TC	3	6	514656	514661	0 %	50 %	0 %	50 %	527320152
10055	NC_021889	A	6	6	514709	514714	100 %	0 %	0 %	0 %	527320152
10056	NC_021889	AAG	2	6	514740	514745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320152
10057	NC_021889	CTG	2	6	514750	514755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320152
10058	NC_021889	TTC	2	6	514762	514767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320152
10059	NC_021889	ACTCCT	2	12	514796	514807	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	527320152
10060	NC_021889	CTG	2	6	514950	514955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320152
10061	NC_021889	GCA	2	6	514998	515003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320152
10062	NC_021889	AAG	2	6	515016	515021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320152
10063	NC_021889	TC	3	6	515025	515030	0 %	50 %	0 %	50 %	527320152
10064	NC_021889	TGT	2	6	515033	515038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320152
10065	NC_021889	ATC	2	6	515147	515152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320152
10066	NC_021889	ATT	2	6	515161	515166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	527320152
10067	NC_021889	GAG	2	6	515234	515239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320152
10068	NC_021889	GATGAA	2	12	515316	515327	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	527320152
10069	NC_021889	TCT	2	6	515340	515345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320152
10070	NC_021889	AG	3	6	515390	515395	50 %	0 %	50 %	0 %	527320152
10071	NC_021889	A	8	8	515442	515449	100 %	0 %	0 %	0 %	527320153
10072	NC_021889	CTCC	2	8	515451	515458	0 %	25 %	0 %	75 %	527320153
10073	NC_021889	AGG	2	6	515465	515470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527320153
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10078	NC_021889	AATG	2	8	515635	515642	50 %	25 %	25 %	0 %	527320154
10079	NC_021889	GTT	2	6	515699	515704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320154
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10081	NC_021889	CAT	2	6	515745	515750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320154
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10084	NC_021889	TCA	2	6	515850	515855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320154
10085	NC_021889	TTGC	2	8	515865	515872	0 %	50 %	25 %	25 %	527320154
10086	NC_021889	AATC	2	8	515874	515881	50 %	25 %	0 %	25 %	527320154
10087	NC_021889	AGCAC	2	10	515915	515924	40 %	0 %	20 %	40 %	527320154
10088	NC_021889	TAA	2	6	515932	515937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320154
10089	NC_021889	AAT	2	6	516026	516031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320154
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10091	NC_021889	GAA	2	6	516150	516155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320154
10092	NC_021889	GAT	2	6	516165	516170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320154
10093	NC_021889	TTCTG	2	10	516182	516191	0 %	60 %	20 %	20 %	527320154
10094	NC_021889	AT	3	6	516241	516246	50 %	50 %	0 %	0 %	527320154
10095	NC_021889	TTG	2	6	516307	516312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320154
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10097	NC_021889	ATCC	2	8	516400	516407	25 %	25 %	0 %	50 %	527320154
10098	NC_021889	ACT	2	6	516461	516466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320154
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10100	NC_021889	TCA	2	6	516531	516536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320154
10101	NC_021889	TC	4	8	516549	516556	0 %	50 %	0 %	50 %	527320154
10102	NC_021889	GAT	2	6	516628	516633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320154
10103	NC_021889	CAG	2	6	516676	516681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320154
10104	NC_021889	TAG	2	6	516699	516704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320154
10105	NC_021889	ATA	2	6	516848	516853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320154
10106	NC_021889	CAG	2	6	516922	516927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320154
10107	NC_021889	GTA	2	6	516961	516966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	527320154
10108	NC_021889	CAACA	2	10	517000	517009	60 %	0 %	0 %	40 %	527320154
10109	NC_021889	GA	3	6	517010	517015	50 %	0 %	50 %	0 %	527320154
10110	NC_021889	CTT	2	6	517059	517064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320154
10111	NC_021889	CTCC	2	8	517238	517245	0 %	25 %	0 %	75 %	527320154
10112	NC_021889	T	6	6	517259	517264	0 %	100 %	0 %	0 %	527320154
10113	NC_021889	CTT	2	6	517278	517283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320154
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10115	NC_021889	CT	3	6	517474	517479	0 %	50 %	0 %	50 %	527320154
10116	NC_021889	AAG	2	6	517521	517526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320154
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10119	NC_021889	AGA	2	6	517801	517806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320154
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10121	NC_021889	TCA	2	6	517904	517909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320154
10122	NC_021889	TAA	2	6	517939	517944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320154
10123	NC_021889	CCT	2	6	517985	517990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527320154
10124	NC_021889	TCT	2	6	518172	518177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320154
10125	NC_021889	TAC	2	6	518188	518193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320154
10126	NC_021889	TGT	2	6	518378	518383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320154
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10140	NC_021889	TTG	2	6	519228	519233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527320154
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10142	NC_021889	AAG	2	6	519309	519314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320154
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10152	NC_021889	AAAG	2	8	520186	520193	75 %	0 %	25 %	0 %	527320155
10153	NC_021889	CAA	2	6	520242	520247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527320155
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10224	NC_021889	TGC	2	6	524269	524274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527320161
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10231	NC_021889	CG	3	6	524530	524535	0 %	0 %	50 %	50 %	527320161
10232	NC_021889	AGA	2	6	524542	524547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527320161
10233	NC_021889	A	6	6	524558	524563	100 %	0 %	0 %	0 %	527320161
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10241	NC_021889	CAG	2	6	525099	525104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527320161
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10243	NC_021889	TCT	2	6	525215	525220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320161
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10361	NC_021889	TGAT	2	8	530223	530230	25 %	50 %	25 %	0 %	527320163
10362	NC_021889	TCA	2	6	530379	530384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527320164
10363	NC_021889	CT	3	6	530418	530423	0 %	50 %	0 %	50 %	527320164
10364	NC_021889	TAA	2	6	530447	530452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320164
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10369	NC_021889	TA	3	6	530617	530622	50 %	50 %	0 %	0 %	527320164
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10379	NC_021889	TCT	2	6	531254	531259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320165
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10391	NC_021889	T	6	6	531870	531875	0 %	100 %	0 %	0 %	527320166
10392	NC_021889	CTAT	2	8	531876	531883	25 %	50 %	0 %	25 %	527320166
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10466	NC_021889	CTT	2	6	535559	535564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527320170
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10470	NC_021889	AGGGAA	2	12	535716	535727	50 %	0 %	50 %	0 %	527320170
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10477	NC_021889	TAA	2	6	535888	535893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527320170
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10483	NC_021889	GA	3	6	536209	536214	50 %	0 %	50 %	0 %	527320171
10484	NC_021889	TCTA	2	8	536280	536287	25 %	50 %	0 %	25 %	527320171
10485	NC_021889	A	6	6	536287	536292	100 %	0 %	0 %	0 %	527320171
10486	NC_021889	A	6	6	536302	536307	100 %	0 %	0 %	0 %	527320171
10487	NC_021889	TCCC	2	8	536353	536360	0 %	25 %	0 %	75 %	527320171
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