MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis RC-F(s)/852

Total Repeats: 20810

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6502	NC_021888	TGC	2	6	348662	348667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319042
6503	NC_021888	CTT	2	6	348729	348734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319042
6504	NC_021888	TCC	2	6	348773	348778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319042
6505	NC_021888	AAG	2	6	348779	348784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319042
6506	NC_021888	T	6	6	348823	348828	0 %	100 %	0 %	0 %	527319042
6507	NC_021888	TCT	2	6	348895	348900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319042
6508	NC_021888	TTC	2	6	348970	348975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319042
6509	NC_021888	CCT	2	6	348983	348988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319042
6510	NC_021888	TCT	2	6	349121	349126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319042
6511	NC_021888	TC	3	6	349140	349145	0 %	50 %	0 %	50 %	527319042
6512	NC_021888	AAAT	2	8	349235	349242	75 %	25 %	0 %	0 %	527319042
6513	NC_021888	AGA	2	6	349243	349248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319042
6514	NC_021888	AGC	2	6	349255	349260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319042
6515	NC_021888	ATA	2	6	349286	349291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319042
6516	NC_021888	CA	3	6	349389	349394	50 %	0 %	0 %	50 %	527319042
6517	NC_021888	CAG	2	6	349410	349415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319042
6518	NC_021888	TGC	2	6	349433	349438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319042
6519	NC_021888	TCC	2	6	349483	349488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319042
6520	NC_021888	A	6	6	349568	349573	100 %	0 %	0 %	0 %	527319042
6521	NC_021888	GCTT	2	8	349574	349581	0 %	50 %	25 %	25 %	527319042
6522	NC_021888	CAA	2	6	349644	349649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319042
6523	NC_021888	AGA	2	6	349672	349677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319042
6524	NC_021888	CTT	2	6	349746	349751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319042
6525	NC_021888	TAA	2	6	349951	349956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319042
6526	NC_021888	AAT	2	6	350044	350049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319042
6527	NC_021888	CGT	2	6	350164	350169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319042
6528	NC_021888	ACT	2	6	350247	350252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319043
6529	NC_021888	TCT	2	6	350326	350331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319043
6530	NC_021888	AG	4	8	350352	350359	50 %	0 %	50 %	0 %	527319043
6531	NC_021888	TC	3	6	350404	350409	0 %	50 %	0 %	50 %	527319043
6532	NC_021888	GAA	2	6	350415	350420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	527319043
6533	NC_021888	TCA	2	6	350422	350427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319043
6534	NC_021888	AAT	2	6	350553	350558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319043
6535	NC_021888	CTAA	2	8	350635	350642	50 %	25 %	0 %	25 %	527319043
6536	NC_021888	GAG	2	6	350669	350674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319043
6537	NC_021888	A	7	7	350700	350706	100 %	0 %	0 %	0 %	527319043
6538	NC_021888	CAA	2	6	350745	350750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319043
6539	NC_021888	AAAAG	2	10	350781	350790	80 %	0 %	20 %	0 %	527319043
6540	NC_021888	A	6	6	350812	350817	100 %	0 %	0 %	0 %	527319043
6541	NC_021888	A	7	7	350835	350841	100 %	0 %	0 %	0 %	527319043
6542	NC_021888	CGC	2	6	350842	350847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319043
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6544	NC_021888	AG	3	6	350921	350926	50 %	0 %	50 %	0 %	527319043
6545	NC_021888	GAG	3	9	350924	350932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319043
6546	NC_021888	GTT	2	6	350939	350944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	527319043
6547	NC_021888	GAG	2	6	350945	350950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319043
6548	NC_021888	AGGA	2	8	350953	350960	50 %	0 %	50 %	0 %	527319043
6549	NC_021888	A	6	6	350965	350970	100 %	0 %	0 %	0 %	527319043
6550	NC_021888	TA	3	6	351373	351378	50 %	50 %	0 %	0 %	527319044
6551	NC_021888	CTGC	2	8	351414	351421	0 %	25 %	25 %	50 %	527319044
6552	NC_021888	CT	3	6	351493	351498	0 %	50 %	0 %	50 %	527319044
6553	NC_021888	CTGC	2	8	351516	351523	0 %	25 %	25 %	50 %	527319044
6554	NC_021888	CCTG	2	8	351548	351555	0 %	25 %	25 %	50 %	527319044
6555	NC_021888	GCC	2	6	351563	351568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319044
6556	NC_021888	T	6	6	351574	351579	0 %	100 %	0 %	0 %	527319044
6557	NC_021888	AAT	2	6	351613	351618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319044
6558	NC_021888	CCT	2	6	351639	351644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319044
6559	NC_021888	CAA	2	6	351645	351650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319044
6560	NC_021888	TGCT	2	8	351658	351665	0 %	50 %	25 %	25 %	527319044
6561	NC_021888	CT	3	6	351664	351669	0 %	50 %	0 %	50 %	527319044
6562	NC_021888	CT	3	6	351906	351911	0 %	50 %	0 %	50 %	527319045
6563	NC_021888	GCT	2	6	351973	351978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319045
6564	NC_021888	GA	3	6	351986	351991	50 %	0 %	50 %	0 %	527319045
6565	NC_021888	CTC	2	6	352025	352030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319045
6566	NC_021888	A	6	6	352042	352047	100 %	0 %	0 %	0 %	527319045
6567	NC_021888	A	8	8	352063	352070	100 %	0 %	0 %	0 %	527319045
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6570	NC_021888	CAA	2	6	352217	352222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319045
6571	NC_021888	ATC	2	6	352240	352245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319045
6572	NC_021888	GAG	2	6	352270	352275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319045
6573	NC_021888	ATC	2	6	352286	352291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319045
6574	NC_021888	AC	3	6	352304	352309	50 %	0 %	0 %	50 %	527319045
6575	NC_021888	TCT	2	6	352315	352320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319045
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6577	NC_021888	CA	3	6	352429	352434	50 %	0 %	0 %	50 %	527319045
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6581	NC_021888	GCT	2	6	352537	352542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319045
6582	NC_021888	GTG	2	6	352544	352549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	527319045
6583	NC_021888	ATTCAA	2	12	352679	352690	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	527319046
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6585	NC_021888	GAG	2	6	352775	352780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	527319046
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6587	NC_021888	CA	3	6	352834	352839	50 %	0 %	0 %	50 %	527319046
6588	NC_021888	CAA	2	6	352929	352934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	527319046
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6591	NC_021888	A	6	6	353091	353096	100 %	0 %	0 %	0 %	527319047
6592	NC_021888	AGCT	2	8	353110	353117	25 %	25 %	25 %	25 %	527319047
6593	NC_021888	TTCA	2	8	353137	353144	25 %	50 %	0 %	25 %	527319047
6594	NC_021888	CT	3	6	353162	353167	0 %	50 %	0 %	50 %	527319047
6595	NC_021888	T	6	6	353194	353199	0 %	100 %	0 %	0 %	527319047
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6598	NC_021888	TCTT	2	8	353240	353247	0 %	75 %	0 %	25 %	527319047
6599	NC_021888	TTC	2	6	353251	353256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319047
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6601	NC_021888	A	6	6	353279	353284	100 %	0 %	0 %	0 %	527319047
6602	NC_021888	AGCA	2	8	353299	353306	50 %	0 %	25 %	25 %	527319047
6603	NC_021888	GCC	2	6	353330	353335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	527319047
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6607	NC_021888	GTTAC	2	10	353537	353546	20 %	40 %	20 %	20 %	527319047
6608	NC_021888	GCA	2	6	353576	353581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	527319047
6609	NC_021888	TAA	2	6	353614	353619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	527319047
6610	NC_021888	TCC	2	6	353632	353637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	527319047
6611	NC_021888	A	7	7	353660	353666	100 %	0 %	0 %	0 %	527319047
6612	NC_021888	TCGC	2	8	353667	353674	0 %	25 %	25 %	50 %	527319047
6613	NC_021888	AAAG	2	8	353696	353703	75 %	0 %	25 %	0 %	527319047
6614	NC_021888	CAT	2	6	353805	353810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	527319047
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6618	NC_021888	TCT	2	6	354161	354166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	527319048
6619	NC_021888	TGC	2	6	354182	354187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	527319048
6620	NC_021888	GTCT	2	8	354271	354278	0 %	50 %	25 %	25 %	527319048
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