MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 20436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021052	CTC	2	6	667347	667352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546613
13002	NC_021052	AGA	2	6	667371	667376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546613
13003	NC_021052	GCT	2	6	667378	667383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546613
13004	NC_021052	GTG	2	6	667385	667390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546613
13005	NC_021052	ATTCAA	2	12	667520	667531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482546614
13006	NC_021052	A	7	7	667530	667536	100 %	0 %	0 %	0 %	482546614
13007	NC_021052	AGC	2	6	667554	667559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546614
13008	NC_021052	AGACCG	2	12	667594	667605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546614
13009	NC_021052	GAG	2	6	667616	667621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482546614
13010	NC_021052	CAAA	2	8	667643	667650	75 %	0 %	0 %	25 %	482546614
13011	NC_021052	CA	3	6	667675	667680	50 %	0 %	0 %	50 %	482546614
13012	NC_021052	GCA	2	6	667709	667714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546614
13013	NC_021052	CA	4	8	667717	667724	50 %	0 %	0 %	50 %	482546614
13014	NC_021052	CAA	2	6	667770	667775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546614
13015	NC_021052	T	7	7	667806	667812	0 %	100 %	0 %	0 %	482546614
13016	NC_021052	TAA	2	6	667887	667892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546615
13017	NC_021052	AGCT	2	8	667951	667958	25 %	25 %	25 %	25 %	482546615
13018	NC_021052	TTCA	2	8	667978	667985	25 %	50 %	0 %	25 %	482546615
13019	NC_021052	CT	3	6	668003	668008	0 %	50 %	0 %	50 %	482546615
13020	NC_021052	T	6	6	668035	668040	0 %	100 %	0 %	0 %	482546615
13021	NC_021052	CTT	2	6	668043	668048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546615
13022	NC_021052	CTTT	2	8	668059	668066	0 %	75 %	0 %	25 %	482546615
13023	NC_021052	GCT	2	6	668073	668078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546615
13024	NC_021052	TCTT	2	8	668081	668088	0 %	75 %	0 %	25 %	482546615
13025	NC_021052	TTC	2	6	668092	668097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546615
13026	NC_021052	TAA	2	6	668098	668103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546615
13027	NC_021052	A	6	6	668120	668125	100 %	0 %	0 %	0 %	482546615
13028	NC_021052	AGCA	2	8	668140	668147	50 %	0 %	25 %	25 %	482546615
13029	NC_021052	GCC	2	6	668171	668176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482546615
13030	NC_021052	AGC	2	6	668278	668283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546615
13031	NC_021052	CCA	2	6	668287	668292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546615
13032	NC_021052	CAA	2	6	668307	668312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546615
13033	NC_021052	TGC	3	9	668341	668349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546615
13034	NC_021052	GCA	2	6	668417	668422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546615
13035	NC_021052	TAAC	2	8	668451	668458	50 %	25 %	0 %	25 %	482546615
13036	NC_021052	TCC	2	6	668473	668478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546615
13037	NC_021052	A	7	7	668501	668507	100 %	0 %	0 %	0 %	482546615
13038	NC_021052	TCGC	2	8	668508	668515	0 %	25 %	25 %	50 %	482546615
13039	NC_021052	AAAG	2	8	668537	668544	75 %	0 %	25 %	0 %	482546615
13040	NC_021052	CAT	2	6	668646	668651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546615
13041	NC_021052	AAG	2	6	668733	668738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546615
13042	NC_021052	CAA	2	6	668799	668804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546615
13043	NC_021052	TCT	2	6	669002	669007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13044	NC_021052	GTCT	2	8	669112	669119	0 %	50 %	25 %	25 %	482546616
13045	NC_021052	CTG	2	6	669122	669127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13046	NC_021052	AGC	2	6	669130	669135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13047	NC_021052	AGC	2	6	669169	669174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13048	NC_021052	AAG	2	6	669198	669203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546616
13049	NC_021052	TCT	2	6	669254	669259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13050	NC_021052	TCT	2	6	669302	669307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13051	NC_021052	CGT	2	6	669319	669324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13052	NC_021052	AAT	2	6	669370	669375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13053	NC_021052	CTT	2	6	669420	669425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13054	NC_021052	CT	3	6	669454	669459	0 %	50 %	0 %	50 %	482546616
13055	NC_021052	AAC	2	6	669490	669495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13056	NC_021052	CTG	2	6	669511	669516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13057	NC_021052	ATCTC	2	10	669596	669605	20 %	40 %	0 %	40 %	482546616
13058	NC_021052	ACA	2	6	669608	669613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13059	NC_021052	TTC	2	6	669626	669631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13060	NC_021052	CAA	2	6	669648	669653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13061	NC_021052	CAG	2	6	669675	669680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13062	NC_021052	CTA	2	6	669702	669707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
13063	NC_021052	CTT	2	6	669804	669809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13064	NC_021052	AT	3	6	669877	669882	50 %	50 %	0 %	0 %	482546616
13065	NC_021052	CAA	2	6	669930	669935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13066	NC_021052	CAG	2	6	670071	670076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13067	NC_021052	CAT	2	6	670080	670085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
13068	NC_021052	ATT	2	6	670228	670233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546616
13069	NC_021052	ACA	2	6	670250	670255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13070	NC_021052	GCA	2	6	670319	670324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13071	NC_021052	C	7	7	670326	670332	0 %	0 %	0 %	100 %	482546616
13072	NC_021052	ATA	2	6	670391	670396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13073	NC_021052	CTC	2	6	670464	670469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546616
13074	NC_021052	GAC	2	6	670470	670475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13075	NC_021052	TCA	2	6	670523	670528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
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13077	NC_021052	TC	4	8	670709	670716	0 %	50 %	0 %	50 %	482546616
13078	NC_021052	TAA	2	6	670719	670724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13079	NC_021052	CTA	2	6	670743	670748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
13080	NC_021052	ACG	2	6	670750	670755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
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13084	NC_021052	TTTG	2	8	671000	671007	0 %	75 %	25 %	0 %	482546616
13085	NC_021052	TAA	2	6	671097	671102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13086	NC_021052	TTTC	2	8	671160	671167	0 %	75 %	0 %	25 %	482546616
13087	NC_021052	GTT	2	6	671393	671398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546616
13088	NC_021052	AAT	2	6	671401	671406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13089	NC_021052	CGA	2	6	671468	671473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546616
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13091	NC_021052	ATA	2	6	671602	671607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13092	NC_021052	AGA	2	6	671653	671658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546616
13093	NC_021052	TGT	2	6	671670	671675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546616
13094	NC_021052	CAT	2	6	671683	671688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
13095	NC_021052	AG	3	6	671719	671724	50 %	0 %	50 %	0 %	482546616
13096	NC_021052	TGC	2	6	671770	671775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546616
13097	NC_021052	CCTTC	2	10	671802	671811	0 %	40 %	0 %	60 %	482546616
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13099	NC_021052	ATC	2	6	671936	671941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
13100	NC_021052	TTC	2	6	671942	671947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13101	NC_021052	ATA	2	6	671993	671998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13102	NC_021052	CAA	2	6	672066	672071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13103	NC_021052	ATT	2	6	672307	672312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546616
13104	NC_021052	TAA	2	6	672318	672323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13105	NC_021052	CCA	2	6	672365	672370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546616
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13107	NC_021052	TTC	2	6	672416	672421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13108	NC_021052	CCAT	2	8	672426	672433	25 %	25 %	0 %	50 %	482546616
13109	NC_021052	GAA	2	6	672446	672451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546616
13110	NC_021052	CTC	2	6	672591	672596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546616
13111	NC_021052	CAA	2	6	672633	672638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546616
13112	NC_021052	CAT	2	6	672654	672659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546616
13113	NC_021052	GTT	2	6	672666	672671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546616
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13115	NC_021052	TTC	2	6	672712	672717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546616
13116	NC_021052	TAA	2	6	672719	672724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546616
13117	NC_021052	GTT	2	6	672782	672787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546616
13118	NC_021052	GAA	2	6	672790	672795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546616
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13241	NC_021052	TC	3	6	679020	679025	0 %	50 %	0 %	50 %	482546621
13242	NC_021052	T	6	6	679155	679160	0 %	100 %	0 %	0 %	482546621
13243	NC_021052	GAA	2	6	679168	679173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546621
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13249	NC_021052	ATC	2	6	679557	679562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546622
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13285	NC_021052	GACC	2	8	680892	680899	25 %	0 %	25 %	50 %	482546624
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13343	NC_021052	TGAG	2	8	685201	685208	25 %	25 %	50 %	0 %	482546628
13344	NC_021052	AC	3	6	685229	685234	50 %	0 %	0 %	50 %	482546628
13345	NC_021052	A	6	6	685330	685335	100 %	0 %	0 %	0 %	482546628
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13348	NC_021052	CAA	2	6	685489	685494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546628
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13351	NC_021052	TGA	2	6	685607	685612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546628
13352	NC_021052	CT	3	6	685634	685639	0 %	50 %	0 %	50 %	482546628
13353	NC_021052	CA	3	6	685643	685648	50 %	0 %	0 %	50 %	482546628
13354	NC_021052	CAA	2	6	685689	685694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546628
13355	NC_021052	GTC	3	9	685708	685716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546628
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13357	NC_021052	GCA	2	6	685763	685768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546628
13358	NC_021052	C	9	9	685812	685820	0 %	0 %	0 %	100 %	482546629
13359	NC_021052	TCT	2	6	685885	685890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546629
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13468	NC_021052	A	8	8	691691	691698	100 %	0 %	0 %	0 %	482546636
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13473	NC_021052	ATG	2	6	691987	691992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546636
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13483	NC_021052	CAA	2	6	692371	692376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546636
13484	NC_021052	GTT	2	6	692379	692384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546636
13485	NC_021052	TTA	2	6	692395	692400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546636
13486	NC_021052	CAC	2	6	692439	692444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546636
13487	NC_021052	AGA	2	6	692462	692467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546636
13488	NC_021052	GGC	2	6	692481	692486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482546636
13489	NC_021052	ATA	2	6	692521	692526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546636
13490	NC_021052	TC	3	6	692540	692545	0 %	50 %	0 %	50 %	482546636
13491	NC_021052	ATCAC	2	10	692620	692629	40 %	20 %	0 %	40 %	482546636
13492	NC_021052	T	6	6	692682	692687	0 %	100 %	0 %	0 %	482546636
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13496	NC_021052	AAAG	2	8	693093	693100	75 %	0 %	25 %	0 %	482546637
13497	NC_021052	TGA	2	6	693164	693169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546637
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13500	NC_021052	CAA	2	6	693251	693256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546637

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