MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Tremblaya phenacola PAVE

Total Repeats: 3478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021555	AGA	2	6	122169	122174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940228
2502	NC_021555	AAT	2	6	122194	122199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940228
2503	NC_021555	TGG	2	6	122240	122245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940228
2504	NC_021555	CAA	2	6	122283	122288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940228
2505	NC_021555	AGA	2	6	122290	122295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940228
2506	NC_021555	GAG	2	6	122296	122301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940228
2507	NC_021555	CCCA	2	8	122316	122323	25 %	0 %	0 %	75 %	557940228
2508	NC_021555	ATTAG	2	10	122417	122426	40 %	40 %	20 %	0 %	557940228
2509	NC_021555	GTT	2	6	122427	122432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940229
2510	NC_021555	TCTT	2	8	122483	122490	0 %	75 %	0 %	25 %	557940229
2511	NC_021555	TAT	2	6	122504	122509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940229
2512	NC_021555	CAA	2	6	122516	122521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940229
2513	NC_021555	CAA	2	6	122533	122538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940229
2514	NC_021555	CCT	2	6	122582	122587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940229
2515	NC_021555	TGG	2	6	122595	122600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940229
2516	NC_021555	AAG	2	6	122650	122655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557940229
2517	NC_021555	AAC	2	6	122663	122668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940229
2518	NC_021555	TAT	2	6	122752	122757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940229
2519	NC_021555	AGG	2	6	122784	122789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940229
2520	NC_021555	CCT	2	6	122825	122830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940229
2521	NC_021555	TGTT	2	8	122850	122857	0 %	75 %	25 %	0 %	557940229
2522	NC_021555	T	6	6	122873	122878	0 %	100 %	0 %	0 %	557940229
2523	NC_021555	ACAAA	2	10	122884	122893	80 %	0 %	0 %	20 %	557940229
2524	NC_021555	TGT	2	6	122950	122955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940229
2525	NC_021555	CTT	2	6	122964	122969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940229
2526	NC_021555	TGT	2	6	122988	122993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940229
2527	NC_021555	CTT	2	6	123069	123074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940229
2528	NC_021555	GAGTTT	2	12	123077	123088	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	557940229
2529	NC_021555	TCG	2	6	123130	123135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940230
2530	NC_021555	TG	3	6	123156	123161	0 %	50 %	50 %	0 %	557940230
2531	NC_021555	TGG	2	6	123165	123170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940230
2532	NC_021555	CT	3	6	123229	123234	0 %	50 %	0 %	50 %	557940230
2533	NC_021555	CT	3	6	123291	123296	0 %	50 %	0 %	50 %	557940230
2534	NC_021555	ATG	2	6	123330	123335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940230
2535	NC_021555	T	7	7	123340	123346	0 %	100 %	0 %	0 %	557940230
2536	NC_021555	AGTCAT	2	12	123406	123417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	557940230
2537	NC_021555	TATTG	2	10	123418	123427	20 %	60 %	20 %	0 %	557940230
2538	NC_021555	TTC	2	6	123570	123575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940231
2539	NC_021555	GGT	2	6	123682	123687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940231
2540	NC_021555	TCAG	2	8	123755	123762	25 %	25 %	25 %	25 %	557940231
2541	NC_021555	T	6	6	123773	123778	0 %	100 %	0 %	0 %	557940231
2542	NC_021555	CTT	2	6	123821	123826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940231
2543	NC_021555	TCA	2	6	123872	123877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940231
2544	NC_021555	CAA	2	6	123888	123893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940231
2545	NC_021555	TTC	2	6	123900	123905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940231
2546	NC_021555	GTT	2	6	123919	123924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940232
2547	NC_021555	GAT	2	6	123947	123952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940232
2548	NC_021555	AAC	2	6	123974	123979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940232
2549	NC_021555	TTGA	2	8	124002	124009	25 %	50 %	25 %	0 %	557940232
2550	NC_021555	GAT	2	6	124045	124050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940233
2551	NC_021555	CT	3	6	124056	124061	0 %	50 %	0 %	50 %	557940233
2552	NC_021555	TTC	2	6	124131	124136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940233
2553	NC_021555	TTA	2	6	124167	124172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940233
2554	NC_021555	AG	3	6	124185	124190	50 %	0 %	50 %	0 %	557940233
2555	NC_021555	CT	3	6	124202	124207	0 %	50 %	0 %	50 %	557940233
2556	NC_021555	CCA	2	6	124217	124222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940233
2557	NC_021555	CAA	2	6	124284	124289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940234
2558	NC_021555	CAT	2	6	124310	124315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940234
2559	NC_021555	TGC	2	6	124334	124339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940234
2560	NC_021555	CT	3	6	124382	124387	0 %	50 %	0 %	50 %	557940234
2561	NC_021555	AAC	2	6	124437	124442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940234
2562	NC_021555	A	6	6	124443	124448	100 %	0 %	0 %	0 %	557940234
2563	NC_021555	AAAAC	2	10	124458	124467	80 %	0 %	0 %	20 %	557940234
2564	NC_021555	ATC	2	6	124499	124504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940234
2565	NC_021555	CAA	2	6	124510	124515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940234
2566	NC_021555	CAA	2	6	124531	124536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940234
2567	NC_021555	CTA	2	6	124542	124547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940234
2568	NC_021555	TTGG	2	8	124568	124575	0 %	50 %	50 %	0 %	557940234
2569	NC_021555	AGG	2	6	124617	124622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940234
2570	NC_021555	ATT	2	6	124632	124637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940234
2571	NC_021555	GAT	2	6	124731	124736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940234
2572	NC_021555	CAAAA	2	10	124781	124790	80 %	0 %	0 %	20 %	557940234
2573	NC_021555	TAA	2	6	124883	124888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940234
2574	NC_021555	TTTGG	2	10	124922	124931	0 %	60 %	40 %	0 %	557940234
2575	NC_021555	GTTT	2	8	124949	124956	0 %	75 %	25 %	0 %	557940234
2576	NC_021555	ATC	2	6	124964	124969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940234
2577	NC_021555	TAA	2	6	124994	124999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940234
2578	NC_021555	CAGC	2	8	125024	125031	25 %	0 %	25 %	50 %	557940234
2579	NC_021555	CAAAC	2	10	125037	125046	60 %	0 %	0 %	40 %	557940234
2580	NC_021555	ATT	2	6	125055	125060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940234
2581	NC_021555	CAC	2	6	125072	125077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557940234
2582	NC_021555	TTA	2	6	125091	125096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940234
2583	NC_021555	GCAG	2	8	125122	125129	25 %	0 %	50 %	25 %	557940234
2584	NC_021555	TGT	2	6	125153	125158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940234
2585	NC_021555	TTTGG	2	10	125190	125199	0 %	60 %	40 %	0 %	557940234
2586	NC_021555	AAT	2	6	125237	125242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940234
2587	NC_021555	GGTTGG	2	12	125271	125282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940234
2588	NC_021555	AAAT	2	8	125319	125326	75 %	25 %	0 %	0 %	557940234
2589	NC_021555	ATA	2	6	125336	125341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940234
2590	NC_021555	GCT	2	6	125538	125543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940235
2591	NC_021555	C	7	7	125607	125613	0 %	0 %	0 %	100 %	557940235
2592	NC_021555	TTTGCC	2	12	125679	125690	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	557940235
2593	NC_021555	CTT	2	6	125724	125729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940235
2594	NC_021555	GGTT	2	8	125825	125832	0 %	50 %	50 %	0 %	557940236
2595	NC_021555	TCT	2	6	125884	125889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940236
2596	NC_021555	TAG	2	6	125899	125904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557940236
2597	NC_021555	TTTGG	2	10	125957	125966	0 %	60 %	40 %	0 %	557940236
2598	NC_021555	GTT	2	6	125999	126004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940237
2599	NC_021555	GAC	2	6	126033	126038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940237
2600	NC_021555	GTTG	2	8	126048	126055	0 %	50 %	50 %	0 %	557940237
2601	NC_021555	CA	3	6	126095	126100	50 %	0 %	0 %	50 %	557940237
2602	NC_021555	TAA	2	6	126156	126161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940237
2603	NC_021555	TGT	2	6	126186	126191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940237
2604	NC_021555	CAA	3	9	126326	126334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940237
2605	NC_021555	ATA	2	6	126352	126357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940237
2606	NC_021555	TAC	2	6	126369	126374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940237
2607	NC_021555	CCT	2	6	126384	126389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557940237
2608	NC_021555	ACT	2	6	126397	126402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940237
2609	NC_021555	AGC	2	6	126455	126460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940238
2610	NC_021555	CTG	2	6	126532	126537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557940238
2611	NC_021555	CTT	2	6	126776	126781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940238
2612	NC_021555	CTT	2	6	126793	126798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940239
2613	NC_021555	TCTT	3	12	126795	126806	0 %	75 %	0 %	25 %	557940239
2614	NC_021555	CTT	2	6	126871	126876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940239
2615	NC_021555	ATCCA	2	10	126910	126919	40 %	20 %	0 %	40 %	557940239
2616	NC_021555	TGGGGT	2	12	126937	126948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557940239
2617	NC_021555	AAC	2	6	127127	127132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940239
2618	NC_021555	ATT	2	6	127166	127171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940239
2619	NC_021555	TTGGA	2	10	127213	127222	20 %	40 %	40 %	0 %	557940239
2620	NC_021555	TAAT	2	8	127320	127327	50 %	50 %	0 %	0 %	557940239
2621	NC_021555	T	8	8	127338	127345	0 %	100 %	0 %	0 %	557940239
2622	NC_021555	TCT	2	6	127356	127361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557940240
2623	NC_021555	AGCAC	2	10	127371	127380	40 %	0 %	20 %	40 %	557940240
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2733	NC_021555	CCAA	2	8	131845	131852	50 %	0 %	0 %	50 %	557940249
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2739	NC_021555	CAATT	2	10	132016	132025	40 %	40 %	0 %	20 %	557940250
2740	NC_021555	ACT	2	6	132079	132084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940250
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2746	NC_021555	ATT	2	6	132301	132306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940251
2747	NC_021555	CAT	2	6	132320	132325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557940251
2748	NC_021555	AAT	2	6	132335	132340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940251
2749	NC_021555	TAA	2	6	132363	132368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940251
2750	NC_021555	TTA	2	6	132380	132385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940251
2751	NC_021555	AGG	2	6	132394	132399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557940251
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2857	NC_021555	TTG	2	6	136895	136900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557940255
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2993	NC_021555	CCCA	2	8	142493	142500	25 %	0 %	0 %	75 %	557940259
2994	NC_021555	TCTCA	2	10	142522	142531	20 %	40 %	0 %	40 %	557940259
2995	NC_021555	TAA	2	6	142539	142544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557940259
2996	NC_021555	CATT	2	8	142578	142585	25 %	50 %	0 %	25 %	557940259
2997	NC_021555	ATTG	2	8	142622	142629	25 %	50 %	25 %	0 %	557940259
2998	NC_021555	TTA	2	6	142635	142640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557940259
2999	NC_021555	CAG	2	6	142656	142661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557940259
3000	NC_021555	AAC	2	6	142675	142680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557940259

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