MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2/434/Bu(f)

Total Repeats: 20436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_021052	ACC	2	6	516779	516784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546476
10003	NC_021052	CTCTT	2	10	516831	516840	0 %	60 %	0 %	40 %	482546476
10004	NC_021052	TAT	2	6	516907	516912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546477
10005	NC_021052	TGA	2	6	516983	516988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546477
10006	NC_021052	CAA	2	6	517094	517099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546477
10007	NC_021052	TA	3	6	517115	517120	50 %	50 %	0 %	0 %	482546477
10008	NC_021052	AGA	2	6	517204	517209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546477
10009	NC_021052	TAA	2	6	517237	517242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546477
10010	NC_021052	CAAG	2	8	517276	517283	50 %	0 %	25 %	25 %	482546477
10011	NC_021052	CT	3	6	517363	517368	0 %	50 %	0 %	50 %	482546478
10012	NC_021052	TCA	2	6	517374	517379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546478
10013	NC_021052	CCCA	2	8	517436	517443	25 %	0 %	0 %	75 %	482546478
10014	NC_021052	GCT	2	6	517477	517482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546478
10015	NC_021052	T	7	7	517609	517615	0 %	100 %	0 %	0 %	482546478
10016	NC_021052	AT	3	6	517644	517649	50 %	50 %	0 %	0 %	482546478
10017	NC_021052	TCTGGA	2	12	517653	517664	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482546478
10018	NC_021052	GCA	2	6	517704	517709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546478
10019	NC_021052	CAA	2	6	517768	517773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546478
10020	NC_021052	T	6	6	517778	517783	0 %	100 %	0 %	0 %	482546478
10021	NC_021052	GAA	2	6	517803	517808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546478
10022	NC_021052	TTC	2	6	517835	517840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546478
10023	NC_021052	TGG	2	6	517919	517924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482546478
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10025	NC_021052	AC	3	6	517959	517964	50 %	0 %	0 %	50 %	482546478
10026	NC_021052	ATA	2	6	517989	517994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546478
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10029	NC_021052	T	6	6	518186	518191	0 %	100 %	0 %	0 %	482546479
10030	NC_021052	T	7	7	518222	518228	0 %	100 %	0 %	0 %	482546479
10031	NC_021052	T	6	6	518268	518273	0 %	100 %	0 %	0 %	482546479
10032	NC_021052	TTC	2	6	518300	518305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546479
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10035	NC_021052	TTTC	2	8	518413	518420	0 %	75 %	0 %	25 %	482546479
10036	NC_021052	TTC	2	6	518429	518434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546479
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10039	NC_021052	CTA	2	6	518539	518544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546479
10040	NC_021052	CTT	2	6	518569	518574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546479
10041	NC_021052	GCA	2	6	518646	518651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546479
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10043	NC_021052	T	7	7	518688	518694	0 %	100 %	0 %	0 %	482546479
10044	NC_021052	AGT	2	6	518777	518782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546479
10045	NC_021052	TAT	2	6	518800	518805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546479
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10049	NC_021052	ATG	2	6	518917	518922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546479
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10051	NC_021052	CTT	2	6	519176	519181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546479
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10053	NC_021052	T	6	6	519220	519225	0 %	100 %	0 %	0 %	482546479
10054	NC_021052	GTTG	2	8	519253	519260	0 %	50 %	50 %	0 %	482546479
10055	NC_021052	TGC	2	6	519272	519277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546479
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10057	NC_021052	CTCTA	2	10	519323	519332	20 %	40 %	0 %	40 %	482546479
10058	NC_021052	TAT	2	6	519362	519367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482546479
10059	NC_021052	GTT	2	6	519444	519449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546480
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10061	NC_021052	TCA	2	6	519506	519511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546480
10062	NC_021052	T	7	7	519534	519540	0 %	100 %	0 %	0 %	482546480
10063	NC_021052	AAG	2	6	519549	519554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546480
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10065	NC_021052	GAA	2	6	519810	519815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546480
10066	NC_021052	GAAA	2	8	519824	519831	75 %	0 %	25 %	0 %	482546480
10067	NC_021052	ACC	2	6	519859	519864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482546480
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10102	NC_021052	AGA	2	6	522382	522387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546483
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10106	NC_021052	GT	3	6	522574	522579	0 %	50 %	50 %	0 %	482546483
10107	NC_021052	CTTTA	2	10	522602	522611	20 %	60 %	0 %	20 %	482546483
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10114	NC_021052	CTA	2	6	522946	522951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546484
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10120	NC_021052	AAACC	2	10	523427	523436	60 %	0 %	0 %	40 %	482546484
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10122	NC_021052	CTT	2	6	523644	523649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546484
10123	NC_021052	TAAA	2	8	523652	523659	75 %	25 %	0 %	0 %	482546484
10124	NC_021052	TTG	2	6	523754	523759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546484
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10126	NC_021052	AAC	2	6	523883	523888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546484
10127	NC_021052	GATG	2	8	523900	523907	25 %	25 %	50 %	0 %	482546484
10128	NC_021052	AAG	2	6	523932	523937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546484
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10135	NC_021052	CTT	2	6	524258	524263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546484
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10138	NC_021052	GATG	2	8	524354	524361	25 %	25 %	50 %	0 %	482546484
10139	NC_021052	ATTC	2	8	524427	524434	25 %	50 %	0 %	25 %	482546484
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10143	NC_021052	A	6	6	524519	524524	100 %	0 %	0 %	0 %	482546485
10144	NC_021052	CT	3	6	524596	524601	0 %	50 %	0 %	50 %	482546485
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10152	NC_021052	GAA	2	6	525232	525237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546486
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10231	NC_021052	CT	3	6	528739	528744	0 %	50 %	0 %	50 %	482546489
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10238	NC_021052	GAAC	2	8	529128	529135	50 %	0 %	25 %	25 %	482546490
10239	NC_021052	CA	4	8	529201	529208	50 %	0 %	0 %	50 %	482546490
10240	NC_021052	T	6	6	529266	529271	0 %	100 %	0 %	0 %	482546490
10241	NC_021052	CTC	2	6	529288	529293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482546490
10242	NC_021052	AGC	2	6	529295	529300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546490
10243	NC_021052	AGC	2	6	529397	529402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546490
10244	NC_021052	CAT	2	6	529417	529422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546490
10245	NC_021052	T	6	6	529445	529450	0 %	100 %	0 %	0 %	482546490
10246	NC_021052	ACA	2	6	529488	529493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482546490
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10248	NC_021052	GCA	2	6	529554	529559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546490
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10250	NC_021052	TAA	2	6	529594	529599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482546490
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10252	NC_021052	TTC	2	6	529737	529742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546490
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10267	NC_021052	TTC	3	9	530263	530271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482546490
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10359	NC_021052	TA	3	6	535087	535092	50 %	50 %	0 %	0 %	482546494
10360	NC_021052	ATG	2	6	535140	535145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546494
10361	NC_021052	TGT	2	6	535148	535153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	482546494
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10485	NC_021052	ATG	2	6	541231	541236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546499
10486	NC_021052	TATT	2	8	541259	541266	25 %	75 %	0 %	0 %	482546499
10487	NC_021052	T	6	6	541308	541313	0 %	100 %	0 %	0 %	482546499
10488	NC_021052	GAT	2	6	541320	541325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482546499
10489	NC_021052	ACTCCA	2	12	541350	541361	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	482546499
10490	NC_021052	GCT	2	6	541373	541378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482546499
10491	NC_021052	GCA	2	6	541409	541414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482546499
10492	NC_021052	AGA	2	6	541427	541432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546499
10493	NC_021052	T	6	6	541460	541465	0 %	100 %	0 %	0 %	482546499
10494	NC_021052	AGA	2	6	541474	541479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546499
10495	NC_021052	AGA	2	6	541504	541509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482546499
10496	NC_021052	TAC	2	6	541515	541520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482546499
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10500	NC_021052	CTGCTT	2	12	541582	541593	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482546499

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